More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1629 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1073  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  57.01 
 
 
753 aa  660    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0361267  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  60.55 
 
 
761 aa  872    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0387  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  44.88 
 
 
911 aa  696    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.807363  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1629  protein-export membrane protein SecD  100 
 
 
748 aa  1468    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.683752  normal  0.475056 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8810  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  68.91 
 
 
756 aa  933    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4072  protein-export membrane protein SecD  51.65 
 
 
885 aa  597  1e-169  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  34.28 
 
 
735 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.87 
 
 
853 aa  390  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.68 
 
 
839 aa  377  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.75 
 
 
848 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0878  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.46 
 
 
834 aa  370  1e-101  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.335263  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.9 
 
 
849 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_004310  BR1324  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.2 
 
 
845 aa  367  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0375911  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1860  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.01 
 
 
844 aa  368  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.34 
 
 
856 aa  365  1e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1284  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.05 
 
 
844 aa  365  2e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.06 
 
 
856 aa  362  1e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  32.94 
 
 
843 aa  361  2e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  34.4 
 
 
759 aa  352  2e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.38 
 
 
762 aa  345  2e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0181  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.67 
 
 
844 aa  344  2.9999999999999997e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  34.64 
 
 
740 aa  337  3.9999999999999995e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3464  protein-export membrane protein SecD  32.53 
 
 
849 aa  332  1e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.068989  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0113  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.08 
 
 
991 aa  322  9.999999999999999e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.758548 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.87 
 
 
754 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4545  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.87 
 
 
754 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4258  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.28 
 
 
755 aa  321  3e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6254  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.27 
 
 
1055 aa  320  5e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5169  protein-export membrane protein SecD  33.72 
 
 
1029 aa  320  7.999999999999999e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325981  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  34.05 
 
 
989 aa  320  7.999999999999999e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4306  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.32 
 
 
754 aa  319  1e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4144  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.32 
 
 
754 aa  319  1e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4641  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.32 
 
 
754 aa  319  1e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4491  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.32 
 
 
754 aa  319  1e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000282789 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4530  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.09 
 
 
754 aa  318  2e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.566924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4155  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.19 
 
 
754 aa  317  6e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0705  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.19 
 
 
754 aa  316  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3127  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.05 
 
 
752 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2513  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.13 
 
 
750 aa  313  5.999999999999999e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000183584  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3596  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.73 
 
 
996 aa  311  2e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.318172 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08751  putative protein-export transmembrane SecDF protein  32.23 
 
 
1001 aa  312  2e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392094  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0935  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.1 
 
 
750 aa  311  2e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2256  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.93 
 
 
991 aa  309  2.0000000000000002e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0092  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.7 
 
 
995 aa  308  3e-82  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2178  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.03 
 
 
995 aa  306  1.0000000000000001e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.900836  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1727  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.37 
 
 
759 aa  301  3e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.347489  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.37 
 
 
759 aa  301  3e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12600  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  29.28 
 
 
977 aa  299  1e-79  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1420  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.47 
 
 
990 aa  298  2e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.469149  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4539  protein-export membrane protein SecD  42.46 
 
 
470 aa  297  4e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.470079  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.32 
 
 
846 aa  297  6e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2336  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.98 
 
 
759 aa  297  6e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.217617  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1201  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.43 
 
 
763 aa  296  7e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.732454  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.81 
 
 
846 aa  296  7e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.823548 
 
 
-
 
NC_002950  PG1762  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.33 
 
 
981 aa  296  9e-79  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  41.93 
 
 
403 aa  290  5.0000000000000004e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000290493  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1604  protein-export membrane protein SecD  38.33 
 
 
399 aa  289  1e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0444022  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0887  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.15 
 
 
785 aa  288  2.9999999999999996e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0891  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.87 
 
 
785 aa  287  5e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.983907  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0142  preprotein translocase subunit SecD  40.79 
 
 
464 aa  287  5.999999999999999e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5077  preprotein translocase subunit SecD  40.18 
 
 
461 aa  284  4.0000000000000003e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1691  protein-export membrane protein SecD  41 
 
 
461 aa  283  1e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0199339  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0716  SecD/SecF family protein-export membrane protein  30.52 
 
 
734 aa  281  4e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000203356  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2884  preprotein translocase subunit SecD  41.11 
 
 
470 aa  280  9e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3212  preprotein translocase subunit SecD  41.11 
 
 
470 aa  280  9e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.718211  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1669  preprotein translocase subunit SecD  41.92 
 
 
413 aa  276  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000293049  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1028  preprotein translocase subunit SecD  39.91 
 
 
471 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.016566 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1490  preprotein translocase subunit SecD  40.69 
 
 
474 aa  274  3e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  39.7 
 
 
406 aa  275  3e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07161  preprotein translocase subunit SecD  38.57 
 
 
489 aa  274  5.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.145798 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07200  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  29.07 
 
 
855 aa  274  6e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  41.9 
 
 
554 aa  273  1e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  41.9 
 
 
554 aa  273  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  42.27 
 
 
554 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  43.05 
 
 
531 aa  270  8e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  41.73 
 
 
532 aa  266  7e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  39.54 
 
 
554 aa  264  6e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1084  preprotein translocase subunit SecD  40.4 
 
 
556 aa  263  8.999999999999999e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.111435 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  39.5 
 
 
525 aa  263  1e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  38.6 
 
 
535 aa  262  2e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12260  protein-export membrane protein SecD  39.07 
 
 
403 aa  261  3e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000764404  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1285  protein-export membrane protein SecD  38.72 
 
 
423 aa  260  5.0000000000000005e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0952765  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  41.15 
 
 
533 aa  261  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  42.02 
 
 
534 aa  260  6e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  38.89 
 
 
533 aa  260  8e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1501  protein-export membrane protein SecD  34.86 
 
 
793 aa  258  2e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.365573  normal  0.0601553 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  38.95 
 
 
531 aa  258  3e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  41.67 
 
 
533 aa  257  7e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1123  preprotein translocase subunit SecD  37.34 
 
 
416 aa  257  7e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1217  protein-export membrane protein SecD  40 
 
 
457 aa  256  8e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000711082  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  39.32 
 
 
532 aa  256  9e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  37.86 
 
 
532 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  39.06 
 
 
533 aa  256  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1272  preprotein translocase subunit SecD  37.88 
 
 
411 aa  256  1.0000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  38.28 
 
 
533 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000256259  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16221  preprotein translocase subunit SecD  37.17 
 
 
495 aa  254  3e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  41.15 
 
 
533 aa  254  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5128  preprotein translocase subunit SecD  40.09 
 
 
464 aa  254  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.473691  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  38.89 
 
 
533 aa  253  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  37.47 
 
 
530 aa  252  1e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>