More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1285 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_1285  protein-export membrane protein SecD  100 
 
 
423 aa  842    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0952765  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  45.8 
 
 
403 aa  352  8e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000290493  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1123  preprotein translocase subunit SecD  47.57 
 
 
416 aa  341  1e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1272  preprotein translocase subunit SecD  42.09 
 
 
411 aa  317  3e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1669  preprotein translocase subunit SecD  46.1 
 
 
413 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000293049  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1604  protein-export membrane protein SecD  42.45 
 
 
399 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0444022  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12260  protein-export membrane protein SecD  42.6 
 
 
403 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000764404  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1462  preprotein translocase subunit SecD  42.25 
 
 
411 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000572302  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  43.06 
 
 
735 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  42.68 
 
 
406 aa  299  5e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1691  protein-export membrane protein SecD  40.75 
 
 
461 aa  298  1e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0199339  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1356  preprotein translocase subunit SecD  41.94 
 
 
410 aa  290  4e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.066873  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0625  preprotein translocase subunit SecD  40.46 
 
 
415 aa  287  2e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000418015  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  42.78 
 
 
525 aa  287  2e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  42.62 
 
 
532 aa  281  2e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  44.47 
 
 
530 aa  279  7e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  41.32 
 
 
594 aa  278  1e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  41.32 
 
 
594 aa  278  1e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  42.08 
 
 
533 aa  278  1e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1908  preprotein translocase subunit SecD  36.47 
 
 
419 aa  278  1e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154062  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  41.78 
 
 
532 aa  277  3e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2197  preprotein translocase subunit SecD  36.47 
 
 
419 aa  276  4e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  40.62 
 
 
533 aa  275  9e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  40.72 
 
 
531 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  42.66 
 
 
848 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  40.83 
 
 
533 aa  272  7e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  40.26 
 
 
534 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  41.44 
 
 
533 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  40.33 
 
 
531 aa  270  4e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  40.61 
 
 
530 aa  269  5e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  41.16 
 
 
554 aa  269  8e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  41.52 
 
 
533 aa  268  1e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000256259  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  38.7 
 
 
740 aa  267  2e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  41.09 
 
 
533 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  41.74 
 
 
849 aa  268  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1769  protein-export membrane protein SecD  38.8 
 
 
512 aa  266  4e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  41.37 
 
 
856 aa  266  5e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  40.83 
 
 
533 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1217  protein-export membrane protein SecD  41.22 
 
 
457 aa  266  5.999999999999999e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000711082  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  41.9 
 
 
532 aa  265  8e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  40.36 
 
 
535 aa  265  1e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2442  protein-export membrane protein SecD  43.29 
 
 
524 aa  265  1e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000311445  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  39.95 
 
 
533 aa  264  2e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1334  protein-export membrane protein SecD  36.3 
 
 
487 aa  263  4e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.763605  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  41.51 
 
 
532 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  42.51 
 
 
533 aa  262  6.999999999999999e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  40 
 
 
554 aa  262  6.999999999999999e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  40.68 
 
 
554 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  40.68 
 
 
554 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  39.46 
 
 
759 aa  261  1e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1407  secretion protein SecD  37.83 
 
 
622 aa  261  2e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0970542  normal  0.495357 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  40.86 
 
 
843 aa  261  2e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1313  preprotein translocase subunit SecD  39.44 
 
 
616 aa  260  3e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.198401  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.54 
 
 
856 aa  259  5.0000000000000005e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2350  preprotein translocase subunit SecD  42.71 
 
 
618 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.951904  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1084  preprotein translocase subunit SecD  40.62 
 
 
556 aa  258  1e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.111435 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  40.54 
 
 
554 aa  258  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1490  preprotein translocase subunit SecD  37.88 
 
 
474 aa  258  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  40.75 
 
 
532 aa  256  7e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1416  preprotein translocase subunit SecD  38.52 
 
 
554 aa  254  1.0000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.457453  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4539  protein-export membrane protein SecD  37.5 
 
 
470 aa  253  4.0000000000000004e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.470079  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  39.95 
 
 
532 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  38.62 
 
 
530 aa  253  6e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0142  preprotein translocase subunit SecD  37.21 
 
 
464 aa  252  9.000000000000001e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0728  preprotein translocase subunit SecD  41.35 
 
 
529 aa  251  2e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.347162  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1629  protein-export membrane protein SecD  39.85 
 
 
748 aa  250  3e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.683752  normal  0.475056 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1116  protein-export membrane protein SecD  36.64 
 
 
472 aa  249  7e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.887298  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  42.78 
 
 
853 aa  249  9e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1696  preprotein translocase subunit SecD  40.55 
 
 
618 aa  248  1e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1116  protein-export membrane protein SecD  39.08 
 
 
500 aa  248  2e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0854  preprotein translocase subunit SecD  39.95 
 
 
533 aa  248  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1575  preprotein translocase subunit SecD  37.97 
 
 
521 aa  247  2e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1571  protein-export membrane protein SecD  35.83 
 
 
503 aa  248  2e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0563  protein-export membrane protein SecD  35.27 
 
 
473 aa  246  4e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  40.94 
 
 
533 aa  247  4e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  37.99 
 
 
761 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  38.77 
 
 
535 aa  246  4.9999999999999997e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0476  preprotein translocase subunit SecD  38.92 
 
 
526 aa  246  6.999999999999999e-64  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2491  protein-export membrane protein SecD  39.22 
 
 
534 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.743414  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0935  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.17 
 
 
750 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1929  preprotein translocase subunit SecD  40.16 
 
 
526 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2188  protein-export membrane protein SecD  39.72 
 
 
534 aa  244  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521622  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2066  preprotein translocase subunit SecD  39.21 
 
 
623 aa  244  3e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.666611  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2835  preprotein translocase subunit SecD  38.69 
 
 
616 aa  244  3e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5077  preprotein translocase subunit SecD  36.24 
 
 
461 aa  243  5e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1218  preprotein translocase subunit SecD  41.3 
 
 
621 aa  242  7.999999999999999e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.518755 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.68 
 
 
839 aa  242  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4747  protein-export membrane protein SecD  39.33 
 
 
533 aa  242  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122054  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0503  preprotein translocase subunit SecD  38.56 
 
 
534 aa  241  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153104  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2513  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.41 
 
 
750 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000183584  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0627  protein-export membrane protein SecD  41.03 
 
 
502 aa  241  2.9999999999999997e-62  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.57035  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1230  preprotein translocase subunit SecD  36.68 
 
 
614 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.181896  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0707  preprotein translocase subunit SecD  41.21 
 
 
521 aa  239  5.999999999999999e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.907979  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2276  protein-export membrane protein SecD  39.27 
 
 
534 aa  239  9e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.394363  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01347  preprotein translocase subunit SecD  41.13 
 
 
599 aa  239  9e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2715  preprotein translocase subunit SecD  38.65 
 
 
626 aa  238  1e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.177706 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1122  preprotein translocase subunit SecD  39.84 
 
 
615 aa  238  1e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.276034  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2810  preprotein translocase subunit SecD  38.9 
 
 
621 aa  238  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0071  preprotein translocase subunit SecD  40.22 
 
 
510 aa  238  2e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1028  preprotein translocase subunit SecD  36.08 
 
 
471 aa  237  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.016566 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>