More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_5129 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_5129  preprotein translocase subunit SecF  100 
 
 		 336 aa  672    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.642857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5076  preprotein translocase subunit SecF  64.02 
 
 		 328 aa  413  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1489  preprotein translocase subunit SecF  65.06 
 
 		 325 aa  404  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.921272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2885  preprotein translocase subunit SecF  62.62 
 
 		 310 aa  395  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4538  protein-export membrane protein SecF  63.64 
 
 		 320 aa  387  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3211  preprotein translocase subunit SecF  62.3 
 
 		 310 aa  375  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.828599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1027  preprotein translocase subunit SecF  59.35 
 
 		 312 aa  363  2e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0198826 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0141  preprotein translocase subunit SecF  56.6 
 
 		 314 aa  319  3e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1278  preprotein translocase subunit SecF  43.17 
 
 		 328 aa  225  9e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.630686  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0871  preprotein translocase subunit SecF  40.88 
 
 		 304 aa  223  4.9999999999999996e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0139488  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09531  preprotein translocase subunit SecF  40.32 
 
 		 318 aa  218  1e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.14982 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0283  preprotein translocase subunit SecF  39.68 
 
 		 321 aa  215  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.164559  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09321  preprotein translocase subunit SecF  41.7 
 
 		 304 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09301  preprotein translocase subunit SecF  41.7 
 
 		 304 aa  212  7.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.359776  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16231  preprotein translocase subunit SecF  39.71 
 
 		 359 aa  212  9e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.205013 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10111  preprotein translocase subunit SecF  38.67 
 
 		 305 aa  211  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1192  preprotein translocase subunit SecF  43.91 
 
 		 329 aa  208  1e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  39.27 
 
 		 286 aa  206  6e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07171  preprotein translocase subunit SecF  41.75 
 
 		 322 aa  203  4e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.434985  normal  0.295105 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  39.47 
 
 		 735 aa  198  7.999999999999999e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1690  preprotein translocase subunit SecF  40.2 
 
 		 310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.113213  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0080  protein-export membrane protein SecF  38.32 
 
 		 317 aa  194  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1271  preprotein translocase subunit SecF  37.74 
 
 		 296 aa  189  7e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  36.91 
 
 		 291 aa  185  9e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  32.77 
 
 		 304 aa  184  1.0000000000000001e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  32.77 
 
 		 304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1424  preprotein translocase subunit SecF  36.58 
 
 		 280 aa  181  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000449698  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  32.88 
 
 		 307 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1463  preprotein translocase subunit SecF  34.63 
 
 		 303 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000137336  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0997  preprotein translocase subunit SecF  33.02 
 
 		 322 aa  170  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0935  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.28 
 
 		 750 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2513  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.2 
 
 		 750 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000183584  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  29.31 
 
 		 761 aa  166  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004364  protein-export membrane protein SecF  33.89 
 
 		 315 aa  166  5e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0679828  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01049  preprotein translocase subunit SecF  33.66 
 
 		 315 aa  166  5.9999999999999996e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3325  protein-export membrane protein SecF  36.05 
 
 		 324 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1355  preprotein translocase subunit SecF  36.39 
 
 		 293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1670  preprotein translocase subunit SecF  35.26 
 
 		 292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00270917  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.15 
 
 		 848 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3983  protein-export membrane protein SecF  35.42 
 
 		 324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.586193  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2737  protein-export membrane protein SecF  34.08 
 
 		 308 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.468895  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1002  protein-export membrane protein SecF  35.28 
 
 		 319 aa  162  5.0000000000000005e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0946  protein-export membrane protein SecF  35.6 
 
 		 349 aa  162  6e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0273  preprotein translocase subunit SecF  34.97 
 
 		 315 aa  162  8.000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  34.35 
 
 		 759 aa  161  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0147  protein translocase subunit secF  45.45 
 
 		 404 aa  161  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000009249  hitchhiker  0.00252765 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.15 
 
 		 849 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3211  protein translocase subunit secF  34.33 
 
 		 311 aa  161  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1231  preprotein translocase subunit SecF  33.81 
 
 		 303 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.611016  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0866  preprotein translocase subunit SecF  32.29 
 
 		 302 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222243  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0013  preprotein translocase subunit SecF  35.42 
 
 		 309 aa  160  3e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245212 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0836  preprotein translocase subunit SecF  34.3 
 
 		 302 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1231  protein-export membrane protein SecF  33.55 
 
 		 313 aa  159  5e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2616  preprotein translocase subunit SecF  31.66 
 
 		 302 aa  159  7e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1416  protein-export membrane protein SecF  33.81 
 
 		 303 aa  159  8e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3103  protein-export membrane protein SecF  34.39 
 
 		 322 aa  159  9e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2065  preprotein translocase subunit SecF  33.43 
 
 		 313 aa  158  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0879  preprotein translocase subunit SecF  33.11 
 
 		 302 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0954141 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0008  preprotein translocase subunit SecF  32.08 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.748405  normal  0.104556 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0027  preprotein translocase subunit SecF  32.09 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2443  preprotein translocase subunit SecF  32.5 
 
 		 347 aa  157  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000105757  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0511  preprotein translocase subunit SecF  31.86 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.956081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_274  protein-export membrane protein, preprotein translocase SecF subunit  29.97 
 
 		 302 aa  157  3e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00850837  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1797  preprotein translocase subunit SecF  31.09 
 
 		 307 aa  157  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12600  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  33.55 
 
 		 977 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2185  protein-export membrane protein SecF  29.72 
 
 		 312 aa  156  5.0000000000000005e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1219  preprotein translocase subunit SecF  35.94 
 
 		 314 aa  156  6e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417925 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  34.72 
 
 		 989 aa  155  7e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2856  protein-export membrane protein SecF  32.15 
 
 		 318 aa  155  7e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.114618 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1454  protein-export membrane protein SecF  35.38 
 
 		 308 aa  155  7e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0298464  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1629  protein-export membrane protein SecD  31.8 
 
 		 748 aa  155  9e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.683752  normal  0.475056 
 
 
-
 
NC_002936  DET0332  preprotein translocase subunit SecF  28.99 
 
 		 301 aa  155  1e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.496269  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2336  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.12 
 
 		 759 aa  155  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.217617  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1727  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.07 
 
 		 759 aa  155  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.347489  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0312  preprotein translocase subunit SecF  29.51 
 
 		 301 aa  155  1e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.111019  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4258  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.33 
 
 		 755 aa  154  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.07 
 
 		 759 aa  155  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0609  preprotein translocase subunit SecF  32.07 
 
 		 316 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1216  protein-export membrane protein SecF  34.36 
 
 		 291 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0233184  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1713  SecF protein  32.02 
 
 		 327 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2432  preprotein translocase subunit SecF  34.22 
 
 		 316 aa  154  2.9999999999999998e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1509  preprotein translocase subunit SecF  33.56 
 
 		 324 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.444089 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1719  preprotein translocase subunit SecF  33.46 
 
 		 302 aa  153  4e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2644  protein-export membrane protein SecF  33.78 
 
 		 304 aa  153  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0946476  hitchhiker  0.00035144 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1064  preprotein translocase subunit SecF  30.84 
 
 		 322 aa  153  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204402 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.65 
 
 		 754 aa  153  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0705  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.56 
 
 		 754 aa  153  5e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2056  protein-export membrane protein SecF  32.56 
 
 		 337 aa  153  5e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.880378  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2426  preprotein translocase subunit SecF  32.34 
 
 		 310 aa  152  5e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2432  preprotein translocase subunit SecF  31.6 
 
 		 301 aa  152  8e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.604218  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5118  preprotein translocase subunit SecF  36.33 
 
 		 319 aa  152  8e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0631  preprotein translocase subunit SecF  33.23 
 
 		 323 aa  152  8.999999999999999e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1976  preprotein translocase subunit SecF  30.27 
 
 		 305 aa  152  8.999999999999999e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0855  preprotein translocase subunit SecF  32.68 
 
 		 302 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0634  preprotein translocase subunit SecF  33.33 
 
 		 316 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4530  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.89 
 
 		 754 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.566924  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1714  protein-export membrane protein SecF  31.83 
 
 		 316 aa  152  8.999999999999999e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.611616  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3200  protein-export membrane protein SecF  30.54 
 
 		 323 aa  152  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0111096  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3224  preprotein translocase subunit SecF  30.54 
 
 		 323 aa  152  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000013674 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0441  preprotein translocase subunit SecF  30.54 
 
 		 323 aa  152  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>