More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2584 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3815  preprotein translocase subunit SecF  84.16 
 
 		 422 aa  709    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130348  normal  0.401094 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2584  preprotein translocase subunit SecF  100 
 
 		 423 aa  842    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.173731  normal  0.904597 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2277  preprotein translocase subunit SecF  73.71 
 
 		 417 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2324  preprotein translocase subunit SecF  73.71 
 
 		 417 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223224  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2316  preprotein translocase subunit SecF  73.71 
 
 		 417 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.658853  normal  0.312291 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12606  preprotein translocase subunit SecF  64.35 
 
 		 442 aa  529  1e-149  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1943  protein-export membrane protein SecF  62.46 
 
 		 374 aa  389  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00503357  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2305  protein-export membrane protein SecF  61.13 
 
 		 421 aa  384  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.879944  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15110  protein translocase subunit secF  51.36 
 
 		 414 aa  377  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.66233 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3390  protein-export membrane protein SecF  44.98 
 
 		 432 aa  340  2e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000120226  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1696  protein-export membrane protein SecF  47.49 
 
 		 396 aa  332  1e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467956  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3823  protein-export membrane protein SecF  42.02 
 
 		 416 aa  286  5.999999999999999e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.344735  normal  0.619548 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1374  preprotein translocase subunit SecF  46.63 
 
 		 398 aa  282  9e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.574602  normal  0.142388 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3173  protein-export membrane protein SecF  42.04 
 
 		 453 aa  277  3e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.12818  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1340  preprotein translocase subunit SecF  42.82 
 
 		 414 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.265736  normal  0.609901 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1997  protein-export membrane protein SecF  45.76 
 
 		 358 aa  265  8e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.498449  normal  0.0822875 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5141  preprotein translocase subunit SecF  46.58 
 
 		 417 aa  259  8e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.358124  hitchhiker  0.00205157 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1365  protein-export membrane protein SecF  40.81 
 
 		 366 aa  256  6e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3050  protein-export membrane protein SecF  45.81 
 
 		 330 aa  254  2.0000000000000002e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1813  protein-export membrane protein SecF  38.12 
 
 		 394 aa  252  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.126223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1803  protein-export membrane protein SecF  39.27 
 
 		 394 aa  247  3e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162985  decreased coverage  0.00000393416 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17560  protein translocase subunit secF  44.15 
 
 		 371 aa  247  3e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.095972 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2357  protein-export membrane protein SecF  42.13 
 
 		 389 aa  246  4.9999999999999997e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677803  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1799  protein-export membrane protein SecF  41.67 
 
 		 360 aa  246  6.999999999999999e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.544061  normal  0.135983 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2028  preprotein translocase subunit SecF  39.64 
 
 		 338 aa  243  3e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000424362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6108  preprotein translocase subunit SecF  40.19 
 
 		 347 aa  243  7e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359416  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13990  protein translocase subunit secF  41.23 
 
 		 364 aa  241  2e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.269244  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2060  protein-export membrane protein SecF  44.23 
 
 		 326 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.616528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2390  protein translocase subunit secF  38.44 
 
 		 412 aa  239  8e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2114  protein-export membrane protein SecF  40 
 
 		 390 aa  238  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205616  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1671  protein-export membrane protein SecF  41.19 
 
 		 363 aa  233  6e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15300  protein translocase subunit secF  41.88 
 
 		 406 aa  232  1e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.54161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2298  preprotein translocase subunit SecF  37.92 
 
 		 340 aa  226  6e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0946  protein-export membrane protein SecF  36.72 
 
 		 349 aa  203  4e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12850  protein translocase subunit secF  37.34 
 
 		 346 aa  196  5.000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0129827  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12600  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  32.85 
 
 		 977 aa  176  9.999999999999999e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  34.62 
 
 		 286 aa  171  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0984  protein-export membrane protein SecD  34.85 
 
 		 900 aa  167  2.9999999999999998e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.583326 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  34.36 
 
 		 989 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2885  preprotein translocase subunit SecF  35.58 
 
 		 310 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1335  protein translocase subunit secF  38.36 
 
 		 292 aa  152  8.999999999999999e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  29.33 
 
 		 735 aa  150  5e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07200  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  33.33 
 
 		 855 aa  148  2.0000000000000003e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  31.6 
 
 		 761 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1907  preprotein translocase subunit SecF  29.69 
 
 		 289 aa  146  7.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0418717  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3211  preprotein translocase subunit SecF  35.28 
 
 		 310 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.828599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2196  preprotein translocase subunit SecF  30.19 
 
 		 289 aa  144  4e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1424  preprotein translocase subunit SecF  28.76 
 
 		 280 aa  143  7e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000449698  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1463  preprotein translocase subunit SecF  31.45 
 
 		 303 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000137336  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0997  preprotein translocase subunit SecF  32.26 
 
 		 322 aa  138  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1271  preprotein translocase subunit SecF  33.56 
 
 		 296 aa  138  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  32.54 
 
 		 307 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.18 
 
 		 762 aa  135  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1690  preprotein translocase subunit SecF  33.55 
 
 		 310 aa  134  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.113213  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5076  preprotein translocase subunit SecF  32.81 
 
 		 328 aa  134  3.9999999999999996e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  30.9 
 
 		 759 aa  133  5e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0626  protein-export membrane protein SecF  30.41 
 
 		 310 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000549124  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2737  protein-export membrane protein SecF  30.3 
 
 		 308 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.468895  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1489  preprotein translocase subunit SecF  31.87 
 
 		 325 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.921272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1355  preprotein translocase subunit SecF  31.67 
 
 		 293 aa  130  3e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0066  protein-export membrane protein SecF  30.33 
 
 		 293 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  30.79 
 
 		 291 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1670  preprotein translocase subunit SecF  33.67 
 
 		 292 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00270917  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1981  preprotein translocase subunit SecF  28.27 
 
 		 305 aa  129  8.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1976  preprotein translocase subunit SecF  28.27 
 
 		 305 aa  129  8.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  28.83 
 
 		 740 aa  129  9.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_002936  DET0332  preprotein translocase subunit SecF  32.89 
 
 		 301 aa  126  9e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.496269  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3211  protein translocase subunit secF  32.89 
 
 		 311 aa  126  9e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1027  preprotein translocase subunit SecF  31.97 
 
 		 312 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0198826 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0141  preprotein translocase subunit SecF  31.23 
 
 		 314 aa  123  7e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0673  preprotein translocase subunit SecF  27.8 
 
 		 299 aa  122  9e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.392414  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08751  putative protein-export transmembrane SecDF protein  26.77 
 
 		 1001 aa  122  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392094  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1770  protein-export membrane protein SecF  27.46 
 
 		 307 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0072  preprotein translocase subunit SecF  28.25 
 
 		 323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5129  preprotein translocase subunit SecF  33.44 
 
 		 336 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.642857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1115  protein-export membrane protein SecF  28.57 
 
 		 302 aa  121  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_274  protein-export membrane protein, preprotein translocase SecF subunit  31.25 
 
 		 302 aa  121  3e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00850837  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1286  protein-export membrane protein SecF  31.09 
 
 		 305 aa  120  3.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.115107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0312  preprotein translocase subunit SecF  30.92 
 
 		 301 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.111019  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4538  protein-export membrane protein SecF  31.76 
 
 		 320 aa  120  3.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0066  protein-export membrane protein SecF  29.74 
 
 		 293 aa  120  6e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0903  protein translocase subunit secF  28.12 
 
 		 318 aa  119  7e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000021842  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0283  preprotein translocase subunit SecF  29.3 
 
 		 321 aa  119  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.164559  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1341  protein-export membrane protein SecF  29.35 
 
 		 298 aa  119  9.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  30.54 
 
 		 304 aa  118  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  30.54 
 
 		 304 aa  118  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0387  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.63 
 
 		 911 aa  118  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.807363  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0475  preprotein translocase subunit SecF  26.84 
 
 		 323 aa  117  3e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09531  preprotein translocase subunit SecF  29.62 
 
 		 318 aa  117  3e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.14982 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0537  protein-export membrane protein SecF  26.48 
 
 		 327 aa  117  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000416815  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4144  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.82 
 
 		 754 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2513  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.51 
 
 		 750 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000183584  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4491  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.82 
 
 		 754 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000282789 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6254  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.83 
 
 		 1055 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1797  preprotein translocase subunit SecF  30.48 
 
 		 307 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4155  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.82 
 
 		 754 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4306  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.48 
 
 		 754 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4641  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.48 
 
 		 754 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1302  protein-export membrane protein SecF  31.38 
 
 		 315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4545  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.87 
 
 		 754 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>