More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1365 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1365  protein-export membrane protein SecF  100 
 
 		 366 aa  729    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17560  protein translocase subunit secF  64.67 
 
 		 371 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.095972 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1799  protein-export membrane protein SecF  59.29 
 
 		 360 aa  416  9.999999999999999e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.544061  normal  0.135983 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1997  protein-export membrane protein SecF  57.42 
 
 		 358 aa  407  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.498449  normal  0.0822875 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1671  protein-export membrane protein SecF  54.67 
 
 		 363 aa  382  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3050  protein-export membrane protein SecF  58.28 
 
 		 330 aa  344  2e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2028  preprotein translocase subunit SecF  51.2 
 
 		 338 aa  341  1e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000424362 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2298  preprotein translocase subunit SecF  50.31 
 
 		 340 aa  331  1e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13990  protein translocase subunit secF  49.55 
 
 		 364 aa  317  2e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.269244  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1340  preprotein translocase subunit SecF  51.56 
 
 		 414 aa  312  6.999999999999999e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.265736  normal  0.609901 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15300  protein translocase subunit secF  51.55 
 
 		 406 aa  310  2.9999999999999997e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.54161  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12850  protein translocase subunit secF  49.04 
 
 		 346 aa  297  2e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0129827  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2390  protein translocase subunit secF  47.27 
 
 		 412 aa  291  1e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2114  protein-export membrane protein SecF  46.08 
 
 		 390 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205616  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2357  protein-export membrane protein SecF  47.76 
 
 		 389 aa  272  6e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3815  preprotein translocase subunit SecF  42.61 
 
 		 422 aa  267  2e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130348  normal  0.401094 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5141  preprotein translocase subunit SecF  47.76 
 
 		 417 aa  261  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.358124  hitchhiker  0.00205157 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15110  protein translocase subunit secF  44.48 
 
 		 414 aa  261  2e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.66233 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3823  protein-export membrane protein SecF  45.4 
 
 		 416 aa  259  4e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.344735  normal  0.619548 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3390  protein-export membrane protein SecF  43.53 
 
 		 432 aa  259  7e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000120226  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6108  preprotein translocase subunit SecF  46.49 
 
 		 347 aa  258  8e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359416  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2584  preprotein translocase subunit SecF  40.81 
 
 		 423 aa  256  5e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.173731  normal  0.904597 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2060  protein-export membrane protein SecF  47.51 
 
 		 326 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.616528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3173  protein-export membrane protein SecF  46.95 
 
 		 453 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.12818  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2316  preprotein translocase subunit SecF  41.1 
 
 		 417 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.658853  normal  0.312291 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1374  preprotein translocase subunit SecF  45.6 
 
 		 398 aa  251  1e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.574602  normal  0.142388 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2277  preprotein translocase subunit SecF  41.1 
 
 		 417 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2324  preprotein translocase subunit SecF  41.1 
 
 		 417 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223224  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1813  protein-export membrane protein SecF  42.46 
 
 		 394 aa  244  9.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.126223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1803  protein-export membrane protein SecF  42.73 
 
 		 394 aa  243  5e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162985  decreased coverage  0.00000393416 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2305  protein-export membrane protein SecF  41.95 
 
 		 421 aa  240  2e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.879944  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1943  protein-export membrane protein SecF  39.94 
 
 		 374 aa  235  9e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00503357  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12606  preprotein translocase subunit SecF  38.84 
 
 		 442 aa  234  3e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1696  protein-export membrane protein SecF  43.17 
 
 		 396 aa  231  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467956  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0946  protein-export membrane protein SecF  39.82 
 
 		 349 aa  224  2e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  36.15 
 
 		 989 aa  181  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  34.81 
 
 		 286 aa  177  3e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07200  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  36.18 
 
 		 855 aa  175  9.999999999999999e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0984  protein-export membrane protein SecD  36.03 
 
 		 900 aa  174  2.9999999999999996e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.583326 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12600  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  31.76 
 
 		 977 aa  173  5e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  33.45 
 
 		 761 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1907  preprotein translocase subunit SecF  31.37 
 
 		 289 aa  152  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0418717  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1463  preprotein translocase subunit SecF  32.69 
 
 		 303 aa  151  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000137336  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2196  preprotein translocase subunit SecF  30.87 
 
 		 289 aa  150  5e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  32.66 
 
 		 735 aa  145  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1424  preprotein translocase subunit SecF  28.97 
 
 		 280 aa  142  7e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000449698  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1271  preprotein translocase subunit SecF  33.68 
 
 		 296 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  29.97 
 
 		 759 aa  138  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1454  protein-export membrane protein SecF  35.19 
 
 		 308 aa  139  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0298464  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.22 
 
 		 762 aa  137  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  32.62 
 
 		 740 aa  135  9e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0537  protein-export membrane protein SecF  29.97 
 
 		 327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000416815  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1335  protein translocase subunit secF  34.27 
 
 		 292 aa  134  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1355  preprotein translocase subunit SecF  32.99 
 
 		 293 aa  134  3e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0113  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.38 
 
 		 991 aa  133  5e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.758548 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1981  preprotein translocase subunit SecF  30.16 
 
 		 305 aa  132  6.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  32.15 
 
 		 291 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0903  protein translocase subunit secF  30.5 
 
 		 318 aa  132  7.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000021842  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1976  preprotein translocase subunit SecF  29.84 
 
 		 305 aa  130  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0387  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.28 
 
 		 911 aa  130  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.807363  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  31.51 
 
 		 307 aa  130  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1690  preprotein translocase subunit SecF  31.29 
 
 		 310 aa  130  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.113213  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1115  protein-export membrane protein SecF  29.68 
 
 		 302 aa  130  4.0000000000000003e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0013  preprotein translocase subunit SecF  33.33 
 
 		 309 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245212 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0511  preprotein translocase subunit SecF  32.67 
 
 		 311 aa  127  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.956081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3211  protein translocase subunit secF  31.02 
 
 		 311 aa  127  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  32.1 
 
 		 304 aa  126  5e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  32.1 
 
 		 304 aa  126  5e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2737  protein-export membrane protein SecF  29.97 
 
 		 308 aa  126  7e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.468895  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1341  protein-export membrane protein SecF  30.45 
 
 		 298 aa  125  8.000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2056  protein-export membrane protein SecF  28.61 
 
 		 337 aa  125  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.880378  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5169  protein-export membrane protein SecD  30.6 
 
 		 1029 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2699  preprotein translocase subunit SecF  31.85 
 
 		 315 aa  125  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.584759  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1670  preprotein translocase subunit SecF  31.38 
 
 		 292 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00270917  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0027  preprotein translocase subunit SecF  30.64 
 
 		 310 aa  124  2e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1404  preprotein translocase subunit SecF  29.13 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0316508  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1904  protein-export membrane protein SecF  26.47 
 
 		 302 aa  124  3e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1714  protein-export membrane protein SecF  28.75 
 
 		 316 aa  124  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.611616  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0332  preprotein translocase subunit SecF  32.43 
 
 		 301 aa  123  4e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.496269  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0626  protein-export membrane protein SecF  29.39 
 
 		 310 aa  123  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000549124  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1201  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.01 
 
 		 763 aa  123  5e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.732454  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0684  preprotein translocase subunit SecF  31.79 
 
 		 309 aa  122  9e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.738953  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4258  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.69 
 
 		 755 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2443  preprotein translocase subunit SecF  28.16 
 
 		 347 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000105757  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2256  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.69 
 
 		 991 aa  121  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1770  protein-export membrane protein SecF  30.1 
 
 		 307 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2334  preprotein translocase subunit SecF  32.79 
 
 		 315 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.307818  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.56 
 
 		 754 aa  120  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4155  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.21 
 
 		 754 aa  120  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6254  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.91 
 
 		 1055 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1216  protein-export membrane protein SecF  32.56 
 
 		 291 aa  120  3e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0233184  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4545  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.56 
 
 		 754 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2667  preprotein translocase subunit SecF  33.33 
 
 		 316 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452274  normal  0.524558 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1797  preprotein translocase subunit SecF  30.52 
 
 		 307 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1027  preprotein translocase subunit SecF  31.68 
 
 		 312 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0198826 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4306  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.21 
 
 		 754 aa  119  6e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4641  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.21 
 
 		 754 aa  119  6e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0312  preprotein translocase subunit SecF  30.98 
 
 		 301 aa  119  6e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.111019  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0609  preprotein translocase subunit SecF  32.2 
 
 		 316 aa  119  7e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4144  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.86 
 
 		 754 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>