More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1278 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1278  preprotein translocase subunit SecF  100 
 
 		 414 aa  830    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000278006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1107  preprotein translocase subunit SecF  95.65 
 
 		 414 aa  763    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0908186  normal  0.232496 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0940  preprotein translocase subunit SecF  77.04 
 
 		 398 aa  479  1e-134  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.494806 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01348  protein-export membrane protein SecF  44.33 
 
 		 313 aa  255  9e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.256718  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1231  protein-export membrane protein SecF  44.41 
 
 		 313 aa  251  2e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  44.83 
 
 		 304 aa  242  7e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  44.83 
 
 		 304 aa  242  7e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0836  preprotein translocase subunit SecF  44.22 
 
 		 302 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0879  preprotein translocase subunit SecF  44.44 
 
 		 302 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0954141 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0866  preprotein translocase subunit SecF  44.7 
 
 		 302 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222243  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2644  protein-export membrane protein SecF  41.58 
 
 		 304 aa  239  5.999999999999999e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0946476  hitchhiker  0.00035144 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2211  preprotein translocase subunit SecF  42.99 
 
 		 314 aa  239  6.999999999999999e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433949  normal  0.220964 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1123  preprotein translocase subunit SecF  42.24 
 
 		 315 aa  238  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2065  preprotein translocase subunit SecF  48.16 
 
 		 313 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004364  protein-export membrane protein SecF  39.35 
 
 		 315 aa  233  5e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0679828  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01049  preprotein translocase subunit SecF  39.54 
 
 		 315 aa  233  6e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1231  preprotein translocase subunit SecF  43.96 
 
 		 303 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.611016  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0684  preprotein translocase subunit SecF  40.13 
 
 		 309 aa  232  9e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.738953  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3110  preprotein translocase subunit SecF  39.87 
 
 		 315 aa  232  9e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0511  preprotein translocase subunit SecF  41.64 
 
 		 311 aa  232  9e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.956081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40450  preprotein translocase subunit SecF  45.93 
 
 		 304 aa  232  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.193489  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1416  protein-export membrane protein SecF  43.96 
 
 		 303 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1219  preprotein translocase subunit SecF  43.23 
 
 		 314 aa  231  2e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417925 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1408  protein translocase subunit secF  44.19 
 
 		 317 aa  230  3e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1404  preprotein translocase subunit SecF  40.07 
 
 		 315 aa  230  3e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0316508  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2334  preprotein translocase subunit SecF  42.91 
 
 		 315 aa  229  7e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.307818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4618  preprotein translocase subunit SecF  44.67 
 
 		 304 aa  229  7e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2836  protein translocase subunit secF  43.79 
 
 		 302 aa  228  1e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2185  protein-export membrane protein SecF  41.46 
 
 		 312 aa  228  2e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1330  SecF protein  43.81 
 
 		 338 aa  228  2e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0105179  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1293  preprotein translocase subunit SecF  44.44 
 
 		 306 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4342  preprotein translocase subunit SecF  43.48 
 
 		 302 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.557524  hitchhiker  0.0000000544827 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2426  preprotein translocase subunit SecF  39.74 
 
 		 310 aa  227  3e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14650  preprotein translocase subunit SecF  44.1 
 
 		 306 aa  227  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2481  preprotein translocase subunit SecF  40.8 
 
 		 315 aa  226  6e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0456849  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1312  preprotein translocase subunit SecF  41.2 
 
 		 313 aa  226  6e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.187294  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2699  preprotein translocase subunit SecF  38.38 
 
 		 315 aa  226  7e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.584759  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1981  preprotein translocase subunit SecF  39.6 
 
 		 305 aa  225  1e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1117  preprotein translocase subunit SecF  44.78 
 
 		 316 aa  225  1e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3281  preprotein translocase subunit SecF  37.71 
 
 		 314 aa  224  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0339451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2349  preprotein translocase subunit SecF  46.04 
 
 		 312 aa  224  2e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2432  preprotein translocase subunit SecF  40.82 
 
 		 316 aa  224  3e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1064  preprotein translocase subunit SecF  38.76 
 
 		 322 aa  224  3e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204402 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1976  preprotein translocase subunit SecF  39.26 
 
 		 305 aa  223  4e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1473  preprotein translocase subunit SecF  40.4 
 
 		 315 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13163  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3517  preprotein translocase subunit SecF  43.85 
 
 		 305 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.943932  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0273  preprotein translocase subunit SecF  40.07 
 
 		 315 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1385  preprotein translocase subunit SecF  40.47 
 
 		 315 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00983524  hitchhiker  0.000000302266 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1438  preprotein translocase subunit SecF  40.47 
 
 		 315 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0107161  hitchhiker  0.00000672809 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2879  preprotein translocase subunit SecF  39.46 
 
 		 315 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0152003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2784  preprotein translocase subunit SecF  39.46 
 
 		 315 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0481367  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2804  preprotein translocase subunit SecF  39.46 
 
 		 315 aa  219  5e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00594045  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1573  preprotein translocase subunit SecF  39.46 
 
 		 315 aa  219  7e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00583403  hitchhiker  0.000000100837 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1450  preprotein translocase subunit SecF  40.13 
 
 		 315 aa  218  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101016  normal  0.0107257 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2080  preprotein translocase subunit SecF  38.36 
 
 		 310 aa  217  2e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.348624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0600  protein-export membrane protein SecF  38.91 
 
 		 306 aa  218  2e-55  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3410  preprotein translocase subunit SecF  38.24 
 
 		 310 aa  216  8e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.470733  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4643  preprotein translocase subunit SecF  35.64 
 
 		 317 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.410756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1509  preprotein translocase subunit SecF  34.69 
 
 		 324 aa  214  2.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.444089 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2947  preprotein translocase subunit SecF  34.9 
 
 		 324 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1792  preprotein translocase subunit SecF  35.03 
 
 		 324 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.105598  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2903  preprotein translocase subunit SecF  40.15 
 
 		 323 aa  213  5.999999999999999e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4004  preprotein translocase subunit SecF  36.68 
 
 		 317 aa  213  5.999999999999999e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.833906 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00357  protein export protein SecF  37.09 
 
 		 323 aa  213  7e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.797763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3200  protein-export membrane protein SecF  37.09 
 
 		 323 aa  213  7e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0111096  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00361  hypothetical protein  37.09 
 
 		 323 aa  213  7e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3224  preprotein translocase subunit SecF  37.09 
 
 		 323 aa  213  7e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000013674 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0489  preprotein translocase subunit SecF  37.09 
 
 		 323 aa  213  7e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0439  preprotein translocase subunit SecF  37.09 
 
 		 323 aa  213  7e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0441  preprotein translocase subunit SecF  37.09 
 
 		 323 aa  213  7e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0328  preprotein translocase subunit SecF  37.09 
 
 		 323 aa  213  7e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.264814  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0479  preprotein translocase subunit SecF  37.09 
 
 		 323 aa  213  7e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0447  preprotein translocase subunit SecF  36.84 
 
 		 323 aa  212  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0454  preprotein translocase subunit SecF  36.84 
 
 		 323 aa  212  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0508  preprotein translocase subunit SecF  36.84 
 
 		 323 aa  212  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0448  preprotein translocase subunit SecF  36.84 
 
 		 323 aa  212  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0467  preprotein translocase subunit SecF  36.84 
 
 		 323 aa  212  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3381  preprotein translocase subunit SecF  35.95 
 
 		 322 aa  212  1e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0144101  normal  0.396634 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3261  preprotein translocase subunit SecF  35.95 
 
 		 322 aa  212  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.578435  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0837  preprotein translocase subunit SecF  36.55 
 
 		 316 aa  212  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3120  preprotein translocase subunit SecF  35.95 
 
 		 322 aa  212  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0405125  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3094  preprotein translocase subunit SecF  39.86 
 
 		 323 aa  212  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278166  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2190  preprotein translocase subunit SecF  40.4 
 
 		 315 aa  211  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.447622  decreased coverage  0.00319916 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1275  preprotein translocase subunit SecF  34.19 
 
 		 316 aa  210  3e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3354  preprotein translocase subunit SecF  35.99 
 
 		 317 aa  210  3e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3374  preprotein translocase subunit SecF  34.19 
 
 		 316 aa  210  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3365  preprotein translocase subunit SecF  34.19 
 
 		 316 aa  210  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0878  preprotein translocase subunit SecF  37.75 
 
 		 323 aa  210  5e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1022  preprotein translocase subunit SecF  37.62 
 
 		 324 aa  209  8e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3331  preprotein translocase subunit SecF  33.87 
 
 		 316 aa  209  9e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0935512  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0687  preprotein translocase subunit SecF  35.33 
 
 		 316 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3807  preprotein translocase subunit SecF  35.67 
 
 		 316 aa  208  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0235  preprotein translocase subunit SecF  35.33 
 
 		 316 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1302  protein-export membrane protein SecF  43.81 
 
 		 315 aa  208  1e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0719  preprotein translocase subunit SecF  35.33 
 
 		 316 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2811  preprotein translocase subunit SecF  34.23 
 
 		 323 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3288  preprotein translocase subunit SecF  36.63 
 
 		 322 aa  207  3e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0609  preprotein translocase subunit SecF  35.02 
 
 		 316 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4086  preprotein translocase subunit SecF  34.56 
 
 		 321 aa  205  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0605459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0300  preprotein translocase subunit SecF  33.87 
 
 		 313 aa  205  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>