More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1670 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1670  preprotein translocase subunit SecF  100 
 
 		 292 aa  581  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00270917  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  59.86 
 
 		 291 aa  354  6.999999999999999e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1271  preprotein translocase subunit SecF  53.31 
 
 		 296 aa  330  2e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1355  preprotein translocase subunit SecF  56.66 
 
 		 293 aa  319  3.9999999999999996e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1690  preprotein translocase subunit SecF  52.94 
 
 		 310 aa  286  4e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.113213  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1424  preprotein translocase subunit SecF  49.64 
 
 		 280 aa  277  2e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000449698  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  46.42 
 
 		 735 aa  264  1e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  50.53 
 
 		 286 aa  262  6e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2737  protein-export membrane protein SecF  45.14 
 
 		 308 aa  239  5.999999999999999e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.468895  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0626  protein-export membrane protein SecF  42.62 
 
 		 310 aa  231  1e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000549124  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1463  preprotein translocase subunit SecF  41.02 
 
 		 303 aa  223  4e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000137336  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0562  protein-export membrane protein SecF  41.99 
 
 		 321 aa  221  9e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0080  protein-export membrane protein SecF  41.64 
 
 		 317 aa  218  7.999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  42.12 
 
 		 307 aa  214  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  44.17 
 
 		 759 aa  214  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1727  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  44.17 
 
 		 759 aa  214  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.347489  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1907  preprotein translocase subunit SecF  43.15 
 
 		 289 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0418717  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2196  preprotein translocase subunit SecF  42.81 
 
 		 289 aa  212  5.999999999999999e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4258  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  42.81 
 
 		 755 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1286  protein-export membrane protein SecF  43.32 
 
 		 305 aa  210  2e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.115107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0705  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  43.82 
 
 		 754 aa  209  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4545  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  43.77 
 
 		 754 aa  208  9e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4144  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  43.77 
 
 		 754 aa  208  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4491  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  43.77 
 
 		 754 aa  208  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000282789 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4530  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  43.42 
 
 		 754 aa  207  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.566924  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004364  protein-export membrane protein SecF  39.13 
 
 		 315 aa  208  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0679828  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2513  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  43.84 
 
 		 750 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000183584  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01049  preprotein translocase subunit SecF  38.46 
 
 		 315 aa  207  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2644  protein-export membrane protein SecF  41.64 
 
 		 304 aa  207  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0946476  hitchhiker  0.00035144 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4306  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  43.42 
 
 		 754 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4641  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  43.42 
 
 		 754 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  43.42 
 
 		 754 aa  206  4e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4155  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  43.42 
 
 		 754 aa  206  4e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3127  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  42.49 
 
 		 752 aa  204  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0935  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  41.58 
 
 		 750 aa  203  3e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0273  preprotein translocase subunit SecF  40.79 
 
 		 315 aa  202  7e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  37.82 
 
 		 761 aa  202  8e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1770  protein-export membrane protein SecF  34.97 
 
 		 307 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3211  protein translocase subunit secF  40.74 
 
 		 311 aa  199  3e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2190  preprotein translocase subunit SecF  43.94 
 
 		 315 aa  199  3e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.447622  decreased coverage  0.00319916 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2616  preprotein translocase subunit SecF  37.87 
 
 		 302 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1714  protein-export membrane protein SecF  37.84 
 
 		 316 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.611616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2056  protein-export membrane protein SecF  37.84 
 
 		 337 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.880378  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1201  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  43.23 
 
 		 763 aa  199  6e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.732454  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1312  preprotein translocase subunit SecF  41.01 
 
 		 313 aa  198  9e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.187294  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1404  preprotein translocase subunit SecF  40.73 
 
 		 315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0316508  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1797  preprotein translocase subunit SecF  40.48 
 
 		 307 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1123  preprotein translocase subunit SecF  40.07 
 
 		 315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3110  preprotein translocase subunit SecF  43.18 
 
 		 315 aa  196  3e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01348  protein-export membrane protein SecF  40.47 
 
 		 313 aa  196  5.000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.256718  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1785  preprotein translocase subunit SecF  37.87 
 
 		 301 aa  195  6e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00817769 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0702  preprotein translocase subunit SecF  35.59 
 
 		 316 aa  195  6e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.686375  normal  0.807805 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1473  preprotein translocase subunit SecF  42.7 
 
 		 315 aa  194  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13163  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1450  preprotein translocase subunit SecF  42.8 
 
 		 315 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101016  normal  0.0107257 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2699  preprotein translocase subunit SecF  39.77 
 
 		 315 aa  194  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.584759  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2432  preprotein translocase subunit SecF  38.6 
 
 		 301 aa  193  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.604218  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1489  preprotein translocase subunit SecF  38.1 
 
 		 325 aa  193  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.921272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0687  preprotein translocase subunit SecF  35.19 
 
 		 316 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0235  preprotein translocase subunit SecF  35.19 
 
 		 316 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1385  preprotein translocase subunit SecF  42.42 
 
 		 315 aa  193  3e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00983524  hitchhiker  0.000000302266 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0719  preprotein translocase subunit SecF  35.19 
 
 		 316 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1438  preprotein translocase subunit SecF  42.42 
 
 		 315 aa  193  3e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0107161  hitchhiker  0.00000672809 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3807  preprotein translocase subunit SecF  34.84 
 
 		 316 aa  192  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1275  preprotein translocase subunit SecF  34.15 
 
 		 316 aa  192  5e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3993  preprotein translocase subunit SecF  34.58 
 
 		 316 aa  192  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.117459  normal  0.130054 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3331  preprotein translocase subunit SecF  33.8 
 
 		 316 aa  192  7e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0935512  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0866  preprotein translocase subunit SecF  39.35 
 
 		 302 aa  191  8e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222243  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4342  preprotein translocase subunit SecF  40.22 
 
 		 302 aa  191  9e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.557524  hitchhiker  0.0000000544827 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3374  preprotein translocase subunit SecF  33.8 
 
 		 316 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2426  preprotein translocase subunit SecF  38.97 
 
 		 310 aa  191  1e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3365  preprotein translocase subunit SecF  33.8 
 
 		 316 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2667  preprotein translocase subunit SecF  35.19 
 
 		 316 aa  191  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452274  normal  0.524558 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0879  preprotein translocase subunit SecF  38.99 
 
 		 302 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0954141 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4538  protein-export membrane protein SecF  40.88 
 
 		 320 aa  190  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2879  preprotein translocase subunit SecF  41.67 
 
 		 315 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0152003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1216  protein-export membrane protein SecF  38.25 
 
 		 291 aa  191  2e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0233184  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2334  preprotein translocase subunit SecF  41.83 
 
 		 315 aa  190  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.307818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2101  protein-export membrane protein SecF  40.91 
 
 		 308 aa  190  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.116132  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2804  preprotein translocase subunit SecF  41.67 
 
 		 315 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00594045  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2784  preprotein translocase subunit SecF  41.67 
 
 		 315 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0481367  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0634  preprotein translocase subunit SecF  34.49 
 
 		 316 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2885  preprotein translocase subunit SecF  39.1 
 
 		 310 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0609  preprotein translocase subunit SecF  34.49 
 
 		 316 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1573  preprotein translocase subunit SecF  41.67 
 
 		 315 aa  189  5e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00583403  hitchhiker  0.000000100837 
 
 
-
 
NC_002936  DET0332  preprotein translocase subunit SecF  39.64 
 
 		 301 aa  189  5.999999999999999e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.496269  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0836  preprotein translocase subunit SecF  38.77 
 
 		 302 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3037  protein-export membrane protein SecF  38.27 
 
 		 316 aa  189  7e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2570  preprotein translocase subunit SecF  34.15 
 
 		 313 aa  188  8e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2384  preprotein translocase subunit SecF  34.15 
 
 		 313 aa  188  8e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0300  preprotein translocase subunit SecF  34.15 
 
 		 313 aa  188  8e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1162  preprotein translocase subunit SecF  34.15 
 
 		 313 aa  188  8e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.954336  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2528  preprotein translocase subunit SecF  34.14 
 
 		 316 aa  187  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0511  preprotein translocase subunit SecF  34.97 
 
 		 311 aa  187  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.956081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1302  protein-export membrane protein SecF  42.34 
 
 		 315 aa  187  1e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40450  preprotein translocase subunit SecF  40.79 
 
 		 304 aa  188  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.193489  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2481  preprotein translocase subunit SecF  42.05 
 
 		 315 aa  187  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0456849  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0123  protein-export membrane protein SecF  37.59 
 
 		 293 aa  187  2e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.504249  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0684  preprotein translocase subunit SecF  35.98 
 
 		 309 aa  186  3e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.738953  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1759  preprotein translocase subunit SecF  42.23 
 
 		 315 aa  186  5e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.020465  normal  0.0122623 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2889  preprotein translocase subunit SecF  42.75 
 
 		 315 aa  186  5e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000629469 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>