More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0871 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0871  preprotein translocase subunit SecF  100 
 
 		 304 aa  591  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0139488  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09301  preprotein translocase subunit SecF  97.37 
 
 		 304 aa  557  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.359776  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09321  preprotein translocase subunit SecF  96.05 
 
 		 304 aa  550  1e-156  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10111  preprotein translocase subunit SecF  77.48 
 
 		 305 aa  466  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09531  preprotein translocase subunit SecF  43.18 
 
 		 318 aa  265  5.999999999999999e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.14982 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0283  preprotein translocase subunit SecF  43.83 
 
 		 321 aa  265  5.999999999999999e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.164559  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1278  preprotein translocase subunit SecF  39.55 
 
 		 328 aa  238  6.999999999999999e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.630686  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16231  preprotein translocase subunit SecF  43.28 
 
 		 359 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.205013 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1192  preprotein translocase subunit SecF  41.97 
 
 		 329 aa  229  6e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07171  preprotein translocase subunit SecF  45.67 
 
 		 322 aa  227  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.434985  normal  0.295105 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5129  preprotein translocase subunit SecF  41.99 
 
 		 336 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.642857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2885  preprotein translocase subunit SecF  39.13 
 
 		 310 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5076  preprotein translocase subunit SecF  39.33 
 
 		 328 aa  204  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3211  preprotein translocase subunit SecF  40.07 
 
 		 310 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.828599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1489  preprotein translocase subunit SecF  38.97 
 
 		 325 aa  192  5e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.921272  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4538  protein-export membrane protein SecF  38.05 
 
 		 320 aa  182  4.0000000000000006e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0141  preprotein translocase subunit SecF  40 
 
 		 314 aa  177  2e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1027  preprotein translocase subunit SecF  38.69 
 
 		 312 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0198826 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  34.78 
 
 		 735 aa  156  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  35.12 
 
 		 286 aa  153  4e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  35.85 
 
 		 304 aa  152  7e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  35.85 
 
 		 304 aa  152  8e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2737  protein-export membrane protein SecF  35.76 
 
 		 308 aa  150  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.468895  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1719  preprotein translocase subunit SecF  34.44 
 
 		 302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  36.06 
 
 		 291 aa  146  5e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1085  preprotein translocase subunit SecF  33.33 
 
 		 328 aa  144  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.161965 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1797  preprotein translocase subunit SecF  33.55 
 
 		 307 aa  145  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  31.21 
 
 		 761 aa  143  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1424  preprotein translocase subunit SecF  33.33 
 
 		 280 aa  142  9e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000449698  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1690  preprotein translocase subunit SecF  32.67 
 
 		 310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.113213  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004364  protein-export membrane protein SecF  32.57 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0679828  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2616  preprotein translocase subunit SecF  30.62 
 
 		 302 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  30.96 
 
 		 989 aa  139  8.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1219  preprotein translocase subunit SecF  32.21 
 
 		 314 aa  139  8.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417925 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01049  preprotein translocase subunit SecF  33.11 
 
 		 315 aa  138  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  29.28 
 
 		 307 aa  138  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0855  preprotein translocase subunit SecF  31.27 
 
 		 302 aa  137  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0997  preprotein translocase subunit SecF  33.33 
 
 		 322 aa  137  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0008  preprotein translocase subunit SecF  32.75 
 
 		 311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.748405  normal  0.104556 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1785  preprotein translocase subunit SecF  32.95 
 
 		 301 aa  136  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00817769 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1713  SecF protein  33.95 
 
 		 327 aa  136  4e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2185  protein-export membrane protein SecF  32.71 
 
 		 312 aa  136  6.0000000000000005e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2080  preprotein translocase subunit SecF  32.24 
 
 		 310 aa  135  7.000000000000001e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.348624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0273  preprotein translocase subunit SecF  34.54 
 
 		 315 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0866  preprotein translocase subunit SecF  31.34 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222243  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1271  preprotein translocase subunit SecF  32.97 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0879  preprotein translocase subunit SecF  31.34 
 
 		 302 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0954141 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0475  preprotein translocase subunit SecF  30.8 
 
 		 323 aa  133  3.9999999999999996e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0014  preprotein translocase subunit SecF  33.21 
 
 		 311 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00246116  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1770  protein-export membrane protein SecF  30.99 
 
 		 307 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1064  preprotein translocase subunit SecF  30.74 
 
 		 322 aa  132  5e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204402 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2432  preprotein translocase subunit SecF  33.01 
 
 		 316 aa  132  6e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  34.59 
 
 		 759 aa  131  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0012  preprotein translocase subunit SecF  32.46 
 
 		 308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000296376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1454  protein-export membrane protein SecF  31.97 
 
 		 308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0298464  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2432  preprotein translocase subunit SecF  32.95 
 
 		 301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.604218  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1799  preprotein translocase subunit SecF  29.87 
 
 		 324 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1404  preprotein translocase subunit SecF  30.6 
 
 		 315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0316508  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0836  preprotein translocase subunit SecF  30.97 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0445  preprotein translocase subunit SecF  29.56 
 
 		 324 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.222875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1355  preprotein translocase subunit SecF  32.45 
 
 		 293 aa  129  4.0000000000000003e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2008  preprotein translocase subunit SecF  32.35 
 
 		 313 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5169  protein-export membrane protein SecD  33.57 
 
 		 1029 aa  130  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325981  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4144  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.71 
 
 		 754 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1981  preprotein translocase subunit SecF  30.35 
 
 		 305 aa  129  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1976  preprotein translocase subunit SecF  30.35 
 
 		 305 aa  129  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0080  protein-export membrane protein SecF  32 
 
 		 317 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3807  preprotein translocase subunit SecF  28.38 
 
 		 316 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0504  preprotein translocase subunit SecF  31.48 
 
 		 313 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.300197  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0687  preprotein translocase subunit SecF  28.38 
 
 		 316 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0235  preprotein translocase subunit SecF  28.38 
 
 		 316 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0719  preprotein translocase subunit SecF  28.38 
 
 		 316 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4491  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.71 
 
 		 754 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000282789 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1123  preprotein translocase subunit SecF  30.17 
 
 		 315 aa  129  6e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2947  preprotein translocase subunit SecF  28.39 
 
 		 324 aa  129  7.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12600  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  31.3 
 
 		 977 aa  128  9.000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0027  preprotein translocase subunit SecF  32.47 
 
 		 310 aa  129  9.000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.33 
 
 		 754 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1278  preprotein translocase subunit SecF  31.46 
 
 		 414 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000278006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2426  preprotein translocase subunit SecF  29.08 
 
 		 310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1231  protein-export membrane protein SecF  31.56 
 
 		 313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3884  preprotein translocase subunit SecF  28.24 
 
 		 317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0703005  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  30.56 
 
 		 740 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4306  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.96 
 
 		 754 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4155  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.33 
 
 		 754 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2811  preprotein translocase subunit SecF  28.2 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4641  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.96 
 
 		 754 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4342  preprotein translocase subunit SecF  31.72 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.557524  hitchhiker  0.0000000544827 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0634  preprotein translocase subunit SecF  28.38 
 
 		 316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4258  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.21 
 
 		 755 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4545  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.96 
 
 		 754 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0609  preprotein translocase subunit SecF  28.38 
 
 		 316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3037  protein-export membrane protein SecF  33.46 
 
 		 316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4530  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.58 
 
 		 754 aa  127  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.566924  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1107  preprotein translocase subunit SecF  31.85 
 
 		 414 aa  127  3e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0908186  normal  0.232496 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0702  preprotein translocase subunit SecF  30.56 
 
 		 316 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.686375  normal  0.807805 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2667  preprotein translocase subunit SecF  28.38 
 
 		 316 aa  127  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452274  normal  0.524558 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1275  preprotein translocase subunit SecF  27.72 
 
 		 316 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0878  preprotein translocase subunit SecF  29.47 
 
 		 323 aa  126  4.0000000000000003e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.89 
 
 		 762 aa  126  4.0000000000000003e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>