More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1620 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1620  protein-export membrane protein SecF  100 
 
 		 323 aa  634    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0072  preprotein translocase subunit SecF  51.7 
 
 		 323 aa  358  9e-98  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0708  preprotein translocase subunit SecF  51.39 
 
 		 323 aa  357  9.999999999999999e-98  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0631  preprotein translocase subunit SecF  52.63 
 
 		 323 aa  347  1e-94  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1235  preprotein translocase subunit SecF  52.63 
 
 		 323 aa  346  3e-94  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.178131  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1110  preprotein translocase subunit SecF  52.63 
 
 		 323 aa  346  3e-94  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1574  preprotein translocase subunit SecF  53.58 
 
 		 323 aa  335  9e-91  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0475  preprotein translocase subunit SecF  48.77 
 
 		 323 aa  328  8e-89  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0729  preprotein translocase subunit SecF  52.62 
 
 		 323 aa  320  3e-86  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.111579  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1047  preprotein translocase subunit SecF  53.56 
 
 		 323 aa  307  2.0000000000000002e-82  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1064  preprotein translocase subunit SecF  41.1 
 
 		 322 aa  239  5e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204402 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  42.2 
 
 		 307 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0878  preprotein translocase subunit SecF  39.04 
 
 		 323 aa  234  2.0000000000000002e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004364  protein-export membrane protein SecF  39.86 
 
 		 315 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0679828  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2056  protein-export membrane protein SecF  36.59 
 
 		 337 aa  230  2e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.880378  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1714  protein-export membrane protein SecF  36.59 
 
 		 316 aa  230  2e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.611616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0448  preprotein translocase subunit SecF  40.27 
 
 		 323 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0508  preprotein translocase subunit SecF  40.27 
 
 		 323 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0467  preprotein translocase subunit SecF  40.27 
 
 		 323 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0454  preprotein translocase subunit SecF  40.27 
 
 		 323 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0447  preprotein translocase subunit SecF  40.27 
 
 		 323 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3281  preprotein translocase subunit SecF  37.58 
 
 		 314 aa  229  5e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0339451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01049  preprotein translocase subunit SecF  38.82 
 
 		 315 aa  229  5e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0273  preprotein translocase subunit SecF  37.79 
 
 		 315 aa  229  6e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2065  preprotein translocase subunit SecF  40.55 
 
 		 313 aa  229  7e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3037  protein-export membrane protein SecF  37.13 
 
 		 316 aa  227  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01348  protein-export membrane protein SecF  38.98 
 
 		 313 aa  226  3e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.256718  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3381  preprotein translocase subunit SecF  40.07 
 
 		 322 aa  226  4e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0144101  normal  0.396634 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3261  preprotein translocase subunit SecF  40.07 
 
 		 322 aa  226  4e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.578435  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1231  protein-export membrane protein SecF  40.2 
 
 		 313 aa  226  4e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3120  preprotein translocase subunit SecF  40.07 
 
 		 322 aa  226  4e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0405125  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2211  preprotein translocase subunit SecF  40.2 
 
 		 314 aa  225  6e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433949  normal  0.220964 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00357  protein export protein SecF  38.91 
 
 		 323 aa  224  2e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.797763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3200  protein-export membrane protein SecF  38.91 
 
 		 323 aa  224  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0111096  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1123  preprotein translocase subunit SecF  39.61 
 
 		 315 aa  224  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0441  preprotein translocase subunit SecF  38.91 
 
 		 323 aa  224  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3224  preprotein translocase subunit SecF  38.91 
 
 		 323 aa  224  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000013674 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0479  preprotein translocase subunit SecF  38.91 
 
 		 323 aa  224  2e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0511  preprotein translocase subunit SecF  36.93 
 
 		 311 aa  224  2e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.956081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0328  preprotein translocase subunit SecF  38.91 
 
 		 323 aa  224  2e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.264814  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0489  preprotein translocase subunit SecF  38.91 
 
 		 323 aa  224  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00361  hypothetical protein  38.91 
 
 		 323 aa  224  2e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0439  preprotein translocase subunit SecF  38.91 
 
 		 323 aa  224  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3211  protein translocase subunit secF  38.51 
 
 		 311 aa  224  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3410  preprotein translocase subunit SecF  34.71 
 
 		 310 aa  223  4e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.470733  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1302  protein-export membrane protein SecF  44.49 
 
 		 315 aa  223  4e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2903  preprotein translocase subunit SecF  39.38 
 
 		 323 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3094  preprotein translocase subunit SecF  39.04 
 
 		 323 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278166  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1981  preprotein translocase subunit SecF  37.04 
 
 		 305 aa  222  8e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1976  preprotein translocase subunit SecF  37.04 
 
 		 305 aa  222  8e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2644  protein-export membrane protein SecF  40.07 
 
 		 304 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0946476  hitchhiker  0.00035144 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1231  preprotein translocase subunit SecF  35.64 
 
 		 303 aa  219  5e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.611016  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2426  preprotein translocase subunit SecF  37.5 
 
 		 310 aa  218  7.999999999999999e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3517  preprotein translocase subunit SecF  39.58 
 
 		 305 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.943932  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1416  protein-export membrane protein SecF  35.64 
 
 		 303 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1330  SecF protein  39.66 
 
 		 338 aa  218  1e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0105179  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2432  preprotein translocase subunit SecF  37.46 
 
 		 316 aa  218  1e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3110  preprotein translocase subunit SecF  35.22 
 
 		 315 aa  216  4e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0702  preprotein translocase subunit SecF  37.54 
 
 		 316 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.686375  normal  0.807805 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3993  preprotein translocase subunit SecF  37.33 
 
 		 316 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.117459  normal  0.130054 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2716  preprotein translocase subunit SecF  37.62 
 
 		 322 aa  215  8e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.141872 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0684  preprotein translocase subunit SecF  34.82 
 
 		 309 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.738953  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0634  preprotein translocase subunit SecF  37.25 
 
 		 316 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0609  preprotein translocase subunit SecF  37.25 
 
 		 316 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4310  protein-export membrane protein SecF  36.65 
 
 		 357 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2190  preprotein translocase subunit SecF  37.29 
 
 		 315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.447622  decreased coverage  0.00319916 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1385  preprotein translocase subunit SecF  37.5 
 
 		 315 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00983524  hitchhiker  0.000000302266 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1438  preprotein translocase subunit SecF  37.5 
 
 		 315 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0107161  hitchhiker  0.00000672809 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0836  preprotein translocase subunit SecF  37.85 
 
 		 302 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2349  preprotein translocase subunit SecF  40.15 
 
 		 312 aa  212  5.999999999999999e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2667  preprotein translocase subunit SecF  36.91 
 
 		 316 aa  211  9e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452274  normal  0.524558 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1473  preprotein translocase subunit SecF  38.93 
 
 		 315 aa  211  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13163  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1022  preprotein translocase subunit SecF  39.73 
 
 		 324 aa  211  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0879  preprotein translocase subunit SecF  38.19 
 
 		 302 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0954141 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0866  preprotein translocase subunit SecF  37.85 
 
 		 302 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222243  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3288  preprotein translocase subunit SecF  39.73 
 
 		 322 aa  210  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2185  protein-export membrane protein SecF  38.13 
 
 		 312 aa  210  2e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1450  preprotein translocase subunit SecF  37.15 
 
 		 315 aa  211  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101016  normal  0.0107257 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2699  preprotein translocase subunit SecF  36.12 
 
 		 315 aa  210  3e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.584759  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3374  preprotein translocase subunit SecF  36.01 
 
 		 316 aa  209  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3365  preprotein translocase subunit SecF  36.01 
 
 		 316 aa  209  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3331  preprotein translocase subunit SecF  36.01 
 
 		 316 aa  209  5e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0935512  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1275  preprotein translocase subunit SecF  36.01 
 
 		 316 aa  209  5e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1404  preprotein translocase subunit SecF  36.24 
 
 		 315 aa  209  6e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0316508  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2481  preprotein translocase subunit SecF  36.67 
 
 		 315 aa  208  8e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0456849  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3807  preprotein translocase subunit SecF  36.91 
 
 		 316 aa  208  9e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2334  preprotein translocase subunit SecF  37.97 
 
 		 315 aa  208  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.307818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1573  preprotein translocase subunit SecF  36.46 
 
 		 315 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00583403  hitchhiker  0.000000100837 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2879  preprotein translocase subunit SecF  36.46 
 
 		 315 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0152003  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2384  preprotein translocase subunit SecF  35.37 
 
 		 313 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0300  preprotein translocase subunit SecF  35.37 
 
 		 313 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2784  preprotein translocase subunit SecF  36.46 
 
 		 315 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0481367  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1162  preprotein translocase subunit SecF  35.37 
 
 		 313 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.954336  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0600  protein-export membrane protein SecF  35.14 
 
 		 306 aa  207  1e-52  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0687  preprotein translocase subunit SecF  36.58 
 
 		 316 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0235  preprotein translocase subunit SecF  36.58 
 
 		 316 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0719  preprotein translocase subunit SecF  36.58 
 
 		 316 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2804  preprotein translocase subunit SecF  36.46 
 
 		 315 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00594045  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2570  preprotein translocase subunit SecF  35.37 
 
 		 313 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.86 
 
 		 856 aa  207  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>