More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2885 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2885  preprotein translocase subunit SecF  100 
 
 
310 aa  612  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3211  preprotein translocase subunit SecF  99.68 
 
 
310 aa  609  1e-173  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.828599  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1027  preprotein translocase subunit SecF  68.28 
 
 
312 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0198826 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5076  preprotein translocase subunit SecF  65.57 
 
 
328 aa  411  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1489  preprotein translocase subunit SecF  62.54 
 
 
325 aa  394  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.921272  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4538  protein-export membrane protein SecF  63.84 
 
 
320 aa  376  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5129  preprotein translocase subunit SecF  62.62 
 
 
336 aa  359  4e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.642857  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0141  preprotein translocase subunit SecF  56.77 
 
 
314 aa  311  1e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1278  preprotein translocase subunit SecF  44.08 
 
 
328 aa  223  4e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.630686  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09531  preprotein translocase subunit SecF  40.45 
 
 
318 aa  215  7e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.14982 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1192  preprotein translocase subunit SecF  45.79 
 
 
329 aa  214  1.9999999999999998e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0283  preprotein translocase subunit SecF  40.13 
 
 
321 aa  213  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.164559  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  40.32 
 
 
286 aa  212  5.999999999999999e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1690  preprotein translocase subunit SecF  40.71 
 
 
310 aa  211  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.113213  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09321  preprotein translocase subunit SecF  42.28 
 
 
304 aa  206  3e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0871  preprotein translocase subunit SecF  39.13 
 
 
304 aa  206  4e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0139488  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16231  preprotein translocase subunit SecF  40.76 
 
 
359 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.205013 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  37.58 
 
 
735 aa  202  5e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09301  preprotein translocase subunit SecF  41.91 
 
 
304 aa  202  8e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.359776  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0080  protein-export membrane protein SecF  36.73 
 
 
317 aa  199  6e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  38.91 
 
 
291 aa  198  9e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10111  preprotein translocase subunit SecF  39.63 
 
 
305 aa  197  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07171  preprotein translocase subunit SecF  44.33 
 
 
322 aa  196  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.434985  normal  0.295105 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3325  protein-export membrane protein SecF  40.51 
 
 
324 aa  196  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1271  preprotein translocase subunit SecF  36.39 
 
 
296 aa  191  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1424  preprotein translocase subunit SecF  36.52 
 
 
280 aa  191  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000449698  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3983  protein-export membrane protein SecF  38.91 
 
 
324 aa  191  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.586193  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  37.37 
 
 
304 aa  188  1e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  37.37 
 
 
304 aa  187  1e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2196  preprotein translocase subunit SecF  36.88 
 
 
289 aa  187  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1907  preprotein translocase subunit SecF  37.54 
 
 
289 aa  187  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0418717  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1463  preprotein translocase subunit SecF  35.53 
 
 
303 aa  183  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000137336  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  32.48 
 
 
989 aa  179  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1719  preprotein translocase subunit SecF  38.26 
 
 
302 aa  177  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  32.48 
 
 
307 aa  178  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2513  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.07 
 
 
750 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000183584  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2737  protein-export membrane protein SecF  35.28 
 
 
308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.468895  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3103  protein-export membrane protein SecF  35.99 
 
 
322 aa  173  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12600  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  33.97 
 
 
977 aa  172  6.999999999999999e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1216  protein-export membrane protein SecF  36.05 
 
 
291 aa  172  9e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0233184  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1670  preprotein translocase subunit SecF  39.1 
 
 
292 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00270917  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1355  preprotein translocase subunit SecF  37.33 
 
 
293 aa  171  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.04 
 
 
759 aa  170  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1727  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.04 
 
 
759 aa  170  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.347489  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1797  preprotein translocase subunit SecF  33.22 
 
 
307 aa  169  5e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0332  preprotein translocase subunit SecF  32.12 
 
 
301 aa  167  2e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.496269  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1340  preprotein translocase subunit SecF  32.72 
 
 
414 aa  167  2e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.265736  normal  0.609901 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01049  preprotein translocase subunit SecF  36.08 
 
 
315 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2443  preprotein translocase subunit SecF  31.55 
 
 
347 aa  166  4e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000105757  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1231  preprotein translocase subunit SecF  35.84 
 
 
303 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.611016  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0935  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.94 
 
 
750 aa  165  8e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  32.45 
 
 
761 aa  165  9e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1785  preprotein translocase subunit SecF  33.22 
 
 
301 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00817769 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  33.21 
 
 
759 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1416  protein-export membrane protein SecF  35.84 
 
 
303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_274  protein-export membrane protein, preprotein translocase SecF subunit  31.79 
 
 
302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00850837  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0855  preprotein translocase subunit SecF  32.59 
 
 
302 aa  163  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2432  preprotein translocase subunit SecF  33.22 
 
 
301 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.604218  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1981  preprotein translocase subunit SecF  34.46 
 
 
305 aa  162  5.0000000000000005e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1976  preprotein translocase subunit SecF  34.46 
 
 
305 aa  162  5.0000000000000005e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004364  protein-export membrane protein SecF  35.1 
 
 
315 aa  162  6e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0679828  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0505  protein-export membrane protein SecF  37.03 
 
 
333 aa  162  6e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0158635  hitchhiker  0.00187348 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2616  preprotein translocase subunit SecF  32.37 
 
 
302 aa  161  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0312  preprotein translocase subunit SecF  30.79 
 
 
301 aa  161  1e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.111019  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2008  preprotein translocase subunit SecF  35.53 
 
 
313 aa  161  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0008  preprotein translocase subunit SecF  32.56 
 
 
311 aa  161  2e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.748405  normal  0.104556 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1231  protein-export membrane protein SecF  39.25 
 
 
313 aa  160  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0866  preprotein translocase subunit SecF  36.56 
 
 
302 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222243  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2584  preprotein translocase subunit SecF  35.58 
 
 
423 aa  160  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.173731  normal  0.904597 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1201  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.73 
 
 
763 aa  160  3e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.732454  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2316  preprotein translocase subunit SecF  34.06 
 
 
417 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.658853  normal  0.312291 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2277  preprotein translocase subunit SecF  34.06 
 
 
417 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1286  protein-export membrane protein SecF  34 
 
 
305 aa  160  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.115107  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2324  preprotein translocase subunit SecF  34.06 
 
 
417 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223224  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0836  preprotein translocase subunit SecF  35.84 
 
 
302 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4144  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.87 
 
 
754 aa  159  6e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4491  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.87 
 
 
754 aa  159  6e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000282789 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0879  preprotein translocase subunit SecF  35.84 
 
 
302 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0954141 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0705  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.87 
 
 
754 aa  158  8e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4155  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.51 
 
 
754 aa  157  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2190  preprotein translocase subunit SecF  38.24 
 
 
315 aa  158  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.447622  decreased coverage  0.00319916 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4306  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.14 
 
 
754 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4545  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.14 
 
 
754 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4641  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.14 
 
 
754 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0997  preprotein translocase subunit SecF  31.19 
 
 
322 aa  157  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4530  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.14 
 
 
754 aa  157  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.566924  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.78 
 
 
754 aa  156  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0387  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.86 
 
 
911 aa  156  4e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.807363  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2426  preprotein translocase subunit SecF  34.47 
 
 
310 aa  156  4e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0946  protein-export membrane protein SecF  31.45 
 
 
349 aa  156  4e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0014  preprotein translocase subunit SecF  31.56 
 
 
311 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00246116  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2065  preprotein translocase subunit SecF  35.91 
 
 
313 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2349  preprotein translocase subunit SecF  36.33 
 
 
312 aa  155  6e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2336  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.16 
 
 
759 aa  155  6e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.217617  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2699  preprotein translocase subunit SecF  38.29 
 
 
315 aa  155  6e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.584759  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2644  protein-export membrane protein SecF  36.3 
 
 
304 aa  155  7e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0946476  hitchhiker  0.00035144 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2080  preprotein translocase subunit SecF  34.29 
 
 
310 aa  155  8e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.348624  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3211  protein translocase subunit secF  36.33 
 
 
311 aa  155  9e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4258  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.58 
 
 
755 aa  155  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2056  protein-export membrane protein SecF  34.67 
 
 
337 aa  154  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.880378  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>