More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1302 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1302  protein-export membrane protein SecF  100 
 
 		 315 aa  616  1e-175  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2065  preprotein translocase subunit SecF  69.13 
 
 		 313 aa  399  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1123  preprotein translocase subunit SecF  56.54 
 
 		 315 aa  337  1.9999999999999998e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1219  preprotein translocase subunit SecF  59.4 
 
 		 314 aa  331  1e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417925 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2644  protein-export membrane protein SecF  56.03 
 
 		 304 aa  328  9e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0946476  hitchhiker  0.00035144 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2349  preprotein translocase subunit SecF  58.69 
 
 		 312 aa  323  2e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01348  protein-export membrane protein SecF  55.91 
 
 		 313 aa  322  4e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.256718  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1330  SecF protein  58.28 
 
 		 338 aa  322  5e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0105179  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01049  preprotein translocase subunit SecF  50.65 
 
 		 315 aa  319  3e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004364  protein-export membrane protein SecF  50.32 
 
 		 315 aa  318  1e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0679828  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0273  preprotein translocase subunit SecF  52.9 
 
 		 315 aa  315  8e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1231  protein-export membrane protein SecF  53.05 
 
 		 313 aa  311  7.999999999999999e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0836  preprotein translocase subunit SecF  51.64 
 
 		 302 aa  308  9e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0879  preprotein translocase subunit SecF  51.64 
 
 		 302 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0954141 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0866  preprotein translocase subunit SecF  50.99 
 
 		 302 aa  305  6e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222243  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0511  preprotein translocase subunit SecF  49.34 
 
 		 311 aa  301  7.000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.956081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2432  preprotein translocase subunit SecF  51.69 
 
 		 316 aa  300  2e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1408  protein translocase subunit secF  52.23 
 
 		 317 aa  300  2e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1064  preprotein translocase subunit SecF  46.77 
 
 		 322 aa  299  3e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204402 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1231  preprotein translocase subunit SecF  50.68 
 
 		 303 aa  295  5e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.611016  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1416  protein-export membrane protein SecF  50.68 
 
 		 303 aa  295  9e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1404  preprotein translocase subunit SecF  51.8 
 
 		 315 aa  293  2e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0316508  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3110  preprotein translocase subunit SecF  49.19 
 
 		 315 aa  292  4e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2836  protein translocase subunit secF  52.46 
 
 		 302 aa  292  6e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0878  preprotein translocase subunit SecF  43.87 
 
 		 323 aa  290  2e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1473  preprotein translocase subunit SecF  52.22 
 
 		 315 aa  289  4e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13163  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2211  preprotein translocase subunit SecF  51.14 
 
 		 314 aa  287  2e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433949  normal  0.220964 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3094  preprotein translocase subunit SecF  44.84 
 
 		 323 aa  287  2e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278166  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2185  protein-export membrane protein SecF  46.58 
 
 		 312 aa  286  4e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2699  preprotein translocase subunit SecF  49.84 
 
 		 315 aa  286  4e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.584759  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4342  preprotein translocase subunit SecF  51.15 
 
 		 302 aa  285  8e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.557524  hitchhiker  0.0000000544827 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3410  preprotein translocase subunit SecF  46.36 
 
 		 310 aa  285  9e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.470733  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0684  preprotein translocase subunit SecF  48.34 
 
 		 309 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.738953  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2334  preprotein translocase subunit SecF  50.97 
 
 		 315 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.307818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1695  preprotein translocase subunit SecF  54.93 
 
 		 320 aa  283  4.0000000000000003e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0508  preprotein translocase subunit SecF  42.9 
 
 		 323 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0454  preprotein translocase subunit SecF  42.9 
 
 		 323 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0447  preprotein translocase subunit SecF  42.9 
 
 		 323 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0448  preprotein translocase subunit SecF  42.9 
 
 		 323 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0467  preprotein translocase subunit SecF  42.9 
 
 		 323 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00357  protein export protein SecF  42.9 
 
 		 323 aa  278  6e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.797763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3200  protein-export membrane protein SecF  42.9 
 
 		 323 aa  278  6e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0111096  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00361  hypothetical protein  42.9 
 
 		 323 aa  278  6e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0441  preprotein translocase subunit SecF  42.9 
 
 		 323 aa  278  6e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0489  preprotein translocase subunit SecF  42.9 
 
 		 323 aa  278  6e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40450  preprotein translocase subunit SecF  53.77 
 
 		 304 aa  278  6e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.193489  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3224  preprotein translocase subunit SecF  42.9 
 
 		 323 aa  278  6e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000013674 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0328  preprotein translocase subunit SecF  42.9 
 
 		 323 aa  278  6e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.264814  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0479  preprotein translocase subunit SecF  42.9 
 
 		 323 aa  278  6e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0439  preprotein translocase subunit SecF  42.9 
 
 		 323 aa  278  6e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3517  preprotein translocase subunit SecF  48.38 
 
 		 305 aa  278  7e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.943932  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2903  preprotein translocase subunit SecF  44.52 
 
 		 323 aa  278  7e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14650  preprotein translocase subunit SecF  49.35 
 
 		 306 aa  277  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3288  preprotein translocase subunit SecF  47.12 
 
 		 322 aa  276  2e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1573  preprotein translocase subunit SecF  51.03 
 
 		 315 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00583403  hitchhiker  0.000000100837 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2190  preprotein translocase subunit SecF  51.14 
 
 		 315 aa  276  4e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.447622  decreased coverage  0.00319916 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3381  preprotein translocase subunit SecF  45.48 
 
 		 322 aa  276  5e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0144101  normal  0.396634 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3261  preprotein translocase subunit SecF  45.48 
 
 		 322 aa  276  5e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.578435  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1293  preprotein translocase subunit SecF  49.03 
 
 		 306 aa  275  5e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3120  preprotein translocase subunit SecF  45.48 
 
 		 322 aa  276  5e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0405125  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3807  preprotein translocase subunit SecF  45.07 
 
 		 316 aa  275  7e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1981  preprotein translocase subunit SecF  45.93 
 
 		 305 aa  275  8e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1976  preprotein translocase subunit SecF  45.93 
 
 		 305 aa  275  8e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0687  preprotein translocase subunit SecF  45.39 
 
 		 316 aa  275  8e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0235  preprotein translocase subunit SecF  45.39 
 
 		 316 aa  275  8e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0719  preprotein translocase subunit SecF  45.39 
 
 		 316 aa  275  8e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4618  preprotein translocase subunit SecF  50.16 
 
 		 304 aa  275  9e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2426  preprotein translocase subunit SecF  46.53 
 
 		 310 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2481  preprotein translocase subunit SecF  51.38 
 
 		 315 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0456849  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2879  preprotein translocase subunit SecF  50.68 
 
 		 315 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0152003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0609  preprotein translocase subunit SecF  44.95 
 
 		 316 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2784  preprotein translocase subunit SecF  50.68 
 
 		 315 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0481367  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1714  protein-export membrane protein SecF  45.93 
 
 		 316 aa  273  3e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.611616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0634  preprotein translocase subunit SecF  44.41 
 
 		 316 aa  273  3e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2056  protein-export membrane protein SecF  46.82 
 
 		 337 aa  273  3e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.880378  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2804  preprotein translocase subunit SecF  50.68 
 
 		 315 aa  273  3e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00594045  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2667  preprotein translocase subunit SecF  45.07 
 
 		 316 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452274  normal  0.524558 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1450  preprotein translocase subunit SecF  51.55 
 
 		 315 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101016  normal  0.0107257 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3281  preprotein translocase subunit SecF  46.39 
 
 		 314 aa  272  6e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0339451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1117  preprotein translocase subunit SecF  52.2 
 
 		 316 aa  271  1e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3374  preprotein translocase subunit SecF  45.07 
 
 		 316 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3331  preprotein translocase subunit SecF  45.07 
 
 		 316 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0935512  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1385  preprotein translocase subunit SecF  51.2 
 
 		 315 aa  271  1e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00983524  hitchhiker  0.000000302266 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1438  preprotein translocase subunit SecF  51.2 
 
 		 315 aa  271  1e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0107161  hitchhiker  0.00000672809 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3365  preprotein translocase subunit SecF  45.07 
 
 		 316 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1759  preprotein translocase subunit SecF  51.79 
 
 		 315 aa  270  2e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.020465  normal  0.0122623 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1275  preprotein translocase subunit SecF  44.74 
 
 		 316 aa  270  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2528  preprotein translocase subunit SecF  46.49 
 
 		 316 aa  270  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3993  preprotein translocase subunit SecF  45.72 
 
 		 316 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.117459  normal  0.130054 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1022  preprotein translocase subunit SecF  45.83 
 
 		 324 aa  269  4e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2947  preprotein translocase subunit SecF  44.44 
 
 		 324 aa  269  4e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3211  protein translocase subunit secF  50.33 
 
 		 311 aa  269  4e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4004  preprotein translocase subunit SecF  46.08 
 
 		 317 aa  269  5e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.833906 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2889  preprotein translocase subunit SecF  52.31 
 
 		 315 aa  269  5e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000629469 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4643  preprotein translocase subunit SecF  44.44 
 
 		 317 aa  268  8.999999999999999e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.410756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4086  preprotein translocase subunit SecF  45.87 
 
 		 321 aa  268  1e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0605459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0702  preprotein translocase subunit SecF  45.39 
 
 		 316 aa  267  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.686375  normal  0.807805 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3354  preprotein translocase subunit SecF  45.75 
 
 		 317 aa  267  2e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2570  preprotein translocase subunit SecF  44.74 
 
 		 313 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1162  preprotein translocase subunit SecF  44.74 
 
 		 313 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.954336  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>