More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2334 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2334  preprotein translocase subunit SecF  100 
 
 		 315 aa  629  1e-179  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.307818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2784  preprotein translocase subunit SecF  85.71 
 
 		 315 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0481367  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1573  preprotein translocase subunit SecF  86.03 
 
 		 315 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00583403  hitchhiker  0.000000100837 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2804  preprotein translocase subunit SecF  85.4 
 
 		 315 aa  531  1e-150  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00594045  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2879  preprotein translocase subunit SecF  85.71 
 
 		 315 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0152003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2699  preprotein translocase subunit SecF  80.95 
 
 		 315 aa  534  1e-150  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.584759  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2481  preprotein translocase subunit SecF  85.08 
 
 		 315 aa  529  1e-149  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0456849  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2889  preprotein translocase subunit SecF  88.89 
 
 		 315 aa  524  1e-148  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000629469 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1759  preprotein translocase subunit SecF  88.25 
 
 		 315 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.020465  normal  0.0122623 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1385  preprotein translocase subunit SecF  84.13 
 
 		 315 aa  512  1e-144  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00983524  hitchhiker  0.000000302266 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1450  preprotein translocase subunit SecF  83.81 
 
 		 315 aa  511  1e-144  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101016  normal  0.0107257 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1438  preprotein translocase subunit SecF  84.13 
 
 		 315 aa  512  1e-144  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0107161  hitchhiker  0.00000672809 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3110  preprotein translocase subunit SecF  76.19 
 
 		 315 aa  508  1e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2190  preprotein translocase subunit SecF  82.86 
 
 		 315 aa  508  1e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.447622  decreased coverage  0.00319916 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1473  preprotein translocase subunit SecF  82.54 
 
 		 315 aa  508  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13163  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1404  preprotein translocase subunit SecF  77.46 
 
 		 315 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0316508  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01049  preprotein translocase subunit SecF  59.49 
 
 		 315 aa  383  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01348  protein-export membrane protein SecF  58.92 
 
 		 313 aa  381  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.256718  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004364  protein-export membrane protein SecF  58.23 
 
 		 315 aa  374  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0679828  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1231  protein-export membrane protein SecF  58.97 
 
 		 313 aa  373  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2432  preprotein translocase subunit SecF  59.31 
 
 		 316 aa  368  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1123  preprotein translocase subunit SecF  57.91 
 
 		 315 aa  367  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2211  preprotein translocase subunit SecF  59.87 
 
 		 314 aa  363  2e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433949  normal  0.220964 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0273  preprotein translocase subunit SecF  59.18 
 
 		 315 aa  363  2e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1064  preprotein translocase subunit SecF  56.39 
 
 		 322 aa  360  2e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204402 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0878  preprotein translocase subunit SecF  52.6 
 
 		 323 aa  330  3e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2903  preprotein translocase subunit SecF  56.49 
 
 		 323 aa  328  8e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0467  preprotein translocase subunit SecF  51.95 
 
 		 323 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0454  preprotein translocase subunit SecF  51.95 
 
 		 323 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0508  preprotein translocase subunit SecF  51.95 
 
 		 323 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0448  preprotein translocase subunit SecF  51.95 
 
 		 323 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0447  preprotein translocase subunit SecF  51.95 
 
 		 323 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3094  preprotein translocase subunit SecF  55.05 
 
 		 323 aa  325  4.0000000000000003e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278166  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00357  protein export protein SecF  50.97 
 
 		 323 aa  323  2e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.797763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3200  protein-export membrane protein SecF  50.97 
 
 		 323 aa  323  2e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0111096  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0441  preprotein translocase subunit SecF  50.97 
 
 		 323 aa  323  2e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0439  preprotein translocase subunit SecF  50.97 
 
 		 323 aa  323  2e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3120  preprotein translocase subunit SecF  54.1 
 
 		 322 aa  323  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0405125  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3261  preprotein translocase subunit SecF  54.1 
 
 		 322 aa  323  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.578435  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0489  preprotein translocase subunit SecF  50.97 
 
 		 323 aa  323  2e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3224  preprotein translocase subunit SecF  50.97 
 
 		 323 aa  323  2e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000013674 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0479  preprotein translocase subunit SecF  50.97 
 
 		 323 aa  323  2e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00361  hypothetical protein  50.97 
 
 		 323 aa  323  2e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3381  preprotein translocase subunit SecF  54.1 
 
 		 322 aa  323  2e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0144101  normal  0.396634 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0328  preprotein translocase subunit SecF  50.97 
 
 		 323 aa  323  2e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.264814  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2065  preprotein translocase subunit SecF  56.44 
 
 		 313 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1022  preprotein translocase subunit SecF  52.13 
 
 		 324 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1219  preprotein translocase subunit SecF  56.46 
 
 		 314 aa  300  3e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417925 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3288  preprotein translocase subunit SecF  51.15 
 
 		 322 aa  298  1e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1330  SecF protein  53.8 
 
 		 338 aa  291  1e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0105179  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2349  preprotein translocase subunit SecF  56.36 
 
 		 312 aa  288  9e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2644  protein-export membrane protein SecF  52.03 
 
 		 304 aa  287  2e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0946476  hitchhiker  0.00035144 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4643  preprotein translocase subunit SecF  45.63 
 
 		 317 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.410756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0511  preprotein translocase subunit SecF  47.7 
 
 		 311 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.956081  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1981  preprotein translocase subunit SecF  47.32 
 
 		 305 aa  284  2.0000000000000002e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1976  preprotein translocase subunit SecF  47.32 
 
 		 305 aa  283  2.0000000000000002e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2080  preprotein translocase subunit SecF  47.4 
 
 		 310 aa  282  6.000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.348624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  49.19 
 
 		 304 aa  280  2e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1275  preprotein translocase subunit SecF  47.71 
 
 		 316 aa  280  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  49.19 
 
 		 304 aa  280  2e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3374  preprotein translocase subunit SecF  47.39 
 
 		 316 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3365  preprotein translocase subunit SecF  47.39 
 
 		 316 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3281  preprotein translocase subunit SecF  45.95 
 
 		 314 aa  278  6e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0339451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2811  preprotein translocase subunit SecF  45.54 
 
 		 323 aa  278  6e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3331  preprotein translocase subunit SecF  47.23 
 
 		 316 aa  278  6e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0935512  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2947  preprotein translocase subunit SecF  46.47 
 
 		 324 aa  278  6e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0687  preprotein translocase subunit SecF  46.93 
 
 		 316 aa  278  7e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0235  preprotein translocase subunit SecF  46.93 
 
 		 316 aa  278  7e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0719  preprotein translocase subunit SecF  46.93 
 
 		 316 aa  278  7e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2960  preprotein translocase subunit SecF  46.18 
 
 		 323 aa  278  8e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2550  preprotein translocase subunit SecF  46.18 
 
 		 323 aa  278  8e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.341971  normal  0.338499 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2426  preprotein translocase subunit SecF  47.37 
 
 		 310 aa  278  8e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3993  preprotein translocase subunit SecF  47.56 
 
 		 316 aa  278  8e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.117459  normal  0.130054 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3807  preprotein translocase subunit SecF  46.28 
 
 		 316 aa  278  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0879  preprotein translocase subunit SecF  47.18 
 
 		 302 aa  277  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0954141 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0702  preprotein translocase subunit SecF  47.56 
 
 		 316 aa  278  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.686375  normal  0.807805 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2570  preprotein translocase subunit SecF  47.06 
 
 		 313 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4004  preprotein translocase subunit SecF  44.98 
 
 		 317 aa  276  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.833906 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1162  preprotein translocase subunit SecF  47.06 
 
 		 313 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.954336  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2384  preprotein translocase subunit SecF  47.06 
 
 		 313 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0866  preprotein translocase subunit SecF  47.18 
 
 		 302 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222243  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1312  preprotein translocase subunit SecF  49.16 
 
 		 313 aa  277  2e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.187294  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0300  preprotein translocase subunit SecF  47.06 
 
 		 313 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0836  preprotein translocase subunit SecF  46.18 
 
 		 302 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0609  preprotein translocase subunit SecF  47.1 
 
 		 316 aa  276  3e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1231  preprotein translocase subunit SecF  48.15 
 
 		 303 aa  276  4e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.611016  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2528  preprotein translocase subunit SecF  46.58 
 
 		 316 aa  276  5e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3354  preprotein translocase subunit SecF  44.66 
 
 		 317 aa  275  7e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0684  preprotein translocase subunit SecF  45.78 
 
 		 309 aa  275  8e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.738953  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0634  preprotein translocase subunit SecF  46.28 
 
 		 316 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2667  preprotein translocase subunit SecF  46.6 
 
 		 316 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452274  normal  0.524558 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1302  protein-export membrane protein SecF  50.97 
 
 		 315 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0600  protein-export membrane protein SecF  46.02 
 
 		 306 aa  275  1.0000000000000001e-72  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1416  protein-export membrane protein SecF  47.81 
 
 		 303 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2716  preprotein translocase subunit SecF  44.9 
 
 		 322 aa  272  5.000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.141872 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2185  protein-export membrane protein SecF  45.83 
 
 		 312 aa  271  9e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3865  preprotein translocase subunit SecF  44.34 
 
 		 317 aa  268  1e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1408  protein translocase subunit secF  48.4 
 
 		 317 aa  267  2e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1792  preprotein translocase subunit SecF  45.03 
 
 		 324 aa  265  8.999999999999999e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.105598  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1509  preprotein translocase subunit SecF  45.03 
 
 		 324 aa  265  8.999999999999999e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.444089 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>