More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1997 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1997  protein-export membrane protein SecF  100 
 
 		 358 aa  711    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.498449  normal  0.0822875 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1799  protein-export membrane protein SecF  62.99 
 
 		 360 aa  428  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.544061  normal  0.135983 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1365  protein-export membrane protein SecF  57.42 
 
 		 366 aa  407  1.0000000000000001e-112  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17560  protein translocase subunit secF  60.16 
 
 		 371 aa  404  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.095972 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1671  protein-export membrane protein SecF  54.6 
 
 		 363 aa  368  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2028  preprotein translocase subunit SecF  52.96 
 
 		 338 aa  354  1e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000424362 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3050  protein-export membrane protein SecF  58.23 
 
 		 330 aa  353  2e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2298  preprotein translocase subunit SecF  54.26 
 
 		 340 aa  350  3e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13990  protein translocase subunit secF  51.26 
 
 		 364 aa  348  1e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.269244  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1340  preprotein translocase subunit SecF  50 
 
 		 414 aa  320  3e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.265736  normal  0.609901 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15300  protein translocase subunit secF  54.97 
 
 		 406 aa  318  7e-86  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.54161  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12850  protein translocase subunit secF  52.38 
 
 		 346 aa  310  2e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0129827  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2390  protein translocase subunit secF  47.75 
 
 		 412 aa  300  3e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3823  protein-export membrane protein SecF  47.72 
 
 		 416 aa  273  5.000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.344735  normal  0.619548 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2357  protein-export membrane protein SecF  46.42 
 
 		 389 aa  271  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3815  preprotein translocase subunit SecF  46.36 
 
 		 422 aa  271  1e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130348  normal  0.401094 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2114  protein-export membrane protein SecF  45.1 
 
 		 390 aa  268  7e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205616  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5141  preprotein translocase subunit SecF  49.02 
 
 		 417 aa  268  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.358124  hitchhiker  0.00205157 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1813  protein-export membrane protein SecF  43.62 
 
 		 394 aa  267  2e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.126223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3390  protein-export membrane protein SecF  44.65 
 
 		 432 aa  267  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000120226  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1803  protein-export membrane protein SecF  45.87 
 
 		 394 aa  266  4e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162985  decreased coverage  0.00000393416 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2584  preprotein translocase subunit SecF  45.76 
 
 		 423 aa  265  7e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.173731  normal  0.904597 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2277  preprotein translocase subunit SecF  44.07 
 
 		 417 aa  264  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2316  preprotein translocase subunit SecF  44.07 
 
 		 417 aa  264  2e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.658853  normal  0.312291 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2324  preprotein translocase subunit SecF  44.07 
 
 		 417 aa  264  2e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223224  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6108  preprotein translocase subunit SecF  42.12 
 
 		 347 aa  263  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359416  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15110  protein translocase subunit secF  45.4 
 
 		 414 aa  262  6.999999999999999e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.66233 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2305  protein-export membrane protein SecF  42.74 
 
 		 421 aa  256  3e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.879944  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1943  protein-export membrane protein SecF  44.54 
 
 		 374 aa  256  5e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00503357  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1374  preprotein translocase subunit SecF  47.56 
 
 		 398 aa  253  3e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.574602  normal  0.142388 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2060  protein-export membrane protein SecF  49.16 
 
 		 326 aa  253  3e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.616528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12606  preprotein translocase subunit SecF  44.22 
 
 		 442 aa  249  5e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1696  protein-export membrane protein SecF  43.23 
 
 		 396 aa  247  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467956  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3173  protein-export membrane protein SecF  47.84 
 
 		 453 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.12818  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0946  protein-export membrane protein SecF  42.22 
 
 		 349 aa  218  1e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  34.17 
 
 		 989 aa  179  4.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07200  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  34.75 
 
 		 855 aa  172  7.999999999999999e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12600  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  34.35 
 
 		 977 aa  169  1e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  35.37 
 
 		 286 aa  169  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0984  protein-export membrane protein SecD  32.23 
 
 		 900 aa  159  1e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.583326 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  33.87 
 
 		 761 aa  156  6e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2196  preprotein translocase subunit SecF  30.33 
 
 		 289 aa  151  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1335  protein translocase subunit secF  37.24 
 
 		 292 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1463  preprotein translocase subunit SecF  33.44 
 
 		 303 aa  147  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000137336  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1907  preprotein translocase subunit SecF  29.67 
 
 		 289 aa  145  1e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0418717  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1690  preprotein translocase subunit SecF  34.92 
 
 		 310 aa  142  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.113213  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  33.33 
 
 		 740 aa  138  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1271  preprotein translocase subunit SecF  31.63 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1355  preprotein translocase subunit SecF  33.33 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.98 
 
 		 762 aa  133  5e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  31.53 
 
 		 759 aa  132  6.999999999999999e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1904  protein-export membrane protein SecF  28.62 
 
 		 302 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2885  preprotein translocase subunit SecF  33.44 
 
 		 310 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0113  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.88 
 
 		 991 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.758548 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  30.16 
 
 		 307 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1670  preprotein translocase subunit SecF  32.46 
 
 		 292 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00270917  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1115  protein-export membrane protein SecF  29.87 
 
 		 302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  30.85 
 
 		 291 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  30.77 
 
 		 735 aa  126  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3211  preprotein translocase subunit SecF  35.13 
 
 		 310 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.828599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1027  preprotein translocase subunit SecF  32.9 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0198826 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1424  preprotein translocase subunit SecF  28.52 
 
 		 280 aa  125  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000449698  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1454  protein-export membrane protein SecF  32.21 
 
 		 308 aa  122  8e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0298464  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1489  preprotein translocase subunit SecF  32.15 
 
 		 325 aa  122  9e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.921272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5169  protein-export membrane protein SecD  30.18 
 
 		 1029 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325981  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1981  preprotein translocase subunit SecF  29.03 
 
 		 305 aa  121  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0997  preprotein translocase subunit SecF  32.67 
 
 		 322 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0903  protein translocase subunit secF  28.44 
 
 		 318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000021842  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5076  preprotein translocase subunit SecF  30.45 
 
 		 328 aa  121  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  29 
 
 		 304 aa  120  3.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  29 
 
 		 304 aa  120  3.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1727  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.91 
 
 		 759 aa  120  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.347489  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.91 
 
 		 759 aa  120  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1976  preprotein translocase subunit SecF  28.71 
 
 		 305 aa  119  7e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0562  protein-export membrane protein SecF  31.03 
 
 		 321 aa  119  7.999999999999999e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6254  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.22 
 
 		 1055 aa  118  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0387  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.43 
 
 		 911 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.807363  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0879  preprotein translocase subunit SecF  31.39 
 
 		 302 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0954141 
 
 
-
 
NC_002950  PG1762  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.19 
 
 		 981 aa  117  3e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0066  protein-export membrane protein SecF  28.66 
 
 		 293 aa  117  3e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1629  protein-export membrane protein SecD  30.62 
 
 		 748 aa  117  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.683752  normal  0.475056 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0866  preprotein translocase subunit SecF  31.07 
 
 		 302 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222243  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0847  protein-export membrane protein SecF  39.88 
 
 		 359 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0561071  normal  0.116765 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2737  protein-export membrane protein SecF  27.59 
 
 		 308 aa  116  5e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.468895  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0034  preprotein translocase subunit SecF  32.11 
 
 		 311 aa  116  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4538  protein-export membrane protein SecF  32.37 
 
 		 320 aa  116  7.999999999999999e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0027  preprotein translocase subunit SecF  30.29 
 
 		 310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2065  preprotein translocase subunit SecF  31.6 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0014  preprotein translocase subunit SecF  30.98 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00246116  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1201  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.31 
 
 		 763 aa  113  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.732454  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3037  protein-export membrane protein SecF  30.88 
 
 		 316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0092  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.23 
 
 		 995 aa  113  4.0000000000000004e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0836  preprotein translocase subunit SecF  30.95 
 
 		 302 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0626  protein-export membrane protein SecF  28.26 
 
 		 310 aa  112  7.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000549124  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.02 
 
 		 856 aa  112  7.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0013  preprotein translocase subunit SecF  31.25 
 
 		 309 aa  112  8.000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245212 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0008  preprotein translocase subunit SecF  31.99 
 
 		 311 aa  112  8.000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.748405  normal  0.104556 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0312  preprotein translocase subunit SecF  30.61 
 
 		 301 aa  112  8.000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.111019  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0878  preprotein translocase subunit SecF  28.62 
 
 		 323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0072  preprotein translocase subunit SecF  27.71 
 
 		 323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>