More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1278 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1278  preprotein translocase subunit SecF  100 
 
 		 328 aa  642    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.630686  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1192  preprotein translocase subunit SecF  82.15 
 
 		 329 aa  484  1e-136  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16231  preprotein translocase subunit SecF  72.45 
 
 		 359 aa  411  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.205013 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07171  preprotein translocase subunit SecF  61.76 
 
 		 322 aa  362  3e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.434985  normal  0.295105 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0283  preprotein translocase subunit SecF  58.22 
 
 		 321 aa  358  6e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.164559  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09531  preprotein translocase subunit SecF  57.89 
 
 		 318 aa  356  2.9999999999999997e-97  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.14982 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1489  preprotein translocase subunit SecF  43.45 
 
 		 325 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.921272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0871  preprotein translocase subunit SecF  39.55 
 
 		 304 aa  251  8.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0139488  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09321  preprotein translocase subunit SecF  38.91 
 
 		 304 aa  249  4e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09301  preprotein translocase subunit SecF  38.59 
 
 		 304 aa  243  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.359776  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10111  preprotein translocase subunit SecF  42.09 
 
 		 305 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5076  preprotein translocase subunit SecF  41.27 
 
 		 328 aa  239  5e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2885  preprotein translocase subunit SecF  44.08 
 
 		 310 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4538  protein-export membrane protein SecF  43.23 
 
 		 320 aa  227  2e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3211  preprotein translocase subunit SecF  44.6 
 
 		 310 aa  225  8e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.828599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5129  preprotein translocase subunit SecF  42.86 
 
 		 336 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.642857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0141  preprotein translocase subunit SecF  44.52 
 
 		 314 aa  210  3e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1027  preprotein translocase subunit SecF  39.49 
 
 		 312 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0198826 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  33.87 
 
 		 286 aa  163  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  35.64 
 
 		 304 aa  160  3e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  36.39 
 
 		 304 aa  160  3e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2947  preprotein translocase subunit SecF  34.41 
 
 		 324 aa  159  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2811  preprotein translocase subunit SecF  34.77 
 
 		 323 aa  159  8e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3281  preprotein translocase subunit SecF  35.87 
 
 		 314 aa  156  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0339451  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0836  preprotein translocase subunit SecF  35.15 
 
 		 302 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1509  preprotein translocase subunit SecF  33.81 
 
 		 324 aa  155  6e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.444089 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1792  preprotein translocase subunit SecF  33.81 
 
 		 324 aa  155  7e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.105598  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004364  protein-export membrane protein SecF  35.37 
 
 		 315 aa  155  8e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0679828  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01049  preprotein translocase subunit SecF  33.95 
 
 		 315 aa  155  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1064  preprotein translocase subunit SecF  34.73 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204402 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3374  preprotein translocase subunit SecF  32.59 
 
 		 316 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3365  preprotein translocase subunit SecF  32.59 
 
 		 316 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3211  protein translocase subunit secF  37.14 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3331  preprotein translocase subunit SecF  32.59 
 
 		 316 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0935512  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2384  preprotein translocase subunit SecF  33.55 
 
 		 313 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0300  preprotein translocase subunit SecF  33.55 
 
 		 313 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0235  preprotein translocase subunit SecF  34.91 
 
 		 316 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0687  preprotein translocase subunit SecF  34.91 
 
 		 316 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0719  preprotein translocase subunit SecF  34.91 
 
 		 316 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2570  preprotein translocase subunit SecF  33.55 
 
 		 313 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1162  preprotein translocase subunit SecF  33.55 
 
 		 313 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.954336  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3807  preprotein translocase subunit SecF  34.55 
 
 		 316 aa  153  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1275  preprotein translocase subunit SecF  32.27 
 
 		 316 aa  152  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1785  preprotein translocase subunit SecF  31.65 
 
 		 301 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00817769 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0866  preprotein translocase subunit SecF  35.15 
 
 		 302 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222243  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  31.79 
 
 		 307 aa  152  8e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0855  preprotein translocase subunit SecF  34.52 
 
 		 302 aa  152  8e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2699  preprotein translocase subunit SecF  35.17 
 
 		 315 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.584759  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0879  preprotein translocase subunit SecF  34.81 
 
 		 302 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0954141 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  33.9 
 
 		 291 aa  151  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2080  preprotein translocase subunit SecF  34.77 
 
 		 310 aa  150  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.348624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2836  protein translocase subunit secF  36.75 
 
 		 302 aa  151  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1231  protein-export membrane protein SecF  33.65 
 
 		 313 aa  150  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0080  protein-export membrane protein SecF  34.84 
 
 		 317 aa  149  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2737  protein-export membrane protein SecF  33.33 
 
 		 308 aa  149  6e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.468895  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2616  preprotein translocase subunit SecF  30.91 
 
 		 302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0702  preprotein translocase subunit SecF  34.31 
 
 		 316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.686375  normal  0.807805 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3410  preprotein translocase subunit SecF  34.31 
 
 		 310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.470733  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2432  preprotein translocase subunit SecF  30.7 
 
 		 301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.604218  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0708  preprotein translocase subunit SecF  31.75 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2528  preprotein translocase subunit SecF  35.27 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3993  preprotein translocase subunit SecF  34.55 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.117459  normal  0.130054 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1719  preprotein translocase subunit SecF  32.51 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1424  preprotein translocase subunit SecF  31.21 
 
 		 280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000449698  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  33.11 
 
 		 735 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0634  preprotein translocase subunit SecF  34.07 
 
 		 316 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0609  preprotein translocase subunit SecF  34.07 
 
 		 316 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2667  preprotein translocase subunit SecF  34.31 
 
 		 316 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452274  normal  0.524558 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2716  preprotein translocase subunit SecF  32.49 
 
 		 322 aa  146  6e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.141872 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2550  preprotein translocase subunit SecF  32.97 
 
 		 323 aa  146  6e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.341971  normal  0.338499 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2426  preprotein translocase subunit SecF  35.9 
 
 		 310 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2960  preprotein translocase subunit SecF  32.97 
 
 		 323 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4086  preprotein translocase subunit SecF  32.38 
 
 		 321 aa  145  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0605459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2185  protein-export membrane protein SecF  30.13 
 
 		 312 aa  145  1e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2211  preprotein translocase subunit SecF  33.9 
 
 		 314 aa  145  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433949  normal  0.220964 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1085  preprotein translocase subunit SecF  33.11 
 
 		 328 aa  144  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.161965 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0447  preprotein translocase subunit SecF  33.65 
 
 		 323 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1271  preprotein translocase subunit SecF  33.22 
 
 		 296 aa  144  3e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4342  preprotein translocase subunit SecF  34.81 
 
 		 302 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.557524  hitchhiker  0.0000000544827 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0454  preprotein translocase subunit SecF  33.65 
 
 		 323 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0448  preprotein translocase subunit SecF  33.65 
 
 		 323 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0467  preprotein translocase subunit SecF  33.65 
 
 		 323 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0508  preprotein translocase subunit SecF  33.65 
 
 		 323 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1216  protein-export membrane protein SecF  34.44 
 
 		 291 aa  143  4e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0233184  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3884  preprotein translocase subunit SecF  33.09 
 
 		 317 aa  143  5e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0703005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2879  preprotein translocase subunit SecF  33.44 
 
 		 315 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0152003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2804  preprotein translocase subunit SecF  33.44 
 
 		 315 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00594045  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0511  preprotein translocase subunit SecF  33.46 
 
 		 311 aa  142  6e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.956081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4310  protein-export membrane protein SecF  35.98 
 
 		 357 aa  142  6e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2784  preprotein translocase subunit SecF  33.44 
 
 		 315 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0481367  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0684  preprotein translocase subunit SecF  33.69 
 
 		 309 aa  142  8e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.738953  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1117  preprotein translocase subunit SecF  34.8 
 
 		 316 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0072  preprotein translocase subunit SecF  31.99 
 
 		 323 aa  141  9.999999999999999e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4644  preprotein translocase subunit SecF  33.57 
 
 		 317 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1404  preprotein translocase subunit SecF  35.64 
 
 		 315 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0316508  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3200  protein-export membrane protein SecF  32.69 
 
 		 323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0111096  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2056  protein-export membrane protein SecF  33.03 
 
 		 337 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.880378  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00361  hypothetical protein  32.69 
 
 		 323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0439  preprotein translocase subunit SecF  32.69 
 
 		 323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0441  preprotein translocase subunit SecF  32.69 
 
 		 323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>