More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3823 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3823  protein-export membrane protein SecF  100 
 
 		 416 aa  838    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.344735  normal  0.619548 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2305  protein-export membrane protein SecF  42.38 
 
 		 421 aa  298  1e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.879944  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2277  preprotein translocase subunit SecF  41.53 
 
 		 417 aa  293  4e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2316  preprotein translocase subunit SecF  41.53 
 
 		 417 aa  293  4e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.658853  normal  0.312291 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2324  preprotein translocase subunit SecF  41.53 
 
 		 417 aa  293  4e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223224  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3390  protein-export membrane protein SecF  47.98 
 
 		 432 aa  291  1e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000120226  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2584  preprotein translocase subunit SecF  42.02 
 
 		 423 aa  291  1e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.173731  normal  0.904597 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1696  protein-export membrane protein SecF  41.93 
 
 		 396 aa  289  6e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467956  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1813  protein-export membrane protein SecF  44.17 
 
 		 394 aa  288  1e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.126223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1340  preprotein translocase subunit SecF  49.84 
 
 		 414 aa  287  2e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.265736  normal  0.609901 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12606  preprotein translocase subunit SecF  42.56 
 
 		 442 aa  286  5e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1803  protein-export membrane protein SecF  47.06 
 
 		 394 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162985  decreased coverage  0.00000393416 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3173  protein-export membrane protein SecF  42.4 
 
 		 453 aa  280  3e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.12818  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15110  protein translocase subunit secF  46 
 
 		 414 aa  275  8e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.66233 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6108  preprotein translocase subunit SecF  46.86 
 
 		 347 aa  273  4.0000000000000004e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359416  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1997  protein-export membrane protein SecF  47.72 
 
 		 358 aa  272  7e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.498449  normal  0.0822875 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2390  protein translocase subunit secF  40.29 
 
 		 412 aa  269  8e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3815  preprotein translocase subunit SecF  39.44 
 
 		 422 aa  266  5.999999999999999e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130348  normal  0.401094 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5141  preprotein translocase subunit SecF  46.96 
 
 		 417 aa  262  6.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.358124  hitchhiker  0.00205157 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1365  protein-export membrane protein SecF  43.3 
 
 		 366 aa  259  7e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2114  protein-export membrane protein SecF  42.9 
 
 		 390 aa  256  5e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205616  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2357  protein-export membrane protein SecF  41.65 
 
 		 389 aa  255  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17560  protein translocase subunit secF  45.45 
 
 		 371 aa  252  1e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.095972 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2060  protein-export membrane protein SecF  48.42 
 
 		 326 aa  249  8e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.616528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1374  preprotein translocase subunit SecF  45.42 
 
 		 398 aa  248  2e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.574602  normal  0.142388 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15300  protein translocase subunit secF  43.21 
 
 		 406 aa  247  3e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.54161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1671  protein-export membrane protein SecF  43.93 
 
 		 363 aa  243  3e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3050  protein-export membrane protein SecF  47.35 
 
 		 330 aa  242  1e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1799  protein-export membrane protein SecF  45.43 
 
 		 360 aa  241  2e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.544061  normal  0.135983 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13990  protein translocase subunit secF  42.49 
 
 		 364 aa  241  2e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.269244  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1943  protein-export membrane protein SecF  41.99 
 
 		 374 aa  238  2e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00503357  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2028  preprotein translocase subunit SecF  40.29 
 
 		 338 aa  223  4.9999999999999996e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000424362 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2298  preprotein translocase subunit SecF  39.56 
 
 		 340 aa  211  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12850  protein translocase subunit secF  41.21 
 
 		 346 aa  210  3e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0129827  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0946  protein-export membrane protein SecF  37.39 
 
 		 349 aa  206  8e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12600  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  38.85 
 
 		 977 aa  194  3e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0984  protein-export membrane protein SecD  38.36 
 
 		 900 aa  187  4e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.583326 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  32.35 
 
 		 989 aa  171  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07200  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  38.85 
 
 		 855 aa  167  2.9999999999999998e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1271  preprotein translocase subunit SecF  34.52 
 
 		 296 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1335  protein translocase subunit secF  38.51 
 
 		 292 aa  160  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1463  preprotein translocase subunit SecF  33.33 
 
 		 303 aa  159  6e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000137336  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  34.56 
 
 		 761 aa  159  9e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  34.75 
 
 		 286 aa  155  9e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  34 
 
 		 291 aa  153  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  29.97 
 
 		 735 aa  149  9e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1027  preprotein translocase subunit SecF  36.22 
 
 		 312 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0198826 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.63 
 
 		 762 aa  144  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  30.25 
 
 		 759 aa  142  7e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2885  preprotein translocase subunit SecF  31.41 
 
 		 310 aa  142  9e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1690  preprotein translocase subunit SecF  30.89 
 
 		 310 aa  142  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.113213  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1976  preprotein translocase subunit SecF  29.52 
 
 		 305 aa  141  3e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1981  preprotein translocase subunit SecF  29.52 
 
 		 305 aa  140  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  32.06 
 
 		 304 aa  140  3.9999999999999997e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1489  preprotein translocase subunit SecF  32.27 
 
 		 325 aa  139  7e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.921272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1797  preprotein translocase subunit SecF  32.44 
 
 		 307 aa  139  7e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1907  preprotein translocase subunit SecF  31.44 
 
 		 289 aa  139  7.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0418717  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  32.06 
 
 		 304 aa  139  7.999999999999999e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2196  preprotein translocase subunit SecF  30.36 
 
 		 289 aa  138  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  35.06 
 
 		 740 aa  136  7.000000000000001e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0013  preprotein translocase subunit SecF  31.41 
 
 		 309 aa  136  8e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245212 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0626  protein-export membrane protein SecF  27.86 
 
 		 310 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000549124  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0387  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.72 
 
 		 911 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.807363  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3211  preprotein translocase subunit SecF  32.85 
 
 		 310 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.828599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1770  protein-export membrane protein SecF  29.93 
 
 		 307 aa  134  3e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1355  preprotein translocase subunit SecF  31.65 
 
 		 293 aa  133  6e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5076  preprotein translocase subunit SecF  30.94 
 
 		 328 aa  133  6.999999999999999e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1670  preprotein translocase subunit SecF  31.23 
 
 		 292 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00270917  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0855  preprotein translocase subunit SecF  30.2 
 
 		 302 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3037  protein-export membrane protein SecF  31.13 
 
 		 316 aa  132  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0600  protein-export membrane protein SecF  27.83 
 
 		 306 aa  131  3e-29  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1424  preprotein translocase subunit SecF  29.35 
 
 		 280 aa  131  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000449698  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0847  protein-export membrane protein SecF  31.01 
 
 		 359 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0561071  normal  0.116765 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0066  protein-export membrane protein SecF  31.89 
 
 		 293 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3211  protein translocase subunit secF  31.35 
 
 		 311 aa  129  8.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1115  protein-export membrane protein SecF  29.45 
 
 		 302 aa  129  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1286  protein-export membrane protein SecF  32.42 
 
 		 305 aa  128  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.115107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01049  preprotein translocase subunit SecF  27.71 
 
 		 315 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.69 
 
 		 856 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1231  protein-export membrane protein SecF  30.64 
 
 		 313 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0123  protein-export membrane protein SecF  30 
 
 		 293 aa  126  6e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.504249  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0014  preprotein translocase subunit SecF  32.69 
 
 		 311 aa  126  6e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00246116  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1341  protein-export membrane protein SecF  28.15 
 
 		 298 aa  126  8.000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2644  protein-export membrane protein SecF  31.8 
 
 		 304 aa  125  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0946476  hitchhiker  0.00035144 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1107  preprotein translocase subunit SecF  28.66 
 
 		 414 aa  125  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0908186  normal  0.232496 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1278  preprotein translocase subunit SecF  28.53 
 
 		 414 aa  125  2e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000278006  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2616  preprotein translocase subunit SecF  29.32 
 
 		 302 aa  124  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0008  preprotein translocase subunit SecF  30.55 
 
 		 311 aa  124  3e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.748405  normal  0.104556 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2432  preprotein translocase subunit SecF  30.03 
 
 		 301 aa  124  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.604218  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0273  preprotein translocase subunit SecF  30.92 
 
 		 315 aa  124  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0113  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.11 
 
 		 991 aa  124  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.758548 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004364  protein-export membrane protein SecF  27.07 
 
 		 315 aa  123  5e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0679828  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2334  preprotein translocase subunit SecF  30.39 
 
 		 315 aa  123  5e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.307818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1219  preprotein translocase subunit SecF  31.76 
 
 		 314 aa  123  6e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417925 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2699  preprotein translocase subunit SecF  29.07 
 
 		 315 aa  123  6e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.584759  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2737  protein-export membrane protein SecF  29.62 
 
 		 308 aa  122  8e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.468895  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0475  preprotein translocase subunit SecF  31.29 
 
 		 323 aa  122  8e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4144  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.89 
 
 		 754 aa  122  9e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4491  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.89 
 
 		 754 aa  122  9e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000282789 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0066  protein-export membrane protein SecF  32.61 
 
 		 293 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>