More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3037 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3037  protein-export membrane protein SecF  100 
 
 		 316 aa  627  1e-179  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2856  protein-export membrane protein SecF  49.84 
 
 		 318 aa  321  8e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.114618 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4405  preprotein translocase subunit SecF  53.4 
 
 		 335 aa  314  9.999999999999999e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0338927  normal  0.256135 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1768  preprotein translocase subunit SecF  52.2 
 
 		 352 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0148605  normal  0.0118701 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2775  preprotein translocase subunit SecF  53.74 
 
 		 334 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.33037 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1002  protein-export membrane protein SecF  47.94 
 
 		 319 aa  312  3.9999999999999997e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1324  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  51.7 
 
 		 845 aa  308  6.999999999999999e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0375911  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1284  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  51.89 
 
 		 844 aa  306  3e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1860  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  51.36 
 
 		 844 aa  306  3e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  51.38 
 
 		 856 aa  304  1.0000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3171  preprotein translocase subunit SecF  50.16 
 
 		 372 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.203608  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2776  preprotein translocase subunit SecF  50.64 
 
 		 369 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.686561  normal  0.719321 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2731  preprotein translocase subunit SecF  53.06 
 
 		 367 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.447806  normal  0.258523 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4310  protein-export membrane protein SecF  47.59 
 
 		 357 aa  298  6e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0997  preprotein translocase subunit SecF  50.16 
 
 		 322 aa  291  9e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  48.57 
 
 		 839 aa  290  2e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1800  preprotein translocase subunit SecF  50.48 
 
 		 340 aa  289  4e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0690803  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  52.32 
 
 		 856 aa  287  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  48.71 
 
 		 846 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1898  protein translocase subunit secF  47.88 
 
 		 314 aa  283  4.0000000000000003e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186497  normal  0.970453 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  49.33 
 
 		 853 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1713  SecF protein  47.49 
 
 		 327 aa  281  8.000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1085  preprotein translocase subunit SecF  46.75 
 
 		 328 aa  281  1e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.161965 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  45.37 
 
 		 848 aa  279  6e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1415  preprotein translocase subunit SecF  45.62 
 
 		 330 aa  278  7e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.661465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  49.83 
 
 		 846 aa  275  8e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.823548 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  46.9 
 
 		 849 aa  275  8e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0181  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  46.18 
 
 		 844 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4227  protein-export membrane protein SecF  46.13 
 
 		 314 aa  272  7e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4597  protein-export membrane protein SecF  46.13 
 
 		 314 aa  271  8.000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486566  normal  0.106389 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4746  protein-export membrane protein SecF  45.79 
 
 		 314 aa  269  4e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0265427 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1858  preprotein translocase subunit SecF  47.52 
 
 		 320 aa  268  7e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.150957  normal  0.772867 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1799  preprotein translocase subunit SecF  46.03 
 
 		 324 aa  267  2e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0445  preprotein translocase subunit SecF  46.03 
 
 		 324 aa  267  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.222875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0878  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  44.75 
 
 		 834 aa  265  7e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.335263  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0887  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  42.57 
 
 		 785 aa  264  1e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0891  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  42.57 
 
 		 785 aa  265  1e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.983907  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0457  preprotein translocase subunit SecF  45.4 
 
 		 324 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0172615  normal  0.0827508 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2189  protein-export membrane protein SecF  44.2 
 
 		 316 aa  263  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.279609  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01049  preprotein translocase subunit SecF  42.09 
 
 		 315 aa  262  4.999999999999999e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2277  protein-export membrane protein SecF  45.45 
 
 		 313 aa  261  8e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2492  protein-export membrane protein SecF  44.83 
 
 		 316 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.27994  normal  0.326076 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2336  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  43.73 
 
 		 759 aa  261  1e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.217617  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004364  protein-export membrane protein SecF  41.41 
 
 		 315 aa  260  3e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0679828  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3211  protein translocase subunit secF  47.4 
 
 		 311 aa  259  3e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1174  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  50.54 
 
 		 858 aa  258  8e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149804  normal  0.102864 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0273  preprotein translocase subunit SecF  44.11 
 
 		 315 aa  258  1e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1123  preprotein translocase subunit SecF  45.8 
 
 		 315 aa  257  2e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1064  preprotein translocase subunit SecF  42.76 
 
 		 322 aa  256  4e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204402 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2432  preprotein translocase subunit SecF  43.43 
 
 		 316 aa  254  1.0000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  44.67 
 
 		 307 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2065  preprotein translocase subunit SecF  47.24 
 
 		 313 aa  250  3e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0878  preprotein translocase subunit SecF  40.28 
 
 		 323 aa  249  5e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3107  protein-export membrane protein SecF  45.45 
 
 		 316 aa  249  5e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.616457  normal  0.192516 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1454  protein translocase subunit secF  46.31 
 
 		 321 aa  248  7e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.982054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01348  protein-export membrane protein SecF  42.42 
 
 		 313 aa  248  1e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.256718  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3110  preprotein translocase subunit SecF  41.95 
 
 		 315 aa  247  2e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2072  protein translocase subunit secF  41.69 
 
 		 325 aa  245  8e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2426  preprotein translocase subunit SecF  39.93 
 
 		 310 aa  245  9e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1404  preprotein translocase subunit SecF  43.43 
 
 		 315 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0316508  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1330  SecF protein  43.73 
 
 		 338 aa  241  1e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0105179  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3120  preprotein translocase subunit SecF  41.67 
 
 		 322 aa  239  5e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0405125  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3381  preprotein translocase subunit SecF  41.67 
 
 		 322 aa  239  5e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0144101  normal  0.396634 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3261  preprotein translocase subunit SecF  41.67 
 
 		 322 aa  239  5e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.578435  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0475  preprotein translocase subunit SecF  42.5 
 
 		 323 aa  238  1e-61  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1231  protein-export membrane protein SecF  42.76 
 
 		 313 aa  238  1e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2056  protein-export membrane protein SecF  39.62 
 
 		 337 aa  237  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.880378  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2699  preprotein translocase subunit SecF  41.2 
 
 		 315 aa  237  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.584759  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1714  protein-export membrane protein SecF  39.62 
 
 		 316 aa  236  3e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.611616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0708  preprotein translocase subunit SecF  38.39 
 
 		 323 aa  236  6e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00357  protein export protein SecF  38.54 
 
 		 323 aa  235  7e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.797763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3200  protein-export membrane protein SecF  38.54 
 
 		 323 aa  235  7e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0111096  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0328  preprotein translocase subunit SecF  38.54 
 
 		 323 aa  235  7e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.264814  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0508  preprotein translocase subunit SecF  38.54 
 
 		 323 aa  235  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0447  preprotein translocase subunit SecF  38.54 
 
 		 323 aa  235  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0441  preprotein translocase subunit SecF  38.54 
 
 		 323 aa  235  7e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0454  preprotein translocase subunit SecF  38.54 
 
 		 323 aa  235  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0448  preprotein translocase subunit SecF  38.54 
 
 		 323 aa  235  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0479  preprotein translocase subunit SecF  38.54 
 
 		 323 aa  235  7e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3224  preprotein translocase subunit SecF  38.54 
 
 		 323 aa  235  7e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000013674 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00361  hypothetical protein  38.54 
 
 		 323 aa  235  7e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0439  preprotein translocase subunit SecF  38.54 
 
 		 323 aa  235  7e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0467  preprotein translocase subunit SecF  38.54 
 
 		 323 aa  235  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0489  preprotein translocase subunit SecF  38.54 
 
 		 323 aa  235  7e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2080  preprotein translocase subunit SecF  39.53 
 
 		 310 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.348624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1312  preprotein translocase subunit SecF  42.95 
 
 		 313 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.187294  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1620  protein-export membrane protein SecF  37.13 
 
 		 323 aa  233  3e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2349  preprotein translocase subunit SecF  42.77 
 
 		 312 aa  233  3e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1302  protein-export membrane protein SecF  43.81 
 
 		 315 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3094  preprotein translocase subunit SecF  39.58 
 
 		 323 aa  232  5e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278166  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1219  preprotein translocase subunit SecF  47.15 
 
 		 314 aa  232  5e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417925 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1473  preprotein translocase subunit SecF  44.53 
 
 		 315 aa  232  6e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13163  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0684  preprotein translocase subunit SecF  39.86 
 
 		 309 aa  231  1e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.738953  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2784  preprotein translocase subunit SecF  43.89 
 
 		 315 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0481367  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2879  preprotein translocase subunit SecF  43.89 
 
 		 315 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0152003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2811  preprotein translocase subunit SecF  39.93 
 
 		 323 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2804  preprotein translocase subunit SecF  43.89 
 
 		 315 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00594045  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1573  preprotein translocase subunit SecF  43.89 
 
 		 315 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00583403  hitchhiker  0.000000100837 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2947  preprotein translocase subunit SecF  40.14 
 
 		 324 aa  229  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0072  preprotein translocase subunit SecF  37.74 
 
 		 323 aa  229  5e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>