More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1898 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1898  protein translocase subunit secF  100 
 
 		 314 aa  624  1e-178  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186497  normal  0.970453 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0997  preprotein translocase subunit SecF  48.17 
 
 		 322 aa  278  1e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3037  protein-export membrane protein SecF  47.88 
 
 		 316 aa  269  5e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1858  preprotein translocase subunit SecF  44.05 
 
 		 320 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.150957  normal  0.772867 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  45 
 
 		 848 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1860  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  43.14 
 
 		 844 aa  251  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  44 
 
 		 849 aa  249  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  45.51 
 
 		 856 aa  248  1e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2856  protein-export membrane protein SecF  40.65 
 
 		 318 aa  246  3e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.114618 
 
 
-
 
NC_004310  BR1324  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  43.48 
 
 		 845 aa  246  4.9999999999999997e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0375911  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1085  preprotein translocase subunit SecF  43.09 
 
 		 328 aa  245  8e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.161965 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1284  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  43.14 
 
 		 844 aa  244  9e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  43.81 
 
 		 839 aa  244  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1002  protein-export membrane protein SecF  39.62 
 
 		 319 aa  243  1.9999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0878  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  42.62 
 
 		 834 aa  241  1e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.335263  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0181  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  42.19 
 
 		 844 aa  241  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  44.62 
 
 		 846 aa  239  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1415  preprotein translocase subunit SecF  40.13 
 
 		 330 aa  239  4e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.661465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1713  SecF protein  42.77 
 
 		 327 aa  236  3e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2775  preprotein translocase subunit SecF  42.99 
 
 		 334 aa  235  6e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.33037 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1768  preprotein translocase subunit SecF  44.41 
 
 		 352 aa  235  7e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0148605  normal  0.0118701 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  42.57 
 
 		 853 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0445  preprotein translocase subunit SecF  41.45 
 
 		 324 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.222875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1799  preprotein translocase subunit SecF  41.45 
 
 		 324 aa  233  3e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0457  preprotein translocase subunit SecF  42.11 
 
 		 324 aa  233  5e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0172615  normal  0.0827508 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4405  preprotein translocase subunit SecF  43.32 
 
 		 335 aa  232  6e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0338927  normal  0.256135 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4597  protein-export membrane protein SecF  40.44 
 
 		 314 aa  232  6e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486566  normal  0.106389 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  46.31 
 
 		 856 aa  232  7.000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4227  protein-export membrane protein SecF  40.13 
 
 		 314 aa  231  1e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4746  protein-export membrane protein SecF  40.75 
 
 		 314 aa  231  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0265427 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  46.2 
 
 		 846 aa  228  9e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.823548 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4310  protein-export membrane protein SecF  42.62 
 
 		 357 aa  228  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3171  preprotein translocase subunit SecF  42.36 
 
 		 372 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.203608  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2731  preprotein translocase subunit SecF  43 
 
 		 367 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.447806  normal  0.258523 
 
 
-
 
NC_004310  BR0891  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.68 
 
 		 785 aa  224  2e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.983907  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2776  preprotein translocase subunit SecF  42.04 
 
 		 369 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.686561  normal  0.719321 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0887  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.68 
 
 		 785 aa  224  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3107  protein-export membrane protein SecF  40.26 
 
 		 316 aa  223  3e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.616457  normal  0.192516 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2336  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  41 
 
 		 759 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.217617  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1800  preprotein translocase subunit SecF  43.77 
 
 		 340 aa  219  5e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0690803  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2189  protein-export membrane protein SecF  39.74 
 
 		 316 aa  218  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.279609  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1123  preprotein translocase subunit SecF  39.87 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2277  protein-export membrane protein SecF  41.45 
 
 		 313 aa  218  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2492  protein-export membrane protein SecF  38.76 
 
 		 316 aa  216  4e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.27994  normal  0.326076 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2072  protein translocase subunit secF  39.74 
 
 		 325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2056  protein-export membrane protein SecF  39.93 
 
 		 337 aa  212  5.999999999999999e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.880378  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1714  protein-export membrane protein SecF  39.93 
 
 		 316 aa  211  9e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.611616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01049  preprotein translocase subunit SecF  38.44 
 
 		 315 aa  210  3e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1231  protein-export membrane protein SecF  37.38 
 
 		 313 aa  210  3e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2065  preprotein translocase subunit SecF  42.62 
 
 		 313 aa  209  6e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1454  protein translocase subunit secF  39.79 
 
 		 321 aa  209  7e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.982054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004364  protein-export membrane protein SecF  38.11 
 
 		 315 aa  204  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0679828  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3110  preprotein translocase subunit SecF  37.92 
 
 		 315 aa  204  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01348  protein-export membrane protein SecF  37.58 
 
 		 313 aa  203  3e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.256718  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0273  preprotein translocase subunit SecF  40.07 
 
 		 315 aa  201  9e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1174  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  43.98 
 
 		 858 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149804  normal  0.102864 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2889  preprotein translocase subunit SecF  41.76 
 
 		 315 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000629469 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2334  preprotein translocase subunit SecF  39.41 
 
 		 315 aa  199  5e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.307818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1573  preprotein translocase subunit SecF  38.11 
 
 		 315 aa  198  9e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00583403  hitchhiker  0.000000100837 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2879  preprotein translocase subunit SecF  38.11 
 
 		 315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0152003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1759  preprotein translocase subunit SecF  42.65 
 
 		 315 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.020465  normal  0.0122623 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2432  preprotein translocase subunit SecF  38.44 
 
 		 316 aa  197  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2784  preprotein translocase subunit SecF  38.11 
 
 		 315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0481367  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2804  preprotein translocase subunit SecF  38.11 
 
 		 315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00594045  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  38.78 
 
 		 304 aa  196  3e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3211  protein translocase subunit secF  39.86 
 
 		 311 aa  197  3e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4004  preprotein translocase subunit SecF  34.43 
 
 		 317 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.833906 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1473  preprotein translocase subunit SecF  38.44 
 
 		 315 aa  196  6e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13163  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  38.44 
 
 		 304 aa  195  1e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3354  preprotein translocase subunit SecF  34.1 
 
 		 317 aa  194  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00357  protein export protein SecF  36.95 
 
 		 323 aa  193  3e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.797763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3200  protein-export membrane protein SecF  36.95 
 
 		 323 aa  193  3e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0111096  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0441  preprotein translocase subunit SecF  36.95 
 
 		 323 aa  193  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3224  preprotein translocase subunit SecF  36.95 
 
 		 323 aa  193  3e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000013674 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0328  preprotein translocase subunit SecF  36.95 
 
 		 323 aa  193  3e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.264814  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0489  preprotein translocase subunit SecF  36.95 
 
 		 323 aa  193  3e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0479  preprotein translocase subunit SecF  36.95 
 
 		 323 aa  193  3e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0439  preprotein translocase subunit SecF  36.95 
 
 		 323 aa  193  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00361  hypothetical protein  36.95 
 
 		 323 aa  193  3e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2190  preprotein translocase subunit SecF  38.03 
 
 		 315 aa  193  3e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.447622  decreased coverage  0.00319916 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2699  preprotein translocase subunit SecF  38.33 
 
 		 315 aa  192  5e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.584759  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1064  preprotein translocase subunit SecF  36.33 
 
 		 322 aa  191  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204402 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  40.14 
 
 		 307 aa  191  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1454  protein-export membrane protein SecF  39.27 
 
 		 308 aa  191  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0298464  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0447  preprotein translocase subunit SecF  36.67 
 
 		 323 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4643  preprotein translocase subunit SecF  33.77 
 
 		 317 aa  190  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.410756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0508  preprotein translocase subunit SecF  36.67 
 
 		 323 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0467  preprotein translocase subunit SecF  36.67 
 
 		 323 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2947  preprotein translocase subunit SecF  34.53 
 
 		 324 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0448  preprotein translocase subunit SecF  36.67 
 
 		 323 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0454  preprotein translocase subunit SecF  36.67 
 
 		 323 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2481  preprotein translocase subunit SecF  36.81 
 
 		 315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0456849  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0511  preprotein translocase subunit SecF  33.66 
 
 		 311 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.956081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1302  protein-export membrane protein SecF  41.95 
 
 		 315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1404  preprotein translocase subunit SecF  37.25 
 
 		 315 aa  189  5e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0316508  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3884  preprotein translocase subunit SecF  36.36 
 
 		 317 aa  189  7e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0703005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1763  protein translocase subunit secF  39.71 
 
 		 351 aa  188  8e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.670148  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1219  preprotein translocase subunit SecF  40.56 
 
 		 314 aa  188  8e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417925 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2811  preprotein translocase subunit SecF  35.23 
 
 		 323 aa  188  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1231  preprotein translocase subunit SecF  36.51 
 
 		 303 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.611016  normal  0.761235 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>