More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2305 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2305  protein-export membrane protein SecF  100 
 
 		 421 aa  831    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.879944  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2584  preprotein translocase subunit SecF  61.13 
 
 		 423 aa  397  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.173731  normal  0.904597 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2316  preprotein translocase subunit SecF  57.62 
 
 		 417 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.658853  normal  0.312291 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2277  preprotein translocase subunit SecF  57.62 
 
 		 417 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2324  preprotein translocase subunit SecF  57.62 
 
 		 417 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223224  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3815  preprotein translocase subunit SecF  60 
 
 		 422 aa  384  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130348  normal  0.401094 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12606  preprotein translocase subunit SecF  53.69 
 
 		 442 aa  380  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1943  protein-export membrane protein SecF  61.01 
 
 		 374 aa  362  5.0000000000000005e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00503357  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15110  protein translocase subunit secF  52.11 
 
 		 414 aa  333  4e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.66233 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1696  protein-export membrane protein SecF  45.38 
 
 		 396 aa  317  3e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467956  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3390  protein-export membrane protein SecF  49.56 
 
 		 432 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000120226  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3823  protein-export membrane protein SecF  42.38 
 
 		 416 aa  306  5.0000000000000004e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.344735  normal  0.619548 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1813  protein-export membrane protein SecF  46.26 
 
 		 394 aa  298  8e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.126223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1803  protein-export membrane protein SecF  45.75 
 
 		 394 aa  293  5e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162985  decreased coverage  0.00000393416 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1340  preprotein translocase subunit SecF  44.82 
 
 		 414 aa  289  5.0000000000000004e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.265736  normal  0.609901 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3173  protein-export membrane protein SecF  47.38 
 
 		 453 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.12818  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1997  protein-export membrane protein SecF  42.74 
 
 		 358 aa  270  2.9999999999999997e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.498449  normal  0.0822875 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5141  preprotein translocase subunit SecF  46.5 
 
 		 417 aa  269  8e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.358124  hitchhiker  0.00205157 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17560  protein translocase subunit secF  44.47 
 
 		 371 aa  258  1e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.095972 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1374  preprotein translocase subunit SecF  44.1 
 
 		 398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.574602  normal  0.142388 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1365  protein-export membrane protein SecF  41.95 
 
 		 366 aa  254  2.0000000000000002e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3050  protein-export membrane protein SecF  44.83 
 
 		 330 aa  250  3e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1799  protein-export membrane protein SecF  43.22 
 
 		 360 aa  249  5e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.544061  normal  0.135983 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1671  protein-export membrane protein SecF  46.71 
 
 		 363 aa  246  4.9999999999999997e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13990  protein translocase subunit secF  39.73 
 
 		 364 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.269244  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2028  preprotein translocase subunit SecF  38.81 
 
 		 338 aa  239  5e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000424362 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2357  protein-export membrane protein SecF  42.06 
 
 		 389 aa  238  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2390  protein translocase subunit secF  40.43 
 
 		 412 aa  238  1e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2114  protein-export membrane protein SecF  40.92 
 
 		 390 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205616  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6108  preprotein translocase subunit SecF  41.58 
 
 		 347 aa  233  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359416  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2298  preprotein translocase subunit SecF  39.2 
 
 		 340 aa  230  4e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15300  protein translocase subunit secF  43.96 
 
 		 406 aa  229  5e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.54161  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2060  protein-export membrane protein SecF  43.32 
 
 		 326 aa  226  6e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.616528  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12850  protein translocase subunit secF  38.71 
 
 		 346 aa  215  9e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0129827  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0946  protein-export membrane protein SecF  38.57 
 
 		 349 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12600  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  37.7 
 
 		 977 aa  206  9e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  34.82 
 
 		 989 aa  183  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0984  protein-export membrane protein SecD  33.9 
 
 		 900 aa  175  9.999999999999999e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.583326 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07200  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  29.95 
 
 		 855 aa  164  3e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1424  preprotein translocase subunit SecF  31.4 
 
 		 280 aa  163  5.0000000000000005e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000449698  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2885  preprotein translocase subunit SecF  32.28 
 
 		 310 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1271  preprotein translocase subunit SecF  34.52 
 
 		 296 aa  151  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1690  preprotein translocase subunit SecF  31.89 
 
 		 310 aa  148  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.113213  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1463  preprotein translocase subunit SecF  31.42 
 
 		 303 aa  147  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000137336  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1335  protein translocase subunit secF  36.33 
 
 		 292 aa  147  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  30.64 
 
 		 735 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  29.93 
 
 		 286 aa  146  8.000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3211  preprotein translocase subunit SecF  34.53 
 
 		 310 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.828599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  33.67 
 
 		 291 aa  142  8e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1489  preprotein translocase subunit SecF  32.26 
 
 		 325 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.921272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5076  preprotein translocase subunit SecF  29.94 
 
 		 328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1355  preprotein translocase subunit SecF  32.33 
 
 		 293 aa  137  4e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  29.7 
 
 		 304 aa  136  5e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6254  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.01 
 
 		 1055 aa  137  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  34.77 
 
 		 759 aa  136  6.0000000000000005e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  29.7 
 
 		 304 aa  136  6.0000000000000005e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2196  preprotein translocase subunit SecF  27.48 
 
 		 289 aa  136  7.000000000000001e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  34.22 
 
 		 740 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  30.1 
 
 		 761 aa  134  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.44 
 
 		 762 aa  134  3.9999999999999996e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1907  preprotein translocase subunit SecF  27.36 
 
 		 289 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0418717  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1670  preprotein translocase subunit SecF  31.33 
 
 		 292 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00270917  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1027  preprotein translocase subunit SecF  32.91 
 
 		 312 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0198826 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1770  protein-export membrane protein SecF  27.93 
 
 		 307 aa  131  3e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1201  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.67 
 
 		 763 aa  130  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.732454  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1976  preprotein translocase subunit SecF  30.63 
 
 		 305 aa  130  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1115  protein-export membrane protein SecF  27.87 
 
 		 302 aa  130  5.0000000000000004e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0387  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.48 
 
 		 911 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.807363  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1981  preprotein translocase subunit SecF  30.31 
 
 		 305 aa  128  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0903  protein translocase subunit secF  30.97 
 
 		 318 aa  126  6e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000021842  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2737  protein-export membrane protein SecF  27.04 
 
 		 308 aa  125  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.468895  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0113  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.38 
 
 		 991 aa  125  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.758548 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0141  preprotein translocase subunit SecF  31.09 
 
 		 314 aa  125  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5129  preprotein translocase subunit SecF  30.68 
 
 		 336 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.642857  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4538  protein-export membrane protein SecF  31.72 
 
 		 320 aa  124  3e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1603  protein-export membrane protein SecF  28.18 
 
 		 290 aa  124  4e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.232098  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3596  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.65 
 
 		 996 aa  123  8e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.318172 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2336  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.98 
 
 		 759 aa  122  9e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.217617  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2616  preprotein translocase subunit SecF  27.87 
 
 		 302 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  29.77 
 
 		 307 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0626  protein-export membrane protein SecF  28.91 
 
 		 310 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000549124  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2008  preprotein translocase subunit SecF  32.71 
 
 		 313 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0283  preprotein translocase subunit SecF  29.78 
 
 		 321 aa  121  3e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.164559  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1341  protein-export membrane protein SecF  27.85 
 
 		 298 aa  120  3e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1117  preprotein translocase subunit SecF  29.97 
 
 		 316 aa  120  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1454  protein-export membrane protein SecF  30.07 
 
 		 308 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0298464  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0080  protein-export membrane protein SecF  30.12 
 
 		 317 aa  120  6e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004364  protein-export membrane protein SecF  31.27 
 
 		 315 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0679828  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0997  preprotein translocase subunit SecF  29.1 
 
 		 322 aa  119  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3211  protein translocase subunit secF  31.13 
 
 		 311 aa  119  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09531  preprotein translocase subunit SecF  30.32 
 
 		 318 aa  119  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.14982 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0066  protein-export membrane protein SecF  27.49 
 
 		 293 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4258  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.52 
 
 		 755 aa  117  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1797  preprotein translocase subunit SecF  29.51 
 
 		 307 aa  117  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0847  protein-export membrane protein SecF  30.28 
 
 		 359 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0561071  normal  0.116765 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3037  protein-export membrane protein SecF  30.66 
 
 		 316 aa  116  6.9999999999999995e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.83 
 
 		 759 aa  116  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1231  protein-export membrane protein SecF  28.47 
 
 		 313 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1727  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.83 
 
 		 759 aa  116  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.347489  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0332  preprotein translocase subunit SecF  28.52 
 
 		 301 aa  116  8.999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.496269  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>