More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0540 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0540  preprotein translocase subunit SecF  100 
 
 		 361 aa  720    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0258314 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1342  preprotein translocase subunit SecF  72.75 
 
 		 362 aa  489  1e-137  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0507667  normal  0.548062 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1928  preprotein translocase subunit SecF  58.15 
 
 		 367 aa  422  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1819  preprotein translocase subunit SecF  62.04 
 
 		 356 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000814771  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0847  protein-export membrane protein SecF  58.07 
 
 		 359 aa  378  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0561071  normal  0.116765 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0682  protein-export membrane protein SecF  55.4 
 
 		 357 aa  367  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.435801  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2443  preprotein translocase subunit SecF  48.7 
 
 		 347 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000105757  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1238  preprotein translocase subunit SecF  47.92 
 
 		 351 aa  288  1e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  44.7 
 
 		 307 aa  277  2e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3211  protein translocase subunit secF  42.51 
 
 		 311 aa  221  1.9999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01049  preprotein translocase subunit SecF  37.05 
 
 		 315 aa  215  8e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004364  protein-export membrane protein SecF  37.29 
 
 		 315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0679828  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0273  preprotein translocase subunit SecF  38.5 
 
 		 315 aa  211  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1064  preprotein translocase subunit SecF  37.04 
 
 		 322 aa  211  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204402 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1110  preprotein translocase subunit SecF  36.59 
 
 		 323 aa  204  1e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1235  preprotein translocase subunit SecF  36.59 
 
 		 323 aa  204  1e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.178131  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0631  preprotein translocase subunit SecF  36.31 
 
 		 323 aa  203  3e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0878  preprotein translocase subunit SecF  36.36 
 
 		 323 aa  203  4e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2349  preprotein translocase subunit SecF  37.46 
 
 		 312 aa  202  9e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3381  preprotein translocase subunit SecF  35.71 
 
 		 322 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0144101  normal  0.396634 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3261  preprotein translocase subunit SecF  35.71 
 
 		 322 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.578435  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3120  preprotein translocase subunit SecF  35.71 
 
 		 322 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0405125  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2699  preprotein translocase subunit SecF  34.64 
 
 		 315 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.584759  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3094  preprotein translocase subunit SecF  36.34 
 
 		 323 aa  199  7.999999999999999e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278166  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0508  preprotein translocase subunit SecF  36.36 
 
 		 323 aa  199  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0447  preprotein translocase subunit SecF  36.36 
 
 		 323 aa  199  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0448  preprotein translocase subunit SecF  36.36 
 
 		 323 aa  199  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1404  preprotein translocase subunit SecF  36.26 
 
 		 315 aa  199  9e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0316508  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0467  preprotein translocase subunit SecF  36.36 
 
 		 323 aa  199  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0454  preprotein translocase subunit SecF  36.36 
 
 		 323 aa  199  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00357  protein export protein SecF  35.71 
 
 		 323 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.797763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3200  protein-export membrane protein SecF  35.71 
 
 		 323 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0111096  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0489  preprotein translocase subunit SecF  35.71 
 
 		 323 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0441  preprotein translocase subunit SecF  35.71 
 
 		 323 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0479  preprotein translocase subunit SecF  35.71 
 
 		 323 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0439  preprotein translocase subunit SecF  35.71 
 
 		 323 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0328  preprotein translocase subunit SecF  35.71 
 
 		 323 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.264814  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3224  preprotein translocase subunit SecF  35.71 
 
 		 323 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000013674 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00361  hypothetical protein  35.71 
 
 		 323 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1330  SecF protein  37.78 
 
 		 338 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0105179  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2065  preprotein translocase subunit SecF  36.52 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2903  preprotein translocase subunit SecF  37.96 
 
 		 323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01348  protein-export membrane protein SecF  36.68 
 
 		 313 aa  194  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.256718  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0008  preprotein translocase subunit SecF  35.17 
 
 		 311 aa  194  3e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.748405  normal  0.104556 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3037  protein-export membrane protein SecF  35.86 
 
 		 316 aa  192  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3288  preprotein translocase subunit SecF  37.14 
 
 		 322 aa  191  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1620  protein-export membrane protein SecF  34.2 
 
 		 323 aa  191  2e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1022  preprotein translocase subunit SecF  36.86 
 
 		 324 aa  191  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0027  preprotein translocase subunit SecF  33.92 
 
 		 310 aa  191  2e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0072  preprotein translocase subunit SecF  34.17 
 
 		 323 aa  191  2e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0014  preprotein translocase subunit SecF  34.31 
 
 		 311 aa  191  2e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00246116  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2644  protein-export membrane protein SecF  34.56 
 
 		 304 aa  190  4e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0946476  hitchhiker  0.00035144 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1574  preprotein translocase subunit SecF  38.82 
 
 		 323 aa  189  4e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0708  preprotein translocase subunit SecF  33.24 
 
 		 323 aa  189  5e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2334  preprotein translocase subunit SecF  37.97 
 
 		 315 aa  189  7e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.307818  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1785  preprotein translocase subunit SecF  32.75 
 
 		 301 aa  189  8e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00817769 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1473  preprotein translocase subunit SecF  37.75 
 
 		 315 aa  189  9e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13163  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2432  preprotein translocase subunit SecF  33.33 
 
 		 301 aa  188  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.604218  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0013  preprotein translocase subunit SecF  35.78 
 
 		 311 aa  187  2e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000001158  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3110  preprotein translocase subunit SecF  34.62 
 
 		 315 aa  186  4e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0475  preprotein translocase subunit SecF  35.71 
 
 		 323 aa  186  4e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2432  preprotein translocase subunit SecF  34.09 
 
 		 316 aa  186  4e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2481  preprotein translocase subunit SecF  37.32 
 
 		 315 aa  186  5e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0456849  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0997  preprotein translocase subunit SecF  35.23 
 
 		 322 aa  186  5e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0013  preprotein translocase subunit SecF  36.08 
 
 		 309 aa  186  6e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245212 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1770  protein-export membrane protein SecF  31.95 
 
 		 307 aa  186  7e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2804  preprotein translocase subunit SecF  36.11 
 
 		 315 aa  186  7e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00594045  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1450  preprotein translocase subunit SecF  36.71 
 
 		 315 aa  185  9e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101016  normal  0.0107257 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0562  protein-export membrane protein SecF  32.95 
 
 		 321 aa  185  1.0000000000000001e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2879  preprotein translocase subunit SecF  35.64 
 
 		 315 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0152003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2784  preprotein translocase subunit SecF  35.64 
 
 		 315 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0481367  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1385  preprotein translocase subunit SecF  36.42 
 
 		 315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00983524  hitchhiker  0.000000302266 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1438  preprotein translocase subunit SecF  36.42 
 
 		 315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0107161  hitchhiker  0.00000672809 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0855  preprotein translocase subunit SecF  34.87 
 
 		 302 aa  184  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1573  preprotein translocase subunit SecF  35.64 
 
 		 315 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00583403  hitchhiker  0.000000100837 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1123  preprotein translocase subunit SecF  35.53 
 
 		 315 aa  183  5.0000000000000004e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0600  protein-export membrane protein SecF  32.44 
 
 		 306 aa  182  7e-45  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1231  preprotein translocase subunit SecF  34.3 
 
 		 303 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.611016  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1231  protein-export membrane protein SecF  35.24 
 
 		 313 aa  181  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1416  protein-export membrane protein SecF  34.3 
 
 		 303 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  31.25 
 
 		 304 aa  181  2e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  31.25 
 
 		 304 aa  181  2e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2211  preprotein translocase subunit SecF  35.16 
 
 		 314 aa  180  2.9999999999999997e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433949  normal  0.220964 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2889  preprotein translocase subunit SecF  38.2 
 
 		 315 aa  180  4e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000629469 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2190  preprotein translocase subunit SecF  36.21 
 
 		 315 aa  180  4e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.447622  decreased coverage  0.00319916 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0866  preprotein translocase subunit SecF  33.04 
 
 		 302 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222243  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.86 
 
 		 856 aa  179  4.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0034  preprotein translocase subunit SecF  33.72 
 
 		 311 aa  179  7e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2775  preprotein translocase subunit SecF  34.18 
 
 		 334 aa  179  9e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.33037 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2616  preprotein translocase subunit SecF  31.69 
 
 		 302 aa  178  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1690  preprotein translocase subunit SecF  35.92 
 
 		 310 aa  178  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.113213  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1759  preprotein translocase subunit SecF  38.32 
 
 		 315 aa  178  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.020465  normal  0.0122623 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0836  preprotein translocase subunit SecF  32.74 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  33.33 
 
 		 291 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0879  preprotein translocase subunit SecF  32.46 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0954141 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0012  preprotein translocase subunit SecF  33.9 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000296376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1797  preprotein translocase subunit SecF  32.54 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4310  protein-export membrane protein SecF  33.62 
 
 		 357 aa  177  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2056  protein-export membrane protein SecF  32.94 
 
 		 337 aa  176  5e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.880378  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1714  protein-export membrane protein SecF  32.94 
 
 		 316 aa  176  5e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.611616  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>