More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1943 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1943  protein-export membrane protein SecF  100 
 
 		 374 aa  746    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00503357  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3815  preprotein translocase subunit SecF  59.66 
 
 		 422 aa  427  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130348  normal  0.401094 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2584  preprotein translocase subunit SecF  62.46 
 
 		 423 aa  424  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.173731  normal  0.904597 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2316  preprotein translocase subunit SecF  60.95 
 
 		 417 aa  420  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.658853  normal  0.312291 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2277  preprotein translocase subunit SecF  60.95 
 
 		 417 aa  420  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2324  preprotein translocase subunit SecF  60.95 
 
 		 417 aa  420  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223224  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2305  protein-export membrane protein SecF  61.01 
 
 		 421 aa  384  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.879944  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12606  preprotein translocase subunit SecF  57.71 
 
 		 442 aa  383  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3390  protein-export membrane protein SecF  52.52 
 
 		 432 aa  338  7e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000120226  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15110  protein translocase subunit secF  49.71 
 
 		 414 aa  333  4e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.66233 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1696  protein-export membrane protein SecF  47.71 
 
 		 396 aa  318  9e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467956  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1997  protein-export membrane protein SecF  44.69 
 
 		 358 aa  274  1.0000000000000001e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.498449  normal  0.0822875 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1340  preprotein translocase subunit SecF  44.62 
 
 		 414 aa  266  5e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.265736  normal  0.609901 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1813  protein-export membrane protein SecF  43.58 
 
 		 394 aa  265  1e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.126223  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1799  protein-export membrane protein SecF  43.37 
 
 		 360 aa  262  6.999999999999999e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.544061  normal  0.135983 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1803  protein-export membrane protein SecF  41.78 
 
 		 394 aa  262  8.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162985  decreased coverage  0.00000393416 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3823  protein-export membrane protein SecF  43.68 
 
 		 416 aa  258  9e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.344735  normal  0.619548 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2357  protein-export membrane protein SecF  44.06 
 
 		 389 aa  254  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1365  protein-export membrane protein SecF  40.88 
 
 		 366 aa  254  2.0000000000000002e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5141  preprotein translocase subunit SecF  47.3 
 
 		 417 aa  253  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.358124  hitchhiker  0.00205157 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2060  protein-export membrane protein SecF  44.83 
 
 		 326 aa  251  2e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.616528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3050  protein-export membrane protein SecF  40.6 
 
 		 330 aa  249  5e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17560  protein translocase subunit secF  44.92 
 
 		 371 aa  249  6e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.095972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6108  preprotein translocase subunit SecF  39.08 
 
 		 347 aa  249  7e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359416  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1671  protein-export membrane protein SecF  42.42 
 
 		 363 aa  248  1e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1374  preprotein translocase subunit SecF  45.74 
 
 		 398 aa  244  9.999999999999999e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.574602  normal  0.142388 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15300  protein translocase subunit secF  42.99 
 
 		 406 aa  242  9e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.54161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3173  protein-export membrane protein SecF  40.33 
 
 		 453 aa  241  1e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.12818  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2114  protein-export membrane protein SecF  38.11 
 
 		 390 aa  238  9e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205616  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13990  protein translocase subunit secF  38.97 
 
 		 364 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.269244  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2390  protein translocase subunit secF  42.26 
 
 		 412 aa  231  1e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2028  preprotein translocase subunit SecF  36.44 
 
 		 338 aa  229  4e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000424362 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2298  preprotein translocase subunit SecF  35.74 
 
 		 340 aa  222  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0946  protein-export membrane protein SecF  37.22 
 
 		 349 aa  206  5e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12850  protein translocase subunit secF  36.62 
 
 		 346 aa  202  9.999999999999999e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0129827  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  33.55 
 
 		 989 aa  166  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12600  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  32.79 
 
 		 977 aa  159  5e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1424  preprotein translocase subunit SecF  31.88 
 
 		 280 aa  156  7e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000449698  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0984  protein-export membrane protein SecD  32.58 
 
 		 900 aa  149  1.0000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.583326 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  31.27 
 
 		 286 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07200  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  32.41 
 
 		 855 aa  145  1e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1463  preprotein translocase subunit SecF  31.83 
 
 		 303 aa  144  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000137336  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  33 
 
 		 761 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5076  preprotein translocase subunit SecF  33.13 
 
 		 328 aa  136  6.0000000000000005e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0387  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.23 
 
 		 911 aa  135  9e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.807363  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1489  preprotein translocase subunit SecF  32.81 
 
 		 325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.921272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1670  preprotein translocase subunit SecF  33.44 
 
 		 292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00270917  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1690  preprotein translocase subunit SecF  32.62 
 
 		 310 aa  130  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.113213  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2885  preprotein translocase subunit SecF  30.34 
 
 		 310 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0141  preprotein translocase subunit SecF  35.42 
 
 		 314 aa  130  4.0000000000000003e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1335  protein translocase subunit secF  35.12 
 
 		 292 aa  129  6e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0903  protein translocase subunit secF  28.53 
 
 		 318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000021842  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2737  protein-export membrane protein SecF  32.34 
 
 		 308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.468895  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0626  protein-export membrane protein SecF  28.04 
 
 		 310 aa  127  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000549124  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1271  preprotein translocase subunit SecF  31.96 
 
 		 296 aa  127  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3211  preprotein translocase subunit SecF  32.5 
 
 		 310 aa  126  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.828599  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  33.23 
 
 		 740 aa  126  6e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1976  preprotein translocase subunit SecF  29.32 
 
 		 305 aa  125  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2196  preprotein translocase subunit SecF  29.9 
 
 		 289 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.13 
 
 		 762 aa  124  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0537  protein-export membrane protein SecF  26.07 
 
 		 327 aa  124  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000416815  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1981  preprotein translocase subunit SecF  29.01 
 
 		 305 aa  123  6e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  29.97 
 
 		 304 aa  122  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  29.97 
 
 		 304 aa  122  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  31.25 
 
 		 759 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0113  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.75 
 
 		 991 aa  122  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.758548 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1907  preprotein translocase subunit SecF  30.19 
 
 		 289 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0418717  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  30.16 
 
 		 735 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  31.23 
 
 		 291 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5129  preprotein translocase subunit SecF  32.73 
 
 		 336 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.642857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1713  SecF protein  30.72 
 
 		 327 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24873  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1201  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.2 
 
 		 763 aa  118  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.732454  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0080  protein-export membrane protein SecF  29.91 
 
 		 317 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3596  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.83 
 
 		 996 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.318172 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0092  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.16 
 
 		 995 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1355  preprotein translocase subunit SecF  31.49 
 
 		 293 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0540  preprotein translocase subunit SecF  31.64 
 
 		 361 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0258314 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1027  preprotein translocase subunit SecF  30 
 
 		 312 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0198826 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4538  protein-export membrane protein SecF  31.11 
 
 		 320 aa  117  3.9999999999999997e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3211  protein translocase subunit secF  30.69 
 
 		 311 aa  117  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1115  protein-export membrane protein SecF  27.42 
 
 		 302 aa  116  7.999999999999999e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.15 
 
 		 856 aa  115  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0066  protein-export membrane protein SecF  27.51 
 
 		 293 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0847  protein-export membrane protein SecF  32.03 
 
 		 359 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0561071  normal  0.116765 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0997  preprotein translocase subunit SecF  28.71 
 
 		 322 aa  114  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1904  protein-export membrane protein SecF  23.96 
 
 		 302 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2513  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.15 
 
 		 750 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000183584  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0475  preprotein translocase subunit SecF  28.04 
 
 		 323 aa  114  4.0000000000000004e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1770  protein-export membrane protein SecF  26.09 
 
 		 307 aa  112  7.000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6254  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.27 
 
 		 1055 aa  112  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1341  protein-export membrane protein SecF  25.99 
 
 		 298 aa  112  9e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  29.25 
 
 		 307 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1330  SecF protein  32.57 
 
 		 338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0105179  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1762  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.08 
 
 		 981 aa  111  2.0000000000000002e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0562  protein-export membrane protein SecF  27.91 
 
 		 321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1797  preprotein translocase subunit SecF  30.09 
 
 		 307 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2616  preprotein translocase subunit SecF  29.41 
 
 		 302 aa  111  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4306  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.82 
 
 		 754 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1231  preprotein translocase subunit SecF  29.87 
 
 		 303 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.611016  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4641  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.82 
 
 		 754 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>