More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0282 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0282  preprotein translocase subunit SecD  100 
 
 		 496 aa  985    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.621699  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09521  preprotein translocase subunit SecD  97.98 
 
 		 496 aa  966    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.1601 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16221  preprotein translocase subunit SecD  62.96 
 
 		 495 aa  613  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07161  preprotein translocase subunit SecD  61.24 
 
 		 489 aa  607  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.145798 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1279  preprotein translocase subunit SecD  60.69 
 
 		 495 aa  598  1e-170  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.221382  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1191  preprotein translocase subunit SecD  59.43 
 
 		 493 aa  598  1e-170  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10121  preprotein translocase subunit SecD  58.67 
 
 		 486 aa  560  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09311  preprotein translocase subunit SecD  57.38 
 
 		 489 aa  542  1e-153  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.483137  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0870  preprotein translocase subunit SecD  57.68 
 
 		 489 aa  538  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09291  preprotein translocase subunit SecD  56.58 
 
 		 487 aa  535  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3212  preprotein translocase subunit SecD  47.97 
 
 		 470 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.718211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2884  preprotein translocase subunit SecD  47.97 
 
 		 470 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1490  preprotein translocase subunit SecD  49.13 
 
 		 474 aa  419  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0142  preprotein translocase subunit SecD  44.81 
 
 		 464 aa  420  1e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4539  protein-export membrane protein SecD  46.68 
 
 		 470 aa  421  1e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.470079  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1028  preprotein translocase subunit SecD  46.67 
 
 		 471 aa  412  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.016566 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5077  preprotein translocase subunit SecD  47.31 
 
 		 461 aa  411  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5128  preprotein translocase subunit SecD  49.13 
 
 		 464 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.473691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0079  protein-export membrane protein SecD  34.56 
 
 		 515 aa  262  1e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  34.15 
 
 		 761 aa  254  3e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1217  protein-export membrane protein SecD  38.39 
 
 		 457 aa  243  7e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000711082  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  36.63 
 
 		 530 aa  243  7e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  34.07 
 
 		 533 aa  241  2e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000256259  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8810  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.15 
 
 		 756 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3982  protein-export membrane protein SecD  34.99 
 
 		 468 aa  240  4e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.728055 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  36.96 
 
 		 533 aa  239  9e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  35.75 
 
 		 533 aa  239  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0387  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.74 
 
 		 911 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.807363  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0563  protein-export membrane protein SecD  35.56 
 
 		 473 aa  236  5.0000000000000005e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1313  preprotein translocase subunit SecD  35.02 
 
 		 616 aa  235  1.0000000000000001e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.198401  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3326  protein-export membrane protein SecD  34.23 
 
 		 474 aa  233  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2442  protein-export membrane protein SecD  35.39 
 
 		 524 aa  234  4.0000000000000004e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000311445  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  33.33 
 
 		 594 aa  232  9e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  33.33 
 
 		 594 aa  232  9e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0012  preprotein translocase subunit SecD  35.15 
 
 		 594 aa  232  1e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.216124  hitchhiker  0.00885825 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  34.32 
 
 		 533 aa  232  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  35.27 
 
 		 532 aa  231  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  33.72 
 
 		 533 aa  231  2e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  34.1 
 
 		 533 aa  231  2e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  35.02 
 
 		 532 aa  229  6e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1691  protein-export membrane protein SecD  41.58 
 
 		 461 aa  228  2e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0199339  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  35.51 
 
 		 530 aa  228  3e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  43.69 
 
 		 403 aa  227  3e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000290493  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  35.6 
 
 		 534 aa  227  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0503  preprotein translocase subunit SecD  36.14 
 
 		 534 aa  227  5.0000000000000005e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153104  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0854  preprotein translocase subunit SecD  35.75 
 
 		 533 aa  226  7e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00356  protein export protein SecD  35.81 
 
 		 615 aa  225  1e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.698554  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3201  protein-export membrane protein SecD  35.81 
 
 		 604 aa  226  1e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.167397  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0478  preprotein translocase subunit SecD  35.81 
 
 		 615 aa  225  1e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3225  preprotein translocase subunit SecD  35.81 
 
 		 604 aa  226  1e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.457914  hitchhiker  0.00000220398 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0488  preprotein translocase subunit SecD  35.81 
 
 		 615 aa  225  1e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00360  hypothetical protein  35.81 
 
 		 615 aa  225  1e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.674482  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0438  preprotein translocase subunit SecD  35.81 
 
 		 615 aa  225  1e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1629  protein-export membrane protein SecD  33.26 
 
 		 748 aa  225  1e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.683752  normal  0.475056 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0327  preprotein translocase subunit SecD  35.81 
 
 		 615 aa  225  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.328268  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0440  preprotein translocase subunit SecD  35.81 
 
 		 615 aa  225  1e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1669  preprotein translocase subunit SecD  44.77 
 
 		 413 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000293049  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  34.09 
 
 		 533 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1123  preprotein translocase subunit SecD  44.4 
 
 		 416 aa  224  3e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.7 
 
 		 848 aa  224  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0877  preprotein translocase subunit SecD  35.35 
 
 		 615 aa  224  3e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1334  protein-export membrane protein SecD  33.69 
 
 		 487 aa  224  3e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.763605  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  33.04 
 
 		 525 aa  223  4.9999999999999996e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0011  preprotein translocase subunit SecD  33.12 
 
 		 605 aa  223  8e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.019109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.96 
 
 		 849 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  34.84 
 
 		 533 aa  219  7e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3095  preprotein translocase subunit SecD  35.81 
 
 		 604 aa  219  7.999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303944  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  35.56 
 
 		 533 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  42.86 
 
 		 406 aa  219  8.999999999999998e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  34.98 
 
 		 531 aa  219  8.999999999999998e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  33.01 
 
 		 532 aa  219  1e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0012  preprotein translocase subunit SecD  32.39 
 
 		 607 aa  219  1e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000769208  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  32.91 
 
 		 531 aa  218  2e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.99 
 
 		 856 aa  218  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1769  protein-export membrane protein SecD  33.96 
 
 		 512 aa  216  8e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  35.14 
 
 		 533 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1604  protein-export membrane protein SecD  42.07 
 
 		 399 aa  216  9.999999999999999e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0444022  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.58 
 
 		 853 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3262  preprotein translocase subunit SecD  34.65 
 
 		 604 aa  213  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.103027  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1929  preprotein translocase subunit SecD  32.58 
 
 		 526 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0007  preprotein translocase subunit SecD  33.03 
 
 		 595 aa  213  5.999999999999999e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.211478 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  32.79 
 
 		 535 aa  213  7e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  31.88 
 
 		 532 aa  213  7e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2904  preprotein translocase subunit SecD  36.28 
 
 		 604 aa  213  7.999999999999999e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.392926  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1455  protein-export membrane protein SecD  42.18 
 
 		 622 aa  212  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.202191  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2184  protein-export membrane protein SecD  35.42 
 
 		 620 aa  210  4e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0504  protein-export membrane protein SecD  33.77 
 
 		 462 aa  210  6e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000522922  hitchhiker  0.000170526 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3121  preprotein translocase subunit SecD  34.88 
 
 		 615 aa  209  6e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000987582  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3382  preprotein translocase subunit SecD  34.88 
 
 		 615 aa  209  6e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00120261  normal  0.627671 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  33.89 
 
 		 530 aa  209  7e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1410  protein-export membrane protein SecD  31.3 
 
 		 613 aa  209  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.447303  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_275  protein-export membrane protein, preprotein translocase SecD subunit  31.59 
 
 		 449 aa  209  1e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000478055  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0313  preprotein translocase subunit SecD  31.59 
 
 		 449 aa  209  1e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000119854  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  33.33 
 
 		 532 aa  207  3e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2540  protein-export membrane protein SecD  31.22 
 
 		 613 aa  207  4e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.712905  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1407  secretion protein SecD  31.18 
 
 		 622 aa  207  4e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0970542  normal  0.495357 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1309  protein-export membrane protein SecD  31.18 
 
 		 613 aa  207  5e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.198651  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0333  preprotein translocase subunit SecD  31.59 
 
 		 449 aa  206  6e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000488895  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1356  preprotein translocase subunit SecD  36.06 
 
 		 410 aa  206  7e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.066873  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.93 
 
 		 839 aa  206  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>