More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0313 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0333  preprotein translocase subunit SecD  95.77 
 
 		 449 aa  859    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000488895  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0313  preprotein translocase subunit SecD  100 
 
 		 449 aa  892    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000119854  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_275  protein-export membrane protein, preprotein translocase SecD subunit  96.66 
 
 		 449 aa  867    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000478055  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12260  protein-export membrane protein SecD  40.44 
 
 		 403 aa  271  2e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000764404  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4539  protein-export membrane protein SecD  38.56 
 
 		 470 aa  271  2.9999999999999997e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.470079  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5077  preprotein translocase subunit SecD  35.92 
 
 		 461 aa  259  9e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3982  protein-export membrane protein SecD  38.43 
 
 		 468 aa  254  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.728055 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0625  preprotein translocase subunit SecD  41.58 
 
 		 415 aa  254  3e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000418015  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1604  protein-export membrane protein SecD  41.65 
 
 		 399 aa  251  2e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0444022  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1490  preprotein translocase subunit SecD  38.26 
 
 		 474 aa  250  4e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1669  preprotein translocase subunit SecD  38.43 
 
 		 413 aa  248  2e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000293049  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0142  preprotein translocase subunit SecD  37.42 
 
 		 464 aa  247  3e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3326  protein-export membrane protein SecD  37.34 
 
 		 474 aa  246  6e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1028  preprotein translocase subunit SecD  38.16 
 
 		 471 aa  244  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.016566 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1691  protein-export membrane protein SecD  36.06 
 
 		 461 aa  243  5e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0199339  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5128  preprotein translocase subunit SecD  36.85 
 
 		 464 aa  239  5e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.473691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1123  preprotein translocase subunit SecD  38.14 
 
 		 416 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2884  preprotein translocase subunit SecD  37.13 
 
 		 470 aa  239  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3212  preprotein translocase subunit SecD  37.13 
 
 		 470 aa  239  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.718211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1462  preprotein translocase subunit SecD  39.63 
 
 		 411 aa  236  7e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000572302  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0504  protein-export membrane protein SecD  36.96 
 
 		 462 aa  233  7.000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000522922  hitchhiker  0.000170526 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  38.04 
 
 		 406 aa  233  8.000000000000001e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  37.68 
 
 		 403 aa  231  2e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000290493  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0079  protein-export membrane protein SecD  42.86 
 
 		 515 aa  229  9e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1356  preprotein translocase subunit SecD  37.13 
 
 		 410 aa  228  2e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.066873  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  37.18 
 
 		 525 aa  222  9.999999999999999e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  37.77 
 
 		 531 aa  221  3e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3104  protein-export membrane protein SecD  33.33 
 
 		 538 aa  221  3e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000111638  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1285  protein-export membrane protein SecD  36.98 
 
 		 423 aa  221  3e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0952765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1908  preprotein translocase subunit SecD  34.62 
 
 		 419 aa  219  6e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154062  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0563  protein-export membrane protein SecD  35.31 
 
 		 473 aa  219  8.999999999999998e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2197  preprotein translocase subunit SecD  34.4 
 
 		 419 aa  218  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1769  protein-export membrane protein SecD  36.8 
 
 		 512 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1272  preprotein translocase subunit SecD  35.33 
 
 		 411 aa  216  8e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1407  secretion protein SecD  35.64 
 
 		 622 aa  214  2.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0970542  normal  0.495357 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  35.8 
 
 		 530 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  35.24 
 
 		 533 aa  211  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000256259  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09521  preprotein translocase subunit SecD  31.87 
 
 		 496 aa  212  1e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.1601 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07161  preprotein translocase subunit SecD  31.56 
 
 		 489 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.145798 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  35.79 
 
 		 532 aa  211  3e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1217  protein-export membrane protein SecD  37.59 
 
 		 457 aa  210  4e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000711082  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  34.62 
 
 		 532 aa  210  5e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  34.72 
 
 		 533 aa  209  6e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0282  preprotein translocase subunit SecD  31.59 
 
 		 496 aa  209  1e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.621699  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  36.32 
 
 		 554 aa  208  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  37.11 
 
 		 554 aa  208  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  37.11 
 
 		 554 aa  208  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  36.02 
 
 		 534 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  34.45 
 
 		 735 aa  207  3e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2645  preprotein translocase subunit SecD  37.28 
 
 		 616 aa  207  3e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00285631  hitchhiker  0.000483823 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  36.6 
 
 		 554 aa  206  8e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1571  protein-export membrane protein SecD  32.44 
 
 		 503 aa  205  1e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  35.75 
 
 		 594 aa  205  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  35.75 
 
 		 594 aa  205  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  34.55 
 
 		 533 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  35.82 
 
 		 554 aa  204  3e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1230  preprotein translocase subunit SecD  37.02 
 
 		 622 aa  204  4e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.888537 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1415  protein-export membrane protein SecD  36.83 
 
 		 622 aa  203  5e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.634858  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0941  preprotein translocase subunit SecD  36.57 
 
 		 625 aa  202  8e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566023 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0877  preprotein translocase subunit SecD  35.29 
 
 		 615 aa  202  8e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  34.26 
 
 		 533 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.95 
 
 		 853 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  35.28 
 
 		 530 aa  202  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  35.38 
 
 		 535 aa  201  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1230  preprotein translocase subunit SecD  36.27 
 
 		 614 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.181896  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1416  preprotein translocase subunit SecD  34.11 
 
 		 554 aa  201  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.457453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16221  preprotein translocase subunit SecD  33.12 
 
 		 495 aa  200  5e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  33.67 
 
 		 533 aa  199  6e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3201  protein-export membrane protein SecD  34.27 
 
 		 604 aa  199  7e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.167397  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3225  preprotein translocase subunit SecD  34.27 
 
 		 604 aa  199  7e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.457914  hitchhiker  0.00000220398 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2212  protein-export membrane protein SecD  35.88 
 
 		 620 aa  199  7e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.363799  normal  0.0593357 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00356  protein export protein SecD  34.27 
 
 		 615 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.698554  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0478  preprotein translocase subunit SecD  34.27 
 
 		 615 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40460  preprotein translocase subunit SecD  36.8 
 
 		 622 aa  199  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0440  preprotein translocase subunit SecD  34.27 
 
 		 615 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09311  preprotein translocase subunit SecD  30.95 
 
 		 489 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.483137  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0438  preprotein translocase subunit SecD  34.27 
 
 		 615 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0488  preprotein translocase subunit SecD  34.27 
 
 		 615 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1108  preprotein translocase subunit SecD  37.34 
 
 		 625 aa  198  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0562212  normal  0.23819 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0327  preprotein translocase subunit SecD  34.27 
 
 		 615 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.328268  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00360  hypothetical protein  34.27 
 
 		 615 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.674482  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0466  preprotein translocase subunit SecD  34.78 
 
 		 615 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0507  preprotein translocase subunit SecD  34.78 
 
 		 615 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.714923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0453  preprotein translocase subunit SecD  34.78 
 
 		 615 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2350  preprotein translocase subunit SecD  34.47 
 
 		 618 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.951904  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0447  preprotein translocase subunit SecD  34.78 
 
 		 615 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0446  preprotein translocase subunit SecD  34.78 
 
 		 615 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1084  preprotein translocase subunit SecD  36.8 
 
 		 556 aa  197  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.111435 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1313  preprotein translocase subunit SecD  34.81 
 
 		 616 aa  198  2.0000000000000003e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.198401  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2184  protein-export membrane protein SecD  37.44 
 
 		 620 aa  198  2.0000000000000003e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2066  preprotein translocase subunit SecD  34.87 
 
 		 623 aa  197  3e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.666611  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  36.03 
 
 		 533 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  33.84 
 
 		 761 aa  197  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1292  preprotein translocase subunit SecD  34.76 
 
 		 620 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14630  preprotein translocase subunit SecD  35 
 
 		 620 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  36.52 
 
 		 533 aa  196  6e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3289  preprotein translocase subunit SecD  35.04 
 
 		 604 aa  196  9e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  36.24 
 
 		 843 aa  196  9e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1063  preprotein translocase subunit SecD  35.29 
 
 		 615 aa  195  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256647 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01347  preprotein translocase subunit SecD  34.72 
 
 		 599 aa  195  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>