More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2616 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2616  preprotein translocase subunit SecF  100 
 
 		 302 aa  600  1.0000000000000001e-171  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0855  preprotein translocase subunit SecF  78.81 
 
 		 302 aa  477  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1797  preprotein translocase subunit SecF  68.32 
 
 		 307 aa  422  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1719  preprotein translocase subunit SecF  65.89 
 
 		 302 aa  401  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1785  preprotein translocase subunit SecF  61.92 
 
 		 301 aa  388  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00817769 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2432  preprotein translocase subunit SecF  60.53 
 
 		 301 aa  384  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.604218  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0504  preprotein translocase subunit SecF  64.53 
 
 		 313 aa  374  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.300197  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2008  preprotein translocase subunit SecF  65.23 
 
 		 313 aa  370  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  41.83 
 
 		 307 aa  229  4e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0562  protein-export membrane protein SecF  39.73 
 
 		 321 aa  212  4.9999999999999996e-54  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1714  protein-export membrane protein SecF  40.34 
 
 		 316 aa  210  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.611616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2056  protein-export membrane protein SecF  40.34 
 
 		 337 aa  210  3e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.880378  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3211  protein translocase subunit secF  39.87 
 
 		 311 aa  208  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2443  preprotein translocase subunit SecF  37.03 
 
 		 347 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000105757  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1330  SecF protein  38.14 
 
 		 338 aa  195  7e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0105179  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3464  protein-export membrane protein SecD  36.15 
 
 		 849 aa  194  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.068989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  38.06 
 
 		 286 aa  194  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  36 
 
 		 304 aa  193  3e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  36.24 
 
 		 304 aa  193  3e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  38.49 
 
 		 989 aa  192  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0836  preprotein translocase subunit SecF  35.17 
 
 		 302 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0092  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.92 
 
 		 995 aa  190  2e-47  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1123  preprotein translocase subunit SecF  36.67 
 
 		 315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4310  protein-export membrane protein SecF  35.33 
 
 		 357 aa  190  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0866  preprotein translocase subunit SecF  36.21 
 
 		 302 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222243  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2065  preprotein translocase subunit SecF  36.43 
 
 		 313 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0123  protein-export membrane protein SecF  37.59 
 
 		 293 aa  189  4e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.504249  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0879  preprotein translocase subunit SecF  36.21 
 
 		 302 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0954141 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2836  protein translocase subunit secF  35.25 
 
 		 302 aa  188  8e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0273  preprotein translocase subunit SecF  39.02 
 
 		 315 aa  188  9e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0511  preprotein translocase subunit SecF  36.81 
 
 		 311 aa  188  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.956081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0997  preprotein translocase subunit SecF  37.5 
 
 		 322 aa  188  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01049  preprotein translocase subunit SecF  37.8 
 
 		 315 aa  187  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2349  preprotein translocase subunit SecF  37.37 
 
 		 312 aa  187  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0027  preprotein translocase subunit SecF  37.1 
 
 		 310 aa  187  2e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1670  preprotein translocase subunit SecF  37.87 
 
 		 292 aa  186  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00270917  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  35.09 
 
 		 291 aa  186  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4342  preprotein translocase subunit SecF  36.21 
 
 		 302 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.557524  hitchhiker  0.0000000544827 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3037  protein-export membrane protein SecF  37.46 
 
 		 316 aa  186  4e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1231  protein-export membrane protein SecF  35.22 
 
 		 313 aa  185  6e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1424  preprotein translocase subunit SecF  34.88 
 
 		 280 aa  185  7e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000449698  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0891  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.69 
 
 		 785 aa  185  9e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.983907  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0887  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.69 
 
 		 785 aa  185  9e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1416  protein-export membrane protein SecF  34.83 
 
 		 303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2185  protein-export membrane protein SecF  33.11 
 
 		 312 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1231  preprotein translocase subunit SecF  34.83 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.611016  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0631  preprotein translocase subunit SecF  38.64 
 
 		 323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3110  preprotein translocase subunit SecF  38.67 
 
 		 315 aa  183  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004364  protein-export membrane protein SecF  37.11 
 
 		 315 aa  183  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0679828  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0682  protein-export membrane protein SecF  33.43 
 
 		 357 aa  183  3e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.435801  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1235  preprotein translocase subunit SecF  38.26 
 
 		 323 aa  182  4.0000000000000006e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.178131  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1110  preprotein translocase subunit SecF  38.26 
 
 		 323 aa  182  4.0000000000000006e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1219  preprotein translocase subunit SecF  37.02 
 
 		 314 aa  183  4.0000000000000006e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417925 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0072  preprotein translocase subunit SecF  35.14 
 
 		 323 aa  182  4.0000000000000006e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6254  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.97 
 
 		 1055 aa  182  7e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1115  protein-export membrane protein SecF  37.79 
 
 		 302 aa  182  8.000000000000001e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0847  protein-export membrane protein SecF  37.46 
 
 		 359 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0561071  normal  0.116765 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1404  preprotein translocase subunit SecF  37.11 
 
 		 315 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0316508  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0013  preprotein translocase subunit SecF  37.54 
 
 		 309 aa  182  9.000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245212 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1770  protein-export membrane protein SecF  33.98 
 
 		 307 aa  181  1e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1324  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.23 
 
 		 845 aa  180  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0375911  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1302  protein-export membrane protein SecF  37.11 
 
 		 315 aa  181  2e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0012  preprotein translocase subunit SecF  36.89 
 
 		 308 aa  180  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000296376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1271  preprotein translocase subunit SecF  36.27 
 
 		 296 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0708  preprotein translocase subunit SecF  34.8 
 
 		 323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1620  protein-export membrane protein SecF  33.78 
 
 		 323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.18 
 
 		 762 aa  180  2.9999999999999997e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1284  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.01 
 
 		 844 aa  179  4e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2426  preprotein translocase subunit SecF  35.57 
 
 		 310 aa  179  4e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.75 
 
 		 856 aa  179  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0540  preprotein translocase subunit SecF  31.69 
 
 		 361 aa  178  8e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0258314 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2644  protein-export membrane protein SecF  34.13 
 
 		 304 aa  178  8e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0946476  hitchhiker  0.00035144 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40450  preprotein translocase subunit SecF  36.46 
 
 		 304 aa  178  8e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.193489  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1002  protein-export membrane protein SecF  36.36 
 
 		 319 aa  178  9e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01348  protein-export membrane protein SecF  35.07 
 
 		 313 aa  178  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.256718  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1342  preprotein translocase subunit SecF  32.94 
 
 		 362 aa  178  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0507667  normal  0.548062 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12600  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  35.35 
 
 		 977 aa  177  2e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0013  preprotein translocase subunit SecF  37.22 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000001158  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1860  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.67 
 
 		 844 aa  177  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1981  preprotein translocase subunit SecF  33.22 
 
 		 305 aa  176  3e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1976  preprotein translocase subunit SecF  33.22 
 
 		 305 aa  176  3e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.93 
 
 		 846 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1085  preprotein translocase subunit SecF  36.04 
 
 		 328 aa  177  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.161965 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2432  preprotein translocase subunit SecF  36.9 
 
 		 316 aa  176  4e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1117  preprotein translocase subunit SecF  33.88 
 
 		 316 aa  176  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1858  preprotein translocase subunit SecF  38.03 
 
 		 320 aa  176  5e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.150957  normal  0.772867 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3517  preprotein translocase subunit SecF  35.42 
 
 		 305 aa  175  7e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.943932  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0387  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.67 
 
 		 911 aa  175  7e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.807363  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0080  protein-export membrane protein SecF  37.27 
 
 		 317 aa  175  7e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0626  protein-export membrane protein SecF  34.2 
 
 		 310 aa  175  7e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000549124  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2336  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.15 
 
 		 759 aa  175  8e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.217617  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1690  preprotein translocase subunit SecF  36.27 
 
 		 310 aa  175  8e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.113213  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2699  preprotein translocase subunit SecF  35.31 
 
 		 315 aa  175  8e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.584759  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1238  preprotein translocase subunit SecF  32.94 
 
 		 351 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0014  preprotein translocase subunit SecF  35.97 
 
 		 311 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00246116  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2856  protein-export membrane protein SecF  36.61 
 
 		 318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.114618 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1064  preprotein translocase subunit SecF  31.67 
 
 		 322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204402 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0113  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.3 
 
 		 991 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.758548 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0687  preprotein translocase subunit SecF  33.98 
 
 		 316 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2101  protein-export membrane protein SecF  36.03 
 
 		 308 aa  173  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.116132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>