More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0984 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0984  protein-export membrane protein SecD  100 
 
 		 900 aa  1817    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.583326 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12600  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  69.11 
 
 		 977 aa  1179    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07200  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  65.29 
 
 		 855 aa  1060    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  31.94 
 
 		 740 aa  373  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  30.38 
 
 		 735 aa  364  4e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  29.43 
 
 		 761 aa  340  7e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0387  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.62 
 
 		 911 aa  321  3.9999999999999996e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.807363  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0935  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.08 
 
 		 750 aa  319  1e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2513  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.91 
 
 		 750 aa  312  2e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000183584  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4155  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.55 
 
 		 754 aa  302  2e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4306  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.92 
 
 		 754 aa  301  3e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4144  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.87 
 
 		 754 aa  301  3e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4641  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.92 
 
 		 754 aa  301  3e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4491  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.87 
 
 		 754 aa  301  3e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000282789 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.8 
 
 		 754 aa  300  1e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4545  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.67 
 
 		 754 aa  299  1e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4530  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.8 
 
 		 754 aa  298  4e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.566924  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0705  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.47 
 
 		 754 aa  297  7e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4258  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.88 
 
 		 755 aa  289  2e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3127  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.84 
 
 		 752 aa  286  1.0000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  29.07 
 
 		 843 aa  275  2.0000000000000002e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1420  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.75 
 
 		 990 aa  265  2e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.469149  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5169  protein-export membrane protein SecD  28.79 
 
 		 1029 aa  265  3e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325981  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4072  protein-export membrane protein SecD  29.07 
 
 		 885 aa  246  9.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1501  protein-export membrane protein SecD  27.13 
 
 		 793 aa  246  1.9999999999999999e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.365573  normal  0.0601553 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0716  SecD/SecF family protein-export membrane protein  26.81 
 
 		 734 aa  243  9e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000203356  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1334  protein-export membrane protein SecD  30.49 
 
 		 487 aa  241  5.999999999999999e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.763605  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  34.24 
 
 		 403 aa  238  4e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000290493  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6108  preprotein translocase subunit SecF  40.51 
 
 		 347 aa  235  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359416  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1340  preprotein translocase subunit SecF  36.17 
 
 		 414 aa  226  2e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.265736  normal  0.609901 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  35.2 
 
 		 989 aa  225  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1490  preprotein translocase subunit SecD  34.18 
 
 		 474 aa  221  6e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1123  preprotein translocase subunit SecD  29.23 
 
 		 416 aa  220  7e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2884  preprotein translocase subunit SecD  35.04 
 
 		 470 aa  220  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3212  preprotein translocase subunit SecD  35.04 
 
 		 470 aa  220  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.718211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  35.81 
 
 		 532 aa  219  2e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12260  protein-export membrane protein SecD  33.16 
 
 		 403 aa  219  2e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000764404  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  34.68 
 
 		 759 aa  218  2.9999999999999998e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0142  preprotein translocase subunit SecD  33.91 
 
 		 464 aa  218  4e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1356  preprotein translocase subunit SecD  31.24 
 
 		 410 aa  218  4e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.066873  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  35.28 
 
 		 533 aa  216  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1272  preprotein translocase subunit SecD  31.14 
 
 		 411 aa  214  4.9999999999999996e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  35.28 
 
 		 594 aa  214  7e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  35.28 
 
 		 594 aa  214  7e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1028  preprotein translocase subunit SecD  32.13 
 
 		 471 aa  213  9e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.016566 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  35.69 
 
 		 533 aa  212  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1285  protein-export membrane protein SecD  30.68 
 
 		 423 aa  211  3e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0952765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1691  protein-export membrane protein SecD  31.31 
 
 		 461 aa  210  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0199339  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  35.71 
 
 		 533 aa  210  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4539  protein-export membrane protein SecD  31.96 
 
 		 470 aa  208  3e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.470079  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0079  protein-export membrane protein SecD  28.68 
 
 		 515 aa  208  3e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  35.69 
 
 		 534 aa  208  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5077  preprotein translocase subunit SecD  32.33 
 
 		 461 aa  207  6e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0946  protein-export membrane protein SecF  37.22 
 
 		 349 aa  206  1e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  34.54 
 
 		 533 aa  206  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  29.22 
 
 		 406 aa  206  2e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2299  preprotein translocase subunit SecD  30.66 
 
 		 585 aa  206  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.844455  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1669  preprotein translocase subunit SecD  31.46 
 
 		 413 aa  206  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000293049  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2442  protein-export membrane protein SecD  35.68 
 
 		 524 aa  205  4e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000311445  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2390  protein translocase subunit secF  39.8 
 
 		 412 aa  205  4e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  33.08 
 
 		 554 aa  204  7e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2114  protein-export membrane protein SecF  35.76 
 
 		 390 aa  203  9e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205616  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3823  protein-export membrane protein SecF  35.13 
 
 		 416 aa  203  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.344735  normal  0.619548 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  35.15 
 
 		 533 aa  203  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.39 
 
 		 856 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  32.74 
 
 		 530 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  33.16 
 
 		 554 aa  202  3e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  35.66 
 
 		 554 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  35.66 
 
 		 554 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  31.45 
 
 		 533 aa  201  7e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  34.5 
 
 		 531 aa  200  7.999999999999999e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1279  preprotein translocase subunit SecD  29.92 
 
 		 495 aa  200  1.0000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.221382  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  38.83 
 
 		 307 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1462  preprotein translocase subunit SecD  32.43 
 
 		 411 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000572302  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2060  protein-export membrane protein SecF  38.11 
 
 		 326 aa  198  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.616528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  33.58 
 
 		 533 aa  198  3e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  33.77 
 
 		 532 aa  198  4.0000000000000005e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  32.75 
 
 		 532 aa  197  7e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07161  preprotein translocase subunit SecD  27.81 
 
 		 489 aa  197  9e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.145798 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2277  preprotein translocase subunit SecF  34.19 
 
 		 417 aa  197  9e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2324  preprotein translocase subunit SecF  34.19 
 
 		 417 aa  197  9e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223224  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2316  preprotein translocase subunit SecF  34.19 
 
 		 417 aa  197  9e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.658853  normal  0.312291 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1217  protein-export membrane protein SecD  33.05 
 
 		 457 aa  196  1e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000711082  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  32.83 
 
 		 533 aa  196  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1670  protein-export membrane protein SecD  30.43 
 
 		 635 aa  195  3e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  33.51 
 
 		 532 aa  195  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1908  preprotein translocase subunit SecD  31.28 
 
 		 419 aa  195  3e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154062  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1604  protein-export membrane protein SecD  30.51 
 
 		 399 aa  195  4e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0444022  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0563  protein-export membrane protein SecD  31.63 
 
 		 473 aa  194  5e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  36.01 
 
 		 286 aa  194  5e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12860  protein-export membrane protein SecD  31.25 
 
 		 620 aa  194  6e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.258671  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09311  preprotein translocase subunit SecD  28.23 
 
 		 489 aa  194  6e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.483137  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10121  preprotein translocase subunit SecD  29.07 
 
 		 486 aa  194  6e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5141  preprotein translocase subunit SecF  37.62 
 
 		 417 aa  194  7e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.358124  hitchhiker  0.00205157 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1116  protein-export membrane protein SecD  31.88 
 
 		 472 aa  193  1e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.887298  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1374  preprotein translocase subunit SecF  34.18 
 
 		 398 aa  193  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.574602  normal  0.142388 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  34.27 
 
 		 554 aa  192  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0067  protein-export membrane protein SecD  30.68 
 
 		 465 aa  192  2e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  32.97 
 
 		 525 aa  192  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2584  preprotein translocase subunit SecF  33.26 
 
 		 423 aa  192  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.173731  normal  0.904597 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>