More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1671 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1671  protein-export membrane protein SecF  100 
 
 
363 aa  710    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1365  protein-export membrane protein SecF  54.95 
 
 
366 aa  394  1e-109  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17560  protein translocase subunit secF  56.44 
 
 
371 aa  397  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.095972 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1799  protein-export membrane protein SecF  57.26 
 
 
360 aa  388  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.544061  normal  0.135983 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1997  protein-export membrane protein SecF  54.6 
 
 
358 aa  385  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.498449  normal  0.0822875 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2298  preprotein translocase subunit SecF  53.05 
 
 
340 aa  320  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2028  preprotein translocase subunit SecF  52 
 
 
338 aa  318  9e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000424362 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3050  protein-export membrane protein SecF  51.38 
 
 
330 aa  311  1e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13990  protein translocase subunit secF  50.31 
 
 
364 aa  310  2e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.269244  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12850  protein translocase subunit secF  49.2 
 
 
346 aa  286  4e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0129827  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15300  protein translocase subunit secF  49.69 
 
 
406 aa  278  1e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.54161  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1340  preprotein translocase subunit SecF  44.57 
 
 
414 aa  275  7e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.265736  normal  0.609901 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2390  protein translocase subunit secF  45.51 
 
 
412 aa  273  3e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3390  protein-export membrane protein SecF  44.94 
 
 
432 aa  267  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000120226  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1813  protein-export membrane protein SecF  43.78 
 
 
394 aa  262  8e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.126223  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3815  preprotein translocase subunit SecF  41.76 
 
 
422 aa  259  7e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130348  normal  0.401094 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1803  protein-export membrane protein SecF  44.14 
 
 
394 aa  258  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162985  decreased coverage  0.00000393416 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3823  protein-export membrane protein SecF  44.11 
 
 
416 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.344735  normal  0.619548 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2305  protein-export membrane protein SecF  45.97 
 
 
421 aa  253  3e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.879944  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2584  preprotein translocase subunit SecF  41.19 
 
 
423 aa  251  1e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.173731  normal  0.904597 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15110  protein translocase subunit secF  44.31 
 
 
414 aa  249  6e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.66233 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2357  protein-export membrane protein SecF  43.17 
 
 
389 aa  248  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677803  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1696  protein-export membrane protein SecF  44.34 
 
 
396 aa  246  4.9999999999999997e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467956  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12606  preprotein translocase subunit SecF  43.79 
 
 
442 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1943  protein-export membrane protein SecF  41.81 
 
 
374 aa  242  6e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00503357  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2316  preprotein translocase subunit SecF  37.27 
 
 
417 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.658853  normal  0.312291 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6108  preprotein translocase subunit SecF  42.86 
 
 
347 aa  238  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359416  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2277  preprotein translocase subunit SecF  37.27 
 
 
417 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2324  preprotein translocase subunit SecF  37.27 
 
 
417 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223224  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3173  protein-export membrane protein SecF  45.25 
 
 
453 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.12818  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5141  preprotein translocase subunit SecF  43.45 
 
 
417 aa  233  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.358124  hitchhiker  0.00205157 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2114  protein-export membrane protein SecF  44.44 
 
 
390 aa  232  7.000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205616  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1374  preprotein translocase subunit SecF  41.1 
 
 
398 aa  232  7.000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.574602  normal  0.142388 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2060  protein-export membrane protein SecF  43.65 
 
 
326 aa  219  6e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.616528  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0946  protein-export membrane protein SecF  39.38 
 
 
349 aa  202  5e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07200  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  37.46 
 
 
855 aa  174  1.9999999999999998e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0984  protein-export membrane protein SecD  33.77 
 
 
900 aa  163  5.0000000000000005e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.583326 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  32.72 
 
 
989 aa  162  6e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12600  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  32.91 
 
 
977 aa  158  1e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  30.07 
 
 
286 aa  150  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2196  preprotein translocase subunit SecF  29.53 
 
 
289 aa  143  4e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1907  preprotein translocase subunit SecF  30.3 
 
 
289 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0418717  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.57 
 
 
762 aa  133  6e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1463  preprotein translocase subunit SecF  28.53 
 
 
303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000137336  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1454  protein-export membrane protein SecF  32.21 
 
 
308 aa  127  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0298464  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  31.79 
 
 
759 aa  126  5e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1335  protein translocase subunit secF  32.61 
 
 
292 aa  126  7e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  32.65 
 
 
740 aa  124  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1355  preprotein translocase subunit SecF  30.56 
 
 
293 aa  123  5e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  31.82 
 
 
761 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1690  preprotein translocase subunit SecF  29.52 
 
 
310 aa  120  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.113213  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4258  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.61 
 
 
755 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1271  preprotein translocase subunit SecF  29.93 
 
 
296 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1424  preprotein translocase subunit SecF  26.21 
 
 
280 aa  119  6e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000449698  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5076  preprotein translocase subunit SecF  29.35 
 
 
328 aa  119  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  28.57 
 
 
735 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0113  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.74 
 
 
991 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.758548 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1981  preprotein translocase subunit SecF  31.8 
 
 
305 aa  117  3e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1670  preprotein translocase subunit SecF  29.18 
 
 
292 aa  116  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00270917  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1216  protein-export membrane protein SecF  32.68 
 
 
291 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0233184  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1976  preprotein translocase subunit SecF  31.45 
 
 
305 aa  115  8.999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1201  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.08 
 
 
763 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.732454  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0562  protein-export membrane protein SecF  27.49 
 
 
321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0903  protein translocase subunit secF  27.22 
 
 
318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000021842  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  28.24 
 
 
291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  29.11 
 
 
307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4155  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.14 
 
 
754 aa  114  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2885  preprotein translocase subunit SecF  30.18 
 
 
310 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3211  preprotein translocase subunit SecF  30.18 
 
 
310 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.828599  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  29.43 
 
 
304 aa  113  4.0000000000000004e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0935  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.84 
 
 
750 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4306  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.14 
 
 
754 aa  113  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4641  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.14 
 
 
754 aa  113  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4144  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.14 
 
 
754 aa  113  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0626  protein-export membrane protein SecF  26.95 
 
 
310 aa  113  6e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000549124  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4491  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.14 
 
 
754 aa  113  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000282789 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  29.43 
 
 
304 aa  113  6e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4545  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.14 
 
 
754 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0705  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.7 
 
 
754 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4530  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.47 
 
 
754 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.566924  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0878  preprotein translocase subunit SecF  28.12 
 
 
323 aa  112  9e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0141  preprotein translocase subunit SecF  32.38 
 
 
314 aa  112  9e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.47 
 
 
754 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0879  preprotein translocase subunit SecF  31.83 
 
 
302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0954141 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3120  preprotein translocase subunit SecF  29.05 
 
 
322 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0405125  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3261  preprotein translocase subunit SecF  29.05 
 
 
322 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.578435  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0866  preprotein translocase subunit SecF  32.18 
 
 
302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222243  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3381  preprotein translocase subunit SecF  29.05 
 
 
322 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0144101  normal  0.396634 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0013  preprotein translocase subunit SecF  31.05 
 
 
309 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00245212 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1027  preprotein translocase subunit SecF  31.14 
 
 
312 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0198826 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1727  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.97 
 
 
759 aa  110  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.347489  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.97 
 
 
759 aa  110  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3127  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.35 
 
 
752 aa  109  6e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0836  preprotein translocase subunit SecF  31.94 
 
 
302 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0447  preprotein translocase subunit SecF  26.25 
 
 
323 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0508  preprotein translocase subunit SecF  26.25 
 
 
323 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0448  preprotein translocase subunit SecF  26.25 
 
 
323 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0454  preprotein translocase subunit SecF  26.25 
 
 
323 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0467  preprotein translocase subunit SecF  26.25 
 
 
323 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1022  preprotein translocase subunit SecF  28.62 
 
 
324 aa  109  9.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>