More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1489 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_1489  preprotein translocase subunit SecF  100 
 
 		 325 aa  652    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.921272  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4538  protein-export membrane protein SecF  75.86 
 
 		 320 aa  482  1e-135  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5076  preprotein translocase subunit SecF  63.69 
 
 		 328 aa  412  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2885  preprotein translocase subunit SecF  62.54 
 
 		 310 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3211  preprotein translocase subunit SecF  62.54 
 
 		 310 aa  378  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.828599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5129  preprotein translocase subunit SecF  65.06 
 
 		 336 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.642857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1027  preprotein translocase subunit SecF  57.78 
 
 		 312 aa  354  1e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0198826 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0141  preprotein translocase subunit SecF  59.38 
 
 		 314 aa  337  9.999999999999999e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1278  preprotein translocase subunit SecF  43.45 
 
 		 328 aa  240  2e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.630686  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1192  preprotein translocase subunit SecF  42.39 
 
 		 329 aa  218  1e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09531  preprotein translocase subunit SecF  39.12 
 
 		 318 aa  218  1e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.14982 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0283  preprotein translocase subunit SecF  38.8 
 
 		 321 aa  216  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.164559  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  40.58 
 
 		 286 aa  211  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16231  preprotein translocase subunit SecF  40.62 
 
 		 359 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.205013 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  38.76 
 
 		 735 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1271  preprotein translocase subunit SecF  38.51 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0871  preprotein translocase subunit SecF  38.97 
 
 		 304 aa  192  6e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0139488  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1690  preprotein translocase subunit SecF  40.19 
 
 		 310 aa  191  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.113213  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09321  preprotein translocase subunit SecF  40.22 
 
 		 304 aa  189  4e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0080  protein-export membrane protein SecF  36.25 
 
 		 317 aa  189  4e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09301  preprotein translocase subunit SecF  39.19 
 
 		 304 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.359776  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  37.29 
 
 		 291 aa  187  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1424  preprotein translocase subunit SecF  36.49 
 
 		 280 aa  187  3e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000449698  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07171  preprotein translocase subunit SecF  39.03 
 
 		 322 aa  186  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.434985  normal  0.295105 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10111  preprotein translocase subunit SecF  38.55 
 
 		 305 aa  181  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3983  protein-export membrane protein SecF  37.85 
 
 		 324 aa  180  4e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.586193  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3325  protein-export membrane protein SecF  38.22 
 
 		 324 aa  179  5.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1670  preprotein translocase subunit SecF  38.1 
 
 		 292 aa  176  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00270917  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  37.22 
 
 		 989 aa  173  3.9999999999999995e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1355  preprotein translocase subunit SecF  36.13 
 
 		 293 aa  172  5e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  33.23 
 
 		 761 aa  171  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0027  preprotein translocase subunit SecF  33.96 
 
 		 310 aa  171  2e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1216  protein-export membrane protein SecF  36.5 
 
 		 291 aa  168  1e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0233184  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  34.64 
 
 		 304 aa  167  2e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3211  protein translocase subunit secF  36.04 
 
 		 311 aa  167  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  34.64 
 
 		 304 aa  167  2e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1463  preprotein translocase subunit SecF  35.95 
 
 		 303 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000137336  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  33.87 
 
 		 307 aa  166  4e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2513  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.08 
 
 		 750 aa  166  4e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000183584  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1785  preprotein translocase subunit SecF  32.35 
 
 		 301 aa  166  4e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00817769 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0997  preprotein translocase subunit SecF  33.99 
 
 		 322 aa  165  8e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2432  preprotein translocase subunit SecF  31.58 
 
 		 301 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.604218  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  36.09 
 
 		 759 aa  165  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0935  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.06 
 
 		 750 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0014  preprotein translocase subunit SecF  32.72 
 
 		 311 aa  162  6e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00246116  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0855  preprotein translocase subunit SecF  32.89 
 
 		 302 aa  161  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0332  preprotein translocase subunit SecF  30.32 
 
 		 301 aa  160  3e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.496269  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2616  preprotein translocase subunit SecF  32.06 
 
 		 302 aa  159  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1231  preprotein translocase subunit SecF  33.45 
 
 		 303 aa  160  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.611016  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.54 
 
 		 754 aa  159  5e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4306  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.54 
 
 		 754 aa  159  6e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4641  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.54 
 
 		 754 aa  159  6e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4545  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.54 
 
 		 754 aa  159  6e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1416  protein-export membrane protein SecF  33.45 
 
 		 303 aa  159  7e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_274  protein-export membrane protein, preprotein translocase SecF subunit  30.65 
 
 		 302 aa  159  7e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00850837  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3127  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.06 
 
 		 752 aa  159  8e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0008  preprotein translocase subunit SecF  33.55 
 
 		 311 aa  158  9e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.748405  normal  0.104556 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0705  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.2 
 
 		 754 aa  158  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4530  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.21 
 
 		 754 aa  158  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.566924  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0312  preprotein translocase subunit SecF  30 
 
 		 301 aa  158  1e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.111019  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0147  protein translocase subunit secF  37.97 
 
 		 404 aa  158  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000009249  hitchhiker  0.00252765 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12600  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  36.53 
 
 		 977 aa  158  1e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0836  preprotein translocase subunit SecF  32.23 
 
 		 302 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4144  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.21 
 
 		 754 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4155  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.54 
 
 		 754 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2196  preprotein translocase subunit SecF  34.5 
 
 		 289 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4258  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.77 
 
 		 755 aa  157  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4491  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.21 
 
 		 754 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000282789 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2737  protein-export membrane protein SecF  35.16 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.468895  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1860  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.49 
 
 		 844 aa  157  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1727  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.54 
 
 		 759 aa  156  4e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.347489  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.54 
 
 		 759 aa  156  4e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2644  protein-export membrane protein SecF  32.81 
 
 		 304 aa  155  6e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0946476  hitchhiker  0.00035144 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1770  protein-export membrane protein SecF  33.45 
 
 		 307 aa  155  7e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0631  preprotein translocase subunit SecF  36.03 
 
 		 323 aa  155  8e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01049  preprotein translocase subunit SecF  35.07 
 
 		 315 aa  154  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1907  preprotein translocase subunit SecF  34.08 
 
 		 289 aa  155  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0418717  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0537  protein-export membrane protein SecF  31.83 
 
 		 327 aa  155  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000416815  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0879  preprotein translocase subunit SecF  32.36 
 
 		 302 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0954141 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1201  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.21 
 
 		 763 aa  154  2e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.732454  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1235  preprotein translocase subunit SecF  36.03 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.178131  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1110  preprotein translocase subunit SecF  36.03 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1858  preprotein translocase subunit SecF  33.65 
 
 		 320 aa  154  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.150957  normal  0.772867 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0687  preprotein translocase subunit SecF  35.42 
 
 		 316 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2947  preprotein translocase subunit SecF  36.23 
 
 		 324 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0866  preprotein translocase subunit SecF  32.04 
 
 		 302 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222243  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0235  preprotein translocase subunit SecF  35.42 
 
 		 316 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0719  preprotein translocase subunit SecF  35.42 
 
 		 316 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1286  protein-export membrane protein SecF  33.33 
 
 		 305 aa  154  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.115107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3807  preprotein translocase subunit SecF  35.06 
 
 		 316 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2528  preprotein translocase subunit SecF  36.3 
 
 		 316 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.31 
 
 		 856 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4310  protein-export membrane protein SecF  33.33 
 
 		 357 aa  153  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  36.3 
 
 		 740 aa  153  4e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004364  protein-export membrane protein SecF  35.82 
 
 		 315 aa  152  5.9999999999999996e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0679828  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2056  protein-export membrane protein SecF  35.42 
 
 		 337 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.880378  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0387  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.7 
 
 		 911 aa  152  7e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.807363  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1714  protein-export membrane protein SecF  35.42 
 
 		 316 aa  152  8.999999999999999e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.611616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3331  preprotein translocase subunit SecF  35.06 
 
 		 316 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0935512  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1719  preprotein translocase subunit SecF  33.33 
 
 		 302 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>