More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0504 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_0504  protein-export membrane protein SecD  100 
 
 		 462 aa  907    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000522922  hitchhiker  0.000170526 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3982  protein-export membrane protein SecD  64.54 
 
 		 468 aa  570  1e-161  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.728055 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3326  protein-export membrane protein SecD  63.26 
 
 		 474 aa  570  1e-161  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3104  protein-export membrane protein SecD  50 
 
 		 538 aa  433  1e-120  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000111638  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0079  protein-export membrane protein SecD  43.14 
 
 		 515 aa  381  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2884  preprotein translocase subunit SecD  41.24 
 
 		 470 aa  277  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3212  preprotein translocase subunit SecD  41.24 
 
 		 470 aa  277  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.718211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0142  preprotein translocase subunit SecD  39.29 
 
 		 464 aa  266  7e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5077  preprotein translocase subunit SecD  39.34 
 
 		 461 aa  266  8e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1028  preprotein translocase subunit SecD  41.03 
 
 		 471 aa  263  6e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.016566 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4539  protein-export membrane protein SecD  37.31 
 
 		 470 aa  258  1e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.470079  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1490  preprotein translocase subunit SecD  38.51 
 
 		 474 aa  258  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1272  preprotein translocase subunit SecD  35.73 
 
 		 411 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1604  protein-export membrane protein SecD  37.21 
 
 		 399 aa  249  6e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0444022  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1123  preprotein translocase subunit SecD  35.43 
 
 		 416 aa  249  1e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  35.45 
 
 		 735 aa  248  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1669  preprotein translocase subunit SecD  37.89 
 
 		 413 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000293049  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1908  preprotein translocase subunit SecD  35.61 
 
 		 419 aa  242  1e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154062  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  34.93 
 
 		 406 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2197  preprotein translocase subunit SecD  35.61 
 
 		 419 aa  240  2.9999999999999997e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  38.14 
 
 		 554 aa  240  5e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1691  protein-export membrane protein SecD  33.92 
 
 		 461 aa  238  1e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0199339  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  34.53 
 
 		 403 aa  239  1e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000290493  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1356  preprotein translocase subunit SecD  35.54 
 
 		 410 aa  236  5.0000000000000005e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.066873  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  38.05 
 
 		 533 aa  236  6e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5128  preprotein translocase subunit SecD  38.71 
 
 		 464 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.473691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12260  protein-export membrane protein SecD  36.01 
 
 		 403 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000764404  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0625  preprotein translocase subunit SecD  34.55 
 
 		 415 aa  234  3e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000418015  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  36.12 
 
 		 533 aa  233  5e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  37.79 
 
 		 532 aa  233  6e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0563  protein-export membrane protein SecD  35.05 
 
 		 473 aa  233  6e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0313  preprotein translocase subunit SecD  36.96 
 
 		 449 aa  233  7.000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000119854  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_275  protein-export membrane protein, preprotein translocase SecD subunit  37.25 
 
 		 449 aa  231  3e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000478055  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0333  preprotein translocase subunit SecD  37.05 
 
 		 449 aa  229  6e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000488895  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1462  preprotein translocase subunit SecD  39.24 
 
 		 411 aa  229  6e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000572302  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07161  preprotein translocase subunit SecD  35.08 
 
 		 489 aa  228  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.145798 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1191  preprotein translocase subunit SecD  34.99 
 
 		 493 aa  227  3e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.86 
 
 		 853 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  37.28 
 
 		 533 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  36.1 
 
 		 533 aa  226  1e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000256259  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  39.34 
 
 		 533 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.44 
 
 		 839 aa  224  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  37.01 
 
 		 534 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.36 
 
 		 848 aa  224  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  37.24 
 
 		 533 aa  223  6e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  35.61 
 
 		 554 aa  222  9.999999999999999e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1279  preprotein translocase subunit SecD  35.06 
 
 		 495 aa  221  1.9999999999999999e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.221382  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10121  preprotein translocase subunit SecD  33.06 
 
 		 486 aa  221  3e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.08 
 
 		 849 aa  221  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  37.04 
 
 		 594 aa  220  5e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  37.04 
 
 		 594 aa  220  5e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1084  preprotein translocase subunit SecD  36.43 
 
 		 556 aa  218  1e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.111435 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  37.98 
 
 		 554 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  35.7 
 
 		 530 aa  218  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  36 
 
 		 554 aa  216  5e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  36 
 
 		 554 aa  216  5e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  36.78 
 
 		 535 aa  216  7e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16221  preprotein translocase subunit SecD  33.99 
 
 		 495 aa  216  8e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  38.42 
 
 		 531 aa  216  9.999999999999999e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  35.44 
 
 		 533 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.31 
 
 		 856 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  36.19 
 
 		 740 aa  214  3.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  36.81 
 
 		 759 aa  213  3.9999999999999995e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  37.22 
 
 		 535 aa  213  7e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09521  preprotein translocase subunit SecD  33.99 
 
 		 496 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.1601 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  37.6 
 
 		 532 aa  211  2e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1416  preprotein translocase subunit SecD  34.97 
 
 		 554 aa  211  3e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.457453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0282  preprotein translocase subunit SecD  33.77 
 
 		 496 aa  210  5e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.621699  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1860  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.11 
 
 		 844 aa  210  6e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  34.66 
 
 		 530 aa  208  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1217  protein-export membrane protein SecD  36.61 
 
 		 457 aa  208  1e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000711082  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  35.68 
 
 		 533 aa  208  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1714  preprotein translocase subunit SecD  36.54 
 
 		 537 aa  208  2e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  36.62 
 
 		 532 aa  207  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4747  protein-export membrane protein SecD  36.55 
 
 		 533 aa  207  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122054  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  34.47 
 
 		 525 aa  207  3e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0086  preprotein translocase subunit SecD  34.56 
 
 		 501 aa  206  6e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.509625  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09311  preprotein translocase subunit SecD  32.57 
 
 		 489 aa  206  6e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.483137  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1334  protein-export membrane protein SecD  32.65 
 
 		 487 aa  206  7e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.763605  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09291  preprotein translocase subunit SecD  32.15 
 
 		 487 aa  206  8e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  35.57 
 
 		 761 aa  205  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  36.11 
 
 		 532 aa  205  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2276  protein-export membrane protein SecD  35.51 
 
 		 534 aa  204  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.394363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4598  protein-export membrane protein SecD  36.04 
 
 		 532 aa  204  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.278601  normal  0.122779 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1285  protein-export membrane protein SecD  34.42 
 
 		 423 aa  204  4e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0952765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.74 
 
 		 856 aa  204  4e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0870  preprotein translocase subunit SecD  31.71 
 
 		 489 aa  202  8e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4228  protein-export membrane protein SecD  35.79 
 
 		 532 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2073  preprotein translocase subunit SecD  36.9 
 
 		 535 aa  201  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2491  protein-export membrane protein SecD  36.11 
 
 		 534 aa  199  6e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.743414  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1629  protein-export membrane protein SecD  35.4 
 
 		 748 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.683752  normal  0.475056 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1571  protein-export membrane protein SecD  33.41 
 
 		 503 aa  198  2.0000000000000003e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  36.46 
 
 		 843 aa  198  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0854  preprotein translocase subunit SecD  35.04 
 
 		 533 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2188  protein-export membrane protein SecD  36.36 
 
 		 534 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521622  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2442  protein-export membrane protein SecD  36.66 
 
 		 524 aa  197  3e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000311445  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2102  protein-export membrane protein SecD  31.45 
 
 		 433 aa  197  5.000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.459213  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0536  protein-export membrane protein SecD  28.24 
 
 		 441 aa  196  5.000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000245038  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1324  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.08 
 
 		 845 aa  196  8.000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0375911  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2540  protein-export membrane protein SecD  42.91 
 
 		 613 aa  196  9e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.712905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>