More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1799 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1799  protein-export membrane protein SecF  100 
 
 		 360 aa  714    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.544061  normal  0.135983 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17560  protein translocase subunit secF  69.92 
 
 		 371 aa  461  1e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.095972 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1997  protein-export membrane protein SecF  62.99 
 
 		 358 aa  446  1.0000000000000001e-124  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.498449  normal  0.0822875 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1365  protein-export membrane protein SecF  59.56 
 
 		 366 aa  431  1e-119  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1671  protein-export membrane protein SecF  57.5 
 
 		 363 aa  375  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13990  protein translocase subunit secF  56 
 
 		 364 aa  365  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.269244  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3050  protein-export membrane protein SecF  61.29 
 
 		 330 aa  360  3e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2028  preprotein translocase subunit SecF  50.15 
 
 		 338 aa  341  1e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000424362 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2298  preprotein translocase subunit SecF  51.25 
 
 		 340 aa  338  8e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15300  protein translocase subunit secF  54.83 
 
 		 406 aa  329  4e-89  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.54161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2390  protein translocase subunit secF  48.25 
 
 		 412 aa  306  5.0000000000000004e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1340  preprotein translocase subunit SecF  49.71 
 
 		 414 aa  305  8.000000000000001e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.265736  normal  0.609901 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12850  protein translocase subunit secF  52.56 
 
 		 346 aa  300  2e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0129827  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6108  preprotein translocase subunit SecF  48.18 
 
 		 347 aa  277  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359416  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2357  protein-export membrane protein SecF  47.3 
 
 		 389 aa  270  4e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3815  preprotein translocase subunit SecF  45.51 
 
 		 422 aa  268  7e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130348  normal  0.401094 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3390  protein-export membrane protein SecF  44.55 
 
 		 432 aa  268  8.999999999999999e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000120226  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15110  protein translocase subunit secF  46.01 
 
 		 414 aa  263  4.999999999999999e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.66233 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2114  protein-export membrane protein SecF  44.07 
 
 		 390 aa  262  6e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205616  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2316  preprotein translocase subunit SecF  40.75 
 
 		 417 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.658853  normal  0.312291 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3823  protein-export membrane protein SecF  46.61 
 
 		 416 aa  260  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.344735  normal  0.619548 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2277  preprotein translocase subunit SecF  40.75 
 
 		 417 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2324  preprotein translocase subunit SecF  40.75 
 
 		 417 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223224  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2060  protein-export membrane protein SecF  49.02 
 
 		 326 aa  258  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.616528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2584  preprotein translocase subunit SecF  42.27 
 
 		 423 aa  258  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.173731  normal  0.904597 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1943  protein-export membrane protein SecF  43.37 
 
 		 374 aa  256  6e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00503357  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5141  preprotein translocase subunit SecF  47.25 
 
 		 417 aa  251  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.358124  hitchhiker  0.00205157 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2305  protein-export membrane protein SecF  40.95 
 
 		 421 aa  247  2e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.879944  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1803  protein-export membrane protein SecF  43.15 
 
 		 394 aa  248  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162985  decreased coverage  0.00000393416 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3173  protein-export membrane protein SecF  47.37 
 
 		 453 aa  247  3e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.12818  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1813  protein-export membrane protein SecF  44.2 
 
 		 394 aa  244  9.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.126223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1374  preprotein translocase subunit SecF  47.06 
 
 		 398 aa  243  3e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.574602  normal  0.142388 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12606  preprotein translocase subunit SecF  40.74 
 
 		 442 aa  243  5e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1696  protein-export membrane protein SecF  43.03 
 
 		 396 aa  238  9e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467956  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0946  protein-export membrane protein SecF  39.45 
 
 		 349 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0984  protein-export membrane protein SecD  34.37 
 
 		 900 aa  171  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.583326 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12600  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  31.54 
 
 		 977 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  33.33 
 
 		 286 aa  161  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07200  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  33.66 
 
 		 855 aa  159  7e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1463  preprotein translocase subunit SecF  32.05 
 
 		 303 aa  157  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000137336  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  35.69 
 
 		 761 aa  150  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  29.75 
 
 		 989 aa  150  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2196  preprotein translocase subunit SecF  30.3 
 
 		 289 aa  149  9e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1907  preprotein translocase subunit SecF  30.51 
 
 		 289 aa  147  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0418717  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.53 
 
 		 762 aa  143  4e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1454  protein-export membrane protein SecF  34.24 
 
 		 308 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0298464  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  33.66 
 
 		 291 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0113  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.25 
 
 		 991 aa  139  6e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.758548 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  34.14 
 
 		 304 aa  136  5e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  34.14 
 
 		 304 aa  136  5e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1424  preprotein translocase subunit SecF  28.03 
 
 		 280 aa  136  6.0000000000000005e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000449698  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4538  protein-export membrane protein SecF  32.71 
 
 		 320 aa  135  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1335  protein translocase subunit secF  34.27 
 
 		 292 aa  132  6.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  29.87 
 
 		 735 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1690  preprotein translocase subunit SecF  32.48 
 
 		 310 aa  130  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.113213  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  30.15 
 
 		 740 aa  130  4.0000000000000003e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0903  protein translocase subunit secF  28.7 
 
 		 318 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000021842  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1762  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.59 
 
 		 981 aa  129  8.000000000000001e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1027  preprotein translocase subunit SecF  31.99 
 
 		 312 aa  129  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0198826 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2885  preprotein translocase subunit SecF  30.77 
 
 		 310 aa  129  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1115  protein-export membrane protein SecF  28.57 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5076  preprotein translocase subunit SecF  31.01 
 
 		 328 aa  127  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1489  preprotein translocase subunit SecF  32.08 
 
 		 325 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.921272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1904  protein-export membrane protein SecF  28.85 
 
 		 302 aa  125  1e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1976  preprotein translocase subunit SecF  29.04 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3211  preprotein translocase subunit SecF  32.85 
 
 		 310 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.828599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  28.98 
 
 		 759 aa  124  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2065  preprotein translocase subunit SecF  32.14 
 
 		 313 aa  125  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1770  protein-export membrane protein SecF  32.35 
 
 		 307 aa  124  3e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1271  preprotein translocase subunit SecF  31.15 
 
 		 296 aa  124  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0562  protein-export membrane protein SecF  29.31 
 
 		 321 aa  123  4e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5169  protein-export membrane protein SecD  29.48 
 
 		 1029 aa  123  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1797  preprotein translocase subunit SecF  30.7 
 
 		 307 aa  123  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3110  preprotein translocase subunit SecF  31.15 
 
 		 315 aa  123  6e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1981  preprotein translocase subunit SecF  28.71 
 
 		 305 aa  123  6e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2056  protein-export membrane protein SecF  30.57 
 
 		 337 aa  122  6e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.880378  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1714  protein-export membrane protein SecF  30.57 
 
 		 316 aa  122  7e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.611616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  27.24 
 
 		 307 aa  122  8e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1670  preprotein translocase subunit SecF  30.42 
 
 		 292 aa  122  8e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00270917  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1355  preprotein translocase subunit SecF  32.25 
 
 		 293 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08751  putative protein-export transmembrane SecDF protein  28.31 
 
 		 1001 aa  122  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392094  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09301  preprotein translocase subunit SecF  33.83 
 
 		 304 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.359776  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1201  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.17 
 
 		 763 aa  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.732454  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0092  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.94 
 
 		 995 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0387  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.46 
 
 		 911 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.807363  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09321  preprotein translocase subunit SecF  33.46 
 
 		 304 aa  120  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1341  protein-export membrane protein SecF  29.55 
 
 		 298 aa  119  6e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1404  preprotein translocase subunit SecF  30 
 
 		 315 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0316508  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1420  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.7 
 
 		 990 aa  119  7.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.469149  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0935  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.87 
 
 		 750 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0997  preprotein translocase subunit SecF  30.7 
 
 		 322 aa  118  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1064  preprotein translocase subunit SecF  28.48 
 
 		 322 aa  118  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204402 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0871  preprotein translocase subunit SecF  33.33 
 
 		 304 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0139488  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2178  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.79 
 
 		 995 aa  118  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.900836  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1603  protein-export membrane protein SecF  28.72 
 
 		 290 aa  117  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.232098  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0847  protein-export membrane protein SecF  30.35 
 
 		 359 aa  116  5e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0561071  normal  0.116765 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0008  preprotein translocase subunit SecF  31.39 
 
 		 311 aa  116  5e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.748405  normal  0.104556 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0066  protein-export membrane protein SecF  26.64 
 
 		 293 aa  116  6e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1629  protein-export membrane protein SecD  31.44 
 
 		 748 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.683752  normal  0.475056 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0080  protein-export membrane protein SecF  27.42 
 
 		 317 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>