More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0682 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0682  protein-export membrane protein SecF  100 
 
 		 357 aa  709    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.435801  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0540  preprotein translocase subunit SecF  55.4 
 
 		 361 aa  383  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0258314 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1819  preprotein translocase subunit SecF  56.09 
 
 		 356 aa  366  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000814771  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0847  protein-export membrane protein SecF  55.94 
 
 		 359 aa  361  9e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0561071  normal  0.116765 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1342  preprotein translocase subunit SecF  55.07 
 
 		 362 aa  358  9e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0507667  normal  0.548062 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1928  preprotein translocase subunit SecF  53.51 
 
 		 367 aa  352  7e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2443  preprotein translocase subunit SecF  51.3 
 
 		 347 aa  325  6e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000105757  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  43.79 
 
 		 307 aa  280  2e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1238  preprotein translocase subunit SecF  44.71 
 
 		 351 aa  278  7e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1785  preprotein translocase subunit SecF  35.07 
 
 		 301 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00817769 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2432  preprotein translocase subunit SecF  33.91 
 
 		 301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.604218  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1770  protein-export membrane protein SecF  35.56 
 
 		 307 aa  212  9e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3211  protein translocase subunit secF  39.13 
 
 		 311 aa  210  3e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0562  protein-export membrane protein SecF  36.04 
 
 		 321 aa  204  2e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0273  preprotein translocase subunit SecF  38.35 
 
 		 315 aa  203  3e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1719  preprotein translocase subunit SecF  33.63 
 
 		 302 aa  202  5e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0008  preprotein translocase subunit SecF  38.12 
 
 		 311 aa  202  5e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.748405  normal  0.104556 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0013  preprotein translocase subunit SecF  37.24 
 
 		 311 aa  202  6e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000001158  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0147  protein translocase subunit secF  33.86 
 
 		 404 aa  202  7e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000009249  hitchhiker  0.00252765 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0013  preprotein translocase subunit SecF  36.58 
 
 		 309 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245212 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0027  preprotein translocase subunit SecF  34.6 
 
 		 310 aa  199  5e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1620  protein-export membrane protein SecF  35.55 
 
 		 323 aa  199  6e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01049  preprotein translocase subunit SecF  36.36 
 
 		 315 aa  199  7e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0855  preprotein translocase subunit SecF  33.43 
 
 		 302 aa  199  9e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0012  preprotein translocase subunit SecF  36.44 
 
 		 308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000296376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2065  preprotein translocase subunit SecF  35.74 
 
 		 313 aa  197  3e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004364  protein-export membrane protein SecF  36.07 
 
 		 315 aa  196  5.000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0679828  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0034  preprotein translocase subunit SecF  36.36 
 
 		 311 aa  196  5.000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1797  preprotein translocase subunit SecF  33.33 
 
 		 307 aa  195  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1235  preprotein translocase subunit SecF  37.84 
 
 		 323 aa  194  2e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.178131  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1110  preprotein translocase subunit SecF  37.84 
 
 		 323 aa  194  2e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2349  preprotein translocase subunit SecF  38.76 
 
 		 312 aa  194  2e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2644  protein-export membrane protein SecF  35.95 
 
 		 304 aa  194  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0946476  hitchhiker  0.00035144 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0631  preprotein translocase subunit SecF  37.84 
 
 		 323 aa  194  2e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2699  preprotein translocase subunit SecF  36.12 
 
 		 315 aa  194  3e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.584759  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3110  preprotein translocase subunit SecF  36.53 
 
 		 315 aa  193  4e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0014  preprotein translocase subunit SecF  34.02 
 
 		 311 aa  193  4e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00246116  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2432  preprotein translocase subunit SecF  36.87 
 
 		 316 aa  192  5e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0708  preprotein translocase subunit SecF  36.87 
 
 		 323 aa  192  6e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0504  preprotein translocase subunit SecF  33.04 
 
 		 313 aa  191  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.300197  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2056  protein-export membrane protein SecF  35.09 
 
 		 337 aa  191  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.880378  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1714  protein-export membrane protein SecF  35.4 
 
 		 316 aa  191  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.611616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2836  protein translocase subunit secF  35.69 
 
 		 302 aa  189  5.999999999999999e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2616  preprotein translocase subunit SecF  32.94 
 
 		 302 aa  188  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0475  preprotein translocase subunit SecF  35.44 
 
 		 323 aa  187  2e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2481  preprotein translocase subunit SecF  36.9 
 
 		 315 aa  187  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0456849  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2211  preprotein translocase subunit SecF  36.98 
 
 		 314 aa  187  3e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433949  normal  0.220964 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01348  protein-export membrane protein SecF  35.2 
 
 		 313 aa  185  9e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.256718  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0072  preprotein translocase subunit SecF  35.4 
 
 		 323 aa  185  1.0000000000000001e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3037  protein-export membrane protein SecF  34.52 
 
 		 316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2334  preprotein translocase subunit SecF  37.1 
 
 		 315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.307818  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1123  preprotein translocase subunit SecF  33.24 
 
 		 315 aa  184  3e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6254  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.89 
 
 		 1055 aa  183  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2190  preprotein translocase subunit SecF  36.83 
 
 		 315 aa  184  3e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.447622  decreased coverage  0.00319916 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2879  preprotein translocase subunit SecF  36.01 
 
 		 315 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0152003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1231  protein-export membrane protein SecF  33.73 
 
 		 313 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2784  preprotein translocase subunit SecF  36.01 
 
 		 315 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0481367  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2804  preprotein translocase subunit SecF  36.01 
 
 		 315 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00594045  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1450  preprotein translocase subunit SecF  36.42 
 
 		 315 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101016  normal  0.0107257 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2008  preprotein translocase subunit SecF  32.55 
 
 		 313 aa  182  6e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0997  preprotein translocase subunit SecF  32.96 
 
 		 322 aa  182  7e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1454  protein-export membrane protein SecF  36.47 
 
 		 308 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0298464  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1404  preprotein translocase subunit SecF  36.5 
 
 		 315 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0316508  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  34.71 
 
 		 304 aa  181  1e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1573  preprotein translocase subunit SecF  36.01 
 
 		 315 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00583403  hitchhiker  0.000000100837 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  34.71 
 
 		 304 aa  181  2e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1385  preprotein translocase subunit SecF  36.12 
 
 		 315 aa  181  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00983524  hitchhiker  0.000000302266 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1438  preprotein translocase subunit SecF  36.12 
 
 		 315 aa  181  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0107161  hitchhiker  0.00000672809 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1473  preprotein translocase subunit SecF  39.38 
 
 		 315 aa  180  4e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13163  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2185  protein-export membrane protein SecF  34.81 
 
 		 312 aa  179  9e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1690  preprotein translocase subunit SecF  34.2 
 
 		 310 aa  178  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.113213  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1047  preprotein translocase subunit SecF  38.44 
 
 		 323 aa  178  1e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1330  SecF protein  34.64 
 
 		 338 aa  177  2e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0105179  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1574  preprotein translocase subunit SecF  36.69 
 
 		 323 aa  177  2e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1064  preprotein translocase subunit SecF  32.86 
 
 		 322 aa  177  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204402 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1302  protein-export membrane protein SecF  35.67 
 
 		 315 aa  176  5e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1324  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.88 
 
 		 845 aa  176  7e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0375911  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0511  preprotein translocase subunit SecF  33.04 
 
 		 311 aa  176  8e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.956081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.44 
 
 		 856 aa  175  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1219  preprotein translocase subunit SecF  37.24 
 
 		 314 aa  175  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417925 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00357  protein export protein SecF  33.43 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.797763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3200  protein-export membrane protein SecF  33.43 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0111096  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1324  protein-export membrane protein SecF  33.07 
 
 		 400 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0920366  normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1284  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.59 
 
 		 844 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0439  preprotein translocase subunit SecF  33.43 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0447  preprotein translocase subunit SecF  33.33 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0467  preprotein translocase subunit SecF  33.33 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0508  preprotein translocase subunit SecF  33.33 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0328  preprotein translocase subunit SecF  33.43 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.264814  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0441  preprotein translocase subunit SecF  33.43 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00361  hypothetical protein  33.43 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3224  preprotein translocase subunit SecF  33.43 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000013674 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0489  preprotein translocase subunit SecF  33.43 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  32.94 
 
 		 286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0479  preprotein translocase subunit SecF  33.43 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0448  preprotein translocase subunit SecF  33.33 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0454  preprotein translocase subunit SecF  33.33 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3464  protein-export membrane protein SecD  31.33 
 
 		 849 aa  173  3.9999999999999995e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.068989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1898  protein translocase subunit secF  34.84 
 
 		 314 aa  172  6.999999999999999e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186497  normal  0.970453 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1759  preprotein translocase subunit SecF  38.72 
 
 		 315 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.020465  normal  0.0122623 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>