More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0123 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0123  protein-export membrane protein SecF  100 
 
 		 293 aa  572  1.0000000000000001e-162  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.504249  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1770  protein-export membrane protein SecF  41.98 
 
 		 307 aa  228  8e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  39.36 
 
 		 307 aa  205  7e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1271  preprotein translocase subunit SecF  39.38 
 
 		 296 aa  205  8e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1714  protein-export membrane protein SecF  39.53 
 
 		 316 aa  203  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.611616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2056  protein-export membrane protein SecF  39.53 
 
 		 337 aa  204  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.880378  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2185  protein-export membrane protein SecF  41.67 
 
 		 312 aa  201  9.999999999999999e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01049  preprotein translocase subunit SecF  39.19 
 
 		 315 aa  199  6e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  40 
 
 		 304 aa  199  6e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  40 
 
 		 304 aa  199  6e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1064  preprotein translocase subunit SecF  38.59 
 
 		 322 aa  196  3e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204402 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0708  preprotein translocase subunit SecF  36.64 
 
 		 323 aa  196  4.0000000000000005e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004364  protein-export membrane protein SecF  38.26 
 
 		 315 aa  195  6e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0679828  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2432  preprotein translocase subunit SecF  39.93 
 
 		 301 aa  194  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.604218  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  37.89 
 
 		 291 aa  195  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0072  preprotein translocase subunit SecF  35.45 
 
 		 323 aa  194  1e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3211  protein translocase subunit secF  41.87 
 
 		 311 aa  194  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3037  protein-export membrane protein SecF  37.75 
 
 		 316 aa  194  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1231  preprotein translocase subunit SecF  39.5 
 
 		 303 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.611016  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3110  preprotein translocase subunit SecF  39.16 
 
 		 315 aa  193  4e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1416  protein-export membrane protein SecF  39.5 
 
 		 303 aa  192  4e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1785  preprotein translocase subunit SecF  38.52 
 
 		 301 aa  192  6e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00817769 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2737  protein-export membrane protein SecF  36.82 
 
 		 308 aa  192  7e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.468895  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0879  preprotein translocase subunit SecF  40.21 
 
 		 302 aa  191  9e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0954141 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2699  preprotein translocase subunit SecF  41.55 
 
 		 315 aa  191  9e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.584759  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0836  preprotein translocase subunit SecF  39.15 
 
 		 302 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0855  preprotein translocase subunit SecF  36.7 
 
 		 302 aa  191  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1312  preprotein translocase subunit SecF  36.33 
 
 		 313 aa  191  1e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.187294  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00357  protein export protein SecF  38.72 
 
 		 323 aa  190  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.797763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3200  protein-export membrane protein SecF  38.72 
 
 		 323 aa  190  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0111096  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00361  hypothetical protein  38.72 
 
 		 323 aa  190  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3224  preprotein translocase subunit SecF  38.72 
 
 		 323 aa  190  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000013674 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0441  preprotein translocase subunit SecF  38.72 
 
 		 323 aa  190  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0328  preprotein translocase subunit SecF  38.72 
 
 		 323 aa  190  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.264814  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0489  preprotein translocase subunit SecF  38.72 
 
 		 323 aa  190  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0479  preprotein translocase subunit SecF  38.72 
 
 		 323 aa  190  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0439  preprotein translocase subunit SecF  38.72 
 
 		 323 aa  190  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0866  preprotein translocase subunit SecF  39.86 
 
 		 302 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222243  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2616  preprotein translocase subunit SecF  37.59 
 
 		 302 aa  189  4e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1404  preprotein translocase subunit SecF  40.21 
 
 		 315 aa  188  7e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0316508  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  37.63 
 
 		 735 aa  188  8e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2879  preprotein translocase subunit SecF  40.14 
 
 		 315 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0152003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1355  preprotein translocase subunit SecF  39.37 
 
 		 293 aa  187  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2784  preprotein translocase subunit SecF  40.14 
 
 		 315 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0481367  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2804  preprotein translocase subunit SecF  40.14 
 
 		 315 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00594045  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2065  preprotein translocase subunit SecF  38.41 
 
 		 313 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1573  preprotein translocase subunit SecF  40.14 
 
 		 315 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00583403  hitchhiker  0.000000100837 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1330  SecF protein  38.38 
 
 		 338 aa  187  2e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0105179  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2334  preprotein translocase subunit SecF  40.85 
 
 		 315 aa  187  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.307818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0273  preprotein translocase subunit SecF  38.89 
 
 		 315 aa  186  3e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.41 
 
 		 856 aa  185  7e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4342  preprotein translocase subunit SecF  40.21 
 
 		 302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.557524  hitchhiker  0.0000000544827 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0878  preprotein translocase subunit SecF  37.71 
 
 		 323 aa  184  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1424  preprotein translocase subunit SecF  37.91 
 
 		 280 aa  185  1.0000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000449698  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2836  protein translocase subunit secF  36.39 
 
 		 302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0448  preprotein translocase subunit SecF  36.45 
 
 		 323 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0475  preprotein translocase subunit SecF  36.52 
 
 		 323 aa  183  3e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0508  preprotein translocase subunit SecF  36.45 
 
 		 323 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0467  preprotein translocase subunit SecF  36.45 
 
 		 323 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0447  preprotein translocase subunit SecF  36.45 
 
 		 323 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0454  preprotein translocase subunit SecF  36.45 
 
 		 323 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4310  protein-export membrane protein SecF  34.33 
 
 		 357 aa  183  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3094  preprotein translocase subunit SecF  38.87 
 
 		 323 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278166  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1473  preprotein translocase subunit SecF  39.08 
 
 		 315 aa  182  6e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13163  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  37.5 
 
 		 286 aa  182  6e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2481  preprotein translocase subunit SecF  39.16 
 
 		 315 aa  182  7e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0456849  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4618  preprotein translocase subunit SecF  39.15 
 
 		 304 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1719  preprotein translocase subunit SecF  38.15 
 
 		 302 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1115  protein-export membrane protein SecF  36.54 
 
 		 302 aa  181  9.000000000000001e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0626  protein-export membrane protein SecF  35.74 
 
 		 310 aa  181  9.000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000549124  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0511  preprotein translocase subunit SecF  35.55 
 
 		 311 aa  181  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.956081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0687  preprotein translocase subunit SecF  35.03 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0235  preprotein translocase subunit SecF  35.03 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0631  preprotein translocase subunit SecF  35.02 
 
 		 323 aa  181  1e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0719  preprotein translocase subunit SecF  35.03 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2190  preprotein translocase subunit SecF  40.85 
 
 		 315 aa  181  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.447622  decreased coverage  0.00319916 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1123  preprotein translocase subunit SecF  39.37 
 
 		 315 aa  181  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2889  preprotein translocase subunit SecF  41.2 
 
 		 315 aa  180  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000629469 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01348  protein-export membrane protein SecF  39.33 
 
 		 313 aa  181  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.256718  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3807  preprotein translocase subunit SecF  34.69 
 
 		 316 aa  180  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2903  preprotein translocase subunit SecF  39.2 
 
 		 323 aa  181  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0013  preprotein translocase subunit SecF  38.46 
 
 		 309 aa  180  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245212 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  36.43 
 
 		 759 aa  181  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40450  preprotein translocase subunit SecF  39.79 
 
 		 304 aa  181  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.193489  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2432  preprotein translocase subunit SecF  40.07 
 
 		 316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1110  preprotein translocase subunit SecF  35.02 
 
 		 323 aa  179  4e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1235  preprotein translocase subunit SecF  35.02 
 
 		 323 aa  179  4e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.178131  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0012  preprotein translocase subunit SecF  36.52 
 
 		 308 aa  179  4e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000296376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1450  preprotein translocase subunit SecF  39.02 
 
 		 315 aa  179  4e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101016  normal  0.0107257 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1690  preprotein translocase subunit SecF  37.41 
 
 		 310 aa  179  5.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.113213  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1620  protein-export membrane protein SecF  37.04 
 
 		 323 aa  179  5.999999999999999e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1385  preprotein translocase subunit SecF  39.02 
 
 		 315 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00983524  hitchhiker  0.000000302266 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1438  preprotein translocase subunit SecF  39.02 
 
 		 315 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0107161  hitchhiker  0.00000672809 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0014  preprotein translocase subunit SecF  37.41 
 
 		 311 aa  179  7e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00246116  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1797  preprotein translocase subunit SecF  36.27 
 
 		 307 aa  178  7e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  37.29 
 
 		 740 aa  178  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0027  preprotein translocase subunit SecF  35.71 
 
 		 310 aa  178  1e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2211  preprotein translocase subunit SecF  40.91 
 
 		 314 aa  178  1e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433949  normal  0.220964 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1219  preprotein translocase subunit SecF  41.38 
 
 		 314 aa  178  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417925 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2008  preprotein translocase subunit SecF  37.13 
 
 		 313 aa  177  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>