More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0013 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0013  preprotein translocase subunit SecF  100 
 
 		 309 aa  610  9.999999999999999e-175  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245212 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0012  preprotein translocase subunit SecF  73.94 
 
 		 308 aa  465  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000296376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0008  preprotein translocase subunit SecF  70.23 
 
 		 311 aa  457  1e-127  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.748405  normal  0.104556 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0014  preprotein translocase subunit SecF  67.64 
 
 		 311 aa  439  9.999999999999999e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00246116  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0027  preprotein translocase subunit SecF  66.99 
 
 		 310 aa  427  1e-119  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0013  preprotein translocase subunit SecF  69.26 
 
 		 311 aa  425  1e-118  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000001158  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0034  preprotein translocase subunit SecF  65.7 
 
 		 311 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1454  protein-export membrane protein SecF  50.84 
 
 		 308 aa  270  2e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0298464  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  43.54 
 
 		 307 aa  240  2e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2056  protein-export membrane protein SecF  40.91 
 
 		 337 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.880378  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1714  protein-export membrane protein SecF  40.91 
 
 		 316 aa  220  3e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.611616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1770  protein-export membrane protein SecF  39.38 
 
 		 307 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08751  putative protein-export transmembrane SecDF protein  39.38 
 
 		 1001 aa  218  7.999999999999999e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392094  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0113  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  41.16 
 
 		 991 aa  218  7.999999999999999e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.758548 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2349  preprotein translocase subunit SecF  47.8 
 
 		 312 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01049  preprotein translocase subunit SecF  40.53 
 
 		 315 aa  216  2.9999999999999998e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5169  protein-export membrane protein SecD  42.67 
 
 		 1029 aa  214  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325981  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00357  protein export protein SecF  38.54 
 
 		 323 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.797763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3200  protein-export membrane protein SecF  38.54 
 
 		 323 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0111096  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0439  preprotein translocase subunit SecF  38.54 
 
 		 323 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0441  preprotein translocase subunit SecF  38.54 
 
 		 323 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3224  preprotein translocase subunit SecF  38.54 
 
 		 323 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000013674 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00361  hypothetical protein  38.54 
 
 		 323 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0489  preprotein translocase subunit SecF  38.54 
 
 		 323 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1064  preprotein translocase subunit SecF  39.67 
 
 		 322 aa  214  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204402 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0479  preprotein translocase subunit SecF  38.54 
 
 		 323 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0328  preprotein translocase subunit SecF  38.54 
 
 		 323 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.264814  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0273  preprotein translocase subunit SecF  43.4 
 
 		 315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0454  preprotein translocase subunit SecF  38.54 
 
 		 323 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004364  protein-export membrane protein SecF  40.13 
 
 		 315 aa  213  3.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0679828  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0467  preprotein translocase subunit SecF  38.54 
 
 		 323 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0447  preprotein translocase subunit SecF  38.54 
 
 		 323 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0508  preprotein translocase subunit SecF  38.54 
 
 		 323 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0448  preprotein translocase subunit SecF  38.54 
 
 		 323 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  41.1 
 
 		 286 aa  212  5.999999999999999e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2699  preprotein translocase subunit SecF  40.56 
 
 		 315 aa  211  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.584759  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0878  preprotein translocase subunit SecF  37.67 
 
 		 323 aa  210  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1404  preprotein translocase subunit SecF  42.11 
 
 		 315 aa  211  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0316508  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1123  preprotein translocase subunit SecF  43.34 
 
 		 315 aa  209  4e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3596  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.91 
 
 		 996 aa  209  6e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.318172 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1219  preprotein translocase subunit SecF  44.18 
 
 		 314 aa  208  8e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417925 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2432  preprotein translocase subunit SecF  41.92 
 
 		 316 aa  207  1e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3211  protein translocase subunit secF  40.78 
 
 		 311 aa  208  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1235  preprotein translocase subunit SecF  40 
 
 		 323 aa  206  4e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.178131  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1110  preprotein translocase subunit SecF  40 
 
 		 323 aa  206  4e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0631  preprotein translocase subunit SecF  40 
 
 		 323 aa  206  4e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2065  preprotein translocase subunit SecF  42.81 
 
 		 313 aa  205  8e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1302  protein-export membrane protein SecF  43.53 
 
 		 315 aa  205  9e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  38.44 
 
 		 304 aa  204  1e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  38.44 
 
 		 304 aa  204  1e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0708  preprotein translocase subunit SecF  38.13 
 
 		 323 aa  204  2e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0562  protein-export membrane protein SecF  37.94 
 
 		 321 aa  204  2e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3110  preprotein translocase subunit SecF  39.58 
 
 		 315 aa  202  4e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3094  preprotein translocase subunit SecF  38.51 
 
 		 323 aa  202  5e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278166  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2903  preprotein translocase subunit SecF  38.85 
 
 		 323 aa  201  9e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1420  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.62 
 
 		 990 aa  199  5e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.469149  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0072  preprotein translocase subunit SecF  37.46 
 
 		 323 aa  199  6e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2481  preprotein translocase subunit SecF  42.31 
 
 		 315 aa  199  7e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0456849  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0997  preprotein translocase subunit SecF  39.87 
 
 		 322 aa  199  7e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1231  protein-export membrane protein SecF  42.14 
 
 		 313 aa  198  9e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2644  protein-export membrane protein SecF  40.07 
 
 		 304 aa  198  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0946476  hitchhiker  0.00035144 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6254  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.82 
 
 		 1055 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2185  protein-export membrane protein SecF  38.16 
 
 		 312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.93 
 
 		 846 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0600  protein-export membrane protein SecF  36.27 
 
 		 306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0475  preprotein translocase subunit SecF  37.41 
 
 		 323 aa  196  3e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.59 
 
 		 762 aa  196  5.000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4310  protein-export membrane protein SecF  37.54 
 
 		 357 aa  196  5.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2432  preprotein translocase subunit SecF  39.22 
 
 		 301 aa  195  8.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.604218  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0682  protein-export membrane protein SecF  36.58 
 
 		 357 aa  195  8.000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.435801  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0540  preprotein translocase subunit SecF  36.08 
 
 		 361 aa  195  1e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0258314 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1416  protein-export membrane protein SecF  39.66 
 
 		 303 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0092  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.26 
 
 		 995 aa  194  2e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1085  preprotein translocase subunit SecF  37.74 
 
 		 328 aa  194  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.161965 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2836  protein translocase subunit secF  37.71 
 
 		 302 aa  194  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2784  preprotein translocase subunit SecF  41.26 
 
 		 315 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0481367  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1231  preprotein translocase subunit SecF  39.66 
 
 		 303 aa  193  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.611016  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01348  protein-export membrane protein SecF  41.55 
 
 		 313 aa  193  3e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.256718  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2190  preprotein translocase subunit SecF  41.96 
 
 		 315 aa  193  3e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.447622  decreased coverage  0.00319916 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2879  preprotein translocase subunit SecF  41.26 
 
 		 315 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0152003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3261  preprotein translocase subunit SecF  38.41 
 
 		 322 aa  192  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.578435  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1981  preprotein translocase subunit SecF  37.01 
 
 		 305 aa  192  4e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1976  preprotein translocase subunit SecF  37.01 
 
 		 305 aa  193  4e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2178  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.1 
 
 		 995 aa  193  4e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.900836  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1330  SecF protein  39.2 
 
 		 338 aa  192  4e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0105179  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0866  preprotein translocase subunit SecF  38.69 
 
 		 302 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222243  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0879  preprotein translocase subunit SecF  38.36 
 
 		 302 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0954141 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3381  preprotein translocase subunit SecF  38.41 
 
 		 322 aa  192  4e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0144101  normal  0.396634 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2804  preprotein translocase subunit SecF  41.38 
 
 		 315 aa  192  4e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00594045  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3120  preprotein translocase subunit SecF  38.41 
 
 		 322 aa  192  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0405125  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0836  preprotein translocase subunit SecF  38.03 
 
 		 302 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1573  preprotein translocase subunit SecF  41.38 
 
 		 315 aa  192  7e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00583403  hitchhiker  0.000000100837 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1117  preprotein translocase subunit SecF  41.05 
 
 		 316 aa  192  8e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1216  protein-export membrane protein SecF  41.33 
 
 		 291 aa  192  8e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0233184  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  39.45 
 
 		 291 aa  192  9e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0123  protein-export membrane protein SecF  38.46 
 
 		 293 aa  191  9e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.504249  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1473  preprotein translocase subunit SecF  42.21 
 
 		 315 aa  191  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13163  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40450  preprotein translocase subunit SecF  42.52 
 
 		 304 aa  191  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.193489  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1450  preprotein translocase subunit SecF  41.26 
 
 		 315 aa  190  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101016  normal  0.0107257 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1408  protein translocase subunit secF  37.75 
 
 		 317 aa  189  5e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>