More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3221 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0387  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  46.68 
 
 
911 aa  723    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.807363  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1629  protein-export membrane protein SecD  60.55 
 
 
748 aa  810    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.683752  normal  0.475056 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  100 
 
 
761 aa  1499    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8810  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  65.14 
 
 
756 aa  866    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1073  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  53.25 
 
 
753 aa  628  1e-178  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0361267  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4072  protein-export membrane protein SecD  49.4 
 
 
885 aa  584  1.0000000000000001e-165  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  33.2 
 
 
735 aa  390  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.53 
 
 
853 aa  387  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.09 
 
 
848 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_004310  BR1324  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.84 
 
 
845 aa  377  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0375911  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.13 
 
 
849 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1284  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.74 
 
 
844 aa  375  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1860  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.63 
 
 
844 aa  372  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.91 
 
 
856 aa  371  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.15 
 
 
856 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  34.71 
 
 
843 aa  362  1e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0878  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.76 
 
 
834 aa  360  4e-98  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.335263  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  34.67 
 
 
740 aa  356  1e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  33.96 
 
 
759 aa  354  4e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.13 
 
 
762 aa  352  2e-95  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0181  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.82 
 
 
844 aa  351  4e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.06 
 
 
839 aa  348  2e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0092  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.89 
 
 
995 aa  345  1e-93  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5169  protein-export membrane protein SecD  34.91 
 
 
1029 aa  345  2e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325981  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3464  protein-export membrane protein SecD  32.33 
 
 
849 aa  342  2e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.068989  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0113  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.7 
 
 
991 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.758548 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0935  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.54 
 
 
750 aa  336  7.999999999999999e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1420  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.57 
 
 
990 aa  332  1e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.469149  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4545  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.61 
 
 
754 aa  327  5e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.61 
 
 
754 aa  326  1e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  32.82 
 
 
989 aa  326  1e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4306  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.47 
 
 
754 aa  325  2e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4144  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.34 
 
 
754 aa  325  2e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4641  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.47 
 
 
754 aa  325  2e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4491  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.34 
 
 
754 aa  325  2e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000282789 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2513  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.07 
 
 
750 aa  324  4e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000183584  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3127  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.44 
 
 
752 aa  323  9.999999999999999e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4530  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.34 
 
 
754 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.566924  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0705  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.51 
 
 
754 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4155  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.2 
 
 
754 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1762  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.89 
 
 
981 aa  320  7.999999999999999e-86  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4258  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.52 
 
 
755 aa  319  1e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3596  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.8 
 
 
996 aa  317  4e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.318172 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0984  protein-export membrane protein SecD  28.73 
 
 
900 aa  312  2e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.583326 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12600  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  27.64 
 
 
977 aa  310  8e-83  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08751  putative protein-export transmembrane SecDF protein  32.52 
 
 
1001 aa  310  9e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392094  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.17 
 
 
759 aa  305  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1727  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.17 
 
 
759 aa  305  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.347489  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1604  protein-export membrane protein SecD  40 
 
 
399 aa  303  6.000000000000001e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0444022  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2178  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.15 
 
 
995 aa  301  3e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.900836  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6254  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.17 
 
 
1055 aa  299  1e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.82 
 
 
846 aa  295  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.823548 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07200  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  29.69 
 
 
855 aa  293  9e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2256  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.74 
 
 
991 aa  292  2e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1201  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.57 
 
 
763 aa  290  7e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.732454  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.37 
 
 
846 aa  288  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2336  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.49 
 
 
759 aa  286  9e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.217617  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0716  SecD/SecF family protein-export membrane protein  29.12 
 
 
734 aa  286  9e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000203356  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1501  protein-export membrane protein SecD  29.97 
 
 
793 aa  284  5.000000000000001e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.365573  normal  0.0601553 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07161  preprotein translocase subunit SecD  36.44 
 
 
489 aa  276  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.145798 
 
 
-
 
NC_004310  BR0891  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.37 
 
 
785 aa  275  2.0000000000000002e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.983907  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0887  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.63 
 
 
785 aa  275  2.0000000000000002e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  38.61 
 
 
406 aa  274  4.0000000000000004e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  42.16 
 
 
525 aa  274  4.0000000000000004e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4539  protein-export membrane protein SecD  39.29 
 
 
470 aa  274  5.000000000000001e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.470079  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0142  preprotein translocase subunit SecD  38.7 
 
 
464 aa  273  1e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1279  preprotein translocase subunit SecD  37.14 
 
 
495 aa  271  2.9999999999999997e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.221382  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  41.71 
 
 
554 aa  271  4e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5077  preprotein translocase subunit SecD  36.75 
 
 
461 aa  270  7e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  41.24 
 
 
530 aa  269  1e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1669  preprotein translocase subunit SecD  38.13 
 
 
413 aa  268  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000293049  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1191  preprotein translocase subunit SecD  37.71 
 
 
493 aa  267  7e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1691  protein-export membrane protein SecD  38.06 
 
 
461 aa  266  8e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0199339  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  40.8 
 
 
554 aa  265  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  40.8 
 
 
554 aa  265  2e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1028  preprotein translocase subunit SecD  37.96 
 
 
471 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.016566 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  37.32 
 
 
403 aa  266  2e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000290493  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  38.94 
 
 
531 aa  265  3e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1929  preprotein translocase subunit SecD  41.62 
 
 
526 aa  265  3e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  38.57 
 
 
532 aa  265  3e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1490  preprotein translocase subunit SecD  36.96 
 
 
474 aa  264  4.999999999999999e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3212  preprotein translocase subunit SecD  36.94 
 
 
470 aa  262  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.718211  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  40.42 
 
 
531 aa  262  2e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2884  preprotein translocase subunit SecD  36.94 
 
 
470 aa  262  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  39.79 
 
 
533 aa  259  9e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  39.2 
 
 
533 aa  259  1e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  39.25 
 
 
554 aa  259  2e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  39.9 
 
 
532 aa  258  3e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  39.56 
 
 
533 aa  258  3e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  39.49 
 
 
534 aa  256  9e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  39.45 
 
 
533 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09521  preprotein translocase subunit SecD  33.53 
 
 
496 aa  256  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.1601 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0282  preprotein translocase subunit SecD  34.22 
 
 
496 aa  256  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.621699  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  40.9 
 
 
532 aa  255  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  38.56 
 
 
533 aa  255  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  38.52 
 
 
535 aa  254  5.000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1217  protein-export membrane protein SecD  39.41 
 
 
457 aa  254  5.000000000000001e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000711082  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1334  protein-export membrane protein SecD  35.32 
 
 
487 aa  254  5.000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.763605  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  39.64 
 
 
533 aa  254  6e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  36.71 
 
 
532 aa  253  7e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>