More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3982 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3982  protein-export membrane protein SecD  100 
 
 		 468 aa  932    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.728055 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3326  protein-export membrane protein SecD  93.46 
 
 		 474 aa  887    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0504  protein-export membrane protein SecD  64.54 
 
 		 462 aa  570  1e-161  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000522922  hitchhiker  0.000170526 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3104  protein-export membrane protein SecD  46.49 
 
 		 538 aa  396  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000111638  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0079  protein-export membrane protein SecD  44.18 
 
 		 515 aa  381  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3212  preprotein translocase subunit SecD  40.94 
 
 		 470 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.718211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2884  preprotein translocase subunit SecD  40.94 
 
 		 470 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5077  preprotein translocase subunit SecD  38.39 
 
 		 461 aa  279  7e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0142  preprotein translocase subunit SecD  40.71 
 
 		 464 aa  278  1e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1028  preprotein translocase subunit SecD  40.82 
 
 		 471 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.016566 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4539  protein-export membrane protein SecD  37.47 
 
 		 470 aa  268  2e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.470079  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1490  preprotein translocase subunit SecD  38.7 
 
 		 474 aa  266  5.999999999999999e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5128  preprotein translocase subunit SecD  41.08 
 
 		 464 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.473691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1123  preprotein translocase subunit SecD  35.7 
 
 		 416 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1669  preprotein translocase subunit SecD  38.48 
 
 		 413 aa  259  7e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000293049  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1191  preprotein translocase subunit SecD  38.48 
 
 		 493 aa  258  1e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12260  protein-export membrane protein SecD  39.56 
 
 		 403 aa  258  2e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000764404  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  36.15 
 
 		 735 aa  256  8e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_275  protein-export membrane protein, preprotein translocase SecD subunit  38.48 
 
 		 449 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000478055  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0333  preprotein translocase subunit SecD  38.29 
 
 		 449 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000488895  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0313  preprotein translocase subunit SecD  38.43 
 
 		 449 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000119854  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1279  preprotein translocase subunit SecD  38 
 
 		 495 aa  252  8.000000000000001e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.221382  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1272  preprotein translocase subunit SecD  33.91 
 
 		 411 aa  252  1e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1356  preprotein translocase subunit SecD  36.28 
 
 		 410 aa  250  3e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.066873  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  35.13 
 
 		 406 aa  250  4e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  35.31 
 
 		 403 aa  250  4e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000290493  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1691  protein-export membrane protein SecD  34.89 
 
 		 461 aa  249  1e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0199339  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1462  preprotein translocase subunit SecD  37.41 
 
 		 411 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000572302  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1604  protein-export membrane protein SecD  37.41 
 
 		 399 aa  243  7e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0444022  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07161  preprotein translocase subunit SecD  34.95 
 
 		 489 aa  241  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.145798 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0282  preprotein translocase subunit SecD  34.99 
 
 		 496 aa  240  4e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.621699  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10121  preprotein translocase subunit SecD  32.83 
 
 		 486 aa  240  4e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09521  preprotein translocase subunit SecD  34.78 
 
 		 496 aa  239  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.1601 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16221  preprotein translocase subunit SecD  35.83 
 
 		 495 aa  235  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  37.2 
 
 		 533 aa  234  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  35.95 
 
 		 533 aa  233  5e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  37.02 
 
 		 532 aa  233  6e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  36.86 
 
 		 533 aa  232  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  38.44 
 
 		 534 aa  232  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  35.7 
 
 		 530 aa  231  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0625  preprotein translocase subunit SecD  36.12 
 
 		 415 aa  230  3e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000418015  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09311  preprotein translocase subunit SecD  33.12 
 
 		 489 aa  229  6e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.483137  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0870  preprotein translocase subunit SecD  32.9 
 
 		 489 aa  229  6e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  37.21 
 
 		 594 aa  229  8e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  37.21 
 
 		 594 aa  229  8e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  38.4 
 
 		 535 aa  228  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  38.34 
 
 		 535 aa  227  4e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1908  preprotein translocase subunit SecD  32.86 
 
 		 419 aa  226  9e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154062  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  38.7 
 
 		 531 aa  225  1e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09291  preprotein translocase subunit SecD  31.81 
 
 		 487 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.97 
 
 		 853 aa  224  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2197  preprotein translocase subunit SecD  32.86 
 
 		 419 aa  224  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  36.39 
 
 		 533 aa  225  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1217  protein-export membrane protein SecD  38.34 
 
 		 457 aa  225  2e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000711082  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  36.65 
 
 		 533 aa  223  7e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  37.19 
 
 		 532 aa  223  8e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  37.69 
 
 		 554 aa  222  9e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  36.41 
 
 		 533 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  36.78 
 
 		 532 aa  221  3e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  36.84 
 
 		 525 aa  220  3.9999999999999997e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  35.52 
 
 		 533 aa  219  7.999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000256259  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  37.23 
 
 		 531 aa  219  7.999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  35.6 
 
 		 759 aa  219  1e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  37.2 
 
 		 533 aa  219  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  36.04 
 
 		 530 aa  218  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  36.29 
 
 		 530 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.37 
 
 		 848 aa  216  7e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.73 
 
 		 856 aa  215  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.46 
 
 		 856 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  36.76 
 
 		 554 aa  212  9e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.21 
 
 		 839 aa  211  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0854  preprotein translocase subunit SecD  37.24 
 
 		 533 aa  211  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.57 
 
 		 849 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4747  protein-export membrane protein SecD  36.72 
 
 		 533 aa  210  3e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122054  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  35.7 
 
 		 554 aa  210  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  35.92 
 
 		 532 aa  209  9e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  36.43 
 
 		 554 aa  209  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  36.43 
 
 		 554 aa  209  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1571  protein-export membrane protein SecD  34.62 
 
 		 503 aa  209  1e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0503  preprotein translocase subunit SecD  34.61 
 
 		 534 aa  207  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153104  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1084  preprotein translocase subunit SecD  34.74 
 
 		 556 aa  208  2e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.111435 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0536  protein-export membrane protein SecD  30.25 
 
 		 441 aa  207  3e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000245038  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  33.63 
 
 		 761 aa  207  4e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  35.62 
 
 		 532 aa  207  4e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1334  protein-export membrane protein SecD  32.52 
 
 		 487 aa  206  7e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.763605  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2442  protein-export membrane protein SecD  35.79 
 
 		 524 aa  205  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000311445  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2276  protein-export membrane protein SecD  36.74 
 
 		 534 aa  205  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.394363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1416  preprotein translocase subunit SecD  32.82 
 
 		 554 aa  204  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.457453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0563  protein-export membrane protein SecD  33.86 
 
 		 473 aa  204  3e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  34.43 
 
 		 533 aa  204  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  35.86 
 
 		 532 aa  204  4e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1860  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.36 
 
 		 844 aa  202  8e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2491  protein-export membrane protein SecD  34.34 
 
 		 534 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.743414  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  33.41 
 
 		 740 aa  202  9.999999999999999e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0904  protein-export membrane protein SecD  31.38 
 
 		 445 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000019832  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  34.74 
 
 		 531 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2102  protein-export membrane protein SecD  31.47 
 
 		 433 aa  201  3e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.459213  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4598  protein-export membrane protein SecD  36.68 
 
 		 532 aa  201  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.278601  normal  0.122779 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1455  protein-export membrane protein SecD  41.58 
 
 		 622 aa  201  3e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.202191  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4306  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.68 
 
 		 754 aa  201  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>