More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCI_0600 on replicon NC_007984
Organism: Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007984  BCI_0600  protein-export membrane protein SecF  100 
 
 
306 aa  597  1e-170  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1064  preprotein translocase subunit SecF  59.21 
 
 
322 aa  378  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204402 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2903  preprotein translocase subunit SecF  60 
 
 
323 aa  377  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00357  protein export protein SecF  57.7 
 
 
323 aa  371  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.797763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3200  protein-export membrane protein SecF  57.7 
 
 
323 aa  371  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0111096  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0508  preprotein translocase subunit SecF  58.03 
 
 
323 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0454  preprotein translocase subunit SecF  58.03 
 
 
323 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0489  preprotein translocase subunit SecF  57.7 
 
 
323 aa  371  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0878  preprotein translocase subunit SecF  59.02 
 
 
323 aa  372  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0441  preprotein translocase subunit SecF  57.7 
 
 
323 aa  371  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00361  hypothetical protein  57.7 
 
 
323 aa  371  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0479  preprotein translocase subunit SecF  57.7 
 
 
323 aa  371  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0439  preprotein translocase subunit SecF  57.7 
 
 
323 aa  371  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3224  preprotein translocase subunit SecF  57.7 
 
 
323 aa  371  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000013674 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0447  preprotein translocase subunit SecF  58.03 
 
 
323 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0467  preprotein translocase subunit SecF  58.03 
 
 
323 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0448  preprotein translocase subunit SecF  58.03 
 
 
323 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0328  preprotein translocase subunit SecF  57.7 
 
 
323 aa  371  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.264814  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3094  preprotein translocase subunit SecF  58.03 
 
 
323 aa  371  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278166  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3120  preprotein translocase subunit SecF  59.21 
 
 
322 aa  358  6e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0405125  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3381  preprotein translocase subunit SecF  59.21 
 
 
322 aa  358  6e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0144101  normal  0.396634 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3261  preprotein translocase subunit SecF  59.21 
 
 
322 aa  358  6e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.578435  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1022  preprotein translocase subunit SecF  59.09 
 
 
324 aa  349  3e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3288  preprotein translocase subunit SecF  59.67 
 
 
322 aa  346  2e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01049  preprotein translocase subunit SecF  48 
 
 
315 aa  300  1e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0273  preprotein translocase subunit SecF  50 
 
 
315 aa  296  3e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004364  protein-export membrane protein SecF  46.94 
 
 
315 aa  295  5e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0679828  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2432  preprotein translocase subunit SecF  48.64 
 
 
316 aa  283  4.0000000000000003e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2699  preprotein translocase subunit SecF  46.02 
 
 
315 aa  278  1e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.584759  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1404  preprotein translocase subunit SecF  47.75 
 
 
315 aa  275  8e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0316508  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01348  protein-export membrane protein SecF  45.7 
 
 
313 aa  273  2.0000000000000002e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.256718  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1473  preprotein translocase subunit SecF  48.44 
 
 
315 aa  271  7e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13163  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1123  preprotein translocase subunit SecF  45.02 
 
 
315 aa  271  1e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3110  preprotein translocase subunit SecF  44.63 
 
 
315 aa  271  1e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2481  preprotein translocase subunit SecF  47.26 
 
 
315 aa  268  1e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0456849  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1231  protein-export membrane protein SecF  45.36 
 
 
313 aa  267  2e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2334  preprotein translocase subunit SecF  46.02 
 
 
315 aa  266  4e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.307818  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1573  preprotein translocase subunit SecF  46.37 
 
 
315 aa  265  5e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00583403  hitchhiker  0.000000100837 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1312  preprotein translocase subunit SecF  43.49 
 
 
313 aa  265  5e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.187294  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2879  preprotein translocase subunit SecF  46.37 
 
 
315 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0152003  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2784  preprotein translocase subunit SecF  46.37 
 
 
315 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0481367  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2804  preprotein translocase subunit SecF  46.37 
 
 
315 aa  264  1e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00594045  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2211  preprotein translocase subunit SecF  46.82 
 
 
314 aa  261  8.999999999999999e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433949  normal  0.220964 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1385  preprotein translocase subunit SecF  45.21 
 
 
315 aa  261  1e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00983524  hitchhiker  0.000000302266 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1438  preprotein translocase subunit SecF  45.21 
 
 
315 aa  261  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0107161  hitchhiker  0.00000672809 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1450  preprotein translocase subunit SecF  44.86 
 
 
315 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101016  normal  0.0107257 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0866  preprotein translocase subunit SecF  44.18 
 
 
302 aa  258  9e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222243  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0879  preprotein translocase subunit SecF  43.84 
 
 
302 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0954141 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0836  preprotein translocase subunit SecF  43.84 
 
 
302 aa  256  3e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1759  preprotein translocase subunit SecF  48.67 
 
 
315 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.020465  normal  0.0122623 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2190  preprotein translocase subunit SecF  44.64 
 
 
315 aa  253  3e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.447622  decreased coverage  0.00319916 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2889  preprotein translocase subunit SecF  48.09 
 
 
315 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000629469 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1231  preprotein translocase subunit SecF  42.12 
 
 
303 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.611016  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1416  protein-export membrane protein SecF  42.12 
 
 
303 aa  250  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2349  preprotein translocase subunit SecF  45.36 
 
 
312 aa  250  2e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4618  preprotein translocase subunit SecF  44.86 
 
 
304 aa  251  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178717  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2056  protein-export membrane protein SecF  42.47 
 
 
337 aa  250  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.880378  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1714  protein-export membrane protein SecF  42.47 
 
 
316 aa  249  3e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.611616  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2065  preprotein translocase subunit SecF  42.11 
 
 
313 aa  245  6.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1330  SecF protein  42.47 
 
 
338 aa  244  9.999999999999999e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0105179  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2644  protein-export membrane protein SecF  41.38 
 
 
304 aa  243  3e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0946476  hitchhiker  0.00035144 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4342  preprotein translocase subunit SecF  43.84 
 
 
302 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.557524  hitchhiker  0.0000000544827 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2185  protein-export membrane protein SecF  40.69 
 
 
312 aa  241  1e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3517  preprotein translocase subunit SecF  41.11 
 
 
305 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.943932  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1981  preprotein translocase subunit SecF  41.72 
 
 
305 aa  237  1e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0511  preprotein translocase subunit SecF  40 
 
 
311 aa  238  1e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.956081  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1976  preprotein translocase subunit SecF  41.72 
 
 
305 aa  237  2e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0475  preprotein translocase subunit SecF  40.07 
 
 
323 aa  236  3e-61  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1302  protein-export membrane protein SecF  42.16 
 
 
315 aa  236  4e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1293  preprotein translocase subunit SecF  41.64 
 
 
306 aa  235  7e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1219  preprotein translocase subunit SecF  42.38 
 
 
314 aa  234  9e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.417925 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14650  preprotein translocase subunit SecF  41.64 
 
 
306 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3281  preprotein translocase subunit SecF  40.28 
 
 
314 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0339451  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0708  preprotein translocase subunit SecF  39.25 
 
 
323 aa  233  3e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40450  preprotein translocase subunit SecF  41.92 
 
 
304 aa  233  4.0000000000000004e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.193489  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0072  preprotein translocase subunit SecF  38.7 
 
 
323 aa  230  2e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  42.95 
 
 
304 aa  230  2e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  42.95 
 
 
304 aa  230  2e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2716  preprotein translocase subunit SecF  38.44 
 
 
322 aa  228  7e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.141872 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2960  preprotein translocase subunit SecF  38.85 
 
 
323 aa  228  7e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1235  preprotein translocase subunit SecF  40.56 
 
 
323 aa  228  9e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.178131  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1110  preprotein translocase subunit SecF  40.56 
 
 
323 aa  228  9e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2550  preprotein translocase subunit SecF  38.38 
 
 
323 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.341971  normal  0.338499 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1509  preprotein translocase subunit SecF  38.91 
 
 
324 aa  227  2e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.444089 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0631  preprotein translocase subunit SecF  40.21 
 
 
323 aa  226  3e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0684  preprotein translocase subunit SecF  37.06 
 
 
309 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.738953  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2080  preprotein translocase subunit SecF  38.7 
 
 
310 aa  224  1e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.348624  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4004  preprotein translocase subunit SecF  36.95 
 
 
317 aa  224  1e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.833906 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1408  protein translocase subunit secF  39.53 
 
 
317 aa  224  1e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2811  preprotein translocase subunit SecF  36.99 
 
 
323 aa  223  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3354  preprotein translocase subunit SecF  37.29 
 
 
317 aa  224  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1792  preprotein translocase subunit SecF  38.7 
 
 
324 aa  224  2e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.105598  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2947  preprotein translocase subunit SecF  37.67 
 
 
324 aa  223  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2426  preprotein translocase subunit SecF  37.85 
 
 
310 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0278  preprotein translocase subunit SecF  35.76 
 
 
344 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.182784  normal  0.130689 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0837  preprotein translocase subunit SecF  37.11 
 
 
316 aa  219  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4086  preprotein translocase subunit SecF  35.49 
 
 
321 aa  219  5e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0605459  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3037  protein-export membrane protein SecF  37.41 
 
 
316 aa  219  5e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1275  preprotein translocase subunit SecF  37.5 
 
 
316 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4643  preprotein translocase subunit SecF  35.86 
 
 
317 aa  218  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.410756  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>