More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1424 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1424  preprotein translocase subunit SecF  100 
 
 		 280 aa  555  1e-157  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000449698  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  50.9 
 
 		 291 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1271  preprotein translocase subunit SecF  47.86 
 
 		 296 aa  265  5.999999999999999e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1690  preprotein translocase subunit SecF  50.18 
 
 		 310 aa  258  5.0000000000000005e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.113213  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1670  preprotein translocase subunit SecF  49.64 
 
 		 292 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00270917  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  43.42 
 
 		 286 aa  241  7e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  44.84 
 
 		 735 aa  237  1e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1355  preprotein translocase subunit SecF  45 
 
 		 293 aa  230  2e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0626  protein-export membrane protein SecF  42.61 
 
 		 310 aa  222  4.9999999999999996e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000549124  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2737  protein-export membrane protein SecF  41.79 
 
 		 308 aa  218  1e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.468895  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1286  protein-export membrane protein SecF  41.75 
 
 		 305 aa  206  3e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.115107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1463  preprotein translocase subunit SecF  38.57 
 
 		 303 aa  205  9e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000137336  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  39.72 
 
 		 307 aa  204  9e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1907  preprotein translocase subunit SecF  40.73 
 
 		 289 aa  204  1e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0418717  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2196  preprotein translocase subunit SecF  40 
 
 		 289 aa  204  2e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  38.52 
 
 		 759 aa  201  8e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1770  protein-export membrane protein SecF  36.49 
 
 		 307 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4258  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.07 
 
 		 755 aa  199  6e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.36 
 
 		 754 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0705  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.01 
 
 		 754 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4306  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.01 
 
 		 754 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4641  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.01 
 
 		 754 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0537  protein-export membrane protein SecF  38.54 
 
 		 327 aa  196  5.000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000416815  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4545  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.01 
 
 		 754 aa  195  6e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4530  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.01 
 
 		 754 aa  195  6e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.566924  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0562  protein-export membrane protein SecF  38.43 
 
 		 321 aa  195  6e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3127  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.65 
 
 		 752 aa  194  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4155  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.65 
 
 		 754 aa  193  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0935  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.57 
 
 		 750 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4144  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.3 
 
 		 754 aa  192  4e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0997  preprotein translocase subunit SecF  37.2 
 
 		 322 aa  192  4e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4491  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.3 
 
 		 754 aa  192  4e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000282789 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  34.53 
 
 		 989 aa  192  6e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3211  protein translocase subunit secF  40.43 
 
 		 311 aa  192  6e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0080  protein-export membrane protein SecF  37.25 
 
 		 317 aa  191  8e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3037  protein-export membrane protein SecF  40.43 
 
 		 316 aa  191  8e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2885  preprotein translocase subunit SecF  36.52 
 
 		 310 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2101  protein-export membrane protein SecF  40.21 
 
 		 308 aa  191  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.116132  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1231  protein-export membrane protein SecF  39.05 
 
 		 313 aa  191  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1312  preprotein translocase subunit SecF  39.36 
 
 		 313 aa  191  1e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.187294  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1117  preprotein translocase subunit SecF  41.3 
 
 		 316 aa  191  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0273  preprotein translocase subunit SecF  39.07 
 
 		 315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1629  protein-export membrane protein SecD  33.94 
 
 		 748 aa  188  7e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.683752  normal  0.475056 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0012  preprotein translocase subunit SecF  39.38 
 
 		 308 aa  188  8e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000296376  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2513  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.79 
 
 		 750 aa  187  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000183584  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1489  preprotein translocase subunit SecF  36.49 
 
 		 325 aa  187  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.921272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01049  preprotein translocase subunit SecF  35.74 
 
 		 315 aa  187  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0332  preprotein translocase subunit SecF  37.81 
 
 		 301 aa  186  4e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.496269  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2616  preprotein translocase subunit SecF  34.88 
 
 		 302 aa  185  6e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_274  protein-export membrane protein, preprotein translocase SecF subunit  37.01 
 
 		 302 aa  185  7e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00850837  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0123  protein-export membrane protein SecF  37.91 
 
 		 293 aa  185  9e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.504249  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3211  preprotein translocase subunit SecF  38.26 
 
 		 310 aa  185  9e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.828599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1719  preprotein translocase subunit SecF  38.4 
 
 		 302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  34.56 
 
 		 304 aa  184  1.0000000000000001e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  34.56 
 
 		 304 aa  184  1.0000000000000001e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004364  protein-export membrane protein SecF  35.74 
 
 		 315 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0679828  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1797  preprotein translocase subunit SecF  34.93 
 
 		 307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.89 
 
 		 759 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1727  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.89 
 
 		 759 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.347489  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  35.76 
 
 		 740 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1603  protein-export membrane protein SecF  34.06 
 
 		 290 aa  183  3e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.232098  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0855  preprotein translocase subunit SecF  35.82 
 
 		 302 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1904  protein-export membrane protein SecF  36.05 
 
 		 302 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2056  protein-export membrane protein SecF  35.99 
 
 		 337 aa  182  6e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.880378  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1714  protein-export membrane protein SecF  35.99 
 
 		 316 aa  182  7e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.611616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  32.85 
 
 		 761 aa  181  8.000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2644  protein-export membrane protein SecF  38.99 
 
 		 304 aa  181  8.000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0946476  hitchhiker  0.00035144 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01348  protein-export membrane protein SecF  38.41 
 
 		 313 aa  181  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.256718  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0312  preprotein translocase subunit SecF  36.65 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.111019  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0475  preprotein translocase subunit SecF  35.04 
 
 		 323 aa  180  2e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0013  preprotein translocase subunit SecF  37.33 
 
 		 309 aa  180  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245212 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1201  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  41.18 
 
 		 763 aa  180  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.732454  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4310  protein-export membrane protein SecF  35.94 
 
 		 357 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2836  protein translocase subunit secF  35.13 
 
 		 302 aa  179  4e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2432  preprotein translocase subunit SecF  34.41 
 
 		 301 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.604218  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0387  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.52 
 
 		 911 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.807363  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1785  preprotein translocase subunit SecF  33.69 
 
 		 301 aa  178  7e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00817769 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3171  preprotein translocase subunit SecF  41.52 
 
 		 372 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.203608  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.21 
 
 		 856 aa  178  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08751  putative protein-export transmembrane SecDF protein  34.84 
 
 		 1001 aa  178  1e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392094  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0008  preprotein translocase subunit SecF  36.9 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.748405  normal  0.104556 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.85 
 
 		 846 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1216  protein-export membrane protein SecF  37.45 
 
 		 291 aa  176  3e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0233184  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2775  preprotein translocase subunit SecF  39.8 
 
 		 334 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.33037 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5169  protein-export membrane protein SecD  37.79 
 
 		 1029 aa  176  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2190  preprotein translocase subunit SecF  37.32 
 
 		 315 aa  176  3e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.447622  decreased coverage  0.00319916 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6254  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.66 
 
 		 1055 aa  176  4e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4405  preprotein translocase subunit SecF  39.93 
 
 		 335 aa  176  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0338927  normal  0.256135 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0014  preprotein translocase subunit SecF  37.59 
 
 		 311 aa  176  4e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00246116  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0702  preprotein translocase subunit SecF  34.87 
 
 		 316 aa  176  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.686375  normal  0.807805 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2426  preprotein translocase subunit SecF  35.25 
 
 		 310 aa  175  6e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0687  preprotein translocase subunit SecF  33.09 
 
 		 316 aa  175  6e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0235  preprotein translocase subunit SecF  33.09 
 
 		 316 aa  175  6e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2699  preprotein translocase subunit SecF  36.11 
 
 		 315 aa  175  6e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.584759  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0609  preprotein translocase subunit SecF  33.09 
 
 		 316 aa  175  6e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0719  preprotein translocase subunit SecF  33.09 
 
 		 316 aa  175  6e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0634  preprotein translocase subunit SecF  33.09 
 
 		 316 aa  175  6e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3993  preprotein translocase subunit SecF  34.87 
 
 		 316 aa  175  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.117459  normal  0.130054 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1341  protein-export membrane protein SecF  35.93 
 
 		 298 aa  175  8e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1123  preprotein translocase subunit SecF  36.82 
 
 		 315 aa  175  8e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>