More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0080 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0080  protein-export membrane protein SecF  100 
 
 		 317 aa  635    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3325  protein-export membrane protein SecF  49.38 
 
 		 324 aa  284  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3983  protein-export membrane protein SecF  50.16 
 
 		 324 aa  281  1e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.586193  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3103  protein-export membrane protein SecF  49.09 
 
 		 322 aa  270  2e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_274  protein-export membrane protein, preprotein translocase SecF subunit  41.56 
 
 		 302 aa  249  6e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00850837  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0312  preprotein translocase subunit SecF  41.8 
 
 		 301 aa  246  4e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.111019  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0332  preprotein translocase subunit SecF  42.31 
 
 		 301 aa  245  6e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.496269  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  43.22 
 
 		 291 aa  245  8e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0505  protein-export membrane protein SecF  46.85 
 
 		 333 aa  245  9e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0158635  hitchhiker  0.00187348 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1271  preprotein translocase subunit SecF  43.19 
 
 		 296 aa  237  2e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  43 
 
 		 286 aa  233  4.0000000000000004e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1355  preprotein translocase subunit SecF  44.18 
 
 		 293 aa  213  2.9999999999999995e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2885  preprotein translocase subunit SecF  36.73 
 
 		 310 aa  199  6e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1670  preprotein translocase subunit SecF  41.64 
 
 		 292 aa  198  9e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00270917  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3211  preprotein translocase subunit SecF  39.1 
 
 		 310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.828599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  37.26 
 
 		 735 aa  196  6e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1424  preprotein translocase subunit SecF  37.25 
 
 		 280 aa  191  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000449698  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5076  preprotein translocase subunit SecF  35.53 
 
 		 328 aa  190  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1489  preprotein translocase subunit SecF  36.25 
 
 		 325 aa  189  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.921272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1770  protein-export membrane protein SecF  36.3 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1690  preprotein translocase subunit SecF  40.32 
 
 		 310 aa  182  8.000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.113213  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1785  preprotein translocase subunit SecF  34.27 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00817769 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  37.38 
 
 		 307 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  37.17 
 
 		 761 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1312  preprotein translocase subunit SecF  39.45 
 
 		 313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.187294  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0855  preprotein translocase subunit SecF  36.67 
 
 		 302 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0562  protein-export membrane protein SecF  38 
 
 		 321 aa  178  9e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4258  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.06 
 
 		 755 aa  178  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2432  preprotein translocase subunit SecF  34.06 
 
 		 301 aa  178  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.604218  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2056  protein-export membrane protein SecF  37.29 
 
 		 337 aa  177  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.880378  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0273  preprotein translocase subunit SecF  40.6 
 
 		 315 aa  176  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1714  protein-export membrane protein SecF  37.29 
 
 		 316 aa  177  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.611616  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.53 
 
 		 754 aa  176  4e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2432  preprotein translocase subunit SecF  38.87 
 
 		 316 aa  176  4e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1719  preprotein translocase subunit SecF  35.79 
 
 		 302 aa  176  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1216  protein-export membrane protein SecF  36.59 
 
 		 291 aa  176  5e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0233184  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0013  preprotein translocase subunit SecF  36.39 
 
 		 309 aa  176  5e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245212 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2616  preprotein translocase subunit SecF  37.27 
 
 		 302 aa  175  7e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4545  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.2 
 
 		 754 aa  175  8e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  36.34 
 
 		 989 aa  174  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4306  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.87 
 
 		 754 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4641  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.87 
 
 		 754 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  35.76 
 
 		 304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0705  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.42 
 
 		 754 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  35.76 
 
 		 304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1797  preprotein translocase subunit SecF  36.86 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4530  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.54 
 
 		 754 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.566924  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00357  protein export protein SecF  35.74 
 
 		 323 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.797763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3200  protein-export membrane protein SecF  35.74 
 
 		 323 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0111096  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0836  preprotein translocase subunit SecF  37.96 
 
 		 302 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0328  preprotein translocase subunit SecF  35.74 
 
 		 323 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.264814  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00361  hypothetical protein  35.74 
 
 		 323 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1981  preprotein translocase subunit SecF  36.13 
 
 		 305 aa  173  3.9999999999999995e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1976  preprotein translocase subunit SecF  36.13 
 
 		 305 aa  173  3.9999999999999995e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0489  preprotein translocase subunit SecF  35.74 
 
 		 323 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3224  preprotein translocase subunit SecF  35.74 
 
 		 323 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000013674 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0439  preprotein translocase subunit SecF  35.74 
 
 		 323 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0441  preprotein translocase subunit SecF  35.74 
 
 		 323 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0479  preprotein translocase subunit SecF  35.74 
 
 		 323 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4144  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.21 
 
 		 754 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4155  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.54 
 
 		 754 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4491  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.21 
 
 		 754 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000282789 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40450  preprotein translocase subunit SecF  39.85 
 
 		 304 aa  172  7.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.193489  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1231  preprotein translocase subunit SecF  37.23 
 
 		 303 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.611016  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2349  preprotein translocase subunit SecF  42.11 
 
 		 312 aa  171  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0123  protein-export membrane protein SecF  36.42 
 
 		 293 aa  171  1e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.504249  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0935  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.87 
 
 		 750 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1064  preprotein translocase subunit SecF  34.78 
 
 		 322 aa  171  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204402 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1341  protein-export membrane protein SecF  36.81 
 
 		 298 aa  171  2e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1416  protein-export membrane protein SecF  37.23 
 
 		 303 aa  170  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2101  protein-export membrane protein SecF  37.38 
 
 		 308 aa  170  3e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.116132  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0879  preprotein translocase subunit SecF  36.46 
 
 		 302 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0954141 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2008  preprotein translocase subunit SecF  36.36 
 
 		 313 aa  169  5e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0141  preprotein translocase subunit SecF  37.01 
 
 		 314 aa  169  5e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0866  preprotein translocase subunit SecF  36.11 
 
 		 302 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222243  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2443  preprotein translocase subunit SecF  34.3 
 
 		 347 aa  169  7e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000105757  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6254  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.43 
 
 		 1055 aa  169  7e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4538  protein-export membrane protein SecF  34.49 
 
 		 320 aa  169  8e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5129  preprotein translocase subunit SecF  38.32 
 
 		 336 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.642857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3127  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.77 
 
 		 752 aa  168  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1027  preprotein translocase subunit SecF  35.94 
 
 		 312 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0198826 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3094  preprotein translocase subunit SecF  35.83 
 
 		 323 aa  167  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278166  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2513  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.18 
 
 		 750 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000183584  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2426  preprotein translocase subunit SecF  32.08 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3331  preprotein translocase subunit SecF  33 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0935512  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2737  protein-export membrane protein SecF  36.82 
 
 		 308 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.468895  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0626  protein-export membrane protein SecF  35.48 
 
 		 310 aa  166  4e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000549124  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3365  preprotein translocase subunit SecF  33 
 
 		 316 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3374  preprotein translocase subunit SecF  33 
 
 		 316 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1907  preprotein translocase subunit SecF  33.99 
 
 		 289 aa  166  5.9999999999999996e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0418717  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004364  protein-export membrane protein SecF  37.37 
 
 		 315 aa  166  5.9999999999999996e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0679828  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1117  preprotein translocase subunit SecF  37.92 
 
 		 316 aa  166  6.9999999999999995e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1231  protein-export membrane protein SecF  36.93 
 
 		 313 aa  165  8e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0687  preprotein translocase subunit SecF  33 
 
 		 316 aa  165  9e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2065  preprotein translocase subunit SecF  38.64 
 
 		 313 aa  165  9e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0235  preprotein translocase subunit SecF  33 
 
 		 316 aa  165  9e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0719  preprotein translocase subunit SecF  33 
 
 		 316 aa  165  9e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3807  preprotein translocase subunit SecF  32.66 
 
 		 316 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0008  preprotein translocase subunit SecF  35.1 
 
 		 311 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.748405  normal  0.104556 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1275  preprotein translocase subunit SecF  32.66 
 
 		 316 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>