More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2390 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2390  protein translocase subunit secF  100 
 
 		 412 aa  824    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1340  preprotein translocase subunit SecF  45.99 
 
 		 414 aa  300  3e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.265736  normal  0.609901 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1997  protein-export membrane protein SecF  47.75 
 
 		 358 aa  300  4e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.498449  normal  0.0822875 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3050  protein-export membrane protein SecF  49.24 
 
 		 330 aa  298  9e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15300  protein translocase subunit secF  41.95 
 
 		 406 aa  292  7e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.54161  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1799  protein-export membrane protein SecF  50.45 
 
 		 360 aa  292  7e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.544061  normal  0.135983 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1365  protein-export membrane protein SecF  47.27 
 
 		 366 aa  291  1e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17560  protein translocase subunit secF  51.67 
 
 		 371 aa  281  1e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.095972 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2028  preprotein translocase subunit SecF  43.11 
 
 		 338 aa  274  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000424362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6108  preprotein translocase subunit SecF  45.81 
 
 		 347 aa  270  5e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359416  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2298  preprotein translocase subunit SecF  44.79 
 
 		 340 aa  267  2e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2357  protein-export membrane protein SecF  42.6 
 
 		 389 aa  267  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2114  protein-export membrane protein SecF  43.54 
 
 		 390 aa  266  5e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205616  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3823  protein-export membrane protein SecF  39.46 
 
 		 416 aa  264  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.344735  normal  0.619548 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5141  preprotein translocase subunit SecF  48.36 
 
 		 417 aa  263  4e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.358124  hitchhiker  0.00205157 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13990  protein translocase subunit secF  41.69 
 
 		 364 aa  260  3e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.269244  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1671  protein-export membrane protein SecF  48.24 
 
 		 363 aa  258  1e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1374  preprotein translocase subunit SecF  44.47 
 
 		 398 aa  258  1e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.574602  normal  0.142388 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3173  protein-export membrane protein SecF  47.9 
 
 		 453 aa  257  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.12818  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12850  protein translocase subunit secF  42.27 
 
 		 346 aa  245  9.999999999999999e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0129827  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2316  preprotein translocase subunit SecF  38.65 
 
 		 417 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.658853  normal  0.312291 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1696  protein-export membrane protein SecF  45.16 
 
 		 396 aa  245  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467956  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2277  preprotein translocase subunit SecF  38.65 
 
 		 417 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2324  preprotein translocase subunit SecF  38.65 
 
 		 417 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223224  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2584  preprotein translocase subunit SecF  38.44 
 
 		 423 aa  239  8e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.173731  normal  0.904597 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15110  protein translocase subunit secF  39.84 
 
 		 414 aa  238  1e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.66233 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1803  protein-export membrane protein SecF  40.43 
 
 		 394 aa  237  3e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162985  decreased coverage  0.00000393416 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1813  protein-export membrane protein SecF  40.73 
 
 		 394 aa  237  4e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.126223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3390  protein-export membrane protein SecF  41.77 
 
 		 432 aa  236  7e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000120226  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3815  preprotein translocase subunit SecF  38.78 
 
 		 422 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130348  normal  0.401094 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2060  protein-export membrane protein SecF  45.75 
 
 		 326 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.616528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2305  protein-export membrane protein SecF  40.43 
 
 		 421 aa  221  1.9999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.879944  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12606  preprotein translocase subunit SecF  37.68 
 
 		 442 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0946  protein-export membrane protein SecF  39.94 
 
 		 349 aa  212  7.999999999999999e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1943  protein-export membrane protein SecF  42.51 
 
 		 374 aa  205  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00503357  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12600  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  35.85 
 
 		 977 aa  195  1e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0984  protein-export membrane protein SecD  39.8 
 
 		 900 aa  188  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.583326 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07200  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  41.07 
 
 		 855 aa  182  1e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  32.34 
 
 		 989 aa  176  5e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1271  preprotein translocase subunit SecF  34.8 
 
 		 296 aa  172  7.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  37.02 
 
 		 286 aa  172  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1463  preprotein translocase subunit SecF  36.19 
 
 		 303 aa  170  4e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000137336  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  34.35 
 
 		 291 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1064  preprotein translocase subunit SecF  31.04 
 
 		 322 aa  159  6e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204402 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  32.91 
 
 		 740 aa  159  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1335  protein translocase subunit secF  35.59 
 
 		 292 aa  159  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2836  protein translocase subunit secF  30.16 
 
 		 302 aa  156  8e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2065  preprotein translocase subunit SecF  33.33 
 
 		 313 aa  155  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  34.34 
 
 		 761 aa  155  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1355  preprotein translocase subunit SecF  34.71 
 
 		 293 aa  155  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  31.73 
 
 		 759 aa  153  5e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1341  protein-export membrane protein SecF  32.01 
 
 		 298 aa  152  8e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1981  preprotein translocase subunit SecF  33.44 
 
 		 305 aa  152  1e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1976  preprotein translocase subunit SecF  33.44 
 
 		 305 aa  152  1e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3110  preprotein translocase subunit SecF  31.78 
 
 		 315 aa  150  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0836  preprotein translocase subunit SecF  32.49 
 
 		 302 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0866  preprotein translocase subunit SecF  32.59 
 
 		 302 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222243  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0879  preprotein translocase subunit SecF  31.76 
 
 		 302 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0954141 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  30.72 
 
 		 735 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1713  SecF protein  34.32 
 
 		 327 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1330  SecF protein  33.66 
 
 		 338 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0105179  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1690  preprotein translocase subunit SecF  33.33 
 
 		 310 aa  147  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.113213  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1231  protein-export membrane protein SecF  29.93 
 
 		 313 aa  147  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2056  protein-export membrane protein SecF  30.84 
 
 		 337 aa  147  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.880378  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1714  protein-export membrane protein SecF  31.01 
 
 		 316 aa  145  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.611616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1302  protein-export membrane protein SecF  32.88 
 
 		 315 aa  144  3e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004364  protein-export membrane protein SecF  31.13 
 
 		 315 aa  144  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0679828  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1424  preprotein translocase subunit SecF  30.58 
 
 		 280 aa  144  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000449698  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1904  protein-export membrane protein SecF  30.62 
 
 		 302 aa  143  5e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2196  preprotein translocase subunit SecF  31.82 
 
 		 289 aa  143  6e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0878  preprotein translocase subunit SecF  29.85 
 
 		 323 aa  142  9e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0273  preprotein translocase subunit SecF  33.11 
 
 		 315 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2644  protein-export membrane protein SecF  31.92 
 
 		 304 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0946476  hitchhiker  0.00035144 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0113  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.38 
 
 		 991 aa  142  9.999999999999999e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.758548 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4342  preprotein translocase subunit SecF  32.27 
 
 		 302 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.557524  hitchhiker  0.0000000544827 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2190  preprotein translocase subunit SecF  31.96 
 
 		 315 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.447622  decreased coverage  0.00319916 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1231  preprotein translocase subunit SecF  32.59 
 
 		 303 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.611016  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  30.99 
 
 		 304 aa  140  3e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1115  protein-export membrane protein SecF  30.25 
 
 		 302 aa  140  3.9999999999999997e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1416  protein-export membrane protein SecF  32.28 
 
 		 303 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  30.99 
 
 		 304 aa  140  6e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0855  preprotein translocase subunit SecF  33.67 
 
 		 302 aa  140  6e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0387  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.83 
 
 		 911 aa  139  7e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.807363  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0066  protein-export membrane protein SecF  30.87 
 
 		 293 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2699  preprotein translocase subunit SecF  28.44 
 
 		 315 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.584759  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1473  preprotein translocase subunit SecF  33.1 
 
 		 315 aa  139  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13163  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01049  preprotein translocase subunit SecF  31.58 
 
 		 315 aa  139  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1907  preprotein translocase subunit SecF  31.93 
 
 		 289 aa  139  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0418717  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1898  protein translocase subunit secF  32.7 
 
 		 314 aa  139  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186497  normal  0.970453 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3037  protein-export membrane protein SecF  30.51 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0080  protein-export membrane protein SecF  30.72 
 
 		 317 aa  138  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.58 
 
 		 762 aa  138  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1385  preprotein translocase subunit SecF  31 
 
 		 315 aa  138  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00983524  hitchhiker  0.000000302266 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1438  preprotein translocase subunit SecF  31 
 
 		 315 aa  138  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0107161  hitchhiker  0.00000672809 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2334  preprotein translocase subunit SecF  31.83 
 
 		 315 aa  138  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.307818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2481  preprotein translocase subunit SecF  31 
 
 		 315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0456849  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2178  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.57 
 
 		 995 aa  137  3.0000000000000003e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.900836  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5076  preprotein translocase subunit SecF  33.22 
 
 		 328 aa  137  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1450  preprotein translocase subunit SecF  31 
 
 		 315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101016  normal  0.0107257 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1770  protein-export membrane protein SecF  32.1 
 
 		 307 aa  137  4e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>