More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0946 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0946  protein-export membrane protein SecF  100 
 
 		 349 aa  687    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1340  preprotein translocase subunit SecF  44.48 
 
 		 414 aa  263  3e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.265736  normal  0.609901 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2114  protein-export membrane protein SecF  41.1 
 
 		 390 aa  247  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205616  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6108  preprotein translocase subunit SecF  38.24 
 
 		 347 aa  241  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359416  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5141  preprotein translocase subunit SecF  43 
 
 		 417 aa  233  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.358124  hitchhiker  0.00205157 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1374  preprotein translocase subunit SecF  44.3 
 
 		 398 aa  233  3e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.574602  normal  0.142388 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2060  protein-export membrane protein SecF  43.46 
 
 		 326 aa  229  4e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.616528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1365  protein-export membrane protein SecF  39.82 
 
 		 366 aa  228  1e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3815  preprotein translocase subunit SecF  38.98 
 
 		 422 aa  226  4e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130348  normal  0.401094 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2357  protein-export membrane protein SecF  38.56 
 
 		 389 aa  226  6e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1997  protein-export membrane protein SecF  42.22 
 
 		 358 aa  223  4e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.498449  normal  0.0822875 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3173  protein-export membrane protein SecF  42.26 
 
 		 453 aa  220  3e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.12818  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3050  protein-export membrane protein SecF  38.14 
 
 		 330 aa  218  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2390  protein translocase subunit secF  39.94 
 
 		 412 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2316  preprotein translocase subunit SecF  37.71 
 
 		 417 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.658853  normal  0.312291 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2277  preprotein translocase subunit SecF  37.71 
 
 		 417 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2324  preprotein translocase subunit SecF  37.71 
 
 		 417 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223224  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17560  protein translocase subunit secF  40.76 
 
 		 371 aa  211  1e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.095972 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15110  protein translocase subunit secF  37.57 
 
 		 414 aa  211  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.66233 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3823  protein-export membrane protein SecF  37.8 
 
 		 416 aa  210  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.344735  normal  0.619548 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2584  preprotein translocase subunit SecF  36.72 
 
 		 423 aa  207  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.173731  normal  0.904597 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2305  protein-export membrane protein SecF  38.57 
 
 		 421 aa  207  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.879944  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1799  protein-export membrane protein SecF  39.45 
 
 		 360 aa  207  2e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.544061  normal  0.135983 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1696  protein-export membrane protein SecF  37.92 
 
 		 396 aa  206  5e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467956  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13990  protein translocase subunit secF  39.33 
 
 		 364 aa  204  2e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.269244  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  39.2 
 
 		 989 aa  202  5e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12606  preprotein translocase subunit SecF  38.05 
 
 		 442 aa  199  5e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12600  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  37.9 
 
 		 977 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3390  protein-export membrane protein SecF  33.94 
 
 		 432 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000120226  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0984  protein-export membrane protein SecD  36.86 
 
 		 900 aa  196  6e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.583326 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1671  protein-export membrane protein SecF  40.59 
 
 		 363 aa  194  2e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15300  protein translocase subunit secF  40.84 
 
 		 406 aa  189  5e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.54161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1813  protein-export membrane protein SecF  36.22 
 
 		 394 aa  189  5.999999999999999e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.126223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2028  preprotein translocase subunit SecF  37.71 
 
 		 338 aa  189  7e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000424362 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2298  preprotein translocase subunit SecF  39.3 
 
 		 340 aa  189  9e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1943  protein-export membrane protein SecF  41.04 
 
 		 374 aa  187  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00503357  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1803  protein-export membrane protein SecF  35.29 
 
 		 394 aa  187  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162985  decreased coverage  0.00000393416 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12850  protein translocase subunit secF  36.79 
 
 		 346 aa  180  2.9999999999999997e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0129827  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07200  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  37.5 
 
 		 855 aa  174  1.9999999999999998e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  36.55 
 
 		 286 aa  172  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1271  preprotein translocase subunit SecF  36.91 
 
 		 296 aa  170  4e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  35.67 
 
 		 291 aa  167  4e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1690  preprotein translocase subunit SecF  37.79 
 
 		 310 aa  166  5e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.113213  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.81 
 
 		 762 aa  166  5e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1770  protein-export membrane protein SecF  31.51 
 
 		 307 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2885  preprotein translocase subunit SecF  32.18 
 
 		 310 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  32.48 
 
 		 740 aa  159  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1355  preprotein translocase subunit SecF  37.06 
 
 		 293 aa  158  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  32.67 
 
 		 307 aa  157  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1201  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.66 
 
 		 763 aa  157  4e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.732454  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1797  preprotein translocase subunit SecF  33.33 
 
 		 307 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  33.85 
 
 		 735 aa  155  9e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  33.9 
 
 		 304 aa  155  1e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  33.9 
 
 		 304 aa  155  1e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2065  preprotein translocase subunit SecF  34.83 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3037  protein-export membrane protein SecF  28.3 
 
 		 316 aa  154  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3211  protein translocase subunit secF  33.76 
 
 		 311 aa  154  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1463  preprotein translocase subunit SecF  31.68 
 
 		 303 aa  153  4e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000137336  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0511  preprotein translocase subunit SecF  31.85 
 
 		 311 aa  153  5e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.956081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3211  preprotein translocase subunit SecF  34.17 
 
 		 310 aa  152  8e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.828599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2196  preprotein translocase subunit SecF  32.89 
 
 		 289 aa  152  8e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0626  protein-export membrane protein SecF  32.59 
 
 		 310 aa  152  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000549124  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  32.26 
 
 		 759 aa  152  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1907  preprotein translocase subunit SecF  30.96 
 
 		 289 aa  152  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0418717  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5129  preprotein translocase subunit SecF  37.41 
 
 		 336 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.642857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1335  protein translocase subunit secF  36.95 
 
 		 292 aa  151  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1898  protein translocase subunit secF  35.46 
 
 		 314 aa  150  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186497  normal  0.970453 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1727  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.37 
 
 		 759 aa  150  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.347489  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1424  preprotein translocase subunit SecF  30.23 
 
 		 280 aa  150  3e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000449698  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.37 
 
 		 759 aa  150  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0141  preprotein translocase subunit SecF  34.49 
 
 		 314 aa  150  4e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0997  preprotein translocase subunit SecF  32.13 
 
 		 322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5076  preprotein translocase subunit SecF  32.2 
 
 		 328 aa  149  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2080  preprotein translocase subunit SecF  31.67 
 
 		 310 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.348624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1489  preprotein translocase subunit SecF  30.59 
 
 		 325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.921272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0631  preprotein translocase subunit SecF  34.02 
 
 		 323 aa  148  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1415  preprotein translocase subunit SecF  32.54 
 
 		 330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.661465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0273  preprotein translocase subunit SecF  32.99 
 
 		 315 aa  147  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0027  preprotein translocase subunit SecF  32.89 
 
 		 310 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2349  preprotein translocase subunit SecF  30.93 
 
 		 312 aa  146  5e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1235  preprotein translocase subunit SecF  33.68 
 
 		 323 aa  145  7.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.178131  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1110  preprotein translocase subunit SecF  33.68 
 
 		 323 aa  145  7.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2513  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.03 
 
 		 750 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000183584  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4538  protein-export membrane protein SecF  31.5 
 
 		 320 aa  145  1e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0072  preprotein translocase subunit SecF  33.23 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004364  protein-export membrane protein SecF  30.34 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0679828  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01049  preprotein translocase subunit SecF  30.34 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1981  preprotein translocase subunit SecF  31.14 
 
 		 305 aa  143  4e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1976  preprotein translocase subunit SecF  31.14 
 
 		 305 aa  143  4e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1302  protein-export membrane protein SecF  33.9 
 
 		 315 aa  143  4e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0080  protein-export membrane protein SecF  33.66 
 
 		 317 aa  143  5e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1330  SecF protein  31.83 
 
 		 338 aa  143  5e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0105179  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0008  preprotein translocase subunit SecF  32.13 
 
 		 311 aa  143  6e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.748405  normal  0.104556 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.9 
 
 		 856 aa  143  6e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0866  preprotein translocase subunit SecF  33.67 
 
 		 302 aa  142  9e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222243  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0702  preprotein translocase subunit SecF  32.04 
 
 		 316 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.686375  normal  0.807805 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1027  preprotein translocase subunit SecF  34.4 
 
 		 312 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0198826 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0708  preprotein translocase subunit SecF  32.03 
 
 		 323 aa  141  9.999999999999999e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0879  preprotein translocase subunit SecF  34.01 
 
 		 302 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0954141 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1620  protein-export membrane protein SecF  27.62 
 
 		 323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>