More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2114 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2114  protein-export membrane protein SecF  100 
 
 		 390 aa  770    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205616  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6108  preprotein translocase subunit SecF  66.07 
 
 		 347 aa  431  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359416  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2060  protein-export membrane protein SecF  67.43 
 
 		 326 aa  377  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.616528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1340  preprotein translocase subunit SecF  47.55 
 
 		 414 aa  332  6e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.265736  normal  0.609901 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2357  protein-export membrane protein SecF  45.5 
 
 		 389 aa  297  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1374  preprotein translocase subunit SecF  45.25 
 
 		 398 aa  289  6e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.574602  normal  0.142388 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5141  preprotein translocase subunit SecF  47.76 
 
 		 417 aa  284  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.358124  hitchhiker  0.00205157 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1365  protein-export membrane protein SecF  46.08 
 
 		 366 aa  272  8.000000000000001e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1997  protein-export membrane protein SecF  43.32 
 
 		 358 aa  271  1e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.498449  normal  0.0822875 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2390  protein translocase subunit secF  40 
 
 		 412 aa  269  7e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1803  protein-export membrane protein SecF  43.88 
 
 		 394 aa  263  3e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162985  decreased coverage  0.00000393416 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3815  preprotein translocase subunit SecF  42.3 
 
 		 422 aa  261  1e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130348  normal  0.401094 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3050  protein-export membrane protein SecF  46.62 
 
 		 330 aa  261  1e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1813  protein-export membrane protein SecF  41.53 
 
 		 394 aa  259  6e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.126223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3823  protein-export membrane protein SecF  39.11 
 
 		 416 aa  259  7e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.344735  normal  0.619548 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17560  protein translocase subunit secF  46.78 
 
 		 371 aa  259  8e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.095972 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15300  protein translocase subunit secF  47.5 
 
 		 406 aa  253  4.0000000000000004e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.54161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2584  preprotein translocase subunit SecF  38.13 
 
 		 423 aa  250  3e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.173731  normal  0.904597 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3390  protein-export membrane protein SecF  36.65 
 
 		 432 aa  248  1e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000120226  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1799  protein-export membrane protein SecF  46.56 
 
 		 360 aa  248  1e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.544061  normal  0.135983 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2316  preprotein translocase subunit SecF  36.07 
 
 		 417 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.658853  normal  0.312291 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2277  preprotein translocase subunit SecF  36.07 
 
 		 417 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2324  preprotein translocase subunit SecF  36.07 
 
 		 417 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223224  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3173  protein-export membrane protein SecF  44.35 
 
 		 453 aa  243  6e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.12818  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0946  protein-export membrane protein SecF  39.45 
 
 		 349 aa  241  2e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12606  preprotein translocase subunit SecF  37.37 
 
 		 442 aa  238  2e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15110  protein translocase subunit secF  41.83 
 
 		 414 aa  238  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.66233 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2028  preprotein translocase subunit SecF  38.97 
 
 		 338 aa  233  4.0000000000000004e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000424362 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13990  protein translocase subunit secF  39.83 
 
 		 364 aa  230  4e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.269244  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2298  preprotein translocase subunit SecF  38.87 
 
 		 340 aa  230  4e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2305  protein-export membrane protein SecF  40 
 
 		 421 aa  225  8e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.879944  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1696  protein-export membrane protein SecF  38.76 
 
 		 396 aa  224  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467956  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1671  protein-export membrane protein SecF  44.09 
 
 		 363 aa  220  3e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1943  protein-export membrane protein SecF  38.29 
 
 		 374 aa  210  4e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00503357  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12850  protein translocase subunit secF  40.38 
 
 		 346 aa  207  2e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0129827  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  34.3 
 
 		 989 aa  187  4e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0984  protein-export membrane protein SecD  35.76 
 
 		 900 aa  185  1.0000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.583326 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  38.97 
 
 		 761 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12600  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  32.81 
 
 		 977 aa  182  6e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07200  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  38.49 
 
 		 855 aa  177  2e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  35.42 
 
 		 286 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0387  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.48 
 
 		 911 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.807363  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  31.63 
 
 		 291 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1271  preprotein translocase subunit SecF  33.77 
 
 		 296 aa  160  5e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  33.9 
 
 		 759 aa  159  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1424  preprotein translocase subunit SecF  33.45 
 
 		 280 aa  159  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000449698  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  35.62 
 
 		 740 aa  155  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1463  preprotein translocase subunit SecF  29.93 
 
 		 303 aa  152  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000137336  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36 
 
 		 762 aa  146  7.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2885  preprotein translocase subunit SecF  32.14 
 
 		 310 aa  143  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1335  protein translocase subunit secF  35.44 
 
 		 292 aa  142  7e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2056  protein-export membrane protein SecF  31.93 
 
 		 337 aa  142  8e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.880378  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1355  preprotein translocase subunit SecF  31.97 
 
 		 293 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1714  protein-export membrane protein SecF  32 
 
 		 316 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.611616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0475  preprotein translocase subunit SecF  32.39 
 
 		 323 aa  141  1.9999999999999998e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2065  preprotein translocase subunit SecF  34.36 
 
 		 313 aa  140  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1115  protein-export membrane protein SecF  31.05 
 
 		 302 aa  140  3.9999999999999997e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0708  preprotein translocase subunit SecF  32.05 
 
 		 323 aa  139  6e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0066  protein-export membrane protein SecF  31.19 
 
 		 293 aa  139  7e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1330  SecF protein  34.35 
 
 		 338 aa  138  1e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0105179  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1216  protein-export membrane protein SecF  34.47 
 
 		 291 aa  138  2e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0233184  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1629  protein-export membrane protein SecD  32.76 
 
 		 748 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.683752  normal  0.475056 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1690  preprotein translocase subunit SecF  32.23 
 
 		 310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.113213  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3211  protein translocase subunit secF  35.02 
 
 		 311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2737  protein-export membrane protein SecF  31.71 
 
 		 308 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.468895  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  29.25 
 
 		 735 aa  136  7.000000000000001e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1073  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.39 
 
 		 753 aa  135  9e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0361267  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1907  preprotein translocase subunit SecF  29.19 
 
 		 289 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0418717  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1064  preprotein translocase subunit SecF  31.23 
 
 		 322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204402 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2080  preprotein translocase subunit SecF  33 
 
 		 310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.348624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01049  preprotein translocase subunit SecF  31.91 
 
 		 315 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2196  preprotein translocase subunit SecF  29.59 
 
 		 289 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0072  preprotein translocase subunit SecF  30.38 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1341  protein-export membrane protein SecF  29.84 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0080  protein-export membrane protein SecF  32.8 
 
 		 317 aa  134  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004364  protein-export membrane protein SecF  31.82 
 
 		 315 aa  134  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0679828  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0631  preprotein translocase subunit SecF  32.05 
 
 		 323 aa  134  3e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3211  preprotein translocase subunit SecF  32.47 
 
 		 310 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.828599  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1235  preprotein translocase subunit SecF  32.69 
 
 		 323 aa  133  6e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.178131  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1110  preprotein translocase subunit SecF  32.69 
 
 		 323 aa  133  6e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0273  preprotein translocase subunit SecF  33.44 
 
 		 315 aa  133  6e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0866  preprotein translocase subunit SecF  30.93 
 
 		 302 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222243  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0879  preprotein translocase subunit SecF  30.58 
 
 		 302 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0954141 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0511  preprotein translocase subunit SecF  34.36 
 
 		 311 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.956081  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0836  preprotein translocase subunit SecF  30.93 
 
 		 302 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2349  preprotein translocase subunit SecF  33.44 
 
 		 312 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1302  protein-export membrane protein SecF  32.89 
 
 		 315 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2432  preprotein translocase subunit SecF  33.66 
 
 		 316 aa  130  4.0000000000000003e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1117  preprotein translocase subunit SecF  34.22 
 
 		 316 aa  130  5.0000000000000004e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0066  protein-export membrane protein SecF  32.88 
 
 		 293 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0626  protein-export membrane protein SecF  29.49 
 
 		 310 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000549124  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1107  preprotein translocase subunit SecF  32.85 
 
 		 414 aa  129  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0908186  normal  0.232496 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2644  protein-export membrane protein SecF  32.38 
 
 		 304 aa  128  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0946476  hitchhiker  0.00035144 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1278  preprotein translocase subunit SecF  32.48 
 
 		 414 aa  128  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000278006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  27.65 
 
 		 307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  32.4 
 
 		 304 aa  128  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4072  protein-export membrane protein SecD  29.39 
 
 		 885 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  32.4 
 
 		 304 aa  128  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2498  protein-export membrane protein SecF  33.45 
 
 		 301 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1404  preprotein translocase subunit SecF  31.43 
 
 		 315 aa  127  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0316508  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>