More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0855 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0855  preprotein translocase subunit SecF  100 
 
 		 302 aa  600  1e-170  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2616  preprotein translocase subunit SecF  78.81 
 
 		 302 aa  477  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1797  preprotein translocase subunit SecF  69.64 
 
 		 307 aa  431  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1719  preprotein translocase subunit SecF  70.53 
 
 		 302 aa  418  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1785  preprotein translocase subunit SecF  65.56 
 
 		 301 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00817769 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2432  preprotein translocase subunit SecF  64.24 
 
 		 301 aa  396  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.604218  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0504  preprotein translocase subunit SecF  65.2 
 
 		 313 aa  369  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.300197  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2008  preprotein translocase subunit SecF  66.67 
 
 		 313 aa  367  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  42 
 
 		 307 aa  228  1e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2056  protein-export membrane protein SecF  40.83 
 
 		 337 aa  207  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.880378  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0562  protein-export membrane protein SecF  38.26 
 
 		 321 aa  207  2e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1714  protein-export membrane protein SecF  41.05 
 
 		 316 aa  207  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.611616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3211  protein translocase subunit secF  39.25 
 
 		 311 aa  199  3.9999999999999996e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2065  preprotein translocase subunit SecF  40.21 
 
 		 313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2443  preprotein translocase subunit SecF  37.13 
 
 		 347 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000105757  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0511  preprotein translocase subunit SecF  36.51 
 
 		 311 aa  195  7e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.956081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4310  protein-export membrane protein SecF  35.49 
 
 		 357 aa  194  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3464  protein-export membrane protein SecD  36.82 
 
 		 849 aa  194  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.068989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1770  protein-export membrane protein SecF  36.12 
 
 		 307 aa  193  3e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  38.78 
 
 		 286 aa  192  8e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0708  preprotein translocase subunit SecF  37.5 
 
 		 323 aa  192  8e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1330  SecF protein  37.93 
 
 		 338 aa  191  9e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0105179  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2426  preprotein translocase subunit SecF  37.16 
 
 		 310 aa  191  9e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0273  preprotein translocase subunit SecF  39.86 
 
 		 315 aa  191  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0123  protein-export membrane protein SecF  36.7 
 
 		 293 aa  191  2e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.504249  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1342  preprotein translocase subunit SecF  34.42 
 
 		 362 aa  191  2e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0507667  normal  0.548062 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0682  protein-export membrane protein SecF  33.43 
 
 		 357 aa  189  5e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.435801  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1271  preprotein translocase subunit SecF  35.88 
 
 		 296 aa  189  5e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1235  preprotein translocase subunit SecF  38.85 
 
 		 323 aa  189  5.999999999999999e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.178131  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1110  preprotein translocase subunit SecF  38.85 
 
 		 323 aa  189  5.999999999999999e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0891  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.7 
 
 		 785 aa  189  7e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.983907  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0631  preprotein translocase subunit SecF  38.85 
 
 		 323 aa  189  7e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0887  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.7 
 
 		 785 aa  189  7e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0072  preprotein translocase subunit SecF  37.06 
 
 		 323 aa  188  8e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0866  preprotein translocase subunit SecF  36.49 
 
 		 302 aa  188  8e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222243  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1123  preprotein translocase subunit SecF  36.68 
 
 		 315 aa  188  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0997  preprotein translocase subunit SecF  38.16 
 
 		 322 aa  187  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0879  preprotein translocase subunit SecF  35.79 
 
 		 302 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0954141 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3110  preprotein translocase subunit SecF  38.68 
 
 		 315 aa  186  5e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2349  preprotein translocase subunit SecF  38.18 
 
 		 312 aa  185  6e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2836  protein translocase subunit secF  35.66 
 
 		 302 aa  186  6e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1620  protein-export membrane protein SecF  35.08 
 
 		 323 aa  185  7e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0836  preprotein translocase subunit SecF  35.44 
 
 		 302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01049  preprotein translocase subunit SecF  38.08 
 
 		 315 aa  185  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1416  protein-export membrane protein SecF  35.09 
 
 		 303 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  36.99 
 
 		 989 aa  184  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0540  preprotein translocase subunit SecF  34.87 
 
 		 361 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0258314 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2336  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.86 
 
 		 759 aa  183  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.217617  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1231  protein-export membrane protein SecF  36.05 
 
 		 313 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1424  preprotein translocase subunit SecF  35.82 
 
 		 280 aa  182  4.0000000000000006e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000449698  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0027  preprotein translocase subunit SecF  35.16 
 
 		 310 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1002  protein-export membrane protein SecF  36.99 
 
 		 319 aa  182  6e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1231  preprotein translocase subunit SecF  35.09 
 
 		 303 aa  182  7e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.611016  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4618  preprotein translocase subunit SecF  35.44 
 
 		 304 aa  181  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  35.29 
 
 		 304 aa  181  1e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  36.82 
 
 		 291 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004364  protein-export membrane protein SecF  37.01 
 
 		 315 aa  181  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0679828  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  35.39 
 
 		 304 aa  181  1e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  37.99 
 
 		 759 aa  181  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0080  protein-export membrane protein SecF  36.67 
 
 		 317 aa  179  4e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1115  protein-export membrane protein SecF  35.92 
 
 		 302 aa  179  4e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0684  preprotein translocase subunit SecF  34.24 
 
 		 309 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.738953  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.71 
 
 		 762 aa  179  4.999999999999999e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.35 
 
 		 856 aa  179  4.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2432  preprotein translocase subunit SecF  38.65 
 
 		 316 aa  179  7e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3037  protein-export membrane protein SecF  37.84 
 
 		 316 aa  178  8e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1819  preprotein translocase subunit SecF  35.38 
 
 		 356 aa  178  8e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000814771  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1219  preprotein translocase subunit SecF  37.11 
 
 		 314 aa  178  8e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417925 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4342  preprotein translocase subunit SecF  35.79 
 
 		 302 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.557524  hitchhiker  0.0000000544827 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0013  preprotein translocase subunit SecF  36.45 
 
 		 309 aa  177  2e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245212 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0235  preprotein translocase subunit SecF  35.57 
 
 		 316 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0847  protein-export membrane protein SecF  36.94 
 
 		 359 aa  177  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0561071  normal  0.116765 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0687  preprotein translocase subunit SecF  35.57 
 
 		 316 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0719  preprotein translocase subunit SecF  35.57 
 
 		 316 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3807  preprotein translocase subunit SecF  35.18 
 
 		 316 aa  176  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0012  preprotein translocase subunit SecF  35.99 
 
 		 308 aa  176  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000296376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2699  preprotein translocase subunit SecF  36.62 
 
 		 315 aa  176  3e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.584759  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2481  preprotein translocase subunit SecF  36.97 
 
 		 315 aa  176  4e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0456849  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.91 
 
 		 856 aa  176  5e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2667  preprotein translocase subunit SecF  35.57 
 
 		 316 aa  176  5e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452274  normal  0.524558 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2856  protein-export membrane protein SecF  36.05 
 
 		 318 aa  176  6e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.114618 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1860  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.22 
 
 		 844 aa  176  6e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3365  preprotein translocase subunit SecF  35.83 
 
 		 316 aa  175  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3374  preprotein translocase subunit SecF  35.83 
 
 		 316 aa  175  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1275  preprotein translocase subunit SecF  35.83 
 
 		 316 aa  175  8e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  36.08 
 
 		 740 aa  175  8e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0014  preprotein translocase subunit SecF  34.84 
 
 		 311 aa  175  9e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00246116  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0634  preprotein translocase subunit SecF  35.18 
 
 		 316 aa  175  9e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0008  preprotein translocase subunit SecF  35.39 
 
 		 311 aa  175  9e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.748405  normal  0.104556 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0609  preprotein translocase subunit SecF  35.18 
 
 		 316 aa  175  9e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14650  preprotein translocase subunit SecF  34.14 
 
 		 306 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.33 
 
 		 846 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1117  preprotein translocase subunit SecF  35.12 
 
 		 316 aa  174  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1293  preprotein translocase subunit SecF  34.14 
 
 		 306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1670  preprotein translocase subunit SecF  36.81 
 
 		 292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00270917  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3331  preprotein translocase subunit SecF  34.78 
 
 		 316 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0935512  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1238  preprotein translocase subunit SecF  33.24 
 
 		 351 aa  173  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0837  preprotein translocase subunit SecF  34.84 
 
 		 316 aa  173  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40450  preprotein translocase subunit SecF  36.11 
 
 		 304 aa  172  5e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.193489  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1690  preprotein translocase subunit SecF  36.88 
 
 		 310 aa  172  5e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.113213  normal  0.394622 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>