More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_09321 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008816  A9601_09321  preprotein translocase subunit SecF  100 
 
 		 304 aa  590  1e-168  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0871  preprotein translocase subunit SecF  96.05 
 
 		 304 aa  568  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0139488  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09301  preprotein translocase subunit SecF  97.7 
 
 		 304 aa  560  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.359776  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10111  preprotein translocase subunit SecF  77.48 
 
 		 305 aa  464  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09531  preprotein translocase subunit SecF  43.69 
 
 		 318 aa  268  7e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.14982 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0283  preprotein translocase subunit SecF  43.69 
 
 		 321 aa  266  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.164559  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1278  preprotein translocase subunit SecF  39.55 
 
 		 328 aa  247  2e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.630686  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07171  preprotein translocase subunit SecF  45.33 
 
 		 322 aa  236  3e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.434985  normal  0.295105 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16231  preprotein translocase subunit SecF  42.67 
 
 		 359 aa  233  3e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.205013 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1192  preprotein translocase subunit SecF  41.61 
 
 		 329 aa  233  4.0000000000000004e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2885  preprotein translocase subunit SecF  41.78 
 
 		 310 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5129  preprotein translocase subunit SecF  40.73 
 
 		 336 aa  209  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.642857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5076  preprotein translocase subunit SecF  40.59 
 
 		 328 aa  208  7e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3211  preprotein translocase subunit SecF  42.28 
 
 		 310 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.828599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1489  preprotein translocase subunit SecF  39.58 
 
 		 325 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.921272  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4538  protein-export membrane protein SecF  38.72 
 
 		 320 aa  186  5e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0141  preprotein translocase subunit SecF  39.87 
 
 		 314 aa  183  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1027  preprotein translocase subunit SecF  39.67 
 
 		 312 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0198826 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  35.45 
 
 		 286 aa  157  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  34.11 
 
 		 735 aa  156  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  36.23 
 
 		 304 aa  155  8e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  36.23 
 
 		 304 aa  155  8e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1719  preprotein translocase subunit SecF  35.74 
 
 		 302 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1424  preprotein translocase subunit SecF  34.34 
 
 		 280 aa  150  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000449698  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1797  preprotein translocase subunit SecF  33.66 
 
 		 307 aa  149  4e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2737  protein-export membrane protein SecF  35.1 
 
 		 308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.468895  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0855  preprotein translocase subunit SecF  32.79 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  35.02 
 
 		 291 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1085  preprotein translocase subunit SecF  33.21 
 
 		 328 aa  146  4.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.161965 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  30.92 
 
 		 307 aa  146  5e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  32.4 
 
 		 989 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1219  preprotein translocase subunit SecF  33.33 
 
 		 314 aa  144  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417925 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2616  preprotein translocase subunit SecF  31.19 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1713  SecF protein  31.92 
 
 		 327 aa  141  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0008  preprotein translocase subunit SecF  32.28 
 
 		 311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.748405  normal  0.104556 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  30.79 
 
 		 761 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1785  preprotein translocase subunit SecF  31.6 
 
 		 301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00817769 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2080  preprotein translocase subunit SecF  32.35 
 
 		 310 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.348624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0997  preprotein translocase subunit SecF  33.33 
 
 		 322 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0879  preprotein translocase subunit SecF  31.72 
 
 		 302 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0954141 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0866  preprotein translocase subunit SecF  31.34 
 
 		 302 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222243  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004364  protein-export membrane protein SecF  32.24 
 
 		 315 aa  138  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0679828  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1271  preprotein translocase subunit SecF  34.63 
 
 		 296 aa  137  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1690  preprotein translocase subunit SecF  31.58 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.113213  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0014  preprotein translocase subunit SecF  32.85 
 
 		 311 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00246116  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2185  protein-export membrane protein SecF  32.33 
 
 		 312 aa  136  3.0000000000000003e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1770  protein-export membrane protein SecF  32.87 
 
 		 307 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2432  preprotein translocase subunit SecF  31.27 
 
 		 301 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.604218  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0836  preprotein translocase subunit SecF  31.72 
 
 		 302 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5169  protein-export membrane protein SecD  33.57 
 
 		 1029 aa  134  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01049  preprotein translocase subunit SecF  32.42 
 
 		 315 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1799  preprotein translocase subunit SecF  29.55 
 
 		 324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0080  protein-export membrane protein SecF  32.73 
 
 		 317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1454  protein-export membrane protein SecF  32.71 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0298464  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0475  preprotein translocase subunit SecF  30.69 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0445  preprotein translocase subunit SecF  29.55 
 
 		 324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.222875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2811  preprotein translocase subunit SecF  30.04 
 
 		 323 aa  133  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0027  preprotein translocase subunit SecF  31.64 
 
 		 310 aa  134  3e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  35.07 
 
 		 759 aa  133  3e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0273  preprotein translocase subunit SecF  34.21 
 
 		 315 aa  134  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4342  preprotein translocase subunit SecF  32.09 
 
 		 302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.557524  hitchhiker  0.0000000544827 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2947  preprotein translocase subunit SecF  29.87 
 
 		 324 aa  132  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2432  preprotein translocase subunit SecF  31.91 
 
 		 316 aa  132  5e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2426  preprotein translocase subunit SecF  30.07 
 
 		 310 aa  132  6e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1976  preprotein translocase subunit SecF  30.74 
 
 		 305 aa  132  7.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1981  preprotein translocase subunit SecF  30.74 
 
 		 305 aa  132  9e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3037  protein-export membrane protein SecF  34.46 
 
 		 316 aa  131  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1064  preprotein translocase subunit SecF  31.17 
 
 		 322 aa  131  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204402 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12600  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  29.37 
 
 		 977 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0504  preprotein translocase subunit SecF  32.59 
 
 		 313 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.300197  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2008  preprotein translocase subunit SecF  31.85 
 
 		 313 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1858  preprotein translocase subunit SecF  34.32 
 
 		 320 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.150957  normal  0.772867 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1355  preprotein translocase subunit SecF  32.45 
 
 		 293 aa  130  3e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4618  preprotein translocase subunit SecF  30.99 
 
 		 304 aa  130  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4310  protein-export membrane protein SecF  27.54 
 
 		 357 aa  130  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  31.35 
 
 		 740 aa  130  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0702  preprotein translocase subunit SecF  30.16 
 
 		 316 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.686375  normal  0.807805 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0012  preprotein translocase subunit SecF  32.58 
 
 		 308 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000296376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4258  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.96 
 
 		 755 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2960  preprotein translocase subunit SecF  28.25 
 
 		 323 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1107  preprotein translocase subunit SecF  32.96 
 
 		 414 aa  129  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0908186  normal  0.232496 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1898  protein translocase subunit secF  31.49 
 
 		 314 aa  129  5.0000000000000004e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186497  normal  0.970453 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4491  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.33 
 
 		 754 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000282789 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4144  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.33 
 
 		 754 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2336  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.06 
 
 		 759 aa  129  7.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.217617  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0878  preprotein translocase subunit SecF  29.65 
 
 		 323 aa  129  7.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0631  preprotein translocase subunit SecF  32.58 
 
 		 323 aa  129  8.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3094  preprotein translocase subunit SecF  31.37 
 
 		 323 aa  129  8.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278166  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0687  preprotein translocase subunit SecF  29.89 
 
 		 316 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2903  preprotein translocase subunit SecF  31.23 
 
 		 323 aa  128  9.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1278  preprotein translocase subunit SecF  32.71 
 
 		 414 aa  128  9.000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000278006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3807  preprotein translocase subunit SecF  29.89 
 
 		 316 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0235  preprotein translocase subunit SecF  29.89 
 
 		 316 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0719  preprotein translocase subunit SecF  29.89 
 
 		 316 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2550  preprotein translocase subunit SecF  27.92 
 
 		 323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.341971  normal  0.338499 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1123  preprotein translocase subunit SecF  30.17 
 
 		 315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1235  preprotein translocase subunit SecF  32.96 
 
 		 323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.178131  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3281  preprotein translocase subunit SecF  29.33 
 
 		 314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0339451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1110  preprotein translocase subunit SecF  32.96 
 
 		 323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0511  preprotein translocase subunit SecF  29.7 
 
 		 311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.956081  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>