More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0141 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0141  preprotein translocase subunit SecF  100 
 
 		 314 aa  625  1e-178  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1489  preprotein translocase subunit SecF  59.38 
 
 		 325 aa  374  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.921272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5076  preprotein translocase subunit SecF  56.29 
 
 		 328 aa  362  4e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2885  preprotein translocase subunit SecF  56.77 
 
 		 310 aa  347  1e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4538  protein-export membrane protein SecF  58.44 
 
 		 320 aa  343  2.9999999999999997e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1027  preprotein translocase subunit SecF  57.79 
 
 		 312 aa  340  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0198826 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3211  preprotein translocase subunit SecF  57.1 
 
 		 310 aa  336  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.828599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5129  preprotein translocase subunit SecF  57.05 
 
 		 336 aa  318  7.999999999999999e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.642857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0283  preprotein translocase subunit SecF  41.67 
 
 		 321 aa  227  2e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.164559  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09531  preprotein translocase subunit SecF  41.35 
 
 		 318 aa  226  4e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.14982 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1278  preprotein translocase subunit SecF  44.52 
 
 		 328 aa  221  9.999999999999999e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.630686  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16231  preprotein translocase subunit SecF  44.61 
 
 		 359 aa  216  4e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.205013 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07171  preprotein translocase subunit SecF  44.16 
 
 		 322 aa  209  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.434985  normal  0.295105 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0871  preprotein translocase subunit SecF  40 
 
 		 304 aa  206  5e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0139488  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09321  preprotein translocase subunit SecF  41.79 
 
 		 304 aa  202  5e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1192  preprotein translocase subunit SecF  43.55 
 
 		 329 aa  202  7e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09301  preprotein translocase subunit SecF  40.2 
 
 		 304 aa  200  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.359776  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  38 
 
 		 286 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  39.41 
 
 		 735 aa  199  5e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10111  preprotein translocase subunit SecF  39.7 
 
 		 305 aa  198  9e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1424  preprotein translocase subunit SecF  35.37 
 
 		 280 aa  186  3e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000449698  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0080  protein-export membrane protein SecF  37.01 
 
 		 317 aa  186  6e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  37.54 
 
 		 304 aa  183  4.0000000000000006e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1690  preprotein translocase subunit SecF  39.25 
 
 		 310 aa  183  4.0000000000000006e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.113213  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  37.42 
 
 		 304 aa  183  4.0000000000000006e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  33.77 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  36.39 
 
 		 761 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1463  preprotein translocase subunit SecF  33.23 
 
 		 303 aa  171  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000137336  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1231  preprotein translocase subunit SecF  35.79 
 
 		 303 aa  170  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.611016  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1216  protein-export membrane protein SecF  38.64 
 
 		 291 aa  169  5e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0233184  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4144  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.92 
 
 		 754 aa  169  7e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4491  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.92 
 
 		 754 aa  169  7e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000282789 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2513  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.78 
 
 		 750 aa  169  8e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000183584  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1201  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.66 
 
 		 763 aa  168  1e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.732454  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4545  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.92 
 
 		 754 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1416  protein-export membrane protein SecF  35.21 
 
 		 303 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4306  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.92 
 
 		 754 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0027  preprotein translocase subunit SecF  34.19 
 
 		 310 aa  168  1e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4641  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.92 
 
 		 754 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0705  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.4 
 
 		 754 aa  168  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4155  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.54 
 
 		 754 aa  167  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1231  protein-export membrane protein SecF  36.21 
 
 		 313 aa  167  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1355  preprotein translocase subunit SecF  36.48 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4530  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.92 
 
 		 754 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.566924  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.54 
 
 		 754 aa  166  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1981  preprotein translocase subunit SecF  36.68 
 
 		 305 aa  166  5e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1976  preprotein translocase subunit SecF  36.68 
 
 		 305 aa  166  5e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  35.54 
 
 		 291 aa  166  5e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2056  protein-export membrane protein SecF  34.69 
 
 		 337 aa  166  6.9999999999999995e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.880378  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1271  preprotein translocase subunit SecF  33.12 
 
 		 296 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0997  preprotein translocase subunit SecF  36.7 
 
 		 322 aa  165  8e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1714  protein-export membrane protein SecF  34.69 
 
 		 316 aa  165  9e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.611616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3127  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.5 
 
 		 752 aa  165  9e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4258  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.88 
 
 		 755 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0935  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.1 
 
 		 750 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0836  preprotein translocase subunit SecF  32.37 
 
 		 302 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.67 
 
 		 759 aa  163  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1727  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.67 
 
 		 759 aa  163  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.347489  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  37.88 
 
 		 759 aa  163  3e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0879  preprotein translocase subunit SecF  33.01 
 
 		 302 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0954141 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0866  preprotein translocase subunit SecF  33.01 
 
 		 302 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222243  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0946  protein-export membrane protein SecF  34.49 
 
 		 349 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1302  protein-export membrane protein SecF  35.95 
 
 		 315 aa  162  7e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2065  preprotein translocase subunit SecF  36.88 
 
 		 313 aa  161  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0984  protein-export membrane protein SecD  36.18 
 
 		 900 aa  161  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.583326 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0072  preprotein translocase subunit SecF  36.88 
 
 		 323 aa  161  2e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  31.67 
 
 		 989 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0708  preprotein translocase subunit SecF  34.48 
 
 		 323 aa  161  2e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3983  protein-export membrane protein SecF  38.06 
 
 		 324 aa  160  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.586193  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0014  preprotein translocase subunit SecF  32.79 
 
 		 311 aa  160  3e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00246116  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1629  protein-export membrane protein SecD  35.2 
 
 		 748 aa  160  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.683752  normal  0.475056 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1454  protein-export membrane protein SecF  38.61 
 
 		 308 aa  160  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0298464  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0332  preprotein translocase subunit SecF  31.35 
 
 		 301 aa  159  6e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.496269  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0855  preprotein translocase subunit SecF  32.59 
 
 		 302 aa  159  6e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2443  preprotein translocase subunit SecF  29.66 
 
 		 347 aa  159  7e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000105757  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3325  protein-export membrane protein SecF  36.86 
 
 		 324 aa  158  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1907  preprotein translocase subunit SecF  34.08 
 
 		 289 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0418717  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2196  preprotein translocase subunit SecF  34.81 
 
 		 289 aa  157  3e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0013  preprotein translocase subunit SecF  34.63 
 
 		 309 aa  156  3e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245212 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3211  protein translocase subunit secF  33.33 
 
 		 311 aa  156  3e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01049  preprotein translocase subunit SecF  35.96 
 
 		 315 aa  157  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2336  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.74 
 
 		 759 aa  156  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.217617  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2432  preprotein translocase subunit SecF  35.74 
 
 		 316 aa  155  6e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2432  preprotein translocase subunit SecF  31.79 
 
 		 301 aa  155  6e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.604218  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_274  protein-export membrane protein, preprotein translocase SecF subunit  30.36 
 
 		 302 aa  155  6e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00850837  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0387  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.87 
 
 		 911 aa  154  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.807363  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1670  preprotein translocase subunit SecF  35.29 
 
 		 292 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00270917  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2644  protein-export membrane protein SecF  34.74 
 
 		 304 aa  155  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0946476  hitchhiker  0.00035144 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1770  protein-export membrane protein SecF  30.67 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004364  protein-export membrane protein SecF  35.27 
 
 		 315 aa  154  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0679828  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2185  protein-export membrane protein SecF  33 
 
 		 312 aa  154  2e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1330  SecF protein  33.9 
 
 		 338 aa  154  2e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0105179  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0312  preprotein translocase subunit SecF  30.69 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.111019  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1785  preprotein translocase subunit SecF  31.67 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00817769 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4310  protein-export membrane protein SecF  32.35 
 
 		 357 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0123  protein-export membrane protein SecF  33.86 
 
 		 293 aa  152  5e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.504249  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1064  preprotein translocase subunit SecF  35.03 
 
 		 322 aa  152  5e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204402 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1719  preprotein translocase subunit SecF  33.57 
 
 		 302 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2101  protein-export membrane protein SecF  36.3 
 
 		 308 aa  152  5.9999999999999996e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.116132  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2211  preprotein translocase subunit SecF  35.87 
 
 		 314 aa  152  7e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433949  normal  0.220964 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>