More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1286 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_1286  protein-export membrane protein SecF  100 
 
 		 305 aa  603  9.999999999999999e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.115107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  47.46 
 
 		 286 aa  258  1e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  45.55 
 
 		 291 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1355  preprotein translocase subunit SecF  44.56 
 
 		 293 aa  233  4.0000000000000004e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1424  preprotein translocase subunit SecF  41.75 
 
 		 280 aa  224  2e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000449698  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1271  preprotein translocase subunit SecF  39.43 
 
 		 296 aa  218  7e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0626  protein-export membrane protein SecF  39.38 
 
 		 310 aa  216  5e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000549124  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  37.1 
 
 		 735 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1670  preprotein translocase subunit SecF  43.32 
 
 		 292 aa  212  5.999999999999999e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00270917  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2196  preprotein translocase subunit SecF  38.72 
 
 		 289 aa  212  7.999999999999999e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1690  preprotein translocase subunit SecF  41.94 
 
 		 310 aa  211  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.113213  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1463  preprotein translocase subunit SecF  35.31 
 
 		 303 aa  210  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000137336  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1907  preprotein translocase subunit SecF  39.06 
 
 		 289 aa  211  2e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0418717  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2644  protein-export membrane protein SecF  39.37 
 
 		 304 aa  202  6e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0946476  hitchhiker  0.00035144 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  41.61 
 
 		 307 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2056  protein-export membrane protein SecF  37.67 
 
 		 337 aa  200  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.880378  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  36.75 
 
 		 304 aa  199  3.9999999999999996e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1714  protein-export membrane protein SecF  37.67 
 
 		 316 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.611616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  37.72 
 
 		 304 aa  199  6e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14650  preprotein translocase subunit SecF  38.81 
 
 		 306 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1293  preprotein translocase subunit SecF  38.46 
 
 		 306 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1219  preprotein translocase subunit SecF  40.14 
 
 		 314 aa  196  6e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417925 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1123  preprotein translocase subunit SecF  38.26 
 
 		 315 aa  190  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1231  preprotein translocase subunit SecF  34.92 
 
 		 303 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.611016  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1416  protein-export membrane protein SecF  34.92 
 
 		 303 aa  189  7e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2616  preprotein translocase subunit SecF  35.4 
 
 		 302 aa  187  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3517  preprotein translocase subunit SecF  37.24 
 
 		 305 aa  187  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.943932  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1312  preprotein translocase subunit SecF  38.89 
 
 		 313 aa  187  2e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.187294  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2737  protein-export membrane protein SecF  35.71 
 
 		 308 aa  187  3e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.468895  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0012  preprotein translocase subunit SecF  40.97 
 
 		 308 aa  186  4e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000296376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1064  preprotein translocase subunit SecF  37.28 
 
 		 322 aa  186  4e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204402 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1770  protein-export membrane protein SecF  37.36 
 
 		 307 aa  186  6e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0836  preprotein translocase subunit SecF  36.36 
 
 		 302 aa  185  8e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2836  protein translocase subunit secF  33.11 
 
 		 302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0631  preprotein translocase subunit SecF  37.24 
 
 		 323 aa  183  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0997  preprotein translocase subunit SecF  38.85 
 
 		 322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1235  preprotein translocase subunit SecF  37.5 
 
 		 323 aa  183  3e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.178131  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1110  preprotein translocase subunit SecF  37.5 
 
 		 323 aa  183  3e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1797  preprotein translocase subunit SecF  34.92 
 
 		 307 aa  183  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1981  preprotein translocase subunit SecF  33.45 
 
 		 305 aa  182  4.0000000000000006e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0866  preprotein translocase subunit SecF  35.31 
 
 		 302 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222243  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1976  preprotein translocase subunit SecF  34.18 
 
 		 305 aa  182  6e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004364  protein-export membrane protein SecF  37.88 
 
 		 315 aa  182  6e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0679828  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1216  protein-export membrane protein SecF  38.15 
 
 		 291 aa  182  7e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0233184  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3211  protein translocase subunit secF  39.46 
 
 		 311 aa  182  7e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01049  preprotein translocase subunit SecF  37.54 
 
 		 315 aa  182  9.000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01348  protein-export membrane protein SecF  36.52 
 
 		 313 aa  181  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.256718  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0879  preprotein translocase subunit SecF  34.97 
 
 		 302 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0954141 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2211  preprotein translocase subunit SecF  40.07 
 
 		 314 aa  181  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433949  normal  0.220964 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1302  protein-export membrane protein SecF  38.33 
 
 		 315 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0013  preprotein translocase subunit SecF  39 
 
 		 309 aa  180  2.9999999999999997e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245212 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2885  preprotein translocase subunit SecF  34 
 
 		 310 aa  179  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0123  protein-export membrane protein SecF  35.61 
 
 		 293 aa  179  4e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.504249  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2667  preprotein translocase subunit SecF  32.99 
 
 		 316 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452274  normal  0.524558 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4310  protein-export membrane protein SecF  38.27 
 
 		 357 aa  179  5.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0687  preprotein translocase subunit SecF  32.48 
 
 		 316 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0080  protein-export membrane protein SecF  34.36 
 
 		 317 aa  178  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0027  preprotein translocase subunit SecF  37.89 
 
 		 310 aa  178  1e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4258  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.79 
 
 		 755 aa  177  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0235  preprotein translocase subunit SecF  32.48 
 
 		 316 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0719  preprotein translocase subunit SecF  32.48 
 
 		 316 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4545  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.95 
 
 		 754 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0634  preprotein translocase subunit SecF  32.3 
 
 		 316 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2432  preprotein translocase subunit SecF  37.33 
 
 		 316 aa  177  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4306  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.6 
 
 		 754 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3807  preprotein translocase subunit SecF  32.3 
 
 		 316 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4641  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.6 
 
 		 754 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3993  preprotein translocase subunit SecF  33.21 
 
 		 316 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.117459  normal  0.130054 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0702  preprotein translocase subunit SecF  33.58 
 
 		 316 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.686375  normal  0.807805 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0609  preprotein translocase subunit SecF  32.3 
 
 		 316 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.6 
 
 		 754 aa  176  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0511  preprotein translocase subunit SecF  33.1 
 
 		 311 aa  176  3e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.956081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3127  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.15 
 
 		 752 aa  176  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1231  protein-export membrane protein SecF  39.78 
 
 		 313 aa  177  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0014  preprotein translocase subunit SecF  38.95 
 
 		 311 aa  176  4e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00246116  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4155  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.95 
 
 		 754 aa  176  4e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40450  preprotein translocase subunit SecF  36.79 
 
 		 304 aa  176  5e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.193489  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3331  preprotein translocase subunit SecF  32.3 
 
 		 316 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0935512  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1620  protein-export membrane protein SecF  35.26 
 
 		 323 aa  176  5e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1275  preprotein translocase subunit SecF  32.3 
 
 		 316 aa  176  5e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4342  preprotein translocase subunit SecF  36.36 
 
 		 302 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.557524  hitchhiker  0.0000000544827 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4530  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.6 
 
 		 754 aa  176  6e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.566924  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.86 
 
 		 759 aa  175  7e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1727  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.86 
 
 		 759 aa  175  7e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.347489  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3365  preprotein translocase subunit SecF  32.3 
 
 		 316 aa  175  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3374  preprotein translocase subunit SecF  32.3 
 
 		 316 aa  175  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4144  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.25 
 
 		 754 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1785  preprotein translocase subunit SecF  35.74 
 
 		 301 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00817769 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4491  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.25 
 
 		 754 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000282789 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4618  preprotein translocase subunit SecF  34.92 
 
 		 304 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  34.36 
 
 		 759 aa  174  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5076  preprotein translocase subunit SecF  32.51 
 
 		 328 aa  174  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0705  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.6 
 
 		 754 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3037  protein-export membrane protein SecF  40.36 
 
 		 316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0072  preprotein translocase subunit SecF  36.33 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0013  preprotein translocase subunit SecF  38.28 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000001158  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0008  preprotein translocase subunit SecF  37.41 
 
 		 311 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.748405  normal  0.104556 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0903  protein translocase subunit secF  34.92 
 
 		 318 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000021842  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1489  preprotein translocase subunit SecF  33.33 
 
 		 325 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.921272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2528  preprotein translocase subunit SecF  32.53 
 
 		 316 aa  172  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>