More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1192 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1192  preprotein translocase subunit SecF  100 
 
 		 329 aa  637    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1278  preprotein translocase subunit SecF  81.46 
 
 		 328 aa  503  1e-141  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.630686  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16231  preprotein translocase subunit SecF  74.38 
 
 		 359 aa  418  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.205013 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07171  preprotein translocase subunit SecF  63.43 
 
 		 322 aa  360  2e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.434985  normal  0.295105 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0283  preprotein translocase subunit SecF  59.27 
 
 		 321 aa  358  9.999999999999999e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.164559  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09531  preprotein translocase subunit SecF  58.94 
 
 		 318 aa  353  2e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.14982 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0871  preprotein translocase subunit SecF  41.95 
 
 		 304 aa  256  4e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0139488  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1489  preprotein translocase subunit SecF  42.39 
 
 		 325 aa  248  8e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.921272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10111  preprotein translocase subunit SecF  42.21 
 
 		 305 aa  244  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09321  preprotein translocase subunit SecF  41.95 
 
 		 304 aa  243  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2885  preprotein translocase subunit SecF  43.69 
 
 		 310 aa  240  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09301  preprotein translocase subunit SecF  41.61 
 
 		 304 aa  240  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.359776  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5076  preprotein translocase subunit SecF  41.85 
 
 		 328 aa  236  4e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4538  protein-export membrane protein SecF  43 
 
 		 320 aa  225  8e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3211  preprotein translocase subunit SecF  45.79 
 
 		 310 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.828599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5129  preprotein translocase subunit SecF  43.91 
 
 		 336 aa  219  6e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.642857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1027  preprotein translocase subunit SecF  41.75 
 
 		 312 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0198826 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0141  preprotein translocase subunit SecF  43.55 
 
 		 314 aa  206  4e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  34.43 
 
 		 286 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  34.78 
 
 		 291 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  33.11 
 
 		 304 aa  152  5.9999999999999996e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  33.11 
 
 		 304 aa  152  7e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3211  protein translocase subunit secF  36.25 
 
 		 311 aa  152  8e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1785  preprotein translocase subunit SecF  32.9 
 
 		 301 aa  152  8e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00817769 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  33.33 
 
 		 307 aa  151  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2432  preprotein translocase subunit SecF  33.01 
 
 		 301 aa  151  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.604218  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1216  protein-export membrane protein SecF  35.58 
 
 		 291 aa  150  3e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0233184  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2947  preprotein translocase subunit SecF  32.98 
 
 		 324 aa  150  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2699  preprotein translocase subunit SecF  36.84 
 
 		 315 aa  150  4e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.584759  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1231  protein-export membrane protein SecF  34.85 
 
 		 313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0836  preprotein translocase subunit SecF  34.48 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  31.83 
 
 		 735 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1719  preprotein translocase subunit SecF  34.53 
 
 		 302 aa  147  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1355  preprotein translocase subunit SecF  35.5 
 
 		 293 aa  146  4.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1085  preprotein translocase subunit SecF  34.12 
 
 		 328 aa  145  6e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.161965 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0080  protein-export membrane protein SecF  33.75 
 
 		 317 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2616  preprotein translocase subunit SecF  32.06 
 
 		 302 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2811  preprotein translocase subunit SecF  32.27 
 
 		 323 aa  145  9e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01049  preprotein translocase subunit SecF  33.12 
 
 		 315 aa  145  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0855  preprotein translocase subunit SecF  33.44 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004364  protein-export membrane protein SecF  33.01 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0679828  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0866  preprotein translocase subunit SecF  32.65 
 
 		 302 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222243  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4310  protein-export membrane protein SecF  34.92 
 
 		 357 aa  143  5e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3281  preprotein translocase subunit SecF  33.7 
 
 		 314 aa  142  6e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0339451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0879  preprotein translocase subunit SecF  33.56 
 
 		 302 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0954141 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  34.65 
 
 		 761 aa  142  9e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2784  preprotein translocase subunit SecF  34.59 
 
 		 315 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0481367  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1404  preprotein translocase subunit SecF  36.57 
 
 		 315 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0316508  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2879  preprotein translocase subunit SecF  34.59 
 
 		 315 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0152003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2080  preprotein translocase subunit SecF  33.45 
 
 		 310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.348624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2804  preprotein translocase subunit SecF  34.59 
 
 		 315 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00594045  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1424  preprotein translocase subunit SecF  31.39 
 
 		 280 aa  141  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000449698  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1770  protein-export membrane protein SecF  34.32 
 
 		 307 aa  140  3e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0684  preprotein translocase subunit SecF  34.24 
 
 		 309 aa  140  3e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.738953  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1792  preprotein translocase subunit SecF  31.43 
 
 		 324 aa  140  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.105598  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  33.33 
 
 		 989 aa  140  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1573  preprotein translocase subunit SecF  34.59 
 
 		 315 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00583403  hitchhiker  0.000000100837 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1275  preprotein translocase subunit SecF  30.6 
 
 		 316 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3374  preprotein translocase subunit SecF  30.16 
 
 		 316 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3365  preprotein translocase subunit SecF  30.16 
 
 		 316 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4618  preprotein translocase subunit SecF  33.79 
 
 		 304 aa  138  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1271  preprotein translocase subunit SecF  34.98 
 
 		 296 aa  138  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3331  preprotein translocase subunit SecF  30.16 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0935512  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0997  preprotein translocase subunit SecF  33.22 
 
 		 322 aa  138  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2481  preprotein translocase subunit SecF  33.97 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0456849  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0708  preprotein translocase subunit SecF  32.73 
 
 		 323 aa  138  2e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2550  preprotein translocase subunit SecF  31.1 
 
 		 323 aa  138  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.341971  normal  0.338499 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2432  preprotein translocase subunit SecF  33.75 
 
 		 316 aa  137  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2836  protein translocase subunit secF  34.53 
 
 		 302 aa  137  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2960  preprotein translocase subunit SecF  31.1 
 
 		 323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2384  preprotein translocase subunit SecF  30.06 
 
 		 313 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1162  preprotein translocase subunit SecF  30.06 
 
 		 313 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.954336  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2570  preprotein translocase subunit SecF  30.06 
 
 		 313 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0300  preprotein translocase subunit SecF  30.06 
 
 		 313 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0687  preprotein translocase subunit SecF  30.23 
 
 		 316 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0235  preprotein translocase subunit SecF  30.23 
 
 		 316 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0719  preprotein translocase subunit SecF  30.23 
 
 		 316 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2716  preprotein translocase subunit SecF  30.25 
 
 		 322 aa  136  5e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.141872 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1509  preprotein translocase subunit SecF  31.91 
 
 		 324 aa  136  5e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.444089 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3807  preprotein translocase subunit SecF  29.9 
 
 		 316 aa  136  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1450  preprotein translocase subunit SecF  33.86 
 
 		 315 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101016  normal  0.0107257 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4342  preprotein translocase subunit SecF  33.9 
 
 		 302 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.557524  hitchhiker  0.0000000544827 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1231  preprotein translocase subunit SecF  33.1 
 
 		 303 aa  135  8e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.611016  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1117  preprotein translocase subunit SecF  36.1 
 
 		 316 aa  135  8e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0273  preprotein translocase subunit SecF  33.11 
 
 		 315 aa  135  9e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0634  preprotein translocase subunit SecF  30.55 
 
 		 316 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4086  preprotein translocase subunit SecF  30.25 
 
 		 321 aa  134  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0605459  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3110  preprotein translocase subunit SecF  31.35 
 
 		 315 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1620  protein-export membrane protein SecF  29.86 
 
 		 323 aa  134  9.999999999999999e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1064  preprotein translocase subunit SecF  35.58 
 
 		 322 aa  135  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204402 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1385  preprotein translocase subunit SecF  33.54 
 
 		 315 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00983524  hitchhiker  0.000000302266 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0609  preprotein translocase subunit SecF  30.55 
 
 		 316 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1438  preprotein translocase subunit SecF  33.54 
 
 		 315 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0107161  hitchhiker  0.00000672809 
 
 
-
 
NC_004310  BR0891  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.58 
 
 		 785 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.983907  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1416  protein-export membrane protein SecF  33.1 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2426  preprotein translocase subunit SecF  31.87 
 
 		 310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0887  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.58 
 
 		 785 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2190  preprotein translocase subunit SecF  34.06 
 
 		 315 aa  133  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.447622  decreased coverage  0.00319916 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3410  preprotein translocase subunit SecF  31.75 
 
 		 310 aa  134  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.470733  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2334  preprotein translocase subunit SecF  34.71 
 
 		 315 aa  134  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.307818  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>