More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0475 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0475  preprotein translocase subunit SecF  100 
 
 		 323 aa  640    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0072  preprotein translocase subunit SecF  60.99 
 
 		 323 aa  410  1e-113  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0708  preprotein translocase subunit SecF  59.13 
 
 		 323 aa  398  9.999999999999999e-111  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1110  preprotein translocase subunit SecF  57.28 
 
 		 323 aa  385  1e-106  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1235  preprotein translocase subunit SecF  57.28 
 
 		 323 aa  385  1e-106  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.178131  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0631  preprotein translocase subunit SecF  57.28 
 
 		 323 aa  384  1e-105  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0729  preprotein translocase subunit SecF  64.71 
 
 		 323 aa  376  1e-103  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.111579  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1047  preprotein translocase subunit SecF  59.13 
 
 		 323 aa  352  4e-96  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1620  protein-export membrane protein SecF  48.77 
 
 		 323 aa  328  8e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1574  preprotein translocase subunit SecF  46.44 
 
 		 323 aa  280  2e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1064  preprotein translocase subunit SecF  39.09 
 
 		 322 aa  244  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204402 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01049  preprotein translocase subunit SecF  41.18 
 
 		 315 aa  237  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0273  preprotein translocase subunit SecF  41.5 
 
 		 315 aa  236  3e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0600  protein-export membrane protein SecF  40.07 
 
 		 306 aa  236  4e-61  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01348  protein-export membrane protein SecF  40.56 
 
 		 313 aa  236  4e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.256718  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004364  protein-export membrane protein SecF  41.18 
 
 		 315 aa  235  9e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0679828  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  44.41 
 
 		 307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1123  preprotein translocase subunit SecF  40.94 
 
 		 315 aa  234  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0511  preprotein translocase subunit SecF  38.82 
 
 		 311 aa  232  8.000000000000001e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.956081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0866  preprotein translocase subunit SecF  40.97 
 
 		 302 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222243  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0879  preprotein translocase subunit SecF  40.97 
 
 		 302 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0954141 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2056  protein-export membrane protein SecF  36.31 
 
 		 337 aa  230  3e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.880378  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1714  protein-export membrane protein SecF  36.31 
 
 		 316 aa  229  4e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.611616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3211  protein translocase subunit secF  41.88 
 
 		 311 aa  229  4e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0836  preprotein translocase subunit SecF  40.83 
 
 		 302 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1981  preprotein translocase subunit SecF  39.1 
 
 		 305 aa  228  9e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1976  preprotein translocase subunit SecF  39.1 
 
 		 305 aa  228  9e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3037  protein-export membrane protein SecF  42.5 
 
 		 316 aa  228  9e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0878  preprotein translocase subunit SecF  36.94 
 
 		 323 aa  228  1e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3517  preprotein translocase subunit SecF  39.6 
 
 		 305 aa  228  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.943932  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3094  preprotein translocase subunit SecF  40.36 
 
 		 323 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278166  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1416  protein-export membrane protein SecF  39.58 
 
 		 303 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1231  preprotein translocase subunit SecF  39.58 
 
 		 303 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.611016  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3171  preprotein translocase subunit SecF  38.39 
 
 		 372 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.203608  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3110  preprotein translocase subunit SecF  36.83 
 
 		 315 aa  223  3e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4310  protein-export membrane protein SecF  40.21 
 
 		 357 aa  223  3e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4342  preprotein translocase subunit SecF  41.52 
 
 		 302 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.557524  hitchhiker  0.0000000544827 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0508  preprotein translocase subunit SecF  36.71 
 
 		 323 aa  222  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0448  preprotein translocase subunit SecF  36.71 
 
 		 323 aa  222  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0454  preprotein translocase subunit SecF  36.71 
 
 		 323 aa  222  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0467  preprotein translocase subunit SecF  36.71 
 
 		 323 aa  222  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0447  preprotein translocase subunit SecF  36.71 
 
 		 323 aa  222  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00357  protein export protein SecF  36.71 
 
 		 323 aa  222  7e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.797763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3200  protein-export membrane protein SecF  36.71 
 
 		 323 aa  222  7e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0111096  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0479  preprotein translocase subunit SecF  36.71 
 
 		 323 aa  222  7e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0489  preprotein translocase subunit SecF  36.71 
 
 		 323 aa  222  7e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0439  preprotein translocase subunit SecF  36.71 
 
 		 323 aa  222  7e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0441  preprotein translocase subunit SecF  36.71 
 
 		 323 aa  222  7e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3224  preprotein translocase subunit SecF  36.71 
 
 		 323 aa  222  7e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000013674 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00361  hypothetical protein  36.71 
 
 		 323 aa  222  7e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0328  preprotein translocase subunit SecF  36.71 
 
 		 323 aa  222  7e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.264814  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2080  preprotein translocase subunit SecF  36.69 
 
 		 310 aa  222  8e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.348624  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2903  preprotein translocase subunit SecF  40.36 
 
 		 323 aa  221  9e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1231  protein-export membrane protein SecF  37.25 
 
 		 313 aa  221  9e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0684  preprotein translocase subunit SecF  36.39 
 
 		 309 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.738953  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2065  preprotein translocase subunit SecF  41.3 
 
 		 313 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1293  preprotein translocase subunit SecF  39.93 
 
 		 306 aa  219  5e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3410  preprotein translocase subunit SecF  36.19 
 
 		 310 aa  219  5e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.470733  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2432  preprotein translocase subunit SecF  40.35 
 
 		 316 aa  219  7e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3120  preprotein translocase subunit SecF  39.78 
 
 		 322 aa  218  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0405125  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4618  preprotein translocase subunit SecF  40.62 
 
 		 304 aa  218  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3381  preprotein translocase subunit SecF  39.78 
 
 		 322 aa  218  1e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0144101  normal  0.396634 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3261  preprotein translocase subunit SecF  39.78 
 
 		 322 aa  218  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.578435  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.99 
 
 		 856 aa  217  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2775  preprotein translocase subunit SecF  38.87 
 
 		 334 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.33037 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14650  preprotein translocase subunit SecF  39.6 
 
 		 306 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1473  preprotein translocase subunit SecF  36.83 
 
 		 315 aa  216  4e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13163  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2716  preprotein translocase subunit SecF  34.5 
 
 		 322 aa  216  5e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.141872 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1404  preprotein translocase subunit SecF  38.03 
 
 		 315 aa  216  5e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0316508  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0702  preprotein translocase subunit SecF  36.45 
 
 		 316 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.686375  normal  0.807805 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2349  preprotein translocase subunit SecF  42.16 
 
 		 312 aa  215  8e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0634  preprotein translocase subunit SecF  35.14 
 
 		 316 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1330  SecF protein  41.22 
 
 		 338 aa  215  9.999999999999999e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0105179  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3993  preprotein translocase subunit SecF  36.58 
 
 		 316 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.117459  normal  0.130054 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2836  protein translocase subunit secF  37.7 
 
 		 302 aa  214  9.999999999999999e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0609  preprotein translocase subunit SecF  34.41 
 
 		 316 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0687  preprotein translocase subunit SecF  33.54 
 
 		 316 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3281  preprotein translocase subunit SecF  37.24 
 
 		 314 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0339451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2481  preprotein translocase subunit SecF  36.89 
 
 		 315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0456849  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2426  preprotein translocase subunit SecF  38.06 
 
 		 310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2667  preprotein translocase subunit SecF  35.14 
 
 		 316 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452274  normal  0.524558 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0235  preprotein translocase subunit SecF  33.54 
 
 		 316 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0719  preprotein translocase subunit SecF  33.54 
 
 		 316 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2334  preprotein translocase subunit SecF  38.59 
 
 		 315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.307818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2699  preprotein translocase subunit SecF  35.83 
 
 		 315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.584759  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2776  preprotein translocase subunit SecF  38.12 
 
 		 369 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.686561  normal  0.719321 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3807  preprotein translocase subunit SecF  33.23 
 
 		 316 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3865  preprotein translocase subunit SecF  37.5 
 
 		 317 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  38.39 
 
 		 304 aa  212  5.999999999999999e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  38.39 
 
 		 304 aa  212  7e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2731  preprotein translocase subunit SecF  37.58 
 
 		 367 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.447806  normal  0.258523 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1408  protein translocase subunit secF  39.19 
 
 		 317 aa  211  1e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0837  preprotein translocase subunit SecF  35.86 
 
 		 316 aa  211  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3374  preprotein translocase subunit SecF  33.12 
 
 		 316 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3331  preprotein translocase subunit SecF  33.64 
 
 		 316 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0935512  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3365  preprotein translocase subunit SecF  33.12 
 
 		 316 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1275  preprotein translocase subunit SecF  33.12 
 
 		 316 aa  211  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2784  preprotein translocase subunit SecF  36.25 
 
 		 315 aa  209  5e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0481367  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2879  preprotein translocase subunit SecF  36.25 
 
 		 315 aa  209  5e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0152003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2804  preprotein translocase subunit SecF  36.25 
 
 		 315 aa  209  5e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00594045  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>