More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1028 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_3212  preprotein translocase subunit SecD  77.23 
 
 		 470 aa  736    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.718211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2884  preprotein translocase subunit SecD  77.23 
 
 		 470 aa  736    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1028  preprotein translocase subunit SecD  100 
 
 		 471 aa  936    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.016566 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0142  preprotein translocase subunit SecD  66.03 
 
 		 464 aa  608  1e-173  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4539  protein-export membrane protein SecD  65.33 
 
 		 470 aa  597  1e-169  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.470079  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5077  preprotein translocase subunit SecD  64.74 
 
 		 461 aa  592  1e-168  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1490  preprotein translocase subunit SecD  65.56 
 
 		 474 aa  588  1e-166  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5128  preprotein translocase subunit SecD  65 
 
 		 464 aa  540  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.473691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1191  preprotein translocase subunit SecD  49.7 
 
 		 493 aa  458  9.999999999999999e-129  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1279  preprotein translocase subunit SecD  50.41 
 
 		 495 aa  458  1e-127  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.221382  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07161  preprotein translocase subunit SecD  48.72 
 
 		 489 aa  431  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.145798 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16221  preprotein translocase subunit SecD  50 
 
 		 495 aa  424  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09521  preprotein translocase subunit SecD  45.25 
 
 		 496 aa  414  1e-114  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.1601 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0282  preprotein translocase subunit SecD  45.29 
 
 		 496 aa  415  1e-114  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.621699  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09291  preprotein translocase subunit SecD  46.44 
 
 		 487 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09311  preprotein translocase subunit SecD  44.97 
 
 		 489 aa  405  1e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.483137  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0870  preprotein translocase subunit SecD  47.62 
 
 		 489 aa  398  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10121  preprotein translocase subunit SecD  45.57 
 
 		 486 aa  396  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1669  preprotein translocase subunit SecD  42.52 
 
 		 413 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000293049  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0079  protein-export membrane protein SecD  40.53 
 
 		 515 aa  291  2e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  40.13 
 
 		 403 aa  290  5.0000000000000004e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000290493  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1123  preprotein translocase subunit SecD  39.9 
 
 		 416 aa  288  2e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  41.97 
 
 		 853 aa  288  2e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.32 
 
 		 849 aa  286  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.72 
 
 		 848 aa  286  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1604  protein-export membrane protein SecD  40.92 
 
 		 399 aa  287  4e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0444022  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  39.56 
 
 		 735 aa  286  5e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3326  protein-export membrane protein SecD  40.52 
 
 		 474 aa  286  5.999999999999999e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  40.62 
 
 		 594 aa  286  8e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  40.62 
 
 		 594 aa  286  8e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  40.9 
 
 		 533 aa  283  5.000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  40.49 
 
 		 533 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  40.05 
 
 		 535 aa  282  1e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  40.49 
 
 		 533 aa  281  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  40.33 
 
 		 534 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  41.39 
 
 		 530 aa  280  3e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  40.97 
 
 		 532 aa  280  4e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1691  protein-export membrane protein SecD  38.76 
 
 		 461 aa  279  8e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0199339  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3982  protein-export membrane protein SecD  40.37 
 
 		 468 aa  278  1e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.728055 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  44.24 
 
 		 856 aa  278  1e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  43.34 
 
 		 839 aa  278  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12260  protein-export membrane protein SecD  39.62 
 
 		 403 aa  277  3e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000764404  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  41.41 
 
 		 533 aa  276  6e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  39.6 
 
 		 533 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000256259  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  40.15 
 
 		 533 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  39.64 
 
 		 533 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1217  protein-export membrane protein SecD  44.08 
 
 		 457 aa  271  1e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000711082  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  40.26 
 
 		 532 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1462  preprotein translocase subunit SecD  39.74 
 
 		 411 aa  270  5e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000572302  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  39.13 
 
 		 530 aa  270  5e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  39.28 
 
 		 532 aa  270  5e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2442  protein-export membrane protein SecD  43.38 
 
 		 524 aa  269  8e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000311445  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  40.31 
 
 		 533 aa  268  2e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  37.96 
 
 		 761 aa  268  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  40.78 
 
 		 531 aa  268  2e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  43.01 
 
 		 856 aa  268  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0387  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.47 
 
 		 911 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.807363  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  42.71 
 
 		 531 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0563  protein-export membrane protein SecD  38.55 
 
 		 473 aa  266  4e-70  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0504  protein-export membrane protein SecD  40.97 
 
 		 462 aa  266  8e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000522922  hitchhiker  0.000170526 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3104  protein-export membrane protein SecD  40.22 
 
 		 538 aa  265  2e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000111638  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  40.1 
 
 		 554 aa  263  4.999999999999999e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  38.24 
 
 		 532 aa  261  2e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  40.57 
 
 		 530 aa  261  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  36.78 
 
 		 843 aa  260  3e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  40.47 
 
 		 535 aa  260  4e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  39.26 
 
 		 532 aa  259  7e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  39.85 
 
 		 525 aa  258  1e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1629  protein-export membrane protein SecD  40.55 
 
 		 748 aa  258  2e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.683752  normal  0.475056 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  40.47 
 
 		 532 aa  256  8e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8810  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.61 
 
 		 756 aa  255  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  36.49 
 
 		 406 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0625  preprotein translocase subunit SecD  48.08 
 
 		 415 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000418015  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  42.78 
 
 		 533 aa  254  3e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1272  preprotein translocase subunit SecD  37.21 
 
 		 411 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2276  protein-export membrane protein SecD  38.76 
 
 		 534 aa  253  6e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.394363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  40.78 
 
 		 533 aa  253  7e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1929  preprotein translocase subunit SecD  39.02 
 
 		 526 aa  252  8.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  39.04 
 
 		 554 aa  252  9.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0503  preprotein translocase subunit SecD  39.02 
 
 		 534 aa  250  3e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153104  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1084  preprotein translocase subunit SecD  36.45 
 
 		 556 aa  251  3e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.111435 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0012  preprotein translocase subunit SecD  37.41 
 
 		 594 aa  250  4e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.216124  hitchhiker  0.00885825 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4072  protein-export membrane protein SecD  33.95 
 
 		 885 aa  250  4e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  37.47 
 
 		 554 aa  250  4e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0313  preprotein translocase subunit SecD  38.69 
 
 		 449 aa  250  5e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000119854  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  40.14 
 
 		 740 aa  249  8e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_002936  DET0333  preprotein translocase subunit SecD  37.67 
 
 		 449 aa  247  3e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000488895  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  38.29 
 
 		 554 aa  247  3e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  38.29 
 
 		 554 aa  247  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0854  preprotein translocase subunit SecD  39.02 
 
 		 533 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0878  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.15 
 
 		 834 aa  246  6.999999999999999e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.335263  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_275  protein-export membrane protein, preprotein translocase SecD subunit  37.9 
 
 		 449 aa  245  9.999999999999999e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000478055  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1714  preprotein translocase subunit SecD  39.28 
 
 		 537 aa  245  9.999999999999999e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4747  protein-export membrane protein SecD  37.38 
 
 		 533 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122054  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1309  protein-export membrane protein SecD  37.7 
 
 		 613 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.198651  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2197  preprotein translocase subunit SecD  36.32 
 
 		 419 aa  244  3e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1860  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.21 
 
 		 844 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1356  preprotein translocase subunit SecD  36.45 
 
 		 410 aa  243  3.9999999999999997e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.066873  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1410  protein-export membrane protein SecD  37.47 
 
 		 613 aa  243  5e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.447303  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4005  preprotein translocase subunit SecD  38.01 
 
 		 632 aa  243  5e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>