More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_0887 on replicon NC_009505
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_2336  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  89.06 
 
 
759 aa  1303    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.217617  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0891  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  99.87 
 
 
785 aa  1565    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.983907  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0887  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  100 
 
 
785 aa  1567    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  45.76 
 
 
856 aa  624  1e-177  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  46.54 
 
 
856 aa  606  9.999999999999999e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  44.03 
 
 
846 aa  566  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.823548 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  42.73 
 
 
846 aa  559  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  41.85 
 
 
853 aa  513  1e-144  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1860  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.98 
 
 
844 aa  496  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.53 
 
 
848 aa  479  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_004310  BR1324  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.85 
 
 
845 aa  478  1e-133  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0375911  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.33 
 
 
849 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1284  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.73 
 
 
844 aa  474  1e-132  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1174  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  42.24 
 
 
858 aa  469  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149804  normal  0.102864 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.9 
 
 
839 aa  455  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0878  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.5 
 
 
834 aa  449  1.0000000000000001e-124  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.335263  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0181  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.82 
 
 
844 aa  423  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  34.99 
 
 
843 aa  394  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3464  protein-export membrane protein SecD  32.32 
 
 
849 aa  355  2e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.068989  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  30.31 
 
 
735 aa  353  7e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  33.24 
 
 
740 aa  347  3e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.14 
 
 
762 aa  341  2.9999999999999998e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  32.83 
 
 
759 aa  340  5e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  41.79 
 
 
533 aa  339  9e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0092  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.94 
 
 
995 aa  337  5e-91  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  42.67 
 
 
532 aa  335  3e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  41.29 
 
 
533 aa  333  7.000000000000001e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  42.04 
 
 
533 aa  330  7e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4155  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.35 
 
 
754 aa  327  7e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  42.27 
 
 
535 aa  326  1e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4530  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.21 
 
 
754 aa  325  1e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.566924  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3127  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.02 
 
 
752 aa  326  1e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08751  putative protein-export transmembrane SecDF protein  34.17 
 
 
1001 aa  326  1e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392094  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0705  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.35 
 
 
754 aa  325  2e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4258  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.17 
 
 
755 aa  324  3e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4306  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.07 
 
 
754 aa  323  5e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4641  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.07 
 
 
754 aa  323  5e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2178  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.82 
 
 
995 aa  324  5e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.900836  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4545  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.07 
 
 
754 aa  324  5e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.07 
 
 
754 aa  323  8e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4144  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.07 
 
 
754 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4491  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.07 
 
 
754 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000282789 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5169  protein-export membrane protein SecD  32.87 
 
 
1029 aa  321  3e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325981  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2513  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.26 
 
 
750 aa  321  3e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000183584  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  42.59 
 
 
534 aa  321  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6254  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.49 
 
 
1055 aa  320  7.999999999999999e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  41.79 
 
 
533 aa  319  2e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3596  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.44 
 
 
996 aa  314  2.9999999999999996e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.318172 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0935  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.59 
 
 
750 aa  314  3.9999999999999997e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  40.29 
 
 
535 aa  314  4.999999999999999e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  41.54 
 
 
533 aa  313  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0113  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.22 
 
 
991 aa  306  8.000000000000001e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.758548 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1416  preprotein translocase subunit SecD  39.95 
 
 
554 aa  301  3e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.457453  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  40.32 
 
 
532 aa  300  9e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2256  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33 
 
 
991 aa  298  2e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1420  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.89 
 
 
990 aa  298  3e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.469149  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1201  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.42 
 
 
763 aa  298  4e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.732454  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  30.97 
 
 
989 aa  294  4e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  30.29 
 
 
761 aa  294  5e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  41.33 
 
 
554 aa  291  3e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.09 
 
 
759 aa  288  2e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  39.95 
 
 
531 aa  289  2e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1727  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.09 
 
 
759 aa  288  2e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.347489  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  38.99 
 
 
531 aa  286  8e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1762  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.39 
 
 
981 aa  286  1.0000000000000001e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8810  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.66 
 
 
756 aa  285  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1084  preprotein translocase subunit SecD  39.4 
 
 
556 aa  285  3.0000000000000004e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.111435 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  38.54 
 
 
554 aa  281  4e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  38.54 
 
 
554 aa  281  4e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1629  protein-export membrane protein SecD  31.15 
 
 
748 aa  280  5e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.683752  normal  0.475056 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2073  preprotein translocase subunit SecD  37.88 
 
 
535 aa  279  2e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  39.62 
 
 
554 aa  277  5e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4310  protein-export membrane protein SecF  43.38 
 
 
357 aa  276  1.0000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  40.11 
 
 
594 aa  273  9e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  40.11 
 
 
594 aa  273  9e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  37.02 
 
 
554 aa  271  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1501  protein-export membrane protein SecD  29.77 
 
 
793 aa  269  1e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.365573  normal  0.0601553 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1714  preprotein translocase subunit SecD  37.66 
 
 
537 aa  268  2e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12600  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  28.12 
 
 
977 aa  267  5e-70  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2276  protein-export membrane protein SecD  37.24 
 
 
534 aa  265  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.394363  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1002  protein-export membrane protein SecF  42.48 
 
 
319 aa  264  6e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0733  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.25 
 
 
1400 aa  262  2e-68  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2188  protein-export membrane protein SecD  38.15 
 
 
534 aa  259  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521622  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4747  protein-export membrane protein SecD  37.6 
 
 
533 aa  257  5e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122054  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0387  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  25.7 
 
 
911 aa  256  8e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.807363  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2491  protein-export membrane protein SecD  36.83 
 
 
534 aa  256  8e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.743414  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3037  protein-export membrane protein SecF  42.57 
 
 
316 aa  256  1.0000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4228  protein-export membrane protein SecD  37.33 
 
 
532 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250212  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4598  protein-export membrane protein SecD  37.33 
 
 
532 aa  254  5.000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.278601  normal  0.122779 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2856  protein-export membrane protein SecF  41.42 
 
 
318 aa  251  5e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.114618 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3171  preprotein translocase subunit SecF  41.47 
 
 
372 aa  251  5e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.203608  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2442  protein-export membrane protein SecD  38.98 
 
 
524 aa  250  6e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000311445  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4405  preprotein translocase subunit SecF  41.31 
 
 
335 aa  249  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0338927  normal  0.256135 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2775  preprotein translocase subunit SecF  41.06 
 
 
334 aa  247  6e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.33037 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1899  protein-export membrane protein SecD  35.6 
 
 
551 aa  247  6.999999999999999e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.680962  normal  0.478196 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  33.1 
 
 
525 aa  246  9e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  36.07 
 
 
530 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  35.54 
 
 
531 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2776  preprotein translocase subunit SecF  40.19 
 
 
369 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.686561  normal  0.719321 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07200  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  28.97 
 
 
855 aa  244  5e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>