More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0511 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0511  preprotein translocase subunit SecF  100 
 
 
311 aa  632  1e-180  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.956081  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2426  preprotein translocase subunit SecF  72.31 
 
 
310 aa  464  1e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0684  preprotein translocase subunit SecF  68.98 
 
 
309 aa  432  1e-120  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.738953  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4004  preprotein translocase subunit SecF  66.02 
 
 
317 aa  421  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.833906 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0837  preprotein translocase subunit SecF  67.88 
 
 
316 aa  422  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4643  preprotein translocase subunit SecF  65.8 
 
 
317 aa  419  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.410756  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2080  preprotein translocase subunit SecF  66.89 
 
 
310 aa  420  1e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.348624  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3374  preprotein translocase subunit SecF  65.9 
 
 
316 aa  418  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3365  preprotein translocase subunit SecF  65.9 
 
 
316 aa  418  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3354  preprotein translocase subunit SecF  65.7 
 
 
317 aa  420  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2667  preprotein translocase subunit SecF  66.56 
 
 
316 aa  418  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452274  normal  0.524558 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3281  preprotein translocase subunit SecF  67.79 
 
 
314 aa  415  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0339451  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2811  preprotein translocase subunit SecF  65.26 
 
 
323 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3807  preprotein translocase subunit SecF  64.94 
 
 
316 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1275  preprotein translocase subunit SecF  65.57 
 
 
316 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0687  preprotein translocase subunit SecF  66.23 
 
 
316 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3993  preprotein translocase subunit SecF  66.78 
 
 
316 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.117459  normal  0.130054 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0634  preprotein translocase subunit SecF  64.94 
 
 
316 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0235  preprotein translocase subunit SecF  66.23 
 
 
316 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0609  preprotein translocase subunit SecF  65.06 
 
 
316 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0719  preprotein translocase subunit SecF  66.23 
 
 
316 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3331  preprotein translocase subunit SecF  65.57 
 
 
316 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0935512  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0300  preprotein translocase subunit SecF  65.57 
 
 
313 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2716  preprotein translocase subunit SecF  65.26 
 
 
322 aa  412  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.141872 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2384  preprotein translocase subunit SecF  65.57 
 
 
313 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2570  preprotein translocase subunit SecF  65.57 
 
 
313 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2960  preprotein translocase subunit SecF  65.91 
 
 
323 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2947  preprotein translocase subunit SecF  64.61 
 
 
324 aa  414  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0702  preprotein translocase subunit SecF  65.05 
 
 
316 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.686375  normal  0.807805 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1162  preprotein translocase subunit SecF  65.57 
 
 
313 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.954336  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1509  preprotein translocase subunit SecF  65.16 
 
 
324 aa  410  1e-113  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.444089 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2550  preprotein translocase subunit SecF  65.58 
 
 
323 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.341971  normal  0.338499 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2528  preprotein translocase subunit SecF  65.02 
 
 
316 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3410  preprotein translocase subunit SecF  65.59 
 
 
310 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.470733  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1792  preprotein translocase subunit SecF  62.9 
 
 
324 aa  403  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.105598  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4086  preprotein translocase subunit SecF  63.69 
 
 
321 aa  401  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0605459  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3884  preprotein translocase subunit SecF  66.78 
 
 
317 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0703005  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3865  preprotein translocase subunit SecF  64.82 
 
 
317 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4644  preprotein translocase subunit SecF  64.82 
 
 
317 aa  390  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0345  preprotein translocase subunit SecF  59.34 
 
 
344 aa  384  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.105677 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0278  preprotein translocase subunit SecF  58.77 
 
 
344 aa  381  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.182784  normal  0.130689 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5118  preprotein translocase subunit SecF  63 
 
 
319 aa  369  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1219  preprotein translocase subunit SecF  51.32 
 
 
314 aa  307  2.0000000000000002e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.417925 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2065  preprotein translocase subunit SecF  52.15 
 
 
313 aa  299  3e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01348  protein-export membrane protein SecF  48.05 
 
 
313 aa  298  5e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.256718  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1231  protein-export membrane protein SecF  47.54 
 
 
313 aa  298  8e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1123  preprotein translocase subunit SecF  46.82 
 
 
315 aa  288  7e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1330  SecF protein  47.73 
 
 
338 aa  288  9e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0105179  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01049  preprotein translocase subunit SecF  45.45 
 
 
315 aa  288  1e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2644  protein-export membrane protein SecF  49.67 
 
 
304 aa  287  2e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0946476  hitchhiker  0.00035144 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004364  protein-export membrane protein SecF  45.13 
 
 
315 aa  285  5e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0679828  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0273  preprotein translocase subunit SecF  47.08 
 
 
315 aa  284  1.0000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3110  preprotein translocase subunit SecF  47.54 
 
 
315 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1302  protein-export membrane protein SecF  49.34 
 
 
315 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2349  preprotein translocase subunit SecF  47.83 
 
 
312 aa  282  4.0000000000000003e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2432  preprotein translocase subunit SecF  46.64 
 
 
316 aa  281  9e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2056  protein-export membrane protein SecF  44.85 
 
 
337 aa  279  5e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.880378  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1714  protein-export membrane protein SecF  44.85 
 
 
316 aa  278  6e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.611616  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2334  preprotein translocase subunit SecF  47.7 
 
 
315 aa  277  1e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.307818  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0879  preprotein translocase subunit SecF  46.71 
 
 
302 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0954141 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0866  preprotein translocase subunit SecF  47.28 
 
 
302 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222243  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0836  preprotein translocase subunit SecF  46.05 
 
 
302 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2879  preprotein translocase subunit SecF  46.23 
 
 
315 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0152003  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2784  preprotein translocase subunit SecF  46.23 
 
 
315 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0481367  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2804  preprotein translocase subunit SecF  46.23 
 
 
315 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00594045  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2190  preprotein translocase subunit SecF  46.05 
 
 
315 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.447622  decreased coverage  0.00319916 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1404  preprotein translocase subunit SecF  42.43 
 
 
315 aa  268  8e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0316508  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2481  preprotein translocase subunit SecF  45.25 
 
 
315 aa  268  1e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0456849  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1981  preprotein translocase subunit SecF  44.88 
 
 
305 aa  266  2e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1976  preprotein translocase subunit SecF  44.88 
 
 
305 aa  266  2e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1573  preprotein translocase subunit SecF  45.9 
 
 
315 aa  266  2e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00583403  hitchhiker  0.000000100837 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1473  preprotein translocase subunit SecF  45.57 
 
 
315 aa  267  2e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13163  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1385  preprotein translocase subunit SecF  46.89 
 
 
315 aa  267  2e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00983524  hitchhiker  0.000000302266 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1438  preprotein translocase subunit SecF  46.89 
 
 
315 aa  267  2e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0107161  hitchhiker  0.00000672809 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2211  preprotein translocase subunit SecF  44.37 
 
 
314 aa  266  2.9999999999999995e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433949  normal  0.220964 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1231  preprotein translocase subunit SecF  46.6 
 
 
303 aa  266  4e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.611016  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2185  protein-export membrane protein SecF  46.21 
 
 
312 aa  266  5e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1450  preprotein translocase subunit SecF  46.56 
 
 
315 aa  265  7e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101016  normal  0.0107257 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1064  preprotein translocase subunit SecF  41.45 
 
 
322 aa  264  1e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204402 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1416  protein-export membrane protein SecF  46.6 
 
 
303 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1759  preprotein translocase subunit SecF  49.45 
 
 
315 aa  264  1e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.020465  normal  0.0122623 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2699  preprotein translocase subunit SecF  42.76 
 
 
315 aa  263  3e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.584759  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2889  preprotein translocase subunit SecF  47.79 
 
 
315 aa  261  1e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000629469 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4342  preprotein translocase subunit SecF  47.08 
 
 
302 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.557524  hitchhiker  0.0000000544827 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1117  preprotein translocase subunit SecF  45.89 
 
 
316 aa  256  3e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  42.35 
 
 
304 aa  256  4e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  42.35 
 
 
304 aa  256  4e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3517  preprotein translocase subunit SecF  45.72 
 
 
305 aa  255  7e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.943932  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1312  preprotein translocase subunit SecF  42.76 
 
 
313 aa  254  1.0000000000000001e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.187294  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4618  preprotein translocase subunit SecF  46.6 
 
 
304 aa  250  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178717  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2836  protein translocase subunit secF  41.58 
 
 
302 aa  250  2e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1695  preprotein translocase subunit SecF  44.48 
 
 
320 aa  249  4e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1408  protein translocase subunit secF  44.7 
 
 
317 aa  246  4e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1293  preprotein translocase subunit SecF  46.55 
 
 
306 aa  245  8e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00357  protein export protein SecF  39.34 
 
 
323 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.797763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3200  protein-export membrane protein SecF  39.34 
 
 
323 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0111096  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0441  preprotein translocase subunit SecF  39.34 
 
 
323 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00361  hypothetical protein  39.34 
 
 
323 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0439  preprotein translocase subunit SecF  39.34 
 
 
323 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3224  preprotein translocase subunit SecF  39.34 
 
 
323 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000013674 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>