More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1271 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1271  preprotein translocase subunit SecF  100 
 
 		 296 aa  586  1e-166  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  55.67 
 
 		 291 aa  340  2e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1355  preprotein translocase subunit SecF  54.45 
 
 		 293 aa  320  1.9999999999999998e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1670  preprotein translocase subunit SecF  53.31 
 
 		 292 aa  307  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00270917  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1690  preprotein translocase subunit SecF  51.71 
 
 		 310 aa  288  8e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.113213  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  45.76 
 
 		 735 aa  268  5.9999999999999995e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1424  preprotein translocase subunit SecF  47.86 
 
 		 280 aa  265  5.999999999999999e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000449698  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0080  protein-export membrane protein SecF  43.19 
 
 		 317 aa  237  2e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1463  preprotein translocase subunit SecF  40.14 
 
 		 303 aa  231  8.000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000137336  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  40.64 
 
 		 286 aa  231  1e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01049  preprotein translocase subunit SecF  39.43 
 
 		 315 aa  213  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0626  protein-export membrane protein SecF  38.83 
 
 		 310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000549124  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2737  protein-export membrane protein SecF  38.08 
 
 		 308 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.468895  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0273  preprotein translocase subunit SecF  41.58 
 
 		 315 aa  210  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004364  protein-export membrane protein SecF  39.07 
 
 		 315 aa  209  4e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0679828  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  40.46 
 
 		 307 aa  208  9e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0879  preprotein translocase subunit SecF  42.96 
 
 		 302 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0954141 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1770  protein-export membrane protein SecF  38.38 
 
 		 307 aa  206  4e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1231  preprotein translocase subunit SecF  42.96 
 
 		 303 aa  206  5e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.611016  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2101  protein-export membrane protein SecF  41.14 
 
 		 308 aa  205  8e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.116132  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0123  protein-export membrane protein SecF  39.38 
 
 		 293 aa  205  8e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.504249  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0935  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.28 
 
 		 750 aa  205  9e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0866  preprotein translocase subunit SecF  42.25 
 
 		 302 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222243  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2644  protein-export membrane protein SecF  41.7 
 
 		 304 aa  204  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0946476  hitchhiker  0.00035144 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1416  protein-export membrane protein SecF  42.61 
 
 		 303 aa  203  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2349  preprotein translocase subunit SecF  43.62 
 
 		 312 aa  203  4e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3325  protein-export membrane protein SecF  39.88 
 
 		 324 aa  201  8e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4342  preprotein translocase subunit SecF  42.96 
 
 		 302 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.557524  hitchhiker  0.0000000544827 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4618  preprotein translocase subunit SecF  41.4 
 
 		 304 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1286  protein-export membrane protein SecF  39.43 
 
 		 305 aa  200  3e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.115107  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40450  preprotein translocase subunit SecF  43.8 
 
 		 304 aa  199  3.9999999999999996e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.193489  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3983  protein-export membrane protein SecF  39.94 
 
 		 324 aa  199  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.586193  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1312  preprotein translocase subunit SecF  39.01 
 
 		 313 aa  198  7e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.187294  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0836  preprotein translocase subunit SecF  40.85 
 
 		 302 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1117  preprotein translocase subunit SecF  43.67 
 
 		 316 aa  198  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1275  preprotein translocase subunit SecF  37.97 
 
 		 316 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01348  protein-export membrane protein SecF  41.22 
 
 		 313 aa  197  1.0000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.256718  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  37.76 
 
 		 304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  37.76 
 
 		 304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3331  preprotein translocase subunit SecF  37.63 
 
 		 316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0935512  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2432  preprotein translocase subunit SecF  40 
 
 		 316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1489  preprotein translocase subunit SecF  38.51 
 
 		 325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.921272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3211  protein translocase subunit secF  41.37 
 
 		 311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3110  preprotein translocase subunit SecF  40.94 
 
 		 315 aa  196  3e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3374  preprotein translocase subunit SecF  37.63 
 
 		 316 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3365  preprotein translocase subunit SecF  37.63 
 
 		 316 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1216  protein-export membrane protein SecF  38.93 
 
 		 291 aa  197  3e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0233184  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.67 
 
 		 759 aa  196  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1727  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.67 
 
 		 759 aa  196  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.347489  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0837  preprotein translocase subunit SecF  38.1 
 
 		 316 aa  196  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4538  protein-export membrane protein SecF  39.23 
 
 		 320 aa  196  4.0000000000000005e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0997  preprotein translocase subunit SecF  37.82 
 
 		 322 aa  195  7e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0631  preprotein translocase subunit SecF  37.46 
 
 		 323 aa  195  7e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2667  preprotein translocase subunit SecF  38.18 
 
 		 316 aa  195  9e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452274  normal  0.524558 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1235  preprotein translocase subunit SecF  37.01 
 
 		 323 aa  194  2e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.178131  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3807  preprotein translocase subunit SecF  37.29 
 
 		 316 aa  193  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0235  preprotein translocase subunit SecF  37.63 
 
 		 316 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1110  preprotein translocase subunit SecF  37.01 
 
 		 323 aa  194  2e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0719  preprotein translocase subunit SecF  37.63 
 
 		 316 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0687  preprotein translocase subunit SecF  37.63 
 
 		 316 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0684  preprotein translocase subunit SecF  41.16 
 
 		 309 aa  193  3e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.738953  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2513  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.26 
 
 		 750 aa  193  3e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000183584  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1907  preprotein translocase subunit SecF  34.72 
 
 		 289 aa  193  3e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0418717  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0609  preprotein translocase subunit SecF  37.29 
 
 		 316 aa  193  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0505  protein-export membrane protein SecF  42.9 
 
 		 333 aa  193  3e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0158635  hitchhiker  0.00187348 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0562  protein-export membrane protein SecF  37.59 
 
 		 321 aa  192  4e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2065  preprotein translocase subunit SecF  44.48 
 
 		 313 aa  193  4e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0634  preprotein translocase subunit SecF  37.68 
 
 		 316 aa  192  5e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0511  preprotein translocase subunit SecF  40.07 
 
 		 311 aa  192  5e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.956081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2481  preprotein translocase subunit SecF  41.88 
 
 		 315 aa  192  6e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0456849  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2196  preprotein translocase subunit SecF  34.26 
 
 		 289 aa  192  7e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4004  preprotein translocase subunit SecF  38.25 
 
 		 317 aa  192  8e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.833906 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2384  preprotein translocase subunit SecF  37.63 
 
 		 313 aa  191  9e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0300  preprotein translocase subunit SecF  37.63 
 
 		 313 aa  191  9e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2570  preprotein translocase subunit SecF  37.63 
 
 		 313 aa  191  9e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1162  preprotein translocase subunit SecF  37.63 
 
 		 313 aa  191  9e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.954336  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3354  preprotein translocase subunit SecF  38.25 
 
 		 317 aa  191  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1785  preprotein translocase subunit SecF  36.91 
 
 		 301 aa  191  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00817769 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2885  preprotein translocase subunit SecF  36.39 
 
 		 310 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2432  preprotein translocase subunit SecF  36.95 
 
 		 301 aa  191  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.604218  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  37.82 
 
 		 761 aa  190  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1415  preprotein translocase subunit SecF  37.07 
 
 		 330 aa  190  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.661465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3037  protein-export membrane protein SecF  41.07 
 
 		 316 aa  189  2.9999999999999997e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2699  preprotein translocase subunit SecF  37.55 
 
 		 315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.584759  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2334  preprotein translocase subunit SecF  40.43 
 
 		 315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.307818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  37.92 
 
 		 989 aa  189  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0855  preprotein translocase subunit SecF  35.88 
 
 		 302 aa  189  5e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0332  preprotein translocase subunit SecF  38.87 
 
 		 301 aa  189  5.999999999999999e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.496269  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1123  preprotein translocase subunit SecF  38.75 
 
 		 315 aa  189  5.999999999999999e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1293  preprotein translocase subunit SecF  38.87 
 
 		 306 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1404  preprotein translocase subunit SecF  39.7 
 
 		 315 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0316508  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14650  preprotein translocase subunit SecF  38.87 
 
 		 306 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1064  preprotein translocase subunit SecF  35.19 
 
 		 322 aa  189  7e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204402 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1330  SecF protein  41.73 
 
 		 338 aa  188  9e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0105179  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0705  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.91 
 
 		 754 aa  187  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  39.12 
 
 		 759 aa  188  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4643  preprotein translocase subunit SecF  37.19 
 
 		 317 aa  188  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.410756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1573  preprotein translocase subunit SecF  41.16 
 
 		 315 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00583403  hitchhiker  0.000000100837 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1231  protein-export membrane protein SecF  40.21 
 
 		 313 aa  188  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1473  preprotein translocase subunit SecF  39.71 
 
 		 315 aa  187  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13163  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>