More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_10121 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_10121  preprotein translocase subunit SecD  100 
 
 		 486 aa  957    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09311  preprotein translocase subunit SecD  79.22 
 
 		 489 aa  776    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.483137  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0870  preprotein translocase subunit SecD  80.12 
 
 		 489 aa  763    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09291  preprotein translocase subunit SecD  79.84 
 
 		 487 aa  777    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07161  preprotein translocase subunit SecD  58.64 
 
 		 489 aa  565  1e-160  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.145798 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0282  preprotein translocase subunit SecD  58.67 
 
 		 496 aa  560  1e-158  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.621699  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09521  preprotein translocase subunit SecD  58.23 
 
 		 496 aa  561  1e-158  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.1601 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1279  preprotein translocase subunit SecD  57.37 
 
 		 495 aa  553  1e-156  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.221382  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16221  preprotein translocase subunit SecD  57.08 
 
 		 495 aa  542  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1191  preprotein translocase subunit SecD  54.75 
 
 		 493 aa  526  1e-148  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0142  preprotein translocase subunit SecD  46.42 
 
 		 464 aa  412  1e-114  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5077  preprotein translocase subunit SecD  44.31 
 
 		 461 aa  403  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2884  preprotein translocase subunit SecD  45.96 
 
 		 470 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3212  preprotein translocase subunit SecD  45.96 
 
 		 470 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.718211  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4539  protein-export membrane protein SecD  43.62 
 
 		 470 aa  393  1e-108  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.470079  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1028  preprotein translocase subunit SecD  46.02 
 
 		 471 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.016566 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1490  preprotein translocase subunit SecD  45.32 
 
 		 474 aa  378  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5128  preprotein translocase subunit SecD  43.53 
 
 		 464 aa  335  1e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.473691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0079  protein-export membrane protein SecD  36.72 
 
 		 515 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  33.81 
 
 		 761 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3326  protein-export membrane protein SecD  33.12 
 
 		 474 aa  243  3.9999999999999997e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3982  protein-export membrane protein SecD  32.83 
 
 		 468 aa  240  4e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.728055 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  34.52 
 
 		 533 aa  240  5e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  34.43 
 
 		 533 aa  237  3e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  36.24 
 
 		 533 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000256259  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  35.11 
 
 		 532 aa  233  8.000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1334  protein-export membrane protein SecD  32.21 
 
 		 487 aa  232  1e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.763605  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0563  protein-export membrane protein SecD  36.16 
 
 		 473 aa  231  2e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.82 
 
 		 856 aa  225  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2442  protein-export membrane protein SecD  35.93 
 
 		 524 aa  224  2e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000311445  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  33.82 
 
 		 533 aa  225  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1669  preprotein translocase subunit SecD  42.36 
 
 		 413 aa  224  3e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000293049  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  36.67 
 
 		 533 aa  223  7e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1769  protein-export membrane protein SecD  34.01 
 
 		 512 aa  222  9.999999999999999e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0504  protein-export membrane protein SecD  33.06 
 
 		 462 aa  221  3e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000522922  hitchhiker  0.000170526 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  34.98 
 
 		 525 aa  221  3e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1691  protein-export membrane protein SecD  34.36 
 
 		 461 aa  219  7e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0199339  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0011  preprotein translocase subunit SecD  34.92 
 
 		 605 aa  218  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.019109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1217  protein-export membrane protein SecD  35.49 
 
 		 457 aa  219  1e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000711082  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  33.78 
 
 		 535 aa  218  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  35.38 
 
 		 533 aa  219  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  33.56 
 
 		 530 aa  219  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0012  preprotein translocase subunit SecD  35.53 
 
 		 594 aa  219  1e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.216124  hitchhiker  0.00885825 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  33.66 
 
 		 531 aa  218  2e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8810  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32 
 
 		 756 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  33.72 
 
 		 533 aa  216  8e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1629  protein-export membrane protein SecD  34.02 
 
 		 748 aa  216  9e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.683752  normal  0.475056 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  32.81 
 
 		 531 aa  216  9.999999999999999e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0007  preprotein translocase subunit SecD  33.33 
 
 		 595 aa  215  9.999999999999999e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.211478 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  34.02 
 
 		 533 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  32.86 
 
 		 532 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1123  preprotein translocase subunit SecD  38.19 
 
 		 416 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0503  preprotein translocase subunit SecD  34.03 
 
 		 534 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153104  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  33.1 
 
 		 534 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  32.45 
 
 		 532 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  34.2 
 
 		 532 aa  213  9e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  34.23 
 
 		 533 aa  211  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  35.2 
 
 		 740 aa  211  2e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  33.49 
 
 		 532 aa  211  3e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1313  preprotein translocase subunit SecD  34.12 
 
 		 616 aa  210  4e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.198401  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0536  protein-export membrane protein SecD  34.52 
 
 		 441 aa  210  4e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000245038  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  33.25 
 
 		 594 aa  210  6e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  33.25 
 
 		 594 aa  210  6e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  42.7 
 
 		 403 aa  210  6e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000290493  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0625  preprotein translocase subunit SecD  44.36 
 
 		 415 aa  209  6e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000418015  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.34 
 
 		 853 aa  209  8e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  41.78 
 
 		 406 aa  209  9e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.38 
 
 		 848 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2396  protein-export membrane protein SecD  32.02 
 
 		 637 aa  208  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  29.98 
 
 		 531 aa  207  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.18 
 
 		 849 aa  207  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  33 
 
 		 530 aa  207  5e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1218  preprotein translocase subunit SecD  34.29 
 
 		 621 aa  207  5e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518755 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.2 
 
 		 856 aa  206  7e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0012  preprotein translocase subunit SecD  32.2 
 
 		 607 aa  206  7e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000769208  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  30.37 
 
 		 535 aa  205  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2184  protein-export membrane protein SecD  32.97 
 
 		 620 aa  206  1e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0877  preprotein translocase subunit SecD  33.12 
 
 		 615 aa  205  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.66 
 
 		 839 aa  204  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0446  preprotein translocase subunit SecD  32.97 
 
 		 615 aa  203  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0453  preprotein translocase subunit SecD  32.97 
 
 		 615 aa  203  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2276  protein-export membrane protein SecD  30.16 
 
 		 534 aa  203  6e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.394363  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00356  protein export protein SecD  33.33 
 
 		 615 aa  202  8e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.698554  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00360  hypothetical protein  33.33 
 
 		 615 aa  202  8e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.674482  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0488  preprotein translocase subunit SecD  33.33 
 
 		 615 aa  202  8e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0440  preprotein translocase subunit SecD  33.33 
 
 		 615 aa  202  8e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0327  preprotein translocase subunit SecD  33.33 
 
 		 615 aa  202  8e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.328268  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0438  preprotein translocase subunit SecD  33.33 
 
 		 615 aa  202  8e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0478  preprotein translocase subunit SecD  33.33 
 
 		 615 aa  202  8e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3201  protein-export membrane protein SecD  32.78 
 
 		 604 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.167397  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3225  preprotein translocase subunit SecD  32.78 
 
 		 604 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.457914  hitchhiker  0.00000220398 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2066  preprotein translocase subunit SecD  34.77 
 
 		 623 aa  202  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.666611  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1571  protein-export membrane protein SecD  31.21 
 
 		 503 aa  202  9.999999999999999e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  31.99 
 
 		 532 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2073  preprotein translocase subunit SecD  31.81 
 
 		 535 aa  202  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0333  preprotein translocase subunit SecD  32.28 
 
 		 449 aa  201  3e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000488895  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0447  preprotein translocase subunit SecD  32.81 
 
 		 615 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0507  preprotein translocase subunit SecD  32.81 
 
 		 615 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.714923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0466  preprotein translocase subunit SecD  32.81 
 
 		 615 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  32.01 
 
 		 554 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>